MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi ZS7 plasmid ZS7_lp36

Total Repeats: 220

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011778	ATT	2	6	5290	5295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868691
2	NC_011778	TGC	2	6	5317	5322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218868691
3	NC_011778	GTC	2	6	5377	5382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218868691
4	NC_011778	TAC	2	6	5472	5477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218868691
5	NC_011778	TTC	2	6	5630	5635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218868691
6	NC_011778	TGA	2	6	5710	5715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218868691
7	NC_011778	GAG	2	6	5739	5744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218868691
8	NC_011778	ATC	2	6	5818	5823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218868691
9	NC_011778	TCA	2	6	5963	5968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218868691
10	NC_011778	ATT	2	6	5999	6004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868691
11	NC_011778	AGT	2	6	6005	6010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218868691
12	NC_011778	AAT	2	6	6454	6459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868686
13	NC_011778	ATA	2	6	8171	8176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868684
14	NC_011778	GAA	2	6	8248	8253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218868684
15	NC_011778	CTG	2	6	8461	8466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218868684
16	NC_011778	ATT	2	6	8636	8641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868684
17	NC_011778	TTA	2	6	8646	8651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868684
18	NC_011778	AGA	2	6	8699	8704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218868684
19	NC_011778	TGA	2	6	8798	8803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218868684
20	NC_011778	TAA	2	6	10341	10346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868679
21	NC_011778	TGC	2	6	10430	10435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218868679
22	NC_011778	TAG	2	6	10502	10507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218868679
23	NC_011778	CTT	2	6	10634	10639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218868679
24	NC_011778	TGA	2	6	10709	10714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218868679
25	NC_011778	GAT	2	6	10720	10725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218868679
26	NC_011778	TAA	2	6	10815	10820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868679
27	NC_011778	GTT	2	6	10822	10827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218868679
28	NC_011778	AGA	2	6	10914	10919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218868679
29	NC_011778	TGA	2	6	11052	11057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218868679
30	NC_011778	GTT	2	6	11193	11198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218868679
31	NC_011778	CTG	2	6	11213	11218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218868679
32	NC_011778	ATG	2	6	11291	11296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218868679
33	NC_011778	TAA	2	6	11315	11320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868679
34	NC_011778	GAT	2	6	11394	11399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218868679
35	NC_011778	ATT	2	6	11428	11433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868679
36	NC_011778	TAA	2	6	11516	11521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868679
37	NC_011778	CAT	2	6	11622	11627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218868679
38	NC_011778	TTG	2	6	11630	11635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218868679
39	NC_011778	ATG	2	6	11642	11647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218868679
40	NC_011778	ATC	2	6	11674	11679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218868679
41	NC_011778	TAA	2	6	11723	11728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868679
42	NC_011778	TGA	2	6	11835	11840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218868679
43	NC_011778	GGT	2	6	11874	11879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218868679
44	NC_011778	ATT	2	6	11939	11944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868679
45	NC_011778	TAT	2	6	12612	12617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868669
46	NC_011778	TAA	2	6	12819	12824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868669
47	NC_011778	AGA	2	6	12853	12858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218868669
48	NC_011778	CTT	2	6	12880	12885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218868669
49	NC_011778	AAT	3	9	12922	12930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868669
50	NC_011778	TTA	2	6	12970	12975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868669
51	NC_011778	ATA	2	6	12986	12991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868669
52	NC_011778	GCG	2	6	13076	13081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218868669
53	NC_011778	GAT	2	6	13099	13104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218868669
54	NC_011778	GAA	2	6	13180	13185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218868669
55	NC_011778	GAA	2	6	13189	13194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218868669
56	NC_011778	AGA	3	9	13197	13205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218868669
57	NC_011778	TAA	2	6	13613	13618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868683
58	NC_011778	AAG	2	6	13629	13634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218868683
59	NC_011778	CTT	2	6	13722	13727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218868683
60	NC_011778	TAA	2	6	13755	13760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868683
61	NC_011778	ATT	2	6	13813	13818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868683
62	NC_011778	CTA	2	6	13925	13930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218868683
63	NC_011778	TAT	2	6	13942	13947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868683
64	NC_011778	AAT	2	6	13999	14004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868683
65	NC_011778	ATC	2	6	14020	14025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218868683
66	NC_011778	TTA	2	6	14162	14167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868683
67	NC_011778	AAG	2	6	14172	14177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218868683
68	NC_011778	CTC	2	6	14274	14279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218868683
69	NC_011778	TAT	2	6	14537	14542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868673
70	NC_011778	GAA	2	6	14634	14639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218868673
71	NC_011778	TTA	2	6	14656	14661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868673
72	NC_011778	CTA	2	6	14752	14757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218868673
73	NC_011778	TTC	2	6	14763	14768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218868673
74	NC_011778	ATT	2	6	14875	14880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868689
75	NC_011778	TAG	2	6	14934	14939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218868689
76	NC_011778	AAT	2	6	15087	15092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868689
77	NC_011778	TAA	2	6	15112	15117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868689
78	NC_011778	TTA	2	6	15203	15208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868689
79	NC_011778	TAT	2	6	15228	15233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868689
80	NC_011778	TGA	3	9	15560	15568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218868689
81	NC_011778	ATA	2	6	15656	15661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868689
82	NC_011778	ATT	2	6	15668	15673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868689
83	NC_011778	TTA	2	6	15704	15709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868689
84	NC_011778	ATA	2	6	16365	16370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868678
85	NC_011778	TAA	2	6	16386	16391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868678
86	NC_011778	GAT	2	6	16433	16438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218868678
87	NC_011778	ATG	2	6	16503	16508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218868678
88	NC_011778	AAG	2	6	16689	16694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218868678
89	NC_011778	TAA	2	6	16737	16742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868678
90	NC_011778	TTA	2	6	17395	17400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868670
91	NC_011778	GTT	2	6	17406	17411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218868670
92	NC_011778	AGA	2	6	17486	17491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218868670
93	NC_011778	TAA	2	6	20646	20651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868672
94	NC_011778	GAA	2	6	20686	20691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218868672
95	NC_011778	ATT	2	6	20706	20711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868672
96	NC_011778	ACA	2	6	20751	20756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218868672
97	NC_011778	GTG	2	6	20810	20815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218868672
98	NC_011778	GGA	2	6	20820	20825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218868672
99	NC_011778	TGA	2	6	20925	20930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218868672
100	NC_011778	TAT	2	6	20956	20961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868672
101	NC_011778	ATG	2	6	20972	20977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218868672
102	NC_011778	CAA	2	6	21092	21097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218868672
103	NC_011778	AGA	2	6	21153	21158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218868672
104	NC_011778	AGA	2	6	21177	21182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218868672
105	NC_011778	TTA	2	6	21205	21210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868672
106	NC_011778	GCA	2	6	21238	21243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218868672
107	NC_011778	TTA	2	6	21379	21384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868672
108	NC_011778	AAG	2	6	21401	21406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218868672
109	NC_011778	TCA	2	6	21789	21794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218868687
110	NC_011778	ATT	2	6	23068	23073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868680
111	NC_011778	ATT	2	6	23119	23124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868680
112	NC_011778	CTT	2	6	23140	23145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218868680
113	NC_011778	AAT	2	6	23174	23179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868680
114	NC_011778	TGT	2	6	23190	23195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218868680
115	NC_011778	CAT	2	6	23235	23240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218868680
116	NC_011778	ACT	2	6	23329	23334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218868680
117	NC_011778	TTA	2	6	23387	23392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868680
118	NC_011778	AGT	2	6	23401	23406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218868680
119	NC_011778	CTT	2	6	23412	23417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218868680
120	NC_011778	TAA	2	6	23499	23504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218868680
121	NC_011778	TTA	2	6	23561	23566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868680
122	NC_011778	GAG	2	6	23574	23579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218868680
123	NC_011778	CTA	2	6	23585	23590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218868680
124	NC_011778	TTA	2	6	23591	23596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218868680
125	NC_011778	CAG	2	6	23934	23939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218868688
126	NC_011778	TGT	2	6	23983	23988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218868688
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.