MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_cp26

Total Repeats: 76

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012129	AAAC	2	8	268	275	75 %	0 %	0 %	25 %	224586460
2	NC_012129	AAAT	2	8	624	631	75 %	25 %	0 %	0 %	224586461
3	NC_012129	AATA	2	8	1294	1301	75 %	25 %	0 %	0 %	224586462
4	NC_012129	CTAC	2	8	1551	1558	25 %	25 %	0 %	50 %	224586462
5	NC_012129	AATT	2	8	1690	1697	50 %	50 %	0 %	0 %	224586462
6	NC_012129	ACAA	2	8	1782	1789	75 %	0 %	0 %	25 %	224586462
7	NC_012129	TAAT	2	8	2555	2562	50 %	50 %	0 %	0 %	224586463
8	NC_012129	ATTT	2	8	3740	3747	25 %	75 %	0 %	0 %	224586463
9	NC_012129	AATG	2	8	4654	4661	50 %	25 %	25 %	0 %	224586465
10	NC_012129	GAAA	2	8	4731	4738	75 %	0 %	25 %	0 %	224586466
11	NC_012129	ATAA	2	8	5110	5117	75 %	25 %	0 %	0 %	224586466
12	NC_012129	CTTT	2	8	5213	5220	0 %	75 %	0 %	25 %	224586466
13	NC_012129	ATAA	2	8	5819	5826	75 %	25 %	0 %	0 %	224586466
14	NC_012129	GTTT	2	8	5841	5848	0 %	75 %	25 %	0 %	224586467
15	NC_012129	CTTT	2	8	6199	6206	0 %	75 %	0 %	25 %	224586467
16	NC_012129	AAAT	2	8	6854	6861	75 %	25 %	0 %	0 %	224586468
17	NC_012129	ACTA	2	8	6963	6970	50 %	25 %	0 %	25 %	224586468
18	NC_012129	ATTA	2	8	8004	8011	50 %	50 %	0 %	0 %	224586469
19	NC_012129	TACT	2	8	8052	8059	25 %	50 %	0 %	25 %	224586469
20	NC_012129	AGAA	3	12	8481	8492	75 %	0 %	25 %	0 %	224586469
21	NC_012129	ATAA	2	8	8794	8801	75 %	25 %	0 %	0 %	224586470
22	NC_012129	ATTT	2	8	8882	8889	25 %	75 %	0 %	0 %	224586470
23	NC_012129	AGAA	2	8	9120	9127	75 %	0 %	25 %	0 %	224586470
24	NC_012129	CAAG	2	8	9333	9340	50 %	0 %	25 %	25 %	224586471
25	NC_012129	TAAG	2	8	9493	9500	50 %	25 %	25 %	0 %	224586471
26	NC_012129	GAAA	2	8	9524	9531	75 %	0 %	25 %	0 %	224586471
27	NC_012129	TTCA	2	8	9555	9562	25 %	50 %	0 %	25 %	224586471
28	NC_012129	AAAT	2	8	10413	10420	75 %	25 %	0 %	0 %	224586472
29	NC_012129	ATTA	2	8	10524	10531	50 %	50 %	0 %	0 %	224586472
30	NC_012129	AAAT	2	8	10542	10549	75 %	25 %	0 %	0 %	224586472
31	NC_012129	AATT	2	8	10842	10849	50 %	50 %	0 %	0 %	224586473
32	NC_012129	TTAT	2	8	12471	12478	25 %	75 %	0 %	0 %	224586474
33	NC_012129	GAAA	2	8	13824	13831	75 %	0 %	25 %	0 %	224586474
34	NC_012129	TATT	2	8	13900	13907	25 %	75 %	0 %	0 %	224586474
35	NC_012129	ATCT	2	8	13984	13991	25 %	50 %	0 %	25 %	224586474
36	NC_012129	GTGG	2	8	14295	14302	0 %	25 %	75 %	0 %	224586475
37	NC_012129	ATTT	2	8	14344	14351	25 %	75 %	0 %	0 %	224586475
38	NC_012129	TTAT	2	8	15476	15483	25 %	75 %	0 %	0 %	224586475
39	NC_012129	TTCA	2	8	15954	15961	25 %	50 %	0 %	25 %	224586476
40	NC_012129	TTGT	2	8	16594	16601	0 %	75 %	25 %	0 %	224586476
41	NC_012129	CATT	2	8	17039	17046	25 %	50 %	0 %	25 %	224586476
42	NC_012129	TTGC	2	8	17490	17497	0 %	50 %	25 %	25 %	224586477
43	NC_012129	ACTA	2	8	17867	17874	50 %	25 %	0 %	25 %	224586477
44	NC_012129	AAGA	2	8	18000	18007	75 %	0 %	25 %	0 %	224586478
45	NC_012129	TATT	2	8	18020	18027	25 %	75 %	0 %	0 %	224586478
46	NC_012129	AAAT	2	8	18071	18078	75 %	25 %	0 %	0 %	224586478
47	NC_012129	ATTA	2	8	18343	18350	50 %	50 %	0 %	0 %	224586479
48	NC_012129	ATAA	2	8	18357	18364	75 %	25 %	0 %	0 %	224586479
49	NC_012129	AATA	2	8	18639	18646	75 %	25 %	0 %	0 %	224586479
50	NC_012129	AAAT	2	8	18894	18901	75 %	25 %	0 %	0 %	224586479
51	NC_012129	TGTT	2	8	18946	18953	0 %	75 %	25 %	0 %	224586479
52	NC_012129	TAAA	2	8	19169	19176	75 %	25 %	0 %	0 %	224586479
53	NC_012129	CCAA	2	8	19204	19211	50 %	0 %	0 %	50 %	224586479
54	NC_012129	AATA	2	8	19263	19270	75 %	25 %	0 %	0 %	224586479
55	NC_012129	ATTC	2	8	19410	19417	25 %	50 %	0 %	25 %	224586479
56	NC_012129	TGAT	2	8	19692	19699	25 %	50 %	25 %	0 %	224586479
57	NC_012129	AATA	2	8	20103	20110	75 %	25 %	0 %	0 %	224586480
58	NC_012129	AAAT	2	8	20358	20365	75 %	25 %	0 %	0 %	224586480
59	NC_012129	CTCA	2	8	20412	20419	25 %	25 %	0 %	50 %	224586480
60	NC_012129	TAAA	2	8	20633	20640	75 %	25 %	0 %	0 %	224586480
61	NC_012129	CCAA	2	8	20668	20675	50 %	0 %	0 %	50 %	224586480
62	NC_012129	ATTC	2	8	20874	20881	25 %	50 %	0 %	25 %	224586480
63	NC_012129	AATT	2	8	21567	21574	50 %	50 %	0 %	0 %	224586481
64	NC_012129	CAAT	2	8	21692	21699	50 %	25 %	0 %	25 %	224586481
65	NC_012129	AATT	2	8	21985	21992	50 %	50 %	0 %	0 %	224586482
66	NC_012129	ATTT	2	8	22751	22758	25 %	75 %	0 %	0 %	224586483
67	NC_012129	ATAA	2	8	22790	22797	75 %	25 %	0 %	0 %	224586483
68	NC_012129	ATTT	2	8	23123	23130	25 %	75 %	0 %	0 %	224586484
69	NC_012129	TAAA	2	8	23247	23254	75 %	25 %	0 %	0 %	224586484
70	NC_012129	TAAT	2	8	23268	23275	50 %	50 %	0 %	0 %	224586484
71	NC_012129	AGAA	2	8	23734	23741	75 %	0 %	25 %	0 %	224586485
72	NC_012129	CAAA	2	8	24034	24041	75 %	0 %	0 %	25 %	224586485
73	NC_012129	TACA	2	8	25560	25567	50 %	25 %	0 %	25 %	224586486
74	NC_012129	TCTT	2	8	25726	25733	0 %	75 %	0 %	25 %	224586486
75	NC_012129	ATTT	2	8	25847	25854	25 %	75 %	0 %	0 %	224586486
76	NC_012129	AAAT	2	8	26020	26027	75 %	25 %	0 %	0 %	224586486

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.