MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. infantis ATCC 15697 chromosome

Total Repeats: 54322

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_011593	TGC	2	6	152773	152778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691050
3002	NC_011593	CCAG	2	8	152791	152798	25 %	0 %	25 %	50 %	213691050
3003	NC_011593	AGC	2	6	152800	152805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691050
3004	NC_011593	TCGAG	2	10	152818	152827	20 %	20 %	40 %	20 %	213691050
3005	NC_011593	CCG	2	6	152850	152855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691050
3006	NC_011593	GT	3	6	152878	152883	0 %	50 %	50 %	0 %	213691050
3007	NC_011593	CGC	2	6	152885	152890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691050
3008	NC_011593	ATG	2	6	152901	152906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213691050
3009	NC_011593	CCT	2	6	153011	153016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	213691050
3010	NC_011593	TGC	2	6	153050	153055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691050
3011	NC_011593	GGAAC	2	10	153098	153107	40 %	0 %	40 %	20 %	213691050
3012	NC_011593	CCA	2	6	153112	153117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213691050
3013	NC_011593	GTG	2	6	153123	153128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213691050
3014	NC_011593	CCTG	2	8	153136	153143	0 %	25 %	25 %	50 %	213691050
3015	NC_011593	CGGCA	2	10	153194	153203	20 %	0 %	40 %	40 %	213691050
3016	NC_011593	TGC	2	6	153217	153222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691050
3017	NC_011593	AATG	2	8	153284	153291	50 %	25 %	25 %	0 %	213691050
3018	NC_011593	ACCCG	2	10	153296	153305	20 %	0 %	20 %	60 %	213691050
3019	NC_011593	TCGG	2	8	153348	153355	0 %	25 %	50 %	25 %	213691050
3020	NC_011593	CGC	2	6	153365	153370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691050
3021	NC_011593	CAT	2	6	153371	153376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213691050
3022	NC_011593	GC	3	6	153379	153384	0 %	0 %	50 %	50 %	213691050
3023	NC_011593	TGC	2	6	153451	153456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691050
3024	NC_011593	CGC	2	6	153476	153481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691050
3025	NC_011593	GCA	2	6	153982	153987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691051
3026	NC_011593	GGC	2	6	154011	154016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691051
3027	NC_011593	CGC	2	6	154062	154067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691051
3028	NC_011593	CCG	2	6	154118	154123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691051
3029	NC_011593	ACT	2	6	154130	154135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213691051
3030	NC_011593	TCT	3	9	154145	154153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	213691051
3031	NC_011593	CTG	2	6	154180	154185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691051
3032	NC_011593	CGCC	2	8	154218	154225	0 %	0 %	25 %	75 %	213691051
3033	NC_011593	CTGC	2	8	154329	154336	0 %	25 %	25 %	50 %	213691051
3034	NC_011593	CCT	2	6	154380	154385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	213691051
3035	NC_011593	GCG	2	6	154412	154417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691051
3036	NC_011593	GC	3	6	154467	154472	0 %	0 %	50 %	50 %	213691051
3037	NC_011593	GC	3	6	154499	154504	0 %	0 %	50 %	50 %	213691051
3038	NC_011593	CTT	2	6	154512	154517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	213691051
3039	NC_011593	CAA	2	6	154554	154559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	213691051
3040	NC_011593	CTG	2	6	154600	154605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691051
3041	NC_011593	TCG	2	6	154622	154627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691051
3042	NC_011593	GGA	2	6	154650	154655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	213691051
3043	NC_011593	AGA	2	6	154685	154690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	213691051
3044	NC_011593	GTC	2	6	154693	154698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691051
3045	NC_011593	TGC	2	6	154742	154747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691051
3046	NC_011593	GGC	4	12	154837	154848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691051
3047	NC_011593	ACCA	2	8	154858	154865	50 %	0 %	0 %	50 %	213691051
3048	NC_011593	TGCTCA	2	12	154874	154885	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	213691051
3049	NC_011593	CCTG	2	8	154925	154932	0 %	25 %	25 %	50 %	213691051
3050	NC_011593	TCC	2	6	154972	154977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	213691051
3051	NC_011593	TCG	2	6	154985	154990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691051
3052	NC_011593	CTG	2	6	155014	155019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691051
3053	NC_011593	GGT	2	6	155023	155028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213691051
3054	NC_011593	AGA	2	6	155039	155044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	213691051
3055	NC_011593	CCTG	2	8	155121	155128	0 %	25 %	25 %	50 %	213691051
3056	NC_011593	CTCCGG	2	12	155154	155165	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	213691051
3057	NC_011593	GCC	2	6	155182	155187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691051
3058	NC_011593	TCG	2	6	155189	155194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691051
3059	NC_011593	GCG	2	6	155197	155202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691051
3060	NC_011593	TGC	2	6	155284	155289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691051
3061	NC_011593	GCA	2	6	155569	155574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691052
3062	NC_011593	AAG	2	6	155620	155625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	213691052
3063	NC_011593	TCACGC	2	12	155655	155666	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	213691052
3064	NC_011593	GTC	2	6	155698	155703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691052
3065	NC_011593	TGA	2	6	155798	155803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213691052
3066	NC_011593	GAA	2	6	155842	155847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	213691052
3067	NC_011593	TCGT	2	8	155975	155982	0 %	50 %	25 %	25 %	213691052
3068	NC_011593	CGC	2	6	155991	155996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691052
3069	NC_011593	GTC	2	6	156013	156018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691052
3070	NC_011593	ACC	2	6	156112	156117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213691052
3071	NC_011593	GAG	2	6	156124	156129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	213691052
3072	NC_011593	ACC	2	6	156179	156184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213691052
3073	NC_011593	GGCT	2	8	156216	156223	0 %	25 %	50 %	25 %	213691052
3074	NC_011593	TCG	2	6	156272	156277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691052
3075	NC_011593	TCA	2	6	156359	156364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213691052
3076	NC_011593	CGA	2	6	156366	156371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691052
3077	NC_011593	AAG	2	6	156376	156381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	213691052
3078	NC_011593	GAC	2	6	156439	156444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691052
3079	NC_011593	AAG	2	6	156469	156474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	213691052
3080	NC_011593	GC	3	6	156525	156530	0 %	0 %	50 %	50 %	213691052
3081	NC_011593	AAC	2	6	156544	156549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	213691052
3082	NC_011593	CAAGGA	2	12	156558	156569	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	213691052
3083	NC_011593	TCG	2	6	156799	156804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691053
3084	NC_011593	CAG	2	6	156825	156830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691053
3085	NC_011593	TCG	2	6	156975	156980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691053
3086	NC_011593	TGC	2	6	156993	156998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691053
3087	NC_011593	GTG	2	6	157030	157035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213691053
3088	NC_011593	CAC	3	9	157122	157130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213691053
3089	NC_011593	CCA	2	6	157139	157144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213691053
3090	NC_011593	CAC	2	6	157147	157152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213691053
3091	NC_011593	GC	3	6	157220	157225	0 %	0 %	50 %	50 %	213691053
3092	NC_011593	CAC	2	6	157243	157248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213691053
3093	NC_011593	GCA	2	6	157322	157327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691053
3094	NC_011593	CTT	2	6	157372	157377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	213691054
3095	NC_011593	CGC	2	6	157390	157395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691054
3096	NC_011593	CG	3	6	157410	157415	0 %	0 %	50 %	50 %	213691054
3097	NC_011593	CGTGG	2	10	157420	157429	0 %	20 %	60 %	20 %	213691054
3098	NC_011593	CAG	2	6	157541	157546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691054
3099	NC_011593	TGG	2	6	157582	157587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213691054
3100	NC_011593	TCG	2	6	157593	157598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691054
3101	NC_011593	CGG	2	6	157630	157635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691054
3102	NC_011593	ATG	2	6	157803	157808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213691054
3103	NC_011593	GCT	2	6	157855	157860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691054
3104	NC_011593	ACG	2	6	157982	157987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691054
3105	NC_011593	TCA	2	6	158034	158039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213691054
3106	NC_011593	ATA	2	6	158040	158045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	213691054
3107	NC_011593	GC	3	6	158096	158101	0 %	0 %	50 %	50 %	213691055
3108	NC_011593	GC	3	6	158129	158134	0 %	0 %	50 %	50 %	213691055
3109	NC_011593	CAC	2	6	158164	158169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213691055
3110	NC_011593	ATA	2	6	158207	158212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	213691055
3111	NC_011593	GAG	2	6	158223	158228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	213691055
3112	NC_011593	CGC	2	6	158280	158285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691055
3113	NC_011593	CCA	2	6	158311	158316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213691055
3114	NC_011593	CCG	2	6	158417	158422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691055
3115	NC_011593	GCC	2	6	158425	158430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691055
3116	NC_011593	CGA	2	6	158445	158450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691055
3117	NC_011593	CATTC	2	10	158482	158491	20 %	40 %	0 %	40 %	213691055
3118	NC_011593	AC	3	6	158580	158585	50 %	0 %	0 %	50 %	213691055
3119	NC_011593	ATA	2	6	158651	158656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	213691055
3120	NC_011593	GCGT	2	8	158917	158924	0 %	25 %	50 %	25 %	213691056
3121	NC_011593	TGT	2	6	159017	159022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	213691056
3122	NC_011593	CTG	2	6	159038	159043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691056
3123	NC_011593	ATG	2	6	159073	159078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213691056
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3233	NC_011593	CTGC	2	8	164148	164155	0 %	25 %	25 %	50 %	213691060
3234	NC_011593	AGC	3	9	164156	164164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691060
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3236	NC_011593	AT	3	6	164247	164252	50 %	50 %	0 %	0 %	213691060
3237	NC_011593	CCA	2	6	164262	164267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213691060
3238	NC_011593	TCA	2	6	164274	164279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213691060
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3240	NC_011593	GCTC	2	8	164325	164332	0 %	25 %	25 %	50 %	213691060
3241	NC_011593	CTC	2	6	164344	164349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	213691060
3242	NC_011593	CGG	2	6	164382	164387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691060
3243	NC_011593	CGTG	2	8	164400	164407	0 %	25 %	50 %	25 %	213691060
3244	NC_011593	GCG	2	6	164536	164541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691060
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3246	NC_011593	GC	3	6	164591	164596	0 %	0 %	50 %	50 %	213691060
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3275	NC_011593	GCG	2	6	165659	165664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691060
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3357	NC_011593	CCA	2	6	169928	169933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213691062
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3362	NC_011593	GAA	2	6	170076	170081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	213691062
3363	NC_011593	CTC	3	9	170088	170096	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	213691062
3364	NC_011593	CCA	2	6	170102	170107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213691062
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3482	NC_011593	CAT	2	6	175068	175073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213691066
3483	NC_011593	CAT	2	6	175092	175097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213691066
3484	NC_011593	TGG	2	6	175130	175135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213691066
3485	NC_011593	CAG	2	6	175169	175174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691066
3486	NC_011593	CGG	2	6	175181	175186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691066
3487	NC_011593	TGATG	2	10	175263	175272	20 %	40 %	40 %	0 %	213691067
3488	NC_011593	CG	3	6	175278	175283	0 %	0 %	50 %	50 %	213691067
3489	NC_011593	GC	3	6	175363	175368	0 %	0 %	50 %	50 %	213691067
3490	NC_011593	CGT	2	6	175408	175413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691067
3491	NC_011593	CCG	2	6	175468	175473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691067
3492	NC_011593	ACCG	2	8	175515	175522	25 %	0 %	25 %	50 %	213691067
3493	NC_011593	GGC	2	6	175564	175569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691067
3494	NC_011593	GAT	2	6	175620	175625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213691067
3495	NC_011593	TCA	2	6	175643	175648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213691067
3496	NC_011593	GCG	2	6	175766	175771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691067
3497	NC_011593	TTC	2	6	175774	175779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	213691067
3498	NC_011593	CAT	2	6	175806	175811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213691067
3499	NC_011593	GCATGA	2	12	175899	175910	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	213691067
3500	NC_011593	GGC	2	6	175954	175959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691067

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