MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp54

Total Repeats: 1179

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012177	ATT	3	9	23821	23829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984412
502	NC_012177	TGC	2	6	23875	23880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224984412
503	NC_012177	TTG	2	6	23898	23903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224984412
504	NC_012177	ACCT	2	8	23950	23957	25 %	25 %	0 %	50 %	224984412
505	NC_012177	AGA	2	6	24031	24036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984412
506	NC_012177	T	6	6	24071	24076	0 %	100 %	0 %	0 %	224984412
507	NC_012177	A	6	6	24170	24175	100 %	0 %	0 %	0 %	224984412
508	NC_012177	ATA	2	6	24189	24194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984412
509	NC_012177	GAT	2	6	24251	24256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984412
510	NC_012177	GAT	2	6	24317	24322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984412
511	NC_012177	TAG	2	6	24325	24330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984412
512	NC_012177	TAA	2	6	24400	24405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984412
513	NC_012177	AGC	2	6	24448	24453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224984412
514	NC_012177	ATA	2	6	24616	24621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984413
515	NC_012177	ACA	2	6	24622	24627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984413
516	NC_012177	TAA	2	6	24656	24661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984413
517	NC_012177	TAAA	2	8	24727	24734	75 %	25 %	0 %	0 %	224984413
518	NC_012177	ACAA	2	8	24744	24751	75 %	0 %	0 %	25 %	224984413
519	NC_012177	GAT	2	6	24756	24761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984413
520	NC_012177	A	6	6	24819	24824	100 %	0 %	0 %	0 %	224984413
521	NC_012177	AAC	2	6	24828	24833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984413
522	NC_012177	TTTTGA	2	12	24863	24874	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	224984413
523	NC_012177	TTG	2	6	24895	24900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224984413
524	NC_012177	GATT	2	8	24986	24993	25 %	50 %	25 %	0 %	224984413
525	NC_012177	T	6	6	24992	24997	0 %	100 %	0 %	0 %	224984413
526	NC_012177	GAA	4	12	25002	25013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984413
527	NC_012177	CAG	2	6	25024	25029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224984413
528	NC_012177	AAG	2	6	25030	25035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984413
529	NC_012177	AGC	2	6	25041	25046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224984413
530	NC_012177	TTA	2	6	25093	25098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984413
531	NC_012177	TAA	2	6	25126	25131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984413
532	NC_012177	TAT	2	6	25163	25168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984413
533	NC_012177	ATTTT	2	10	25197	25206	20 %	80 %	0 %	0 %	224984413
534	NC_012177	T	7	7	25203	25209	0 %	100 %	0 %	0 %	224984413
535	NC_012177	A	7	7	25577	25583	100 %	0 %	0 %	0 %	224984414
536	NC_012177	T	8	8	25659	25666	0 %	100 %	0 %	0 %	224984414
537	NC_012177	CAG	2	6	25686	25691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224984414
538	NC_012177	AATT	2	8	25711	25718	50 %	50 %	0 %	0 %	224984414
539	NC_012177	GCTT	2	8	25722	25729	0 %	50 %	25 %	25 %	224984414
540	NC_012177	CTT	2	6	25734	25739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224984414
541	NC_012177	AAG	2	6	25746	25751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984414
542	NC_012177	CTT	2	6	25796	25801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224984414
543	NC_012177	GAAGAT	2	12	25862	25873	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	224984414
544	NC_012177	A	6	6	25929	25934	100 %	0 %	0 %	0 %	224984414
545	NC_012177	TTA	2	6	25935	25940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984414
546	NC_012177	TAA	2	6	26040	26045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984414
547	NC_012177	ATTATG	2	12	26055	26066	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	224984414
548	NC_012177	CTT	2	6	26105	26110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224984414
549	NC_012177	ATTT	2	8	26132	26139	25 %	75 %	0 %	0 %	224984414
550	NC_012177	T	6	6	26170	26175	0 %	100 %	0 %	0 %	224984414
551	NC_012177	TTG	2	6	26205	26210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224984414
552	NC_012177	AGA	2	6	26230	26235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984414
553	NC_012177	AAT	2	6	26255	26260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984414
554	NC_012177	T	7	7	26281	26287	0 %	100 %	0 %	0 %	224984414
555	NC_012177	AGT	2	6	26324	26329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984414
556	NC_012177	AGC	2	6	26337	26342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224984414
557	NC_012177	ATG	2	6	26382	26387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984414
558	NC_012177	T	6	6	26391	26396	0 %	100 %	0 %	0 %	224984414
559	NC_012177	TAA	2	6	26427	26432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984414
560	NC_012177	AGT	2	6	26546	26551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984414
561	NC_012177	ATT	2	6	26571	26576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984414
562	NC_012177	ATT	2	6	26580	26585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984414
563	NC_012177	ATGC	2	8	26613	26620	25 %	25 %	25 %	25 %	224984414
564	NC_012177	GA	4	8	26699	26706	50 %	0 %	50 %	0 %	224984414
565	NC_012177	CTT	2	6	26714	26719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224984414
566	NC_012177	TA	3	6	26726	26731	50 %	50 %	0 %	0 %	224984414
567	NC_012177	TTAA	2	8	26744	26751	50 %	50 %	0 %	0 %	224984414
568	NC_012177	A	6	6	26831	26836	100 %	0 %	0 %	0 %	224984415
569	NC_012177	AAG	2	6	26876	26881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984415
570	NC_012177	A	6	6	26886	26891	100 %	0 %	0 %	0 %	224984415
571	NC_012177	TAA	2	6	26916	26921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984415
572	NC_012177	TAA	2	6	26967	26972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984415
573	NC_012177	ATAA	2	8	27019	27026	75 %	25 %	0 %	0 %	224984415
574	NC_012177	GGT	2	6	27099	27104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224984415
575	NC_012177	TTA	2	6	27125	27130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984415
576	NC_012177	TGA	2	6	27183	27188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984415
577	NC_012177	GATT	2	8	27189	27196	25 %	50 %	25 %	0 %	224984415
578	NC_012177	TCT	2	6	27199	27204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224984415
579	NC_012177	ATA	2	6	27274	27279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984415
580	NC_012177	AAATC	2	10	27295	27304	60 %	20 %	0 %	20 %	224984415
581	NC_012177	AAT	2	6	27310	27315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984415
582	NC_012177	T	7	7	27333	27339	0 %	100 %	0 %	0 %	224984415
583	NC_012177	AATG	2	8	27373	27380	50 %	25 %	25 %	0 %	224984415
584	NC_012177	TAA	2	6	27408	27413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984415
585	NC_012177	A	6	6	27412	27417	100 %	0 %	0 %	0 %	224984415
586	NC_012177	A	6	6	27506	27511	100 %	0 %	0 %	0 %	224984416
587	NC_012177	A	9	9	27568	27576	100 %	0 %	0 %	0 %	224984416
588	NC_012177	A	6	6	27585	27590	100 %	0 %	0 %	0 %	224984416
589	NC_012177	AGT	2	6	27644	27649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984416
590	NC_012177	ATTTT	2	10	27667	27676	20 %	80 %	0 %	0 %	224984416
591	NC_012177	GGC	2	6	27800	27805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224984416
592	NC_012177	TGA	2	6	27838	27843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984416
593	NC_012177	AGA	2	6	27925	27930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984416
594	NC_012177	TAA	3	9	27936	27944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984416
595	NC_012177	GAA	2	6	28016	28021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984416
596	NC_012177	AGA	2	6	28031	28036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984416
597	NC_012177	T	7	7	28059	28065	0 %	100 %	0 %	0 %	224984416
598	NC_012177	CAAA	2	8	28069	28076	75 %	0 %	0 %	25 %	224984416
599	NC_012177	ACA	2	6	28114	28119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984417
600	NC_012177	ACG	2	6	28132	28137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224984417
601	NC_012177	CAA	2	6	28212	28217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984417
602	NC_012177	AG	3	6	28220	28225	50 %	0 %	50 %	0 %	224984417
603	NC_012177	ATT	2	6	28254	28259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984417
604	NC_012177	CAA	2	6	28321	28326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984417
605	NC_012177	ATTA	2	8	28353	28360	50 %	50 %	0 %	0 %	224984417
606	NC_012177	TACT	2	8	28382	28389	25 %	50 %	0 %	25 %	224984417
607	NC_012177	CAAACA	2	12	28420	28431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984417
608	NC_012177	AAT	2	6	28460	28465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984417
609	NC_012177	ATT	2	6	28492	28497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984417
610	NC_012177	AGT	2	6	28524	28529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984417
611	NC_012177	CTT	2	6	28539	28544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224984417
612	NC_012177	TGA	2	6	28547	28552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984417
613	NC_012177	CCAAA	2	10	28590	28599	60 %	0 %	0 %	40 %	224984417
614	NC_012177	ATG	2	6	28651	28656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984417
615	NC_012177	AGA	2	6	28676	28681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984417
616	NC_012177	GA	3	6	28683	28688	50 %	0 %	50 %	0 %	224984417
617	NC_012177	AAT	2	6	28755	28760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984417
618	NC_012177	TAA	2	6	28802	28807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984417
619	NC_012177	TTA	2	6	28839	28844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984417
620	NC_012177	AAG	2	6	28868	28873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984417
621	NC_012177	ACT	3	9	28880	28888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984417
622	NC_012177	CAA	2	6	28990	28995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984417
623	NC_012177	A	6	6	28994	28999	100 %	0 %	0 %	0 %	224984417
624	NC_012177	ATGA	2	8	29030	29037	50 %	25 %	25 %	0 %	224984418
625	NC_012177	A	6	6	29093	29098	100 %	0 %	0 %	0 %	224984418
626	NC_012177	AAGAAT	2	12	29236	29247	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	224984418
627	NC_012177	TGTT	2	8	29271	29278	0 %	75 %	25 %	0 %	224984418
628	NC_012177	TAT	2	6	29285	29290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984418
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