MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. infantis ATCC 15697 chromosome

Total Repeats: 54322

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_011593	CGG	2	6	81514	81519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213690990
1502	NC_011593	TGG	2	6	81525	81530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213690990
1503	NC_011593	GCTG	2	8	81547	81554	0 %	25 %	50 %	25 %	213690990
1504	NC_011593	TGG	2	6	81672	81677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213690990
1505	NC_011593	GCA	2	6	81708	81713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690990
1506	NC_011593	CGTGGC	2	12	81739	81750	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	213690990
1507	NC_011593	CCTG	2	8	81792	81799	0 %	25 %	25 %	50 %	213690990
1508	NC_011593	GCC	2	6	81806	81811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690990
1509	NC_011593	TGG	2	6	81816	81821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213690990
1510	NC_011593	CCG	3	9	81822	81830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690990
1511	NC_011593	GCA	2	6	81951	81956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690991
1512	NC_011593	GTC	2	6	81967	81972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690991
1513	NC_011593	GTG	2	6	82022	82027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213690991
1514	NC_011593	GTCC	2	8	82110	82117	0 %	25 %	25 %	50 %	213690991
1515	NC_011593	GCCCG	2	10	82159	82168	0 %	0 %	40 %	60 %	213690991
1516	NC_011593	GC	4	8	82170	82177	0 %	0 %	50 %	50 %	213690991
1517	NC_011593	CAG	2	6	82183	82188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690991
1518	NC_011593	CGT	2	6	82308	82313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690991
1519	NC_011593	CAT	2	6	82357	82362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213690991
1520	NC_011593	CG	3	6	82524	82529	0 %	0 %	50 %	50 %	213690992
1521	NC_011593	ATA	2	6	82532	82537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	213690992
1522	NC_011593	GGAA	2	8	82556	82563	50 %	0 %	50 %	0 %	213690992
1523	NC_011593	CACCG	2	10	82582	82591	20 %	0 %	20 %	60 %	213690992
1524	NC_011593	CGG	2	6	82605	82610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213690992
1525	NC_011593	CGA	2	6	82621	82626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690992
1526	NC_011593	AAC	2	6	82635	82640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	213690992
1527	NC_011593	CCG	2	6	82662	82667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690992
1528	NC_011593	CTG	2	6	82680	82685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690992
1529	NC_011593	CGC	2	6	82696	82701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690992
1530	NC_011593	ACC	2	6	82719	82724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213690992
1531	NC_011593	CCG	2	6	82794	82799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690992
1532	NC_011593	AGC	2	6	82815	82820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690992
1533	NC_011593	CTG	2	6	82832	82837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690992
1534	NC_011593	GACC	2	8	82849	82856	25 %	0 %	25 %	50 %	213690992
1535	NC_011593	CGG	2	6	82936	82941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213690992
1536	NC_011593	GTC	2	6	82947	82952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690992
1537	NC_011593	GCC	2	6	82955	82960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690992
1538	NC_011593	CTCGC	2	10	82976	82985	0 %	20 %	20 %	60 %	213690992
1539	NC_011593	CGA	2	6	83047	83052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690992
1540	NC_011593	CTGG	2	8	83083	83090	0 %	25 %	50 %	25 %	213690992
1541	NC_011593	GTC	2	6	83156	83161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690992
1542	NC_011593	GC	3	6	83206	83211	0 %	0 %	50 %	50 %	213690992
1543	NC_011593	ACG	2	6	83289	83294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690992
1544	NC_011593	CCA	2	6	83394	83399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213690992
1545	NC_011593	AGC	2	6	83424	83429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690992
1546	NC_011593	CTT	2	6	83434	83439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	213690992
1547	NC_011593	ACG	2	6	83457	83462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690992
1548	NC_011593	TCT	2	6	83472	83477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	213690992
1549	NC_011593	GAC	2	6	83503	83508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690992
1550	NC_011593	ACCC	2	8	83543	83550	25 %	0 %	0 %	75 %	213690992
1551	NC_011593	CAC	2	6	83626	83631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213690992
1552	NC_011593	CTG	2	6	83660	83665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690992
1553	NC_011593	GGCC	2	8	83685	83692	0 %	0 %	50 %	50 %	213690992
1554	NC_011593	GCT	2	6	83707	83712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690992
1555	NC_011593	ATC	2	6	83729	83734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213690992
1556	NC_011593	GCC	2	6	83783	83788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690992
1557	NC_011593	CGG	2	6	83854	83859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213690992
1558	NC_011593	GCT	2	6	83896	83901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690992
1559	NC_011593	TCA	2	6	84018	84023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213690992
1560	NC_011593	AAG	2	6	84110	84115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	213690992
1561	NC_011593	CGC	2	6	84118	84123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690992
1562	NC_011593	AAG	2	6	84128	84133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	213690992
1563	NC_011593	CAA	2	6	84136	84141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	213690992
1564	NC_011593	CGA	2	6	84187	84192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690992
1565	NC_011593	TTC	2	6	84332	84337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	213690992
1566	NC_011593	CTA	2	6	84358	84363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213690992
1567	NC_011593	CAA	2	6	84391	84396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	213690992
1568	NC_011593	CAG	2	6	84412	84417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690992
1569	NC_011593	TGC	2	6	84453	84458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690992
1570	NC_011593	CTT	2	6	84643	84648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	213690992
1571	NC_011593	CGA	2	6	84667	84672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690992
1572	NC_011593	GAA	2	6	84679	84684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	213690992
1573	NC_011593	CCT	2	6	84708	84713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	213690992
1574	NC_011593	TGG	2	6	84753	84758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213690992
1575	NC_011593	CTC	2	6	85005	85010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	213690992
1576	NC_011593	GGC	2	6	85139	85144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213690993
1577	NC_011593	GAG	2	6	85200	85205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	213690993
1578	NC_011593	CTC	2	6	85220	85225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	213690993
1579	NC_011593	CTG	2	6	85247	85252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690993
1580	NC_011593	CAA	2	6	85270	85275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	213690993
1581	NC_011593	GCG	2	6	85278	85283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213690993
1582	NC_011593	CCG	2	6	85290	85295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690993
1583	NC_011593	CAG	2	6	85298	85303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690993
1584	NC_011593	GAA	2	6	85307	85312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	213690993
1585	NC_011593	AGA	2	6	85325	85330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	213690993
1586	NC_011593	TCGG	2	8	85476	85483	0 %	25 %	50 %	25 %	213690994
1587	NC_011593	TGCA	2	8	85537	85544	25 %	25 %	25 %	25 %	213690994
1588	NC_011593	GGT	2	6	85585	85590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213690994
1589	NC_011593	TGA	2	6	85595	85600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213690994
1590	NC_011593	TTG	2	6	85613	85618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	213690994
1591	NC_011593	CGTG	2	8	85619	85626	0 %	25 %	50 %	25 %	213690994
1592	NC_011593	GGC	2	6	85701	85706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213690994
1593	NC_011593	TGG	2	6	85718	85723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213690994
1594	NC_011593	TCA	2	6	85739	85744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213690994
1595	NC_011593	GGC	2	6	85882	85887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213690994
1596	NC_011593	TGT	2	6	85901	85906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	213690994
1597	NC_011593	CAT	2	6	85985	85990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213690994
1598	NC_011593	TGG	2	6	85994	85999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213690994
1599	NC_011593	GTGGC	3	15	86078	86092	0 %	20 %	60 %	20 %	213690994
1600	NC_011593	CGG	2	6	86103	86108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213690994
1601	NC_011593	GTGG	2	8	86116	86123	0 %	25 %	75 %	0 %	213690994
1602	NC_011593	GCT	2	6	86136	86141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690994
1603	NC_011593	GGTG	2	8	86142	86149	0 %	25 %	75 %	0 %	213690994
1604	NC_011593	TGG	2	6	86210	86215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213690994
1605	NC_011593	TGT	2	6	86237	86242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	213690994
1606	NC_011593	CCATC	2	10	86910	86919	20 %	20 %	0 %	60 %	213690995
1607	NC_011593	TCA	2	6	86921	86926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213690995
1608	NC_011593	GTA	2	6	87012	87017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213690995
1609	NC_011593	CAC	2	6	87018	87023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213690995
1610	NC_011593	GAT	2	6	87039	87044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213690995
1611	NC_011593	TCA	2	6	87140	87145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213690995
1612	NC_011593	TTG	2	6	87277	87282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	213690995
1613	NC_011593	CAG	2	6	87293	87298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690995
1614	NC_011593	GTT	2	6	87336	87341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	213690995
1615	NC_011593	GCG	2	6	87510	87515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213690996
1616	NC_011593	TCG	4	12	87525	87536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690996
1617	NC_011593	CTG	2	6	87551	87556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690996
1618	NC_011593	TGG	2	6	87612	87617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213690996
1619	NC_011593	GCA	2	6	87646	87651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690996
1620	NC_011593	CAAGG	2	10	87740	87749	40 %	0 %	40 %	20 %	213690996
1621	NC_011593	TGC	2	6	87777	87782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690996
1622	NC_011593	CAGCGG	2	12	87790	87801	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	213690996
1623	NC_011593	GAC	2	6	87818	87823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690996
1624	NC_011593	CAA	3	9	87847	87855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	213690996
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1872	NC_011593	GAT	2	6	97587	97592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213691003
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1991	NC_011593	GGCC	2	8	102749	102756	0 %	0 %	50 %	50 %	213691007
1992	NC_011593	CAA	2	6	102773	102778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	213691007
1993	NC_011593	CGG	3	9	102812	102820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691007
1994	NC_011593	TCT	2	6	102862	102867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	213691007
1995	NC_011593	ACG	2	6	102919	102924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691007
1996	NC_011593	CGA	2	6	102928	102933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691007
1997	NC_011593	GCACCG	2	12	103046	103057	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	213691008
1998	NC_011593	CGT	2	6	103081	103086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691008
1999	NC_011593	CG	4	8	103090	103097	0 %	0 %	50 %	50 %	213691008
2000	NC_011593	TGT	2	6	103125	103130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	213691008

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