MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. infantis ATCC 15697 chromosome

Total Repeats: 54322

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_011593	CCA	2	6	176034	176039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213691067
3502	NC_011593	CTG	2	6	176299	176304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691067
3503	NC_011593	TCA	2	6	176360	176365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213691067
3504	NC_011593	ATG	2	6	176451	176456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213691068
3505	NC_011593	AGC	2	6	176529	176534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691068
3506	NC_011593	GCG	2	6	176638	176643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691068
3507	NC_011593	CTG	2	6	176654	176659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691068
3508	NC_011593	CGT	2	6	176732	176737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691068
3509	NC_011593	CGA	2	6	176785	176790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691068
3510	NC_011593	G	6	6	176809	176814	0 %	0 %	100 %	0 %	213691068
3511	NC_011593	CTG	2	6	176903	176908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691068
3512	NC_011593	GCA	2	6	176973	176978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691068
3513	NC_011593	GGT	2	6	177016	177021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213691068
3514	NC_011593	GCA	2	6	177040	177045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691068
3515	NC_011593	TTC	2	6	177094	177099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	213691068
3516	NC_011593	ATTG	2	8	177112	177119	25 %	50 %	25 %	0 %	213691068
3517	NC_011593	GCT	2	6	177334	177339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691068
3518	NC_011593	CAG	2	6	177359	177364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691068
3519	NC_011593	GC	4	8	177419	177426	0 %	0 %	50 %	50 %	213691068
3520	NC_011593	TGAGA	2	10	177433	177442	40 %	20 %	40 %	0 %	213691068
3521	NC_011593	CGA	2	6	177532	177537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691068
3522	NC_011593	GTG	2	6	177581	177586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213691068
3523	NC_011593	TTG	2	6	177599	177604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	213691068
3524	NC_011593	TGGC	2	8	177634	177641	0 %	25 %	50 %	25 %	213691068
3525	NC_011593	CAT	2	6	177764	177769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213691068
3526	NC_011593	GC	3	6	177799	177804	0 %	0 %	50 %	50 %	213691068
3527	NC_011593	TTCG	2	8	177841	177848	0 %	50 %	25 %	25 %	213691068
3528	NC_011593	ATATGG	2	12	177849	177860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213691068
3529	NC_011593	ATC	2	6	177979	177984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213691069
3530	NC_011593	GTC	3	9	178048	178056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691069
3531	NC_011593	CGC	2	6	178071	178076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691069
3532	NC_011593	GC	3	6	178079	178084	0 %	0 %	50 %	50 %	213691069
3533	NC_011593	TGG	2	6	178172	178177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213691069
3534	NC_011593	CGG	2	6	178197	178202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691069
3535	NC_011593	AAT	2	6	178219	178224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	213691069
3536	NC_011593	ATC	2	6	178381	178386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213691069
3537	NC_011593	GGC	2	6	178450	178455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691069
3538	NC_011593	GGC	2	6	178492	178497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691069
3539	NC_011593	CCA	2	6	178559	178564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213691069
3540	NC_011593	GCC	2	6	178607	178612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691069
3541	NC_011593	GTT	2	6	178647	178652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	213691069
3542	NC_011593	TGG	2	6	178701	178706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213691069
3543	NC_011593	TGGA	2	8	178863	178870	25 %	25 %	50 %	0 %	213691070
3544	NC_011593	CGAAAT	2	12	178906	178917	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	213691070
3545	NC_011593	CAA	2	6	178924	178929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	213691070
3546	NC_011593	GGC	2	6	178931	178936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691070
3547	NC_011593	AGC	2	6	179043	179048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691070
3548	NC_011593	GCTC	2	8	179118	179125	0 %	25 %	25 %	50 %	213691070
3549	NC_011593	CATCC	2	10	179137	179146	20 %	20 %	0 %	60 %	213691070
3550	NC_011593	ACT	2	6	179156	179161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213691070
3551	NC_011593	CGC	2	6	179163	179168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691070
3552	NC_011593	CAT	2	6	179185	179190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213691070
3553	NC_011593	CGA	2	6	179230	179235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691070
3554	NC_011593	GTG	2	6	179321	179326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213691070
3555	NC_011593	TTC	2	6	179335	179340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	213691070
3556	NC_011593	CTG	2	6	179768	179773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691071
3557	NC_011593	GTG	2	6	179867	179872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213691071
3558	NC_011593	TTC	2	6	179873	179878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	213691071
3559	NC_011593	TGT	2	6	179901	179906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	213691071
3560	NC_011593	CGGC	2	8	179910	179917	0 %	0 %	50 %	50 %	213691071
3561	NC_011593	TGC	2	6	179935	179940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691071
3562	NC_011593	GTT	2	6	179962	179967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	213691071
3563	NC_011593	TGC	2	6	179973	179978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691071
3564	NC_011593	GGT	2	6	179980	179985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213691071
3565	NC_011593	GC	3	6	179991	179996	0 %	0 %	50 %	50 %	213691071
3566	NC_011593	ACT	2	6	180018	180023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213691071
3567	NC_011593	GCC	2	6	180042	180047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691071
3568	NC_011593	ATC	2	6	180050	180055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213691071
3569	NC_011593	GCTG	2	8	180130	180137	0 %	25 %	50 %	25 %	213691071
3570	NC_011593	CTT	2	6	180151	180156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	213691071
3571	NC_011593	CTT	2	6	180280	180285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	213691071
3572	NC_011593	CTG	2	6	180338	180343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691071
3573	NC_011593	TCGC	2	8	180347	180354	0 %	25 %	25 %	50 %	213691071
3574	NC_011593	CAT	2	6	180361	180366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213691071
3575	NC_011593	AAG	3	9	180392	180400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	213691071
3576	NC_011593	CTA	2	6	180795	180800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213691072
3577	NC_011593	CCG	2	6	180805	180810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691072
3578	NC_011593	TGA	2	6	181121	181126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213691072
3579	NC_011593	GC	4	8	181166	181173	0 %	0 %	50 %	50 %	213691072
3580	NC_011593	TGG	2	6	181183	181188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213691072
3581	NC_011593	ACG	2	6	181226	181231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691072
3582	NC_011593	TCG	2	6	181391	181396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691072
3583	NC_011593	ACT	2	6	181457	181462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213691072
3584	NC_011593	CTTG	2	8	181572	181579	0 %	50 %	25 %	25 %	213691072
3585	NC_011593	TGA	2	6	181666	181671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213691073
3586	NC_011593	TTC	2	6	181697	181702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	213691073
3587	NC_011593	ATG	2	6	181713	181718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213691073
3588	NC_011593	CGC	2	6	181827	181832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691073
3589	NC_011593	AGT	2	6	181834	181839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213691073
3590	NC_011593	GC	3	6	181863	181868	0 %	0 %	50 %	50 %	213691073
3591	NC_011593	GAT	2	6	181886	181891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213691073
3592	NC_011593	CGC	2	6	181909	181914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691073
3593	NC_011593	GCT	2	6	182045	182050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691073
3594	NC_011593	GCT	2	6	182053	182058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691073
3595	NC_011593	ACC	2	6	182126	182131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213691073
3596	NC_011593	GCT	2	6	182143	182148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691073
3597	NC_011593	GTG	2	6	182324	182329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213691073
3598	NC_011593	GTG	2	6	182343	182348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213691073
3599	NC_011593	GC	3	6	182368	182373	0 %	0 %	50 %	50 %	213691073
3600	NC_011593	CAC	2	6	182387	182392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213691073
3601	NC_011593	GGC	2	6	182393	182398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691073
3602	NC_011593	ACC	2	6	182402	182407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213691073
3603	NC_011593	TTGC	2	8	182459	182466	0 %	50 %	25 %	25 %	213691073
3604	NC_011593	AGTC	2	8	182470	182477	25 %	25 %	25 %	25 %	213691073
3605	NC_011593	GGC	2	6	182497	182502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691073
3606	NC_011593	GGT	2	6	182518	182523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213691073
3607	NC_011593	GCG	2	6	182548	182553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691073
3608	NC_011593	GCC	2	6	182625	182630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691073
3609	NC_011593	TCC	2	6	182632	182637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	213691073
3610	NC_011593	GCC	2	6	182645	182650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691073
3611	NC_011593	TGG	3	9	182698	182706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213691073
3612	NC_011593	TGA	2	6	182708	182713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213691073
3613	NC_011593	GGC	2	6	182730	182735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691074
3614	NC_011593	GAA	2	6	182760	182765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	213691074
3615	NC_011593	GCTG	2	8	182784	182791	0 %	25 %	50 %	25 %	213691074
3616	NC_011593	CG	3	6	182886	182891	0 %	0 %	50 %	50 %	213691074
3617	NC_011593	GGC	2	6	182902	182907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691074
3618	NC_011593	CAG	2	6	182937	182942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691074
3619	NC_011593	GCG	2	6	182997	183002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691074
3620	NC_011593	CGA	2	6	183009	183014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691074
3621	NC_011593	CCG	2	6	183053	183058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691074
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3623	NC_011593	GCT	2	6	183192	183197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691074
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3625	NC_011593	CGC	2	6	183272	183277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691074
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3729	NC_011593	TGCCT	2	10	189120	189129	0 %	40 %	20 %	40 %	213691081
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3732	NC_011593	GTG	2	6	189209	189214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213691081
3733	NC_011593	GCGA	2	8	189282	189289	25 %	0 %	50 %	25 %	213691081
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3736	NC_011593	GCTG	2	8	189430	189437	0 %	25 %	50 %	25 %	213691081
3737	NC_011593	GAC	2	6	189461	189466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691081
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3863	NC_011593	GC	3	6	196688	196693	0 %	0 %	50 %	50 %	213691089
3864	NC_011593	GAT	2	6	196712	196717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213691089
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3983	NC_011593	ATT	2	6	202796	202801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	213691092
3984	NC_011593	AATG	2	8	202802	202809	50 %	25 %	25 %	0 %	213691092
3985	NC_011593	GGT	2	6	202952	202957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213691092
3986	NC_011593	GGT	2	6	202976	202981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213691092
3987	NC_011593	GTG	3	9	203022	203030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213691092
3988	NC_011593	GAA	2	6	203084	203089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	213691092
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3990	NC_011593	CCT	2	6	203221	203226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	213691092
3991	NC_011593	ACG	2	6	203300	203305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691092
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3995	NC_011593	TGA	2	6	204115	204120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213691093
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