MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi ZS7 plasmid ZS7_cp32-4

Total Repeats: 374

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011736	AGA	2	6	1326	1331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442415
2	NC_011736	AGA	2	6	1350	1355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442415
3	NC_011736	ATT	2	6	1530	1535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442415
4	NC_011736	TGC	2	6	1610	1615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442415
5	NC_011736	TTC	3	9	1809	1817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442415
6	NC_011736	ATT	2	6	1840	1845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442415
7	NC_011736	CAA	2	6	2086	2091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442407
8	NC_011736	TGG	2	6	2154	2159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218442407
9	NC_011736	AAC	2	6	2250	2255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442407
10	NC_011736	TGG	3	9	2274	2282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218442407
11	NC_011736	TAA	2	6	2566	2571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442407
12	NC_011736	GCT	2	6	2656	2661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442398
13	NC_011736	GAT	2	6	2740	2745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442398
14	NC_011736	AGT	2	6	2815	2820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442398
15	NC_011736	TTA	2	6	3137	3142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442398
16	NC_011736	CCA	2	6	3160	3165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218442398
17	NC_011736	TGG	2	6	3330	3335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218442398
18	NC_011736	AAG	2	6	3410	3415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442427
19	NC_011736	ATC	2	6	3550	3555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442427
20	NC_011736	TGG	2	6	3647	3652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218442427
21	NC_011736	CTA	2	6	3706	3711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442427
22	NC_011736	AAT	2	6	3726	3731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442427
23	NC_011736	TAG	2	6	3745	3750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442427
24	NC_011736	TAA	2	6	3791	3796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442427
25	NC_011736	TAA	2	6	3939	3944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442427
26	NC_011736	ATT	2	6	3968	3973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442417
27	NC_011736	TGA	2	6	3974	3979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442417
28	NC_011736	ATT	2	6	3982	3987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442417
29	NC_011736	TAT	2	6	4031	4036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442417
30	NC_011736	ACA	2	6	4134	4139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442417
31	NC_011736	ATT	2	6	4201	4206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442417
32	NC_011736	TAA	3	9	4286	4294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442417
33	NC_011736	AGT	2	6	4329	4334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442417
34	NC_011736	TTA	2	6	4348	4353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442417
35	NC_011736	ACT	2	6	4433	4438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442417
36	NC_011736	AGA	2	6	4460	4465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442417
37	NC_011736	CGA	2	6	4544	4549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442417
38	NC_011736	GAT	2	6	4562	4567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442417
39	NC_011736	GCA	3	9	4614	4622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442417
40	NC_011736	AGT	2	6	4635	4640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442417
41	NC_011736	TAA	2	6	4685	4690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442417
42	NC_011736	AGA	2	6	4694	4699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442417
43	NC_011736	TTA	2	6	4765	4770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442417
44	NC_011736	GGT	2	6	4866	4871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218442417
45	NC_011736	CTA	2	6	4879	4884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442417
46	NC_011736	GAA	3	9	4981	4989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442425
47	NC_011736	GTT	2	6	5194	5199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442425
48	NC_011736	ATT	2	6	5255	5260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442425
49	NC_011736	TAG	2	6	5265	5270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442425
50	NC_011736	GAA	2	6	5281	5286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442425
51	NC_011736	GGC	2	6	5287	5292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218442425
52	NC_011736	TGT	2	6	5489	5494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442404
53	NC_011736	TTC	2	6	5510	5515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442404
54	NC_011736	TTA	2	6	5563	5568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442404
55	NC_011736	TGG	2	6	5812	5817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218442396
56	NC_011736	AAT	2	6	5921	5926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442396
57	NC_011736	TAT	2	6	6015	6020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442396
58	NC_011736	GTA	2	6	6078	6083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442396
59	NC_011736	GCA	2	6	6089	6094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442396
60	NC_011736	TTG	2	6	6102	6107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442396
61	NC_011736	AAT	2	6	6229	6234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442433
62	NC_011736	ATC	2	6	6263	6268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442433
63	NC_011736	GCT	2	6	6289	6294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442433
64	NC_011736	ATA	2	6	6304	6309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442433
65	NC_011736	TTA	2	6	6602	6607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442433
66	NC_011736	AGG	2	6	6689	6694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218442433
67	NC_011736	TAG	2	6	6754	6759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442406
68	NC_011736	ATT	2	6	6765	6770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442406
69	NC_011736	TAA	2	6	6811	6816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442406
70	NC_011736	TGC	2	6	6820	6825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442406
71	NC_011736	TAA	2	6	6853	6858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442406
72	NC_011736	GAA	2	6	6971	6976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442406
73	NC_011736	TGT	2	6	7060	7065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442406
74	NC_011736	TTA	2	6	7068	7073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442406
75	NC_011736	GAT	2	6	7094	7099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442406
76	NC_011736	GAT	2	6	7118	7123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442406
77	NC_011736	AAT	2	6	7244	7249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442406
78	NC_011736	TTG	2	6	7350	7355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442406
79	NC_011736	CTT	2	6	7406	7411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218442406
80	NC_011736	AAG	2	6	7446	7451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442406
81	NC_011736	ATT	2	6	7517	7522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442406
82	NC_011736	TTA	2	6	7527	7532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442406
83	NC_011736	TTA	2	6	7656	7661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442406
84	NC_011736	TAC	2	6	7771	7776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442406
85	NC_011736	TGG	2	6	7869	7874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218442424
86	NC_011736	CAA	2	6	7919	7924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442424
87	NC_011736	TAG	2	6	7935	7940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442424
88	NC_011736	TAA	2	6	7961	7966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442424
89	NC_011736	TGA	2	6	8055	8060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442424
90	NC_011736	ACA	2	6	8069	8074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442424
91	NC_011736	ATT	2	6	8137	8142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442424
92	NC_011736	AAG	2	6	8175	8180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442424
93	NC_011736	CTG	2	6	8186	8191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442424
94	NC_011736	AAC	2	6	8248	8253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442424
95	NC_011736	TTA	2	6	8270	8275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442426
96	NC_011736	TTA	2	6	8505	8510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442426
97	NC_011736	TTG	2	6	8522	8527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442426
98	NC_011736	AAT	2	6	8529	8534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442426
99	NC_011736	AAT	2	6	8614	8619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442426
100	NC_011736	TCA	2	6	8689	8694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442426
101	NC_011736	ATG	3	9	8860	8868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442405
102	NC_011736	AAG	2	6	8871	8876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442405
103	NC_011736	TGC	2	6	9015	9020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218442413
104	NC_011736	TTG	2	6	9371	9376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442413
105	NC_011736	GGC	2	6	9436	9441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218442413
106	NC_011736	ACA	2	6	9510	9515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442413
107	NC_011736	ATA	2	6	9551	9556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442413
108	NC_011736	AGA	2	6	9606	9611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442413
109	NC_011736	CAA	2	6	9695	9700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442413
110	NC_011736	AGC	2	6	9705	9710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218442413
111	NC_011736	GTG	2	6	9749	9754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218442413
112	NC_011736	ATT	2	6	9803	9808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442413
113	NC_011736	ACT	2	6	9867	9872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442413
114	NC_011736	TAA	2	6	9923	9928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442413
115	NC_011736	AAT	2	6	9948	9953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442413
116	NC_011736	GAT	2	6	9985	9990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442413
117	NC_011736	TAA	2	6	10026	10031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442413
118	NC_011736	TTA	2	6	10046	10051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442413
119	NC_011736	GGT	2	6	10198	10203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218442413
120	NC_011736	TGA	2	6	10263	10268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442413
121	NC_011736	TAT	2	6	10365	10370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442421
122	NC_011736	AAT	3	9	10372	10380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442421
123	NC_011736	AAT	2	6	10449	10454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442421
124	NC_011736	TAA	2	6	10463	10468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442421
125	NC_011736	GTT	2	6	10607	10612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218442421
126	NC_011736	ATT	2	6	10631	10636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218442421
127	NC_011736	AAC	2	6	10802	10807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218442421
128	NC_011736	TGA	2	6	10917	10922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218442421
129	NC_011736	TAC	2	6	10997	11002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218442402
130	NC_011736	GAA	2	6	11080	11085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218442402
131	NC_011736	TAA	2	6	11099	11104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218442402
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.