MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_cp32-10

Total Repeats: 345

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012133	TAG	2	6	93	98	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586581
2	NC_012133	AGA	2	6	166	171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586581
3	NC_012133	TAT	2	6	274	279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586581
4	NC_012133	AAT	3	9	452	460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586581
5	NC_012133	CTT	2	6	693	698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224586581
6	NC_012133	TAA	2	6	721	726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586581
7	NC_012133	TCT	2	6	749	754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224586581
8	NC_012133	TAA	2	6	859	864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586581
9	NC_012133	TTA	2	6	909	914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586581
10	NC_012133	ATT	2	6	927	932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586581
11	NC_012133	ATG	2	6	1029	1034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586581
12	NC_012133	ATT	2	6	1053	1058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586581
13	NC_012133	AGC	2	6	1235	1240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224586581
14	NC_012133	TAA	2	6	1246	1251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586581
15	NC_012133	GGA	2	6	1252	1257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	224586581
16	NC_012133	ATT	2	6	1279	1284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586581
17	NC_012133	GAA	2	6	1333	1338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586601
18	NC_012133	AGA	2	6	1356	1361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586601
19	NC_012133	ATA	2	6	1439	1444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586601
20	NC_012133	ATT	2	6	1539	1544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586601
21	NC_012133	AGC	2	6	1597	1602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224586601
22	NC_012133	TAA	2	6	1608	1613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586601
23	NC_012133	ACT	2	6	1620	1625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586601
24	NC_012133	AAC	2	6	1760	1765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224586601
25	NC_012133	TTC	3	9	1818	1826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224586601
26	NC_012133	TTA	2	6	1835	1840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586601
27	NC_012133	TTG	2	6	1850	1855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224586601
28	NC_012133	AGA	2	6	1863	1868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586601
29	NC_012133	TGA	2	6	2080	2085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586606
30	NC_012133	CAA	2	6	2094	2099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224586606
31	NC_012133	TAG	2	6	2177	2182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586606
32	NC_012133	GTG	2	6	2290	2295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224586606
33	NC_012133	AAG	2	6	2391	2396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586606
34	NC_012133	AGA	2	6	2519	2524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586606
35	NC_012133	ATA	2	6	2626	2631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586592
36	NC_012133	GCT	2	6	2664	2669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224586592
37	NC_012133	ATG	2	6	2707	2712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586592
38	NC_012133	TGA	2	6	2753	2758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586592
39	NC_012133	TAG	2	6	2819	2824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586592
40	NC_012133	GTT	2	6	2833	2838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224586592
41	NC_012133	AGA	2	6	2903	2908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586592
42	NC_012133	ATC	2	6	3173	3178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586592
43	NC_012133	ATC	2	6	3261	3266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586592
44	NC_012133	ATT	2	6	3280	3285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586592
45	NC_012133	ACA	2	6	3398	3403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224586577
46	NC_012133	AGT	2	6	3406	3411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586577
47	NC_012133	CAG	2	6	3464	3469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224586577
48	NC_012133	ATC	2	6	3570	3575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586577
49	NC_012133	GTG	2	6	3672	3677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224586577
50	NC_012133	GAT	2	6	3707	3712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586577
51	NC_012133	CTA	2	6	3726	3731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586577
52	NC_012133	TAA	2	6	3745	3750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586577
53	NC_012133	ATG	3	9	3903	3911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586577
54	NC_012133	AGT	3	9	3925	3933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586577
55	NC_012133	ATT	2	6	3991	3996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586597
56	NC_012133	TGA	2	6	3997	4002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586597
57	NC_012133	ATT	2	6	4005	4010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586597
58	NC_012133	ACA	2	6	4157	4162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224586597
59	NC_012133	AGT	2	6	4210	4215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586597
60	NC_012133	ATT	2	6	4224	4229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586597
61	NC_012133	TAA	3	9	4309	4317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586597
62	NC_012133	AGC	2	6	4352	4357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224586597
63	NC_012133	TTA	2	6	4371	4376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586597
64	NC_012133	CTT	2	6	4457	4462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224586597
65	NC_012133	AGA	2	6	4483	4488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586597
66	NC_012133	ATG	2	6	4586	4591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586597
67	NC_012133	GCA	2	6	4637	4642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224586597
68	NC_012133	TAA	2	6	4708	4713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586597
69	NC_012133	GAA	3	9	5003	5011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586600
70	NC_012133	TTA	2	6	5048	5053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586600
71	NC_012133	GTT	2	6	5216	5221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224586600
72	NC_012133	ATT	2	6	5277	5282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586600
73	NC_012133	GGT	2	6	5309	5314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224586600
74	NC_012133	CAT	2	6	5397	5402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586600
75	NC_012133	GAC	2	6	5530	5535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224586576
76	NC_012133	CAA	2	6	5542	5547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224586576
77	NC_012133	TTA	2	6	5585	5590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586576
78	NC_012133	CAA	2	6	5942	5947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224586583
79	NC_012133	GTA	2	6	6100	6105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586583
80	NC_012133	TTG	2	6	6124	6129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224586583
81	NC_012133	AAT	2	6	6248	6253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586613
82	NC_012133	GTA	2	6	6437	6442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586613
83	NC_012133	TTC	2	6	6661	6666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224586613
84	NC_012133	ATT	2	6	6784	6789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586611
85	NC_012133	AGC	2	6	6812	6817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224586611
86	NC_012133	TAA	2	6	6830	6835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586611
87	NC_012133	ATG	2	6	6841	6846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586611
88	NC_012133	TAA	2	6	6872	6877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586611
89	NC_012133	AAC	2	6	6883	6888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224586611
90	NC_012133	ACT	2	6	6950	6955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586611
91	NC_012133	TGT	2	6	7079	7084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224586611
92	NC_012133	TTA	2	6	7087	7092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586611
93	NC_012133	GAT	2	6	7116	7121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586611
94	NC_012133	AGA	2	6	7139	7144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586611
95	NC_012133	TAA	2	6	7148	7153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586611
96	NC_012133	AGA	2	6	7193	7198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586611
97	NC_012133	AAT	2	6	7218	7223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586611
98	NC_012133	TGA	2	6	7379	7384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586611
99	NC_012133	CTT	2	6	7431	7436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224586611
100	NC_012133	AAG	2	6	7471	7476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586611
101	NC_012133	ATT	2	6	7542	7547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586611
102	NC_012133	TAA	2	6	7987	7992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586610
103	NC_012133	ATT	2	6	8163	8168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586610
104	NC_012133	GAA	2	6	8190	8195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586610
105	NC_012133	AAG	2	6	8201	8206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586610
106	NC_012133	TTA	2	6	8529	8534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586612
107	NC_012133	TTG	2	6	8546	8551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224586612
108	NC_012133	TAT	2	6	8553	8558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586612
109	NC_012133	TTA	2	6	8654	8659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586612
110	NC_012133	AAT	2	6	8858	8863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586578
111	NC_012133	GCA	2	6	9039	9044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224586585
112	NC_012133	GTA	2	6	9115	9120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586585
113	NC_012133	TTA	2	6	9144	9149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586585
114	NC_012133	CTT	2	6	9525	9530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224586585
115	NC_012133	AAT	2	6	9531	9536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586585
116	NC_012133	AGA	2	6	9617	9622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586585
117	NC_012133	CTG	2	6	9763	9768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224586585
118	NC_012133	TGA	2	6	9770	9775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586585
119	NC_012133	GAA	2	6	9854	9859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586585
120	NC_012133	GAA	2	6	10002	10007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586585
121	NC_012133	AGT	2	6	10187	10192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586585
122	NC_012133	TAA	2	6	10193	10198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586585
123	NC_012133	CGG	2	6	10244	10249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224586585
124	NC_012133	ATA	3	9	10261	10269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586585
125	NC_012133	TAA	2	6	10315	10320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586579
126	NC_012133	AAC	2	6	10366	10371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224586579
127	NC_012133	ATT	2	6	10456	10461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586579
128	NC_012133	TTA	2	6	10527	10532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586579
129	NC_012133	TAT	2	6	10535	10540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586579
130	NC_012133	CTT	2	6	10617	10622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224586579
131	NC_012133	AAC	2	6	10704	10709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224586579
132	NC_012133	TGA	2	6	10819	10824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586579
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135	NC_012133	CAA	2	6	11113	11118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224586586
136	NC_012133	TGG	2	6	11230	11235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224586586
137	NC_012133	CTT	2	6	11281	11286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224586586
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139	NC_012133	ATA	2	6	11474	11479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586586
140	NC_012133	AGA	2	6	11572	11577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586586
141	NC_012133	CAA	2	6	11600	11605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224586586
142	NC_012133	AAC	2	6	11746	11751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224586586
143	NC_012133	AAG	2	6	11986	11991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586588
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152	NC_012133	TAA	2	6	12457	12462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586589
153	NC_012133	TTG	2	6	12474	12479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224586589
154	NC_012133	TAA	2	6	12598	12603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586589
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159	NC_012133	ATT	2	6	12880	12885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586603
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246	NC_012133	ATA	2	6	19527	19532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586593
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250	NC_012133	ACA	2	6	20014	20019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224586593
251	NC_012133	ATG	2	6	20091	20096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586593
252	NC_012133	TAT	2	6	20222	20227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586582
253	NC_012133	TAC	2	6	20418	20423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586582
254	NC_012133	AAG	2	6	20658	20663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586582
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256	NC_012133	ATT	2	6	20720	20725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586582
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.