MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp25

Total Repeats: 326

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012166	AGA	2	6	32	37	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984010
2	NC_012166	GGA	2	6	93	98	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	224984010
3	NC_012166	AAT	2	6	673	678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984011
4	NC_012166	ATA	2	6	704	709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984011
5	NC_012166	AAG	2	6	834	839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984011
6	NC_012166	ATG	2	6	888	893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984011
7	NC_012166	ATG	2	6	1026	1031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984011
8	NC_012166	AAT	2	6	1103	1108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984011
9	NC_012166	ATT	2	6	1983	1988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984012
10	NC_012166	ATT	2	6	2257	2262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984013
11	NC_012166	AAC	2	6	2365	2370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984014
12	NC_012166	TAA	2	6	2382	2387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984014
13	NC_012166	TCT	2	6	2436	2441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224984014
14	NC_012166	TAA	2	6	2629	2634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984015
15	NC_012166	CAA	2	6	2701	2706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984015
16	NC_012166	ACT	2	6	2805	2810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984015
17	NC_012166	CTA	2	6	2884	2889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984015
18	NC_012166	ACA	2	6	2919	2924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984015
19	NC_012166	TAA	2	6	2925	2930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984015
20	NC_012166	TAA	3	9	3037	3045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984015
21	NC_012166	ATA	2	6	3048	3053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984015
22	NC_012166	AAG	2	6	3054	3059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984015
23	NC_012166	AGA	2	6	3064	3069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984015
24	NC_012166	AGA	2	6	3178	3183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984015
25	NC_012166	AAT	2	6	3245	3250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984015
26	NC_012166	ACA	2	6	3483	3488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984015
27	NC_012166	CAA	2	6	3547	3552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984015
28	NC_012166	CAA	2	6	3622	3627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984015
29	NC_012166	AAC	2	6	3660	3665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984015
30	NC_012166	ATA	2	6	3748	3753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984016
31	NC_012166	TCA	2	6	3779	3784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984016
32	NC_012166	GAA	2	6	3803	3808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984016
33	NC_012166	ATT	2	6	4000	4005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984016
34	NC_012166	TAA	2	6	4121	4126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984016
35	NC_012166	AAT	2	6	4265	4270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984016
36	NC_012166	AGG	2	6	4289	4294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	224984017
37	NC_012166	ACC	2	6	4386	4391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224984017
38	NC_012166	AGA	2	6	4412	4417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984017
39	NC_012166	TTC	2	6	4481	4486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224984017
40	NC_012166	AAT	2	6	4503	4508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984017
41	NC_012166	ATA	3	9	4623	4631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984017
42	NC_012166	ATT	2	6	4653	4658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984017
43	NC_012166	ATA	2	6	4689	4694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984017
44	NC_012166	ATT	2	6	4736	4741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984017
45	NC_012166	AAG	2	6	4754	4759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984017
46	NC_012166	TTA	2	6	4827	4832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984017
47	NC_012166	TAA	2	6	4837	4842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984017
48	NC_012166	GAT	2	6	4848	4853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984017
49	NC_012166	TAA	2	6	4998	5003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984017
50	NC_012166	TAC	2	6	5070	5075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984018
51	NC_012166	ATA	2	6	5177	5182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984018
52	NC_012166	AGA	2	6	5328	5333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984018
53	NC_012166	AAG	2	6	5402	5407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984018
54	NC_012166	TAT	2	6	5485	5490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984018
55	NC_012166	ATA	2	6	5811	5816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984019
56	NC_012166	ATA	2	6	5839	5844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984019
57	NC_012166	TTA	2	6	5910	5915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984019
58	NC_012166	ATA	2	6	6897	6902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984020
59	NC_012166	TTA	2	6	6918	6923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984020
60	NC_012166	GAA	2	6	6951	6956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984020
61	NC_012166	GAA	2	6	6960	6965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984020
62	NC_012166	GTT	2	6	6966	6971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224984020
63	NC_012166	ATG	2	6	7146	7151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984020
64	NC_012166	TCA	2	6	7382	7387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984020
65	NC_012166	ATT	2	6	7427	7432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984021
66	NC_012166	ATT	2	6	7500	7505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984021
67	NC_012166	AGA	2	6	7514	7519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984021
68	NC_012166	TGA	2	6	7532	7537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984021
69	NC_012166	ATA	2	6	7708	7713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984021
70	NC_012166	AAT	2	6	7779	7784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984021
71	NC_012166	CAA	2	6	7803	7808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984021
72	NC_012166	GTT	2	6	7950	7955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224984021
73	NC_012166	TCT	2	6	8280	8285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224984022
74	NC_012166	ATC	2	6	8289	8294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984022
75	NC_012166	ATC	2	6	8430	8435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984022
76	NC_012166	TTA	2	6	8626	8631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984023
77	NC_012166	AAG	2	6	9094	9099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984024
78	NC_012166	AGA	2	6	9127	9132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984024
79	NC_012166	ACC	2	6	9163	9168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224984024
80	NC_012166	TAA	2	6	9247	9252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984024
81	NC_012166	TAG	2	6	9270	9275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984024
82	NC_012166	CTC	2	6	9294	9299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224984024
83	NC_012166	GAC	2	6	9338	9343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224984024
84	NC_012166	GAC	2	6	9357	9362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224984024
85	NC_012166	CAG	2	6	9415	9420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224984024
86	NC_012166	TTA	2	6	9617	9622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984024
87	NC_012166	GAA	2	6	9635	9640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984024
88	NC_012166	CAA	2	6	9702	9707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984024
89	NC_012166	TGA	2	6	9708	9713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984024
90	NC_012166	AAT	2	6	10019	10024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984025
91	NC_012166	GAT	2	6	10044	10049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984025
92	NC_012166	TAA	2	6	10233	10238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984026
93	NC_012166	GTT	2	6	10268	10273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224984026
94	NC_012166	TTA	2	6	10323	10328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984026
95	NC_012166	TAA	2	6	10961	10966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984027
96	NC_012166	AGA	2	6	11018	11023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984027
97	NC_012166	TAA	2	6	11150	11155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984028
98	NC_012166	ATG	2	6	11167	11172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984028
99	NC_012166	CAG	2	6	11218	11223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224984028
100	NC_012166	TAA	2	6	11230	11235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984028
101	NC_012166	AGA	2	6	11248	11253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984028
102	NC_012166	GAA	2	6	11279	11284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984028
103	NC_012166	AAG	2	6	11293	11298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984028
104	NC_012166	AAG	2	6	11307	11312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984029
105	NC_012166	GGA	2	6	11325	11330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	224984029
106	NC_012166	AGG	2	6	11336	11341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	224984029
107	NC_012166	TAA	2	6	11360	11365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984029
108	NC_012166	ATA	2	6	11389	11394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984029
109	NC_012166	ATT	2	6	11471	11476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984029
110	NC_012166	AAT	2	6	11516	11521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984030
111	NC_012166	ATA	2	6	11547	11552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984030
112	NC_012166	AAG	2	6	11677	11682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984031
113	NC_012166	ATG	2	6	11731	11736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984031
114	NC_012166	ATG	2	6	11869	11874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224984031
115	NC_012166	AAT	2	6	11946	11951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984031
116	NC_012166	AAT	2	6	12332	12337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984032
117	NC_012166	ATT	2	6	12833	12838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984033
118	NC_012166	ATT	2	6	13107	13112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984033
119	NC_012166	AAC	2	6	13215	13220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984033
120	NC_012166	TAA	2	6	13232	13237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984033
121	NC_012166	TAA	2	6	13467	13472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984034
122	NC_012166	CAA	2	6	13539	13544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984034
123	NC_012166	ACT	2	6	13643	13648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984034
124	NC_012166	CTA	2	6	13722	13727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224984034
125	NC_012166	ACA	2	6	13757	13762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984034
126	NC_012166	TAA	2	6	13763	13768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984034
127	NC_012166	TAA	3	9	13875	13883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984034
128	NC_012166	ATA	2	6	13886	13891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984034
129	NC_012166	AAG	2	6	13892	13897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984034
130	NC_012166	AGA	2	6	13902	13907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984034
131	NC_012166	AGA	2	6	14016	14021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984034
132	NC_012166	AAT	2	6	14083	14088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984034
133	NC_012166	ACA	2	6	14321	14326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984034
134	NC_012166	CAA	2	6	14385	14390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984034
135	NC_012166	CAA	2	6	14460	14465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984034
136	NC_012166	AAC	2	6	14498	14503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224984034
137	NC_012166	ATA	2	6	14586	14591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984035
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140	NC_012166	TAA	2	6	14959	14964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984035
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143	NC_012166	AGG	2	6	15127	15132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	224984036
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145	NC_012166	AGA	2	6	15250	15255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984036
146	NC_012166	TTC	2	6	15319	15324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224984036
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152	NC_012166	ATT	2	6	15574	15579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984036
153	NC_012166	AAG	2	6	15592	15597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224984036
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156	NC_012166	TAA	2	6	15675	15680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984036
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158	NC_012166	TAA	2	6	15836	15841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224984036
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165	NC_012166	TAT	2	6	16616	16621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224984038
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172	NC_012166	GTT	2	6	17802	17807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224984039
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254	NC_012166	TTC	2	6	25870	25875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224984056
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.