MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. infantis ATCC 15697 chromosome

Total Repeats: 54322

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011593	GCGGAC	2	12	27476	27487	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	213690952
502	NC_011593	TCG	2	6	27489	27494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690952
503	NC_011593	CCGCGG	2	12	27495	27506	0 %	0 %	50 %	50 %	213690952
504	NC_011593	TCA	2	6	27514	27519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213690952
505	NC_011593	TGC	2	6	27544	27549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690952
506	NC_011593	TGCGCA	2	12	27571	27582	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	213690952
507	NC_011593	CGC	2	6	27622	27627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690952
508	NC_011593	CAG	2	6	27665	27670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690952
509	NC_011593	GTA	2	6	27674	27679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213690952
510	NC_011593	GAT	2	6	27776	27781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213690952
511	NC_011593	GTC	3	9	27785	27793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690952
512	NC_011593	GC	4	8	27802	27809	0 %	0 %	50 %	50 %	213690952
513	NC_011593	GAC	2	6	27869	27874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690952
514	NC_011593	GC	3	6	27896	27901	0 %	0 %	50 %	50 %	213690952
515	NC_011593	CGT	2	6	28197	28202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690953
516	NC_011593	CATC	2	8	28280	28287	25 %	25 %	0 %	50 %	213690953
517	NC_011593	CCG	2	6	28335	28340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690953
518	NC_011593	CAG	3	9	28431	28439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690953
519	NC_011593	CAT	2	6	28466	28471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213690953
520	NC_011593	ATG	2	6	28534	28539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213690953
521	NC_011593	GTC	2	6	28552	28557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690953
522	NC_011593	GTC	2	6	28576	28581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690953
523	NC_011593	GGCCA	2	10	28600	28609	20 %	0 %	40 %	40 %	213690953
524	NC_011593	CGA	2	6	28658	28663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690953
525	NC_011593	GCG	2	6	28677	28682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213690953
526	NC_011593	CGC	2	6	28694	28699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690953
527	NC_011593	GCT	2	6	28709	28714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690953
528	NC_011593	CGC	2	6	28795	28800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690953
529	NC_011593	CGC	2	6	28920	28925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690953
530	NC_011593	CCTA	2	8	28933	28940	25 %	25 %	0 %	50 %	213690953
531	NC_011593	CGC	2	6	28959	28964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690953
532	NC_011593	CCG	2	6	28973	28978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690953
533	NC_011593	GTG	2	6	28980	28985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213690953
534	NC_011593	CAGG	2	8	29340	29347	25 %	0 %	50 %	25 %	213690954
535	NC_011593	GCA	2	6	29484	29489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690954
536	NC_011593	CTT	2	6	29533	29538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	213690954
537	NC_011593	TGT	2	6	29541	29546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	213690954
538	NC_011593	AGT	2	6	29547	29552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213690954
539	NC_011593	CGT	2	6	29685	29690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690954
540	NC_011593	TCT	2	6	29918	29923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	213690954
541	NC_011593	GC	3	6	29926	29931	0 %	0 %	50 %	50 %	213690954
542	NC_011593	ACGA	2	8	30011	30018	50 %	0 %	25 %	25 %	213690954
543	NC_011593	GGCA	2	8	30028	30035	25 %	0 %	50 %	25 %	213690954
544	NC_011593	GCC	2	6	30037	30042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690954
545	NC_011593	TGA	2	6	30080	30085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213690954
546	NC_011593	CGT	2	6	30141	30146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690954
547	NC_011593	TGC	2	6	30155	30160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690954
548	NC_011593	CAG	2	6	30164	30169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690954
549	NC_011593	TCA	2	6	30402	30407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213690954
550	NC_011593	AAT	2	6	30437	30442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	213690954
551	NC_011593	TGA	2	6	30513	30518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213690954
552	NC_011593	CAG	2	6	30553	30558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690954
553	NC_011593	GCA	2	6	30615	30620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690954
554	NC_011593	GAT	2	6	30916	30921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213690955
555	NC_011593	GTC	2	6	30970	30975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690955
556	NC_011593	CTC	2	6	31018	31023	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	213690955
557	NC_011593	CG	3	6	31084	31089	0 %	0 %	50 %	50 %	213690955
558	NC_011593	GCC	2	6	31102	31107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690955
559	NC_011593	CGG	2	6	31125	31130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213690955
560	NC_011593	TCG	2	6	31133	31138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690955
561	NC_011593	GTGC	2	8	31218	31225	0 %	25 %	50 %	25 %	213690955
562	NC_011593	CCT	2	6	31242	31247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	213690955
563	NC_011593	GATGGC	2	12	31273	31284	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	213690955
564	NC_011593	TCA	2	6	31301	31306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213690955
565	NC_011593	CGT	2	6	31440	31445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690956
566	NC_011593	TCC	2	6	31457	31462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	213690956
567	NC_011593	GCG	2	6	31516	31521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213690956
568	NC_011593	GAC	2	6	31537	31542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690956
569	NC_011593	TGT	2	6	31545	31550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	213690956
570	NC_011593	CGT	2	6	31554	31559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690956
571	NC_011593	GCA	2	6	31566	31571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690956
572	NC_011593	CACC	2	8	31575	31582	25 %	0 %	0 %	75 %	213690956
573	NC_011593	TCC	2	6	31640	31645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	213690956
574	NC_011593	GTG	2	6	31730	31735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213690956
575	NC_011593	CGC	2	6	31740	31745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690956
576	NC_011593	CTC	2	6	31792	31797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	213690956
577	NC_011593	CCGT	2	8	31823	31830	0 %	25 %	25 %	50 %	213690956
578	NC_011593	GCC	2	6	31831	31836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690956
579	NC_011593	TCG	2	6	31841	31846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690956
580	NC_011593	GATG	2	8	31860	31867	25 %	25 %	50 %	0 %	213690956
581	NC_011593	GCA	2	6	31878	31883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690956
582	NC_011593	GCA	2	6	31896	31901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690956
583	NC_011593	CAC	2	6	31936	31941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213690956
584	NC_011593	CAG	2	6	31978	31983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690956
585	NC_011593	CGT	2	6	32010	32015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690956
586	NC_011593	CGG	2	6	32070	32075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213690956
587	NC_011593	GC	3	6	32117	32122	0 %	0 %	50 %	50 %	213690956
588	NC_011593	CGA	2	6	32139	32144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690956
589	NC_011593	TCG	3	9	32231	32239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690956
590	NC_011593	CTG	2	6	32257	32262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213690956
591	NC_011593	GAT	2	6	32317	32322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213690956
592	NC_011593	GGC	2	6	32325	32330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213690956
593	NC_011593	CGG	2	6	32334	32339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213690956
594	NC_011593	CAC	2	6	32359	32364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213690956
595	NC_011593	GC	4	8	32366	32373	0 %	0 %	50 %	50 %	213690956
596	NC_011593	GAT	2	6	32443	32448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213690956
597	NC_011593	GAT	2	6	32458	32463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213690956
598	NC_011593	GCC	2	6	32473	32478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690956
599	NC_011593	ACC	2	6	32510	32515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213690956
600	NC_011593	TCC	2	6	32651	32656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	213690956
601	NC_011593	AG	3	6	32687	32692	50 %	0 %	50 %	0 %	213690956
602	NC_011593	AGG	2	6	32750	32755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	213690956
603	NC_011593	CCG	2	6	33036	33041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690957
604	NC_011593	GCC	2	6	33049	33054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690957
605	NC_011593	CAT	2	6	33130	33135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213690957
606	NC_011593	GCA	2	6	33205	33210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690957
607	NC_011593	GA	3	6	33225	33230	50 %	0 %	50 %	0 %	213690957
608	NC_011593	AATCC	2	10	33372	33381	40 %	20 %	0 %	40 %	213690957
609	NC_011593	AAGGG	2	10	33435	33444	40 %	0 %	60 %	0 %	213690957
610	NC_011593	TCA	2	6	33450	33455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213690957
611	NC_011593	GAT	2	6	33485	33490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213690957
612	NC_011593	GCA	2	6	33514	33519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690957
613	NC_011593	TGA	2	6	33553	33558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213690957
614	NC_011593	AAG	2	6	33563	33568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	213690957
615	NC_011593	CGC	2	6	33656	33661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213690957
616	NC_011593	TTG	2	6	33798	33803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	213690957
617	NC_011593	CTA	2	6	33805	33810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213690957
618	NC_011593	GAC	2	6	33857	33862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690957
619	NC_011593	CGA	2	6	33898	33903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690957
620	NC_011593	CAC	2	6	33931	33936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213690957
621	NC_011593	AG	3	6	33943	33948	50 %	0 %	50 %	0 %	213690957
622	NC_011593	GGTG	2	8	33994	34001	0 %	25 %	75 %	0 %	213690957
623	NC_011593	GC	3	6	34016	34021	0 %	0 %	50 %	50 %	213690957
624	NC_011593	CGA	2	6	35584	35589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213690958
625	NC_011593	TCA	2	6	35590	35595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213690958
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747	NC_011593	ACA	2	6	41243	41248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	213690962
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