MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi ZS7 plasmid ZS7_lp28-2

Total Repeats: 70

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011779	GTTT	2	8	168	175	0 %	75 %	25 %	0 %	218868770
2	NC_011779	TAAT	2	8	375	382	50 %	50 %	0 %	0 %	218868770
3	NC_011779	AATT	2	8	573	580	50 %	50 %	0 %	0 %	218868770
4	NC_011779	TGAT	2	8	771	778	25 %	50 %	25 %	0 %	218868770
5	NC_011779	CTTT	2	8	807	814	0 %	75 %	0 %	25 %	218868770
6	NC_011779	ATCA	2	8	4634	4641	50 %	25 %	0 %	25 %	218868794
7	NC_011779	AAGA	3	12	4770	4781	75 %	0 %	25 %	0 %	218868794
8	NC_011779	GAAA	2	8	5171	5178	75 %	0 %	25 %	0 %	218868794
9	NC_011779	AAAT	2	8	5308	5315	75 %	25 %	0 %	0 %	218868794
10	NC_011779	AATC	2	8	5612	5619	50 %	25 %	0 %	25 %	218868786
11	NC_011779	ATTT	2	8	5637	5644	25 %	75 %	0 %	0 %	218868786
12	NC_011779	AATT	2	8	6146	6153	50 %	50 %	0 %	0 %	218868777
13	NC_011779	TTTA	2	8	7121	7128	25 %	75 %	0 %	0 %	218868797
14	NC_011779	CTAA	2	8	7575	7582	50 %	25 %	0 %	25 %	218868773
15	NC_011779	TTCG	2	8	7984	7991	0 %	50 %	25 %	25 %	218868773
16	NC_011779	GTTT	2	8	8008	8015	0 %	75 %	25 %	0 %	218868773
17	NC_011779	CAAA	2	8	8361	8368	75 %	0 %	0 %	25 %	218868773
18	NC_011779	CTTT	2	8	8793	8800	0 %	75 %	0 %	25 %	218868773
19	NC_011779	GATC	2	8	8874	8881	25 %	25 %	25 %	25 %	218868773
20	NC_011779	CTTT	2	8	9081	9088	0 %	75 %	0 %	25 %	218868773
21	NC_011779	TTTA	2	8	9959	9966	25 %	75 %	0 %	0 %	218868773
22	NC_011779	TCGC	2	8	9990	9997	0 %	25 %	25 %	50 %	218868773
23	NC_011779	TTTG	2	8	10493	10500	0 %	75 %	25 %	0 %	218868773
24	NC_011779	GTTC	2	8	10866	10873	0 %	50 %	25 %	25 %	218868772
25	NC_011779	AAAC	2	8	10881	10888	75 %	0 %	0 %	25 %	218868772
26	NC_011779	AATT	2	8	11150	11157	50 %	50 %	0 %	0 %	218868787
27	NC_011779	ATTA	2	8	11523	11530	50 %	50 %	0 %	0 %	218868787
28	NC_011779	AATC	2	8	12140	12147	50 %	25 %	0 %	25 %	218868781
29	NC_011779	AAGT	2	8	12740	12747	50 %	25 %	25 %	0 %	218868780
30	NC_011779	AATT	2	8	13022	13029	50 %	50 %	0 %	0 %	218868782
31	NC_011779	AAAG	2	8	13211	13218	75 %	0 %	25 %	0 %	218868782
32	NC_011779	TAAA	2	8	13320	13327	75 %	25 %	0 %	0 %	218868791
33	NC_011779	TTTG	2	8	13429	13436	0 %	75 %	25 %	0 %	218868791
34	NC_011779	AACA	2	8	13692	13699	75 %	0 %	0 %	25 %	218868774
35	NC_011779	ATCT	2	8	14949	14956	25 %	50 %	0 %	25 %	218868784
36	NC_011779	ATTT	2	8	15457	15464	25 %	75 %	0 %	0 %	218868784
37	NC_011779	TTTC	2	8	15562	15569	0 %	75 %	0 %	25 %	218868778
38	NC_011779	CTTA	2	8	15572	15579	25 %	50 %	0 %	25 %	218868778
39	NC_011779	TGAA	2	8	15830	15837	50 %	25 %	25 %	0 %	218868778
40	NC_011779	GTTT	2	8	16689	16696	0 %	75 %	25 %	0 %	218868779
41	NC_011779	GCAA	2	8	16757	16764	50 %	0 %	25 %	25 %	218868779
42	NC_011779	ATTG	2	8	17531	17538	25 %	50 %	25 %	0 %	218868779
43	NC_011779	TTTC	2	8	17597	17604	0 %	75 %	0 %	25 %	218868779
44	NC_011779	AAAG	2	8	18004	18011	75 %	0 %	25 %	0 %	218868793
45	NC_011779	AATA	2	8	18158	18165	75 %	25 %	0 %	0 %	218868775
46	NC_011779	AATT	2	8	18297	18304	50 %	50 %	0 %	0 %	218868775
47	NC_011779	TTTG	2	8	18508	18515	0 %	75 %	25 %	0 %	218868775
48	NC_011779	TACC	2	8	18877	18884	25 %	25 %	0 %	50 %	218868789
49	NC_011779	TTCC	2	8	19344	19351	0 %	50 %	0 %	50 %	218868789
50	NC_011779	ATTG	2	8	21388	21395	25 %	50 %	25 %	0 %	218868792
51	NC_011779	TGCT	2	8	22056	22063	0 %	50 %	25 %	25 %	218868792
52	NC_011779	TTGT	2	8	22590	22597	0 %	75 %	25 %	0 %	218868783
53	NC_011779	GGTT	2	8	22601	22608	0 %	50 %	50 %	0 %	218868783
54	NC_011779	AAGA	2	8	22636	22643	75 %	0 %	25 %	0 %	218868783
55	NC_011779	TTAC	2	8	23440	23447	25 %	50 %	0 %	25 %	218868785
56	NC_011779	AATC	2	8	23465	23472	50 %	25 %	0 %	25 %	218868785
57	NC_011779	AATA	2	8	23529	23536	75 %	25 %	0 %	0 %	218868785
58	NC_011779	AGAT	2	8	24085	24092	50 %	25 %	25 %	0 %	218868790
59	NC_011779	ATTT	2	8	24125	24132	25 %	75 %	0 %	0 %	218868790
60	NC_011779	TGAT	2	8	24719	24726	25 %	50 %	25 %	0 %	218868769
61	NC_011779	GGAA	2	8	25661	25668	50 %	0 %	50 %	0 %	218868769
62	NC_011779	GATA	2	8	27038	27045	50 %	25 %	25 %	0 %	218868799
63	NC_011779	ATCA	2	8	27048	27055	50 %	25 %	0 %	25 %	218868799
64	NC_011779	TAAA	2	8	27460	27467	75 %	25 %	0 %	0 %	218868796
65	NC_011779	ACAT	2	8	27547	27554	50 %	25 %	0 %	25 %	218868796
66	NC_011779	ATTA	2	8	28796	28803	50 %	50 %	0 %	0 %	218868795
67	NC_011779	TTGA	2	8	29053	29060	25 %	50 %	25 %	0 %	218868798
68	NC_011779	TAAT	2	8	29261	29268	50 %	50 %	0 %	0 %	218868798
69	NC_011779	ATTC	2	8	29532	29539	25 %	50 %	0 %	25 %	218868798
70	NC_011779	ATTT	2	8	29542	29549	25 %	75 %	0 %	0 %	218868798

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.