MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis AD011 chromosome

Total Repeats: 37566

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_011835	TGC	2	6	180897	180902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219682644
3502	NC_011835	CGA	2	6	180907	180912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219682644
3503	NC_011835	CGA	2	6	180928	180933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219682644
3504	NC_011835	GGC	2	6	180970	180975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219682644
3505	NC_011835	CG	3	6	181025	181030	0 %	0 %	50 %	50 %	219682644
3506	NC_011835	GCAC	2	8	181095	181102	25 %	0 %	25 %	50 %	219682644
3507	NC_011835	GCA	2	6	181118	181123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219682645
3508	NC_011835	CGC	2	6	181178	181183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219682645
3509	NC_011835	TGA	2	6	181198	181203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219682645
3510	NC_011835	GCT	2	6	181223	181228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219682645
3511	NC_011835	CCGC	2	8	181237	181244	0 %	0 %	25 %	75 %	219682645
3512	NC_011835	GCT	2	6	181256	181261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219682645
3513	NC_011835	CG	3	6	181293	181298	0 %	0 %	50 %	50 %	219682645
3514	NC_011835	TG	3	6	181304	181309	0 %	50 %	50 %	0 %	219682645
3515	NC_011835	TCG	2	6	181339	181344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219682645
3516	NC_011835	CCG	2	6	181345	181350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219682645
3517	NC_011835	TGC	2	6	181405	181410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219682645
3518	NC_011835	TGC	2	6	181429	181434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219682645
3519	NC_011835	TGG	2	6	181447	181452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219682645
3520	NC_011835	CGC	2	6	181486	181491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219682645
3521	NC_011835	TGC	2	6	181516	181521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219682645
3522	NC_011835	TTC	2	6	181563	181568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219682645
3523	NC_011835	GCT	2	6	181604	181609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219682645
3524	NC_011835	GCC	2	6	181635	181640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219682645
3525	NC_011835	TCG	2	6	181656	181661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219682645
3526	NC_011835	GCTT	2	8	181672	181679	0 %	50 %	25 %	25 %	219682645
3527	NC_011835	ATG	2	6	181728	181733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219682645
3528	NC_011835	ATC	2	6	181743	181748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219682645
3529	NC_011835	CGC	2	6	181769	181774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219682645
3530	NC_011835	GGC	2	6	181796	181801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219682645
3531	NC_011835	GCT	2	6	181817	181822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219682645
3532	NC_011835	GCT	2	6	181858	181863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219682645
3533	NC_011835	GCC	2	6	181889	181894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219682645
3534	NC_011835	GCAG	2	8	181930	181937	25 %	0 %	50 %	25 %	219682645
3535	NC_011835	GCG	2	6	181938	181943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219682645
3536	NC_011835	CCG	2	6	181969	181974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219682645
3537	NC_011835	GCA	2	6	182176	182181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219682646
3538	NC_011835	CGAG	2	8	182262	182269	25 %	0 %	50 %	25 %	219682646
3539	NC_011835	TGG	2	6	182314	182319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219682646
3540	NC_011835	GC	3	6	182341	182346	0 %	0 %	50 %	50 %	219682646
3541	NC_011835	GGA	2	6	182365	182370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219682646
3542	NC_011835	CTA	2	6	182392	182397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219682646
3543	NC_011835	GC	3	6	182419	182424	0 %	0 %	50 %	50 %	219682646
3544	NC_011835	ACT	2	6	182445	182450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219682646
3545	NC_011835	TGG	2	6	182475	182480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219682646
3546	NC_011835	GGT	2	6	182488	182493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219682646
3547	NC_011835	ACT	2	6	182508	182513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219682646
3548	NC_011835	CGG	2	6	182541	182546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219682646
3549	NC_011835	TTC	2	6	182549	182554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219682646
3550	NC_011835	TCA	2	6	182562	182567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219682646
3551	NC_011835	GCT	2	6	182569	182574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219682646
3552	NC_011835	TCA	2	6	182625	182630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219682646
3553	NC_011835	GC	3	6	182707	182712	0 %	0 %	50 %	50 %	219682646
3554	NC_011835	CGG	2	6	182740	182745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219682646
3555	NC_011835	CTT	2	6	182746	182751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219682646
3556	NC_011835	CG	4	8	182769	182776	0 %	0 %	50 %	50 %	219682646
3557	NC_011835	TCG	3	9	182811	182819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219682646
3558	NC_011835	CGG	2	6	182833	182838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219682646
3559	NC_011835	CG	3	6	182895	182900	0 %	0 %	50 %	50 %	219682646
3560	NC_011835	CAT	3	9	182953	182961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219682646
3561	NC_011835	GTG	2	6	182966	182971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219682646
3562	NC_011835	GCC	2	6	183041	183046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219682646
3563	NC_011835	TGA	2	6	183078	183083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219682646
3564	NC_011835	TCGC	2	8	183128	183135	0 %	25 %	25 %	50 %	219682646
3565	NC_011835	GCG	2	6	183180	183185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219682646
3566	NC_011835	GGCG	2	8	183193	183200	0 %	0 %	75 %	25 %	219682646
3567	NC_011835	GCC	2	6	183212	183217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219682646
3568	NC_011835	GTG	2	6	183224	183229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219682646
3569	NC_011835	CGT	2	6	183232	183237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219682646
3570	NC_011835	CGC	2	6	183295	183300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219682646
3571	NC_011835	GAT	2	6	183316	183321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219682646
3572	NC_011835	CGG	2	6	183344	183349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219682646
3573	NC_011835	TGG	2	6	183477	183482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219682646
3574	NC_011835	GTT	2	6	183550	183555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219682646
3575	NC_011835	CGC	2	6	183556	183561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219682646
3576	NC_011835	CG	3	6	183576	183581	0 %	0 %	50 %	50 %	219682646
3577	NC_011835	ATG	2	6	184232	184237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219682647
3578	NC_011835	TCC	3	9	184261	184269	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219682647
3579	NC_011835	CG	3	6	184273	184278	0 %	0 %	50 %	50 %	219682647
3580	NC_011835	CGC	2	6	184296	184301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219682647
3581	NC_011835	CGA	2	6	184302	184307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219682647
3582	NC_011835	GAC	2	6	184350	184355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219682647
3583	NC_011835	CGG	2	6	184371	184376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219682647
3584	NC_011835	GGC	2	6	184411	184416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219682647
3585	NC_011835	CTCGC	2	10	184534	184543	0 %	20 %	20 %	60 %	219682647
3586	NC_011835	GGC	2	6	184633	184638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219682647
3587	NC_011835	AGC	3	9	184640	184648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219682647
3588	NC_011835	CG	4	8	184659	184666	0 %	0 %	50 %	50 %	219682647
3589	NC_011835	GAA	2	6	184674	184679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219682647
3590	NC_011835	GCT	3	9	184686	184694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219682647
3591	NC_011835	CGA	2	6	184698	184703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219682647
3592	NC_011835	ACCG	2	8	184704	184711	25 %	0 %	25 %	50 %	219682647
3593	NC_011835	GC	3	6	184712	184717	0 %	0 %	50 %	50 %	219682647
3594	NC_011835	AGG	2	6	184736	184741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219682647
3595	NC_011835	TGC	2	6	184742	184747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219682647
3596	NC_011835	CTG	2	6	184750	184755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219682647
3597	NC_011835	G	7	7	184914	184920	0 %	0 %	100 %	0 %	219682647
3598	NC_011835	GC	4	8	185015	185022	0 %	0 %	50 %	50 %	219682648
3599	NC_011835	TCA	3	9	185094	185102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219682648
3600	NC_011835	CGA	2	6	185214	185219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219682648
3601	NC_011835	AGC	2	6	185325	185330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219682648
3602	NC_011835	GCC	2	6	185369	185374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219682648
3603	NC_011835	CACG	2	8	185446	185453	25 %	0 %	25 %	50 %	219682648
3604	NC_011835	AAG	2	6	185462	185467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219682648
3605	NC_011835	CGC	2	6	185488	185493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219682648
3606	NC_011835	GAT	2	6	185504	185509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219682648
3607	NC_011835	TCG	2	6	185529	185534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219682648
3608	NC_011835	CGC	3	9	185680	185688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219682648
3609	NC_011835	GAT	2	6	185726	185731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219682648
3610	NC_011835	ACG	2	6	185763	185768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219682648
3611	NC_011835	TGG	2	6	185844	185849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219682648
3612	NC_011835	AGG	2	6	185850	185855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219682648
3613	NC_011835	GAA	3	9	185878	185886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219682648
3614	NC_011835	GCG	2	6	185906	185911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219682648
3615	NC_011835	GAC	2	6	185945	185950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219682648
3616	NC_011835	CGGT	2	8	185988	185995	0 %	25 %	50 %	25 %	219682648
3617	NC_011835	GCC	2	6	186041	186046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219682648
3618	NC_011835	GAGG	2	8	186058	186065	25 %	0 %	75 %	0 %	219682648
3619	NC_011835	GCA	2	6	186067	186072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219682648
3620	NC_011835	AC	3	6	186081	186086	50 %	0 %	0 %	50 %	219682648
3621	NC_011835	CGC	2	6	186112	186117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219682648
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3741	NC_011835	TCA	2	6	194089	194094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219682652
3742	NC_011835	GCA	2	6	194144	194149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219682652
3743	NC_011835	CGA	2	6	194156	194161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219682652
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3745	NC_011835	CGT	2	6	194201	194206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219682652
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3853	NC_011835	GTC	2	6	198492	198497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219682654
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3981	NC_011835	GC	4	8	204683	204690	0 %	0 %	50 %	50 %	219682660
3982	NC_011835	GGA	2	6	204706	204711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219682660
3983	NC_011835	GGA	2	6	204715	204720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219682660
3984	NC_011835	GCA	2	6	204810	204815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219682661
3985	NC_011835	CAG	2	6	204829	204834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219682661
3986	NC_011835	AGT	2	6	204873	204878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219682661
3987	NC_011835	TGA	2	6	204957	204962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219682661
3988	NC_011835	GAA	2	6	205078	205083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219682661
3989	NC_011835	ACC	2	6	205104	205109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219682661
3990	NC_011835	CCA	2	6	205110	205115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219682661
3991	NC_011835	CAC	2	6	205135	205140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219682661
3992	NC_011835	GCA	2	6	205188	205193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219682661
3993	NC_011835	ACC	2	6	205298	205303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219682661
3994	NC_011835	AGC	3	9	205304	205312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219682661
3995	NC_011835	GC	3	6	205311	205316	0 %	0 %	50 %	50 %	219682661
3996	NC_011835	GGAA	2	8	205328	205335	50 %	0 %	50 %	0 %	219682661
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3999	NC_011835	TGTT	2	8	205583	205590	0 %	75 %	25 %	0 %	219682661
4000	NC_011835	GAG	2	6	205625	205630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219682661

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