MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp28-3

Total Repeats: 1325

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012185	ATT	2	6	34728	34733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984692
502	NC_012185	ATAA	2	8	34754	34761	75 %	25 %	0 %	0 %	224984692
503	NC_012185	TGC	2	6	34786	34791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224984692
504	NC_012185	TTTC	2	8	34847	34854	0 %	75 %	0 %	25 %	224984692
505	NC_012185	ATCA	2	8	34858	34865	50 %	25 %	0 %	25 %	224984692
506	NC_012185	TC	3	6	34867	34872	0 %	50 %	0 %	50 %	224984692
507	NC_012185	ATT	3	9	34894	34902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984692
508	NC_012185	TTA	2	6	34931	34936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984692
509	NC_012185	T	6	6	34958	34963	0 %	100 %	0 %	0 %	224984692
510	NC_012185	TTA	2	6	35014	35019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984693
511	NC_012185	T	7	7	35049	35055	0 %	100 %	0 %	0 %	224984693
512	NC_012185	ATT	2	6	35057	35062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984693
513	NC_012185	TCA	2	6	35069	35074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984693
514	NC_012185	AAT	2	6	35078	35083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984693
515	NC_012185	T	7	7	35188	35194	0 %	100 %	0 %	0 %	224984693
516	NC_012185	AAT	2	6	35304	35309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984693
517	NC_012185	CAT	2	6	35331	35336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984693
518	NC_012185	TAT	2	6	35388	35393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984693
519	NC_012185	ATTCT	2	10	35421	35430	20 %	60 %	0 %	20 %	224984693
520	NC_012185	TCT	2	6	35560	35565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224984693
521	NC_012185	ATT	2	6	35643	35648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984694
522	NC_012185	TA	3	6	35692	35697	50 %	50 %	0 %	0 %	224984694
523	NC_012185	AGA	2	6	35716	35721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984694
524	NC_012185	TTC	2	6	35733	35738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224984694
525	NC_012185	TCT	2	6	35747	35752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224984694
526	NC_012185	AAT	2	6	35801	35806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984694
527	NC_012185	TAT	2	6	35817	35822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984694
528	NC_012185	T	6	6	35871	35876	0 %	100 %	0 %	0 %	224984694
529	NC_012185	A	6	6	35881	35886	100 %	0 %	0 %	0 %	224984694
530	NC_012185	A	6	6	35952	35957	100 %	0 %	0 %	0 %	224984694
531	NC_012185	T	6	6	36043	36048	0 %	100 %	0 %	0 %	224984695
532	NC_012185	ATT	2	6	36129	36134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984695
533	NC_012185	ATTG	2	8	36148	36155	25 %	50 %	25 %	0 %	224984695
534	NC_012185	TA	3	6	36185	36190	50 %	50 %	0 %	0 %	224984696
535	NC_012185	T	6	6	36194	36199	0 %	100 %	0 %	0 %	224984696
536	NC_012185	ATC	2	6	36226	36231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984696
537	NC_012185	TAG	3	9	36243	36251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984696
538	NC_012185	TAA	2	6	36274	36279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984696
539	NC_012185	A	6	6	36299	36304	100 %	0 %	0 %	0 %	224984696
540	NC_012185	TTA	2	6	36363	36368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984696
541	NC_012185	T	6	6	36376	36381	0 %	100 %	0 %	0 %	224984696
542	NC_012185	T	6	6	36417	36422	0 %	100 %	0 %	0 %	224984697
543	NC_012185	T	6	6	36444	36449	0 %	100 %	0 %	0 %	224984697
544	NC_012185	TTG	2	6	36477	36482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224984697
545	NC_012185	ATT	2	6	36488	36493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984697
546	NC_012185	TA	3	6	36505	36510	50 %	50 %	0 %	0 %	224984697
547	NC_012185	A	6	6	36660	36665	100 %	0 %	0 %	0 %	224984698
548	NC_012185	A	6	6	36671	36676	100 %	0 %	0 %	0 %	224984698
549	NC_012185	T	6	6	36711	36716	0 %	100 %	0 %	0 %	224984698
550	NC_012185	TAT	2	6	36732	36737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984698
551	NC_012185	T	6	6	36767	36772	0 %	100 %	0 %	0 %	224984699
552	NC_012185	ATT	2	6	36800	36805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984699
553	NC_012185	CTTT	2	8	36854	36861	0 %	75 %	0 %	25 %	224984699
554	NC_012185	AT	3	6	37270	37275	50 %	50 %	0 %	0 %	224984700
555	NC_012185	T	6	6	37275	37280	0 %	100 %	0 %	0 %	224984700
556	NC_012185	GTT	2	6	37296	37301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224984700
557	NC_012185	T	8	8	37316	37323	0 %	100 %	0 %	0 %	224984700
558	NC_012185	AGA	2	6	37381	37386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984700
559	NC_012185	CTT	2	6	37580	37585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224984701
560	NC_012185	AT	3	6	37586	37591	50 %	50 %	0 %	0 %	224984701
561	NC_012185	TAT	3	9	37589	37597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984701
562	NC_012185	AGT	2	6	37658	37663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984701
563	NC_012185	T	8	8	37692	37699	0 %	100 %	0 %	0 %	224984701
564	NC_012185	T	6	6	37734	37739	0 %	100 %	0 %	0 %	224984701
565	NC_012185	TAG	2	6	37795	37800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984701
566	NC_012185	GTG	2	6	37864	37869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224984701
567	NC_012185	ATA	2	6	37902	37907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984701
568	NC_012185	T	7	7	37915	37921	0 %	100 %	0 %	0 %	224984701
569	NC_012185	TTG	2	6	37939	37944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224984701
570	NC_012185	TGT	2	6	37984	37989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224984701
571	NC_012185	TGT	2	6	37994	37999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224984701
572	NC_012185	T	6	6	38039	38044	0 %	100 %	0 %	0 %	224984701
573	NC_012185	TAA	3	9	38059	38067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984702
574	NC_012185	TAT	2	6	38071	38076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984702
575	NC_012185	T	6	6	38107	38112	0 %	100 %	0 %	0 %	224984702
576	NC_012185	A	7	7	38113	38119	100 %	0 %	0 %	0 %	224984702
577	NC_012185	CTT	2	6	38331	38336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224984703
578	NC_012185	T	7	7	38335	38341	0 %	100 %	0 %	0 %	224984703
579	NC_012185	AAT	3	9	38437	38445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984704
580	NC_012185	ATA	2	6	38459	38464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984704
581	NC_012185	TTA	2	6	38596	38601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984704
582	NC_012185	GTACA	2	10	38694	38703	40 %	20 %	20 %	20 %	224984705
583	NC_012185	AGAT	2	8	38745	38752	50 %	25 %	25 %	0 %	224984705
584	NC_012185	AGC	2	6	39296	39301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224984706
585	NC_012185	AGA	2	6	39345	39350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984706
586	NC_012185	AT	3	6	39384	39389	50 %	50 %	0 %	0 %	224984706
587	NC_012185	TAA	2	6	39443	39448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984707
588	NC_012185	TAC	2	6	39488	39493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984707
589	NC_012185	AGTT	2	8	39500	39507	25 %	50 %	25 %	0 %	224984707
590	NC_012185	GTT	2	6	39511	39516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224984707
591	NC_012185	TCA	2	6	39578	39583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984707
592	NC_012185	ATT	2	6	39627	39632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984708
593	NC_012185	ATCACC	2	12	39643	39654	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	224984708
594	NC_012185	TATT	2	8	39659	39666	25 %	75 %	0 %	0 %	224984708
595	NC_012185	TTTTG	2	10	39690	39699	0 %	80 %	20 %	0 %	224984708
596	NC_012185	CAAT	2	8	39713	39720	50 %	25 %	0 %	25 %	224984708
597	NC_012185	C	6	6	39723	39728	0 %	0 %	0 %	100 %	224984708
598	NC_012185	C	6	6	39731	39736	0 %	0 %	0 %	100 %	224984708
599	NC_012185	C	10	10	39739	39748	0 %	0 %	0 %	100 %	224984708
600	NC_012185	ATT	2	6	39773	39778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984709
601	NC_012185	AG	3	6	39863	39868	50 %	0 %	50 %	0 %	224984709
602	NC_012185	TTA	2	6	39882	39887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984709
603	NC_012185	TCT	2	6	40029	40034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224984710
604	NC_012185	T	7	7	40061	40067	0 %	100 %	0 %	0 %	224984710
605	NC_012185	TAT	2	6	40087	40092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984710
606	NC_012185	TTTA	2	8	40094	40101	25 %	75 %	0 %	0 %	224984710
607	NC_012185	ATT	2	6	40109	40114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984710
608	NC_012185	ATA	2	6	40156	40161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984710
609	NC_012185	TAT	2	6	40162	40167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984710
610	NC_012185	T	6	6	40316	40321	0 %	100 %	0 %	0 %	224984711
611	NC_012185	GTT	2	6	40366	40371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224984711
612	NC_012185	GATA	2	8	40374	40381	50 %	25 %	25 %	0 %	224984711
613	NC_012185	ACT	3	9	40393	40401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984711
614	NC_012185	TTA	2	6	40415	40420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984711
615	NC_012185	ATA	2	6	40448	40453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984711
616	NC_012185	TAT	2	6	40457	40462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984711
617	NC_012185	T	7	7	40472	40478	0 %	100 %	0 %	0 %	224984711
618	NC_012185	AAT	3	9	40480	40488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984711
619	NC_012185	ATT	2	6	40491	40496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984711
620	NC_012185	TATC	2	8	40603	40610	25 %	50 %	0 %	25 %	224984712
621	NC_012185	ATA	2	6	40688	40693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984712
622	NC_012185	T	7	7	40694	40700	0 %	100 %	0 %	0 %	224984712
623	NC_012185	TAA	2	6	40738	40743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984712
624	NC_012185	AAG	2	6	41269	41274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984713
625	NC_012185	CATG	2	8	41286	41293	25 %	25 %	25 %	25 %	224984713
626	NC_012185	TTG	2	6	41297	41302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224984713
627	NC_012185	GAA	2	6	41318	41323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984713
628	NC_012185	TTA	2	6	41339	41344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984713
629	NC_012185	TAT	2	6	41359	41364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984713
630	NC_012185	GTA	2	6	41513	41518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984714
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632	NC_012185	TAT	2	6	41571	41576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984714
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