MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi ZS7 plasmid ZS7_cp32-9

Total Repeats: 67

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011722	AGCA	2	8	1427	1434	50 %	0 %	25 %	25 %	218203924
2	NC_011722	TTGC	2	8	1615	1622	0 %	50 %	25 %	25 %	218203924
3	NC_011722	GTTC	2	8	1680	1687	0 %	50 %	25 %	25 %	218203924
4	NC_011722	TGCT	2	8	2536	2543	0 %	50 %	25 %	25 %	218203898
5	NC_011722	CAAG	2	8	2685	2692	50 %	0 %	25 %	25 %	218203929
6	NC_011722	ATGT	2	8	3022	3029	25 %	50 %	25 %	0 %	218203929
7	NC_011722	GTAT	2	8	3047	3054	25 %	50 %	25 %	0 %	218203929
8	NC_011722	ATAA	2	8	3129	3136	75 %	25 %	0 %	0 %	218203929
9	NC_011722	CAAT	2	8	3211	3218	50 %	25 %	0 %	25 %	218203929
10	NC_011722	TTTA	2	8	3902	3909	25 %	75 %	0 %	0 %	218203907
11	NC_011722	GTAA	2	8	3940	3947	50 %	25 %	25 %	0 %	218203907
12	NC_011722	CTTT	2	8	4316	4323	0 %	75 %	0 %	25 %	218203914
13	NC_011722	TTAT	2	8	4754	4761	25 %	75 %	0 %	0 %	218203914
14	NC_011722	TCAT	2	8	4854	4861	25 %	50 %	0 %	25 %	218203914
15	NC_011722	TTAC	2	8	5162	5169	25 %	50 %	0 %	25 %	218203925
16	NC_011722	AATG	2	8	5409	5416	50 %	25 %	25 %	0 %	218203925
17	NC_011722	AAGT	2	8	6074	6081	50 %	25 %	25 %	0 %	218203923
18	NC_011722	CTTG	2	8	8810	8817	0 %	50 %	25 %	25 %	218203917
19	NC_011722	AATT	2	8	8956	8963	50 %	50 %	0 %	0 %	218203917
20	NC_011722	AACG	2	8	9541	9548	50 %	0 %	25 %	25 %	218203910
21	NC_011722	CAAG	2	8	9646	9653	50 %	0 %	25 %	25 %	218203910
22	NC_011722	TAAT	2	8	10124	10131	50 %	50 %	0 %	0 %	218203910
23	NC_011722	TGGA	2	8	10191	10198	25 %	25 %	50 %	0 %	218203910
24	NC_011722	AGAA	2	8	10422	10429	75 %	0 %	25 %	0 %	218203931
25	NC_011722	CTTT	2	8	10733	10740	0 %	75 %	0 %	25 %	218203931
26	NC_011722	AGTT	2	8	10927	10934	25 %	50 %	25 %	0 %	218203931
27	NC_011722	GGCA	2	8	11398	11405	25 %	0 %	50 %	25 %	218203903
28	NC_011722	TAAT	2	8	13038	13045	50 %	50 %	0 %	0 %	218203922
29	NC_011722	CCTA	2	8	15144	15151	25 %	25 %	0 %	50 %	218203906
30	NC_011722	TCAA	2	8	15696	15703	50 %	25 %	0 %	25 %	218203899
31	NC_011722	AGGA	2	8	15768	15775	50 %	0 %	50 %	0 %	218203899
32	NC_011722	CTAT	2	8	15780	15787	25 %	50 %	0 %	25 %	218203899
33	NC_011722	TAAC	2	8	15850	15857	50 %	25 %	0 %	25 %	218203930
34	NC_011722	ATAG	2	8	16782	16789	50 %	25 %	25 %	0 %	218203920
35	NC_011722	AGAT	2	8	16867	16874	50 %	25 %	25 %	0 %	218203920
36	NC_011722	AGAT	2	8	16921	16928	50 %	25 %	25 %	0 %	218203920
37	NC_011722	ATAG	2	8	16956	16963	50 %	25 %	25 %	0 %	218203920
38	NC_011722	CAAA	2	8	17328	17335	75 %	0 %	0 %	25 %	218203927
39	NC_011722	AATA	2	8	19696	19703	75 %	25 %	0 %	0 %	218203932
40	NC_011722	GAAA	2	8	19762	19769	75 %	0 %	25 %	0 %	218203932
41	NC_011722	AAAT	2	8	19848	19855	75 %	25 %	0 %	0 %	218203932
42	NC_011722	GAAA	2	8	19961	19968	75 %	0 %	25 %	0 %	218203932
43	NC_011722	AAAT	2	8	20536	20543	75 %	25 %	0 %	0 %	218203909
44	NC_011722	TTTA	2	8	20681	20688	25 %	75 %	0 %	0 %	218203909
45	NC_011722	TCAA	2	8	20801	20808	50 %	25 %	0 %	25 %	218203916
46	NC_011722	AAAG	2	8	20861	20868	75 %	0 %	25 %	0 %	218203916
47	NC_011722	AATT	2	8	21223	21230	50 %	50 %	0 %	0 %	218203916
48	NC_011722	AATA	2	8	21274	21281	75 %	25 %	0 %	0 %	218203916
49	NC_011722	AGAT	2	8	22322	22329	50 %	25 %	25 %	0 %	218203918
50	NC_011722	ATAG	2	8	22378	22385	50 %	25 %	25 %	0 %	218203918
51	NC_011722	AAAT	2	8	22430	22437	75 %	25 %	0 %	0 %	218203918
52	NC_011722	TAAG	2	8	23161	23168	50 %	25 %	25 %	0 %	218203928
53	NC_011722	AAAT	2	8	23462	23469	75 %	25 %	0 %	0 %	218203928
54	NC_011722	AATC	2	8	24033	24040	50 %	25 %	0 %	25 %	218203928
55	NC_011722	AGAT	2	8	24257	24264	50 %	25 %	25 %	0 %	218203928
56	NC_011722	TGCA	2	8	24850	24857	25 %	25 %	25 %	25 %	218203921
57	NC_011722	TAAA	2	8	24995	25002	75 %	25 %	0 %	0 %	218203921
58	NC_011722	ACCA	2	8	25364	25371	50 %	0 %	0 %	50 %	218203921
59	NC_011722	TTGT	2	8	26063	26070	0 %	75 %	25 %	0 %	218203908
60	NC_011722	TAGA	2	8	27308	27315	50 %	25 %	25 %	0 %	218203911
61	NC_011722	AAAG	2	8	27511	27518	75 %	0 %	25 %	0 %	218203911
62	NC_011722	CAGT	2	8	27636	27643	25 %	25 %	25 %	25 %	218203911
63	NC_011722	AATA	2	8	27901	27908	75 %	25 %	0 %	0 %	218203912
64	NC_011722	AATT	2	8	28248	28255	50 %	50 %	0 %	0 %	218203912
65	NC_011722	TAAA	2	8	28922	28929	75 %	25 %	0 %	0 %	218203901
66	NC_011722	CAAG	2	8	28947	28954	50 %	0 %	25 %	25 %	218203901
67	NC_011722	AATT	2	8	28968	28975	50 %	50 %	0 %	0 %	218203901

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.