MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. infantis ATCC 15697 chromosome

Total Repeats: 54322

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011593	AT	3	6	55844	55849	50 %	50 %	0 %	0 %	213690972
1002	NC_011593	GGA	2	6	56232	56237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	213690973
1003	NC_011593	GAG	2	6	56298	56303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	213690973
1004	NC_011593	TGA	2	6	56397	56402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213690973
1005	NC_011593	CGC	2	6	56429	56434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690973
1006	NC_011593	GA	3	6	56446	56451	50 %	0 %	50 %	0 %	213690973
1007	NC_011593	GCT	2	6	56592	56597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690973
1008	NC_011593	AAAG	2	8	56940	56947	75 %	0 %	25 %	0 %	213690974
1009	NC_011593	ATG	2	6	56992	56997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213690974
1010	NC_011593	TTG	2	6	57001	57006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	213690974
1011	NC_011593	GGC	2	6	57036	57041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213690974
1012	NC_011593	CTA	2	6	57232	57237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213690974
1013	NC_011593	TGTT	2	8	57298	57305	0 %	75 %	25 %	0 %	213690974
1014	NC_011593	GTT	2	6	57449	57454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	213690974
1015	NC_011593	TGA	2	6	57464	57469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213690974
1016	NC_011593	GTT	2	6	57495	57500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	213690974
1017	NC_011593	ATCG	2	8	57568	57575	25 %	25 %	25 %	25 %	213690974
1018	NC_011593	TGA	2	6	57604	57609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213690974
1019	NC_011593	TGG	2	6	57655	57660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213690974
1020	NC_011593	TCGA	2	8	57751	57758	25 %	25 %	25 %	25 %	213690974
1021	NC_011593	TGA	3	9	57836	57844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213690974
1022	NC_011593	GGA	2	6	57867	57872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	213690974
1023	NC_011593	GAA	2	6	58056	58061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	213690974
1024	NC_011593	TCC	2	6	58072	58077	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	213690974
1025	NC_011593	GTG	2	6	58083	58088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213690974
1026	NC_011593	GCT	2	6	58175	58180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690974
1027	NC_011593	TGG	2	6	58267	58272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213690974
1028	NC_011593	CTCG	2	8	58309	58316	0 %	25 %	25 %	50 %	213690974
1029	NC_011593	CG	3	6	58367	58372	0 %	0 %	50 %	50 %	213690974
1030	NC_011593	A	7	7	58426	58432	100 %	0 %	0 %	0 %	213690974
1031	NC_011593	GTC	2	6	58440	58445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690974
1032	NC_011593	TTTG	2	8	58466	58473	0 %	75 %	25 %	0 %	213690974
1033	NC_011593	GTT	2	6	58499	58504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	213690974
1034	NC_011593	GAA	2	6	58505	58510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	213690974
1035	NC_011593	GAT	2	6	58573	58578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213690974
1036	NC_011593	CGG	3	9	59355	59363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213690975
1037	NC_011593	TGC	2	6	59370	59375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690975
1038	NC_011593	TGG	2	6	59376	59381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213690975
1039	NC_011593	GGC	2	6	59390	59395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213690975
1040	NC_011593	GCG	2	6	59400	59405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213690975
1041	NC_011593	ACC	2	6	59429	59434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213690975
1042	NC_011593	GT	3	6	59544	59549	0 %	50 %	50 %	0 %	213690975
1043	NC_011593	GCA	2	6	59590	59595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690975
1044	NC_011593	TGG	2	6	59613	59618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213690975
1045	NC_011593	GAT	2	6	59624	59629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213690975
1046	NC_011593	CGC	2	6	59733	59738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690975
1047	NC_011593	GGC	2	6	59795	59800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213690975
1048	NC_011593	CGA	2	6	59884	59889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690975
1049	NC_011593	GGC	2	6	59945	59950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213690975
1050	NC_011593	CAA	2	6	60094	60099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	213690975
1051	NC_011593	TAC	2	6	60101	60106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213690975
1052	NC_011593	GGC	2	6	60110	60115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213690975
1053	NC_011593	AGC	2	6	60240	60245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690975
1054	NC_011593	TGAG	2	8	60285	60292	25 %	25 %	50 %	0 %	213690975
1055	NC_011593	CAG	2	6	60368	60373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690975
1056	NC_011593	ATC	2	6	60374	60379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213690975
1057	NC_011593	CAA	2	6	60460	60465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	213690975
1058	NC_011593	GCT	2	6	60496	60501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690975
1059	NC_011593	CAT	2	6	60673	60678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213690975
1060	NC_011593	GCG	2	6	60696	60701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213690975
1061	NC_011593	CGG	2	6	60715	60720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213690975
1062	NC_011593	ACG	2	6	60750	60755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690975
1063	NC_011593	AAGG	2	8	60833	60840	50 %	0 %	50 %	0 %	213690975
1064	NC_011593	CCATT	2	10	60918	60927	20 %	40 %	0 %	40 %	213690975
1065	NC_011593	GCG	2	6	61004	61009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213690975
1066	NC_011593	TCGA	2	8	61028	61035	25 %	25 %	25 %	25 %	213690975
1067	NC_011593	TCT	2	6	61298	61303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	213690976
1068	NC_011593	GC	3	6	61344	61349	0 %	0 %	50 %	50 %	213690976
1069	NC_011593	CCA	2	6	61370	61375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213690976
1070	NC_011593	GAA	2	6	61398	61403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	213690976
1071	NC_011593	CCT	2	6	61458	61463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	213690976
1072	NC_011593	ATG	2	6	61474	61479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213690976
1073	NC_011593	TCG	2	6	61490	61495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690976
1074	NC_011593	CT	3	6	61566	61571	0 %	50 %	0 %	50 %	213690976
1075	NC_011593	TGT	2	6	61590	61595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	213690976
1076	NC_011593	CTTC	2	8	61619	61626	0 %	50 %	0 %	50 %	213690976
1077	NC_011593	CTG	2	6	61636	61641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690976
1078	NC_011593	ACT	2	6	61764	61769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213690976
1079	NC_011593	TTC	2	6	61777	61782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	213690976
1080	NC_011593	TTCCG	2	10	61807	61816	0 %	40 %	20 %	40 %	213690976
1081	NC_011593	TGC	2	6	61829	61834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690976
1082	NC_011593	GC	5	10	61853	61862	0 %	0 %	50 %	50 %	213690976
1083	NC_011593	CGGT	2	8	61879	61886	0 %	25 %	50 %	25 %	213690976
1084	NC_011593	TTG	2	6	61915	61920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	213690976
1085	NC_011593	GCT	2	6	61932	61937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690976
1086	NC_011593	ATC	2	6	61972	61977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213690976
1087	NC_011593	GCA	2	6	62009	62014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690976
1088	NC_011593	GGC	2	6	62022	62027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213690976
1089	NC_011593	CG	3	6	62034	62039	0 %	0 %	50 %	50 %	213690976
1090	NC_011593	TGA	2	6	62054	62059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213690976
1091	NC_011593	GCT	3	9	62067	62075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690976
1092	NC_011593	CAT	2	6	62112	62117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213690976
1093	NC_011593	ATCACG	2	12	62191	62202	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	213690977
1094	NC_011593	CA	3	6	62285	62290	50 %	0 %	0 %	50 %	213690977
1095	NC_011593	GAT	2	6	62435	62440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213690977
1096	NC_011593	GTG	2	6	62522	62527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213690977
1097	NC_011593	ATC	2	6	62636	62641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213690977
1098	NC_011593	TGT	2	6	62706	62711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	213690977
1099	NC_011593	GCT	2	6	62824	62829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690977
1100	NC_011593	TCA	2	6	62830	62835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213690977
1101	NC_011593	CTG	2	6	62837	62842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690977
1102	NC_011593	TGC	2	6	62850	62855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690977
1103	NC_011593	CGG	2	6	62890	62895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213690977
1104	NC_011593	GCC	2	6	62941	62946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690977
1105	NC_011593	CGT	2	6	62952	62957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690977
1106	NC_011593	ATG	2	6	62966	62971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213690977
1107	NC_011593	GCG	2	6	62972	62977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213690977
1108	NC_011593	CCG	2	6	63023	63028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690977
1109	NC_011593	GGT	2	6	63049	63054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213690977
1110	NC_011593	GAA	2	6	63100	63105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	213690977
1111	NC_011593	TGC	2	6	63171	63176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690978
1112	NC_011593	GCGT	2	8	63177	63184	0 %	25 %	50 %	25 %	213690978
1113	NC_011593	TGGA	2	8	63207	63214	25 %	25 %	50 %	0 %	213690978
1114	NC_011593	ATG	2	6	63237	63242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213690978
1115	NC_011593	TGG	2	6	63279	63284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213690978
1116	NC_011593	GATT	2	8	63325	63332	25 %	50 %	25 %	0 %	213690978
1117	NC_011593	TGG	2	6	63333	63338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213690978
1118	NC_011593	GTG	2	6	63426	63431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213690978
1119	NC_011593	CATT	2	8	63464	63471	25 %	50 %	0 %	25 %	213690978
1120	NC_011593	TGC	2	6	63480	63485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690978
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1122	NC_011593	TGA	2	6	63651	63656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213690978
1123	NC_011593	ATT	2	6	63740	63745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	213690978
1124	NC_011593	CTG	2	6	63749	63754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690978
1125	NC_011593	AGG	2	6	63765	63770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	213690978
1126	NC_011593	CGT	2	6	63835	63840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690978
1127	NC_011593	GCA	2	6	63901	63906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690978
1128	NC_011593	GAT	2	6	63940	63945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213690978
1129	NC_011593	GC	3	6	63948	63953	0 %	0 %	50 %	50 %	213690978
1130	NC_011593	GTC	2	6	63954	63959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690978
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1132	NC_011593	GAT	2	6	64034	64039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213690978
1133	NC_011593	GGAAT	2	10	64060	64069	40 %	20 %	40 %	0 %	213690978
1134	NC_011593	TGG	2	6	64128	64133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213690978
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1145	NC_011593	GATGCC	2	12	64547	64558	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	213690978
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1152	NC_011593	CAT	2	6	65018	65023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213690978
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1158	NC_011593	AATC	2	8	65603	65610	50 %	25 %	0 %	25 %	213690979
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1185	NC_011593	CG	3	6	67337	67342	0 %	0 %	50 %	50 %	213690981
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1234	NC_011593	A	7	7	69530	69536	100 %	0 %	0 %	0 %	213690982
1235	NC_011593	GC	3	6	69614	69619	0 %	0 %	50 %	50 %	213690982
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1239	NC_011593	ATG	2	6	69731	69736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213690982
1240	NC_011593	ACC	2	6	69851	69856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213690982
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1243	NC_011593	GGC	2	6	70054	70059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213690982
1244	NC_011593	GAT	2	6	70136	70141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213690982
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1246	NC_011593	CGA	2	6	70225	70230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690982
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1248	NC_011593	CTG	2	6	70308	70313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690982
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1253	NC_011593	CGG	2	6	70644	70649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213690982
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1494	NC_011593	TCA	2	6	81339	81344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213690990
1495	NC_011593	CTG	3	9	81383	81391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690990
1496	NC_011593	CAGC	2	8	81418	81425	25 %	0 %	25 %	50 %	213690990
1497	NC_011593	CCG	2	6	81432	81437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690990
1498	NC_011593	TCA	2	6	81441	81446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213690990
1499	NC_011593	CGC	2	6	81448	81453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690990
1500	NC_011593	CCG	2	6	81456	81461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690990

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