MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. infantis ATCC 15697 chromosome

Total Repeats: 41314

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011593	CCA	2	6	205	210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213690929
2	NC_011593	GCC	2	6	243	248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690929
3	NC_011593	GTT	2	6	327	332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	213690929
4	NC_011593	ACA	2	6	373	378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	213690929
5	NC_011593	CGG	2	6	505	510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213690929
6	NC_011593	CAG	2	6	645	650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690929
7	NC_011593	CGG	2	6	1019	1024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213690929
8	NC_011593	TTC	2	6	1047	1052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	213690929
9	NC_011593	GCC	2	6	1184	1189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690929
10	NC_011593	TTC	2	6	1213	1218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	213690929
11	NC_011593	CTT	2	6	1394	1399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	213690929
12	NC_011593	CAC	2	6	1400	1405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213690929
13	NC_011593	CAT	2	6	1430	1435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213690929
14	NC_011593	CAC	2	6	1598	1603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213690929
15	NC_011593	GCA	2	6	1640	1645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690929
16	NC_011593	CGA	2	6	2011	2016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690930
17	NC_011593	CGG	2	6	2098	2103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213690930
18	NC_011593	TGT	2	6	2129	2134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	213690930
19	NC_011593	CGA	2	6	2181	2186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690930
20	NC_011593	TTA	2	6	2311	2316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	213690930
21	NC_011593	CCA	2	6	2608	2613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213690931
22	NC_011593	CTG	2	6	2663	2668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690931
23	NC_011593	GTC	2	6	2936	2941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690931
24	NC_011593	ACC	2	6	3014	3019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213690931
25	NC_011593	ACT	2	6	3037	3042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213690931
26	NC_011593	TGA	2	6	3064	3069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213690931
27	NC_011593	GCT	2	6	3112	3117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690931
28	NC_011593	CGG	2	6	3174	3179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213690931
29	NC_011593	CGA	2	6	3196	3201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690931
30	NC_011593	CAA	2	6	3223	3228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	213690931
31	NC_011593	CCG	2	6	3324	3329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690931
32	NC_011593	CGA	2	6	3337	3342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690931
33	NC_011593	CGA	2	6	3382	3387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690931
34	NC_011593	AGG	2	6	3420	3425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	213690931
35	NC_011593	CCG	2	6	3432	3437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690931
36	NC_011593	GAC	2	6	3466	3471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690931
37	NC_011593	CAG	2	6	3500	3505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690931
38	NC_011593	CGA	2	6	3517	3522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690931
39	NC_011593	AAC	2	6	3563	3568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	213690931
40	NC_011593	TGG	2	6	3714	3719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213690932
41	NC_011593	CCA	2	6	3801	3806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213690932
42	NC_011593	TGA	2	6	3823	3828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213690932
43	NC_011593	GTG	2	6	3870	3875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213690932
44	NC_011593	GTC	2	6	3901	3906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690932
45	NC_011593	ATC	2	6	3923	3928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213690932
46	NC_011593	CGC	2	6	3995	4000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690932
47	NC_011593	ATG	2	6	4004	4009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213690932
48	NC_011593	TTG	2	6	4091	4096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	213690932
49	NC_011593	AAT	2	6	4118	4123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	213690932
50	NC_011593	CGA	2	6	4309	4314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690932
51	NC_011593	GAT	2	6	4562	4567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213690932
52	NC_011593	TGA	2	6	4582	4587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213690932
53	NC_011593	CGC	2	6	4939	4944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690933
54	NC_011593	TGA	2	6	5006	5011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213690933
55	NC_011593	CCA	2	6	5012	5017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213690933
56	NC_011593	GCG	2	6	5038	5043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213690933
57	NC_011593	GTG	2	6	5083	5088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213690933
58	NC_011593	CGG	3	9	5293	5301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213690933
59	NC_011593	AGC	2	6	5510	5515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690934
60	NC_011593	GGC	2	6	5520	5525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213690934
61	NC_011593	CAA	2	6	5538	5543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	213690934
62	NC_011593	CAC	2	6	5686	5691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213690934
63	NC_011593	TCG	2	6	5705	5710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690934
64	NC_011593	CGA	2	6	5721	5726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690934
65	NC_011593	GTG	2	6	5788	5793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213690934
66	NC_011593	TGA	2	6	5858	5863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213690934
67	NC_011593	CGG	2	6	5877	5882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213690934
68	NC_011593	CGG	4	12	5889	5900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213690934
69	NC_011593	CGG	2	6	5913	5918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213690934
70	NC_011593	ACC	2	6	6118	6123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213690934
71	NC_011593	CAG	2	6	6157	6162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690934
72	NC_011593	CGA	2	6	6201	6206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690934
73	NC_011593	CGA	2	6	6228	6233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690934
74	NC_011593	CGG	2	6	6248	6253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213690934
75	NC_011593	TCA	2	6	6365	6370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213690934
76	NC_011593	CCG	2	6	6404	6409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690934
77	NC_011593	ACC	2	6	6427	6432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213690934
78	NC_011593	CCA	2	6	6473	6478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213690934
79	NC_011593	GGC	2	6	6484	6489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213690934
80	NC_011593	GAG	2	6	6496	6501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	213690934
81	NC_011593	CGA	2	6	6588	6593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690934
82	NC_011593	CCG	2	6	6611	6616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690934
83	NC_011593	TGA	2	6	6707	6712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213690934
84	NC_011593	CAT	2	6	6762	6767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213690934
85	NC_011593	GCC	2	6	6802	6807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690934
86	NC_011593	CGC	2	6	6829	6834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690934
87	NC_011593	CCG	2	6	6851	6856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690934
88	NC_011593	TCC	2	6	6886	6891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	213690934
89	NC_011593	ATG	2	6	7033	7038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213690934
90	NC_011593	CGG	3	9	7074	7082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213690934
91	NC_011593	TCA	3	9	7127	7135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213690934
92	NC_011593	TTC	2	6	7189	7194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	213690934
93	NC_011593	GAT	2	6	7209	7214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213690934
94	NC_011593	CCG	2	6	7217	7222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690934
95	NC_011593	GCC	2	6	7242	7247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690934
96	NC_011593	GCC	2	6	7340	7345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690934
97	NC_011593	ACC	2	6	7417	7422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213690934
98	NC_011593	CGC	3	9	7467	7475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690934
99	NC_011593	CGA	2	6	7479	7484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690934
100	NC_011593	CGC	2	6	7522	7527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690934
101	NC_011593	ACA	2	6	7656	7661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	213690935
102	NC_011593	CGA	2	6	7666	7671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690935
103	NC_011593	AGG	2	6	7713	7718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	213690935
104	NC_011593	ACC	2	6	7724	7729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213690935
105	NC_011593	GCG	2	6	7749	7754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213690935
106	NC_011593	GCA	2	6	7777	7782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690935
107	NC_011593	TCG	2	6	7824	7829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690935
108	NC_011593	ACG	2	6	7896	7901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690935
109	NC_011593	ACA	2	6	7926	7931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	213690935
110	NC_011593	ACC	2	6	7968	7973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213690935
111	NC_011593	TCG	2	6	8043	8048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690935
112	NC_011593	GCC	3	9	8087	8095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690935
113	NC_011593	ACG	2	6	8184	8189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690935
114	NC_011593	TGC	2	6	8211	8216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690935
115	NC_011593	CCG	2	6	8250	8255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690935
116	NC_011593	CCA	2	6	8274	8279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213690935
117	NC_011593	CGC	2	6	8286	8291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690935
118	NC_011593	CTG	2	6	8360	8365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690935
119	NC_011593	CAT	2	6	8380	8385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213690935
120	NC_011593	CCA	2	6	8412	8417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213690935
121	NC_011593	TCA	2	6	8466	8471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213690935
122	NC_011593	GAG	2	6	8495	8500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	213690935
123	NC_011593	TGG	2	6	8520	8525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213690935
124	NC_011593	CGA	2	6	8623	8628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690935
125	NC_011593	GGT	2	6	8689	8694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213690935
126	NC_011593	AAC	2	6	8699	8704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	213690935
127	NC_011593	GCA	2	6	8725	8730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690935
128	NC_011593	ACC	2	6	8814	8819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213690935
129	NC_011593	GAG	2	6	8867	8872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	213690935
130	NC_011593	GCT	2	6	8983	8988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690935
131	NC_011593	ATC	2	6	9146	9151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213690935
132	NC_011593	CGA	2	6	9154	9159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690935
133	NC_011593	CGA	2	6	9163	9168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690935
134	NC_011593	CGA	2	6	9187	9192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690935
135	NC_011593	CGC	2	6	9194	9199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690935
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254	NC_011593	TCG	2	6	20020	20025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690945
255	NC_011593	TGA	2	6	20087	20092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213690945
256	NC_011593	TTC	2	6	20172	20177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	213690945
257	NC_011593	TGG	2	6	20224	20229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213690945
258	NC_011593	TCG	3	9	20381	20389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690945
259	NC_011593	GCA	2	6	20423	20428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690945
260	NC_011593	TGG	2	6	20588	20593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213690945
261	NC_011593	GTC	2	6	20639	20644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690945
262	NC_011593	GCC	2	6	20667	20672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690945
263	NC_011593	CGA	2	6	20681	20686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690945
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271	NC_011593	TGG	2	6	21230	21235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213690945
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285	NC_011593	GCC	2	6	21755	21760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690946
286	NC_011593	GGT	2	6	21765	21770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213690946
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498	NC_011593	TCG	2	6	35772	35777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690958
499	NC_011593	GTC	2	6	35780	35785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690958
500	NC_011593	CGG	2	6	35860	35865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213690958

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