MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. infantis ATCC 15697 chromosome

Total Repeats: 54322

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_011593	TCG	2	6	103158	103163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691008
2003	NC_011593	GCTCG	2	10	103183	103192	0 %	20 %	40 %	40 %	213691008
2004	NC_011593	GGC	2	6	103211	103216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691008
2005	NC_011593	CTG	3	9	103220	103228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691008
2006	NC_011593	CGG	2	6	103235	103240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691008
2007	NC_011593	TCG	2	6	103278	103283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691008
2008	NC_011593	CTG	2	6	103289	103294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691008
2009	NC_011593	TCT	2	6	103299	103304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	213691008
2010	NC_011593	TCG	2	6	103310	103315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691008
2011	NC_011593	CCG	2	6	103344	103349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691008
2012	NC_011593	GAT	2	6	103393	103398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213691008
2013	NC_011593	GCC	2	6	103412	103417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691008
2014	NC_011593	TCG	2	6	103426	103431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691008
2015	NC_011593	TGC	2	6	103449	103454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691008
2016	NC_011593	CGGC	2	8	103473	103480	0 %	0 %	50 %	50 %	213691008
2017	NC_011593	CGG	2	6	103495	103500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691008
2018	NC_011593	GCC	2	6	103523	103528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691008
2019	NC_011593	CGC	2	6	103540	103545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691008
2020	NC_011593	CGCC	2	8	103611	103618	0 %	0 %	25 %	75 %	213691008
2021	NC_011593	GTGG	2	8	103657	103664	0 %	25 %	75 %	0 %	213691008
2022	NC_011593	ATC	2	6	103679	103684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213691008
2023	NC_011593	CGC	2	6	103687	103692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691008
2024	NC_011593	CGC	3	9	103716	103724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691008
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2028	NC_011593	ACGCC	2	10	103839	103848	20 %	0 %	20 %	60 %	213691008
2029	NC_011593	TGC	2	6	103875	103880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691008
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2033	NC_011593	CGG	2	6	104257	104262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691009
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2037	NC_011593	GCGG	2	8	104321	104328	0 %	0 %	75 %	25 %	213691009
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2065	NC_011593	CGCCGG	2	12	105280	105291	0 %	0 %	50 %	50 %	213691009
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2122	NC_011593	CGG	2	6	107631	107636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691010
2123	NC_011593	GAG	2	6	107641	107646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	213691010
2124	NC_011593	GCT	2	6	107667	107672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691010
2125	NC_011593	GTTG	2	8	107714	107721	0 %	50 %	50 %	0 %	213691010
2126	NC_011593	TCG	2	6	107744	107749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691010
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2129	NC_011593	CGA	2	6	107838	107843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691010
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2131	NC_011593	GGA	2	6	107934	107939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	213691010
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2133	NC_011593	ACCCGG	2	12	108086	108097	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	213691010
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2153	NC_011593	GCCG	2	8	109576	109583	0 %	0 %	50 %	50 %	213691011
2154	NC_011593	GGC	2	6	109589	109594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691011
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2231	NC_011593	TGC	2	6	114148	114153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691016
2232	NC_011593	CTTGG	2	10	114154	114163	0 %	40 %	40 %	20 %	213691016
2233	NC_011593	CG	3	6	114199	114204	0 %	0 %	50 %	50 %	213691016
2234	NC_011593	GCG	2	6	114212	114217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691016
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2238	NC_011593	CCGTG	2	10	114280	114289	0 %	20 %	40 %	40 %	213691016
2239	NC_011593	TGA	2	6	114695	114700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213691017
2240	NC_011593	CGA	2	6	114726	114731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691017
2241	NC_011593	TTC	2	6	114736	114741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	213691017
2242	NC_011593	ATG	2	6	114799	114804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213691017
2243	NC_011593	TCG	2	6	114839	114844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691017
2244	NC_011593	AGGA	2	8	114865	114872	50 %	0 %	50 %	0 %	213691017
2245	NC_011593	CG	3	6	114915	114920	0 %	0 %	50 %	50 %	213691017
2246	NC_011593	CGA	2	6	114924	114929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691017
2247	NC_011593	CGT	2	6	114967	114972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691017
2248	NC_011593	CTT	2	6	115002	115007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	213691017
2249	NC_011593	ATGCCG	2	12	115075	115086	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	213691017
2250	NC_011593	GTAT	2	8	115165	115172	25 %	50 %	25 %	0 %	213691018
2251	NC_011593	A	6	6	115243	115248	100 %	0 %	0 %	0 %	213691018
2252	NC_011593	TAA	2	6	115285	115290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	213691018
2253	NC_011593	ATT	2	6	115322	115327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	213691018
2254	NC_011593	TTC	2	6	115387	115392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	213691018
2255	NC_011593	TGGT	2	8	115461	115468	0 %	50 %	50 %	0 %	213691018
2256	NC_011593	CT	3	6	115537	115542	0 %	50 %	0 %	50 %	213691018
2257	NC_011593	TCT	2	6	115557	115562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	213691018
2258	NC_011593	GCAGG	2	10	115574	115583	20 %	0 %	60 %	20 %	213691018
2259	NC_011593	TGTT	2	8	115591	115598	0 %	75 %	25 %	0 %	213691018
2260	NC_011593	AAG	2	6	115697	115702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	213691018
2261	NC_011593	TAT	2	6	115745	115750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	213691018
2262	NC_011593	TGG	2	6	116084	116089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213691019
2263	NC_011593	CTG	2	6	116230	116235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691019
2264	NC_011593	TGC	2	6	116237	116242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691019
2265	NC_011593	CTTGC	2	10	116246	116255	0 %	40 %	20 %	40 %	213691019
2266	NC_011593	AACCA	2	10	116550	116559	60 %	0 %	0 %	40 %	213691020
2267	NC_011593	CAA	2	6	116620	116625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	213691020
2268	NC_011593	CTG	2	6	116632	116637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691020
2269	NC_011593	CGT	2	6	116715	116720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691020
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2271	NC_011593	CCGG	2	8	116742	116749	0 %	0 %	50 %	50 %	213691020
2272	NC_011593	GTC	2	6	116846	116851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691021
2273	NC_011593	CGGC	2	8	116857	116864	0 %	0 %	50 %	50 %	213691021
2274	NC_011593	CGG	2	6	117016	117021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691021
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2283	NC_011593	AGT	2	6	118210	118215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213691022
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2321	NC_011593	GCA	2	6	120180	120185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691023
2322	NC_011593	CTA	2	6	120246	120251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213691023
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2325	NC_011593	GCCA	2	8	120334	120341	25 %	0 %	25 %	50 %	213691023
2326	NC_011593	CAG	2	6	120367	120372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691023
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2332	NC_011593	GCG	2	6	120662	120667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691023
2333	NC_011593	TCCA	2	8	120718	120725	25 %	25 %	0 %	50 %	213691023
2334	NC_011593	CAT	2	6	120765	120770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213691023
2335	NC_011593	CAT	2	6	120786	120791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213691023
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2337	NC_011593	CAG	2	6	120820	120825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691023
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2341	NC_011593	ACG	2	6	121010	121015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691023
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2343	NC_011593	GTGACC	2	12	121057	121068	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	213691023
2344	NC_011593	AAC	3	9	121075	121083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	213691023
2345	NC_011593	CGG	2	6	121137	121142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691023
2346	NC_011593	CGGC	2	8	121157	121164	0 %	0 %	50 %	50 %	213691023
2347	NC_011593	CCG	2	6	121217	121222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691023
2348	NC_011593	ATCGGC	2	12	121228	121239	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	213691023
2349	NC_011593	CGA	2	6	121275	121280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691023
2350	NC_011593	ATC	2	6	121282	121287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213691023
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2353	NC_011593	GTC	2	6	121408	121413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691023
2354	NC_011593	CGG	2	6	121416	121421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691023
2355	NC_011593	GGCC	2	8	121434	121441	0 %	0 %	50 %	50 %	213691023
2356	NC_011593	AGG	2	6	121445	121450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	213691023
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2358	NC_011593	GCT	2	6	121500	121505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691023
2359	NC_011593	AGG	2	6	121598	121603	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	213691023
2360	NC_011593	GTC	2	6	121605	121610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691023
2361	NC_011593	AAC	2	6	121654	121659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	213691023
2362	NC_011593	ACGGCG	2	12	121673	121684	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	213691023
2363	NC_011593	CAA	2	6	121692	121697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	213691023
2364	NC_011593	CGG	2	6	121698	121703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691023
2365	NC_011593	CGA	2	6	121704	121709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691023
2366	NC_011593	AACGGC	2	12	121723	121734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691023
2367	NC_011593	CGG	3	9	121758	121766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691023
2368	NC_011593	ATG	2	6	122184	122189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213691024
2369	NC_011593	TCA	2	6	122197	122202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213691024
2370	NC_011593	TTC	2	6	122205	122210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	213691024
2371	NC_011593	GTC	3	9	122253	122261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691024
2372	NC_011593	CGC	2	6	122264	122269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691024
2373	NC_011593	TCA	2	6	122359	122364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213691024
2374	NC_011593	ATC	2	6	122379	122384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213691024
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2376	NC_011593	CTG	2	6	122445	122450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691024
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2378	NC_011593	GAG	2	6	122541	122546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	213691024
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2380	NC_011593	CGT	2	6	122612	122617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691024
2381	NC_011593	CCG	2	6	122678	122683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691024
2382	NC_011593	TCGAT	2	10	122717	122726	20 %	40 %	20 %	20 %	213691024
2383	NC_011593	TGT	2	6	122806	122811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	213691024
2384	NC_011593	GCC	2	6	122943	122948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691024
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2386	NC_011593	GCT	2	6	123140	123145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691024
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2388	NC_011593	GTC	2	6	123181	123186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691024
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2393	NC_011593	TGC	2	6	123313	123318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691024
2394	NC_011593	CGGCG	2	10	123320	123329	0 %	0 %	60 %	40 %	213691024
2395	NC_011593	TGA	2	6	123355	123360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213691024
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2399	NC_011593	GAG	2	6	123540	123545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	213691024
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2425	NC_011593	GTC	3	9	124266	124274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691024
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2433	NC_011593	GTGGCT	2	12	124770	124781	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	213691025
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2435	NC_011593	CT	3	6	124913	124918	0 %	50 %	0 %	50 %	213691025
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2445	NC_011593	TCG	2	6	125361	125366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691025
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2451	NC_011593	GGAA	2	8	125730	125737	50 %	0 %	50 %	0 %	213691025
2452	NC_011593	GC	3	6	125779	125784	0 %	0 %	50 %	50 %	213691025
2453	NC_011593	CGG	2	6	125788	125793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691025
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2482	NC_011593	GCGT	2	8	127495	127502	0 %	25 %	50 %	25 %	213691027
2483	NC_011593	CGC	2	6	127538	127543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691027
2484	NC_011593	TGC	2	6	127552	127557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691027
2485	NC_011593	TTG	2	6	127558	127563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	213691027
2486	NC_011593	GGC	2	6	127581	127586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691027
2487	NC_011593	TTC	2	6	127614	127619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	213691027
2488	NC_011593	GACC	2	8	127631	127638	25 %	0 %	25 %	50 %	213691027
2489	NC_011593	CAA	2	6	127643	127648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	213691027
2490	NC_011593	GAT	2	6	127652	127657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213691027
2491	NC_011593	CTA	2	6	127658	127663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213691027
2492	NC_011593	TCAT	3	12	127715	127726	25 %	50 %	0 %	25 %	213691027
2493	NC_011593	TCA	2	6	127735	127740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213691027
2494	NC_011593	CGG	2	6	127841	127846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691027
2495	NC_011593	GTC	2	6	127863	127868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691027
2496	NC_011593	CAT	2	6	127871	127876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213691027
2497	NC_011593	TCCA	2	8	127901	127908	25 %	25 %	0 %	50 %	213691027
2498	NC_011593	ATG	2	6	127911	127916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213691027
2499	NC_011593	GTG	2	6	127926	127931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213691027
2500	NC_011593	GAA	2	6	127939	127944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	213691027

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