MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp54

Total Repeats: 41

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012177	ATATTA	2	12	658	669	50 %	50 %	0 %	0 %	224984382
2	NC_012177	TAGGAG	2	12	947	958	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	224984382
3	NC_012177	AAAAGA	2	12	1858	1869	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	224984383
4	NC_012177	ATTTAA	2	12	4762	4773	50 %	50 %	0 %	0 %	224984386
5	NC_012177	ACAATA	2	12	5445	5456	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	224984387
6	NC_012177	AAAGAC	2	12	9390	9401	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	224984394
7	NC_012177	TAAAAT	2	12	11157	11168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984396
8	NC_012177	GAAAAA	2	12	11860	11871	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	224984397
9	NC_012177	CAAAAA	2	12	12815	12826	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	224984398
10	NC_012177	TTTAAG	2	12	13172	13183	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	224984398
11	NC_012177	TTAGAA	2	12	13280	13291	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	224984398
12	NC_012177	GATAAA	2	12	14135	14146	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	224984400
13	NC_012177	TAAAGA	2	12	14285	14296	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	224984400
14	NC_012177	TTCTTG	2	12	17626	17637	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	224984404
15	NC_012177	AGAAAA	2	12	18823	18834	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	224984406
16	NC_012177	ATTTTT	2	12	20126	20137	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	224984407
17	NC_012177	AAAATA	2	12	20334	20345	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	224984407
18	NC_012177	GAATAG	2	12	22701	22712	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	224984410
19	NC_012177	TTCCAA	2	12	23151	23162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984410
20	NC_012177	TTTTGA	2	12	24863	24874	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	224984413
21	NC_012177	GAAGAT	2	12	25862	25873	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	224984414
22	NC_012177	ATTATG	2	12	26055	26066	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	224984414
23	NC_012177	CAAACA	2	12	28420	28431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984417
24	NC_012177	AAGAAT	2	12	29236	29247	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	224984418
25	NC_012177	CAAAAG	2	12	30196	30207	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	224984420
26	NC_012177	TTCCAA	2	12	32003	32014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984423
27	NC_012177	TTAGAT	2	12	33477	33488	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	224984426
28	NC_012177	TACAAA	2	12	34579	34590	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	224984427
29	NC_012177	ATAAAA	2	12	35320	35331	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	224984428
30	NC_012177	TAATTT	2	12	36983	36994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984430
31	NC_012177	TTTTCT	2	12	37670	37681	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	224984431
32	NC_012177	GTTTTT	2	12	37790	37801	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	224984431
33	NC_012177	TCAATT	2	12	37874	37885	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	224984431
34	NC_012177	TCAAAC	2	12	37886	37897	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	224984431
35	NC_012177	GAATTT	2	12	42400	42411	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	224984436
36	NC_012177	TAATTT	2	12	43690	43701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984437
37	NC_012177	TTAGAT	2	12	48427	48438	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	224984444
38	NC_012177	TCAATT	2	12	49103	49114	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	224984445
39	NC_012177	TCAATT	2	12	50139	50150	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	224984446
40	NC_012177	TGTTTT	2	12	50824	50835	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	224984447
41	NC_012177	TTTTCA	2	12	51203	51214	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	224984447

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.