MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Buchnera aphidicola str. Tuc7 (Acyrthosiphon pisum) chromosome

Total Repeats: 324

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011834	ATATTA	2	12	2717	2728	50 %	50 %	0 %	0 %	219681947
2	NC_011834	TTTTAT	2	12	3039	3050	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	219681947
3	NC_011834	GGAATT	2	12	3217	3228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219681948
4	NC_011834	AAAACA	2	12	5822	5833	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	219681951
5	NC_011834	CATCAG	2	12	9822	9833	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	219681955
6	NC_011834	ACTGAA	2	12	11111	11122	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	219681955
7	NC_011834	TAAAAA	2	12	11530	11541	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	219681956
8	NC_011834	GCCATT	2	12	12723	12734	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	219681957
9	NC_011834	TGAACG	2	12	12752	12763	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	219681957
10	NC_011834	TGAATA	2	12	15548	15559	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	219681959
11	NC_011834	ATTAAT	2	12	17187	17198	50 %	50 %	0 %	0 %	219681960
12	NC_011834	ATAAAA	2	12	25686	25697	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	219681968
13	NC_011834	AATGAT	2	12	30153	30164	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	219681971
14	NC_011834	AGAAAA	2	12	32963	32974	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	219681972
15	NC_011834	TTTTTG	2	12	34928	34939	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	219681973
16	NC_011834	ACATAT	2	12	40968	40979	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	219681976
17	NC_011834	CTACTG	2	12	42534	42545	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	219681976
18	NC_011834	ATTTCG	2	12	44892	44903	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	219681977
19	NC_011834	AGAAAC	2	12	47314	47325	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	219681981
20	NC_011834	TCATTT	2	12	47577	47588	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	219681981
21	NC_011834	TATAGA	2	12	48117	48128	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	219681982
22	NC_011834	GTTTTT	2	12	49179	49190	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	219681983
23	NC_011834	CAATTT	2	12	51390	51401	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	219681985
24	NC_011834	ATCTTT	2	12	55549	55560	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	219681989
25	NC_011834	ATTTTT	2	12	60076	60087	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	219681993
26	NC_011834	ATCTGT	2	12	60565	60576	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	219681993
27	NC_011834	TTCAAA	2	12	65474	65485	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	219681998
28	NC_011834	TAAAGA	2	12	66343	66354	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	219681999
29	NC_011834	TAATTT	2	12	67312	67323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219681999
30	NC_011834	ATTTCC	2	12	72112	72123	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	219682004
31	NC_011834	TTAAAA	2	12	72915	72926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219682005
32	NC_011834	TACTAT	2	12	73568	73579	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	219682005
33	NC_011834	AAATCA	2	12	75187	75198	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	219682006
34	NC_011834	GATATG	2	12	75350	75361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219682006
35	NC_011834	ATAGAA	2	12	76599	76610	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	219682007
36	NC_011834	TGATTT	2	12	76692	76703	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	219682007
37	NC_011834	GAAAAA	2	12	79485	79496	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	219682009
38	NC_011834	TATTGA	2	12	81464	81475	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	219682011
39	NC_011834	TAATAT	2	12	82653	82664	50 %	50 %	0 %	0 %	219682013
40	NC_011834	ATTTCT	2	12	83194	83205	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	219682013
41	NC_011834	TTTTAA	2	12	83943	83954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219682014
42	NC_011834	AATAAA	2	12	84553	84564	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	219682015
43	NC_011834	TAAAAA	2	12	85638	85649	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	219682016
44	NC_011834	ATGTTA	2	12	86915	86926	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	219682018
45	NC_011834	ATTTTT	2	12	87305	87316	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	219682019
46	NC_011834	ATTTTA	2	12	89388	89399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219682021
47	NC_011834	AAAATT	2	12	90088	90099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219682021
48	NC_011834	TTTTTC	2	12	90950	90961	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	219682022
49	NC_011834	TGAAAA	2	12	92416	92427	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	219682023
50	NC_011834	AACATT	2	12	99139	99150	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	219682027
51	NC_011834	TTATTT	2	12	102079	102090	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	219682029
52	NC_011834	CATGGT	2	12	103692	103703	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	219682030
53	NC_011834	ATAGTA	2	12	108559	108570	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	219682035
54	NC_011834	TTGATG	2	12	109895	109906	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	219682037
55	NC_011834	ATTTAT	2	12	114287	114298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219682041
56	NC_011834	TAAAAA	2	12	121891	121902	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	219682048
57	NC_011834	TGTTCT	2	12	122919	122930	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	219682049
58	NC_011834	ATTTTA	2	12	124340	124351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219682051
59	NC_011834	TTTTTC	2	12	125437	125448	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	219682051
60	NC_011834	AAAGAA	2	12	126204	126215	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	219682052
61	NC_011834	TTTTTA	2	12	126927	126938	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	219682052
62	NC_011834	TCTTTT	2	12	127409	127420	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	219682053
63	NC_011834	AATGAT	2	12	132930	132941	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	219682057
64	NC_011834	TTAAAT	2	12	133844	133855	50 %	50 %	0 %	0 %	219682060
65	NC_011834	TGAATA	2	12	135888	135899	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	219682061
66	NC_011834	ATTTTC	2	12	138480	138491	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	219682063
67	NC_011834	TAAAAA	2	12	139223	139234	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	219682064
68	NC_011834	ATTCAT	2	12	139891	139902	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	219682065
69	NC_011834	TTTTTA	2	12	140363	140374	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	219682066
70	NC_011834	ATAAAA	2	12	141382	141393	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	219682066
71	NC_011834	TTTTAT	2	12	141693	141704	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	219682066
72	NC_011834	TTAAAT	2	12	142338	142349	50 %	50 %	0 %	0 %	219682067
73	NC_011834	CTTTTT	2	12	143983	143994	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	219682068
74	NC_011834	TAAAGT	2	12	144990	145001	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	219682069
75	NC_011834	CATCAA	2	12	150677	150688	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	219682075
76	NC_011834	CTAAAT	2	12	153663	153674	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	219682076
77	NC_011834	ATTAGA	2	12	155445	155456	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	219682078
78	NC_011834	GAATAA	2	12	156610	156621	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	219682079
79	NC_011834	ATTTAA	2	12	158850	158861	50 %	50 %	0 %	0 %	219682080
80	NC_011834	GAATTT	2	12	161709	161720	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	219682083
81	NC_011834	TTTCCT	2	12	163593	163604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219682084
82	NC_011834	TTATTT	2	12	172212	172223	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	219682091
83	NC_011834	TTTTTA	2	12	174589	174600	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	219682095
84	NC_011834	ATTTTA	2	12	176837	176848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219682096
85	NC_011834	TTTAAT	2	12	177456	177467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219682096
86	NC_011834	CTGGAA	2	12	177680	177691	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	219682096
87	NC_011834	AAAGAT	2	12	181578	181589	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	219682098
88	NC_011834	ATATAA	2	12	181827	181838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219682098
89	NC_011834	AGTGAA	2	12	185023	185034	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	219682101
90	NC_011834	ATAGAA	2	12	185483	185494	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	219682101
91	NC_011834	AAAAGA	2	12	185867	185878	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	219682102
92	NC_011834	GTCTTT	2	12	185885	185896	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	219682102
93	NC_011834	GCTTTA	2	12	186021	186032	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	219682102
94	NC_011834	AAATTC	2	12	187408	187419	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	219682103
95	NC_011834	TTTATT	2	12	188468	188479	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	219682105
96	NC_011834	AAACAA	2	12	190203	190214	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	219682106
97	NC_011834	ATTAAA	2	12	190528	190539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219682106
98	NC_011834	TCTATT	2	12	190580	190591	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	219682106
99	NC_011834	AACTTT	2	12	190637	190648	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	219682106
100	NC_011834	ATTAAT	2	12	191273	191284	50 %	50 %	0 %	0 %	219682106
101	NC_011834	ATTTTT	2	12	194361	194372	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	219682109
102	NC_011834	TTAATT	2	12	195964	195975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219682110
103	NC_011834	ATTAAT	2	12	196914	196925	50 %	50 %	0 %	0 %	219682110
104	NC_011834	TTTTCC	2	12	197370	197381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219682110
105	NC_011834	TGACAA	2	12	199048	199059	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	219682111
106	NC_011834	GTTTTA	2	12	201039	201050	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	219682114
107	NC_011834	GTATTG	2	12	201304	201315	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	219682115
108	NC_011834	TTTTCT	2	12	201792	201803	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	219682115
109	NC_011834	ATAGAA	2	12	204793	204804	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	219682119
110	NC_011834	ATTGGT	2	12	205685	205696	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	219682120
111	NC_011834	AGATAT	2	12	206237	206248	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	219682121
112	NC_011834	CATTCG	2	12	207489	207500	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	219682122
113	NC_011834	ATTTTT	2	12	208055	208066	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	219682122
114	NC_011834	CCTAAT	2	12	208253	208264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219682122
115	NC_011834	TTTTAA	2	12	209558	209569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219682124
116	NC_011834	TTGTTT	2	12	210260	210271	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	219682124
117	NC_011834	CCTATT	2	12	210306	210317	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	219682124
118	NC_011834	TTTATA	2	12	212523	212534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219682125
119	NC_011834	ATTAAT	2	12	214198	214209	50 %	50 %	0 %	0 %	219682127
120	NC_011834	CTAATC	2	12	217208	217219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219682130
121	NC_011834	TTTTAT	2	12	217244	217255	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	219682130
122	NC_011834	GAAAAA	2	12	220097	220108	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	219682131
123	NC_011834	TTTTAT	2	12	221908	221919	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	219682133
124	NC_011834	TGGAAA	2	12	224660	224671	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	219682135
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.