MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. infantis ATCC 15697 chromosome

Total Repeats: 54322

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_011593	CTG	3	9	275198	275206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691149
5502	NC_011593	CTCG	2	8	275233	275240	0 %	25 %	25 %	50 %	213691149
5503	NC_011593	ACG	2	6	275283	275288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691149
5504	NC_011593	GC	3	6	275344	275349	0 %	0 %	50 %	50 %	213691149
5505	NC_011593	GC	3	6	275377	275382	0 %	0 %	50 %	50 %	213691149
5506	NC_011593	ACC	2	6	275584	275589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213691149
5507	NC_011593	CCG	3	9	275765	275773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691150
5508	NC_011593	CGA	2	6	275822	275827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691150
5509	NC_011593	GGC	3	9	275859	275867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691150
5510	NC_011593	AGA	2	6	275881	275886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	213691150
5511	NC_011593	ATC	2	6	275889	275894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213691150
5512	NC_011593	GAC	2	6	275895	275900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691150
5513	NC_011593	CTG	2	6	275919	275924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691150
5514	NC_011593	TGA	2	6	275956	275961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213691150
5515	NC_011593	TTG	2	6	276082	276087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	213691150
5516	NC_011593	CAA	2	6	276197	276202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	213691150
5517	NC_011593	GC	4	8	276223	276230	0 %	0 %	50 %	50 %	213691150
5518	NC_011593	TGC	2	6	276268	276273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691150
5519	NC_011593	CCG	2	6	276310	276315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691150
5520	NC_011593	TCG	2	6	276320	276325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691150
5521	NC_011593	CCA	2	6	276397	276402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213691150
5522	NC_011593	CG	3	6	276404	276409	0 %	0 %	50 %	50 %	213691150
5523	NC_011593	GCC	2	6	276417	276422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691150
5524	NC_011593	CTG	2	6	276628	276633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691151
5525	NC_011593	AGC	2	6	276670	276675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691151
5526	NC_011593	TCG	2	6	276680	276685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691151
5527	NC_011593	AAG	2	6	276697	276702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	213691151
5528	NC_011593	AAG	2	6	276781	276786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	213691151
5529	NC_011593	GCC	3	9	276787	276795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691151
5530	NC_011593	GCT	2	6	276811	276816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691151
5531	NC_011593	GCC	2	6	276835	276840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691151
5532	NC_011593	CAG	2	6	276920	276925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691152
5533	NC_011593	GGC	3	9	276965	276973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691152
5534	NC_011593	CGA	2	6	277040	277045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691152
5535	NC_011593	TGC	2	6	277159	277164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691152
5536	NC_011593	CGA	2	6	277277	277282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691152
5537	NC_011593	GC	3	6	277295	277300	0 %	0 %	50 %	50 %	213691152
5538	NC_011593	GCC	2	6	277344	277349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691152
5539	NC_011593	CGA	2	6	277367	277372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691152
5540	NC_011593	CAT	2	6	277514	277519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213691152
5541	NC_011593	GCC	2	6	277536	277541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691152
5542	NC_011593	GAG	2	6	277590	277595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	213691152
5543	NC_011593	GACT	2	8	277619	277626	25 %	25 %	25 %	25 %	213691152
5544	NC_011593	CGC	2	6	277667	277672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691152
5545	NC_011593	TGG	2	6	277729	277734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213691152
5546	NC_011593	CCCA	2	8	277765	277772	25 %	0 %	0 %	75 %	213691152
5547	NC_011593	TCG	2	6	277822	277827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691152
5548	NC_011593	CA	3	6	277838	277843	50 %	0 %	0 %	50 %	213691152
5549	NC_011593	CGA	2	6	277850	277855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691152
5550	NC_011593	CTT	2	6	277859	277864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	213691152
5551	NC_011593	GGC	2	6	277902	277907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691152
5552	NC_011593	GCT	2	6	278024	278029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691152
5553	NC_011593	GGA	2	6	278057	278062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	213691152
5554	NC_011593	GGCC	2	8	278168	278175	0 %	0 %	50 %	50 %	213691152
5555	NC_011593	ACC	2	6	278205	278210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213691152
5556	NC_011593	CG	3	6	278217	278222	0 %	0 %	50 %	50 %	213691152
5557	NC_011593	GAA	2	6	278315	278320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	213691152
5558	NC_011593	CCA	2	6	278323	278328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213691152
5559	NC_011593	GCT	2	6	278480	278485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691152
5560	NC_011593	GTG	2	6	278523	278528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213691152
5561	NC_011593	TCG	2	6	278544	278549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691152
5562	NC_011593	CTA	2	6	278555	278560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213691152
5563	NC_011593	CGT	2	6	278615	278620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691152
5564	NC_011593	ACGA	2	8	278785	278792	50 %	0 %	25 %	25 %	213691153
5565	NC_011593	GCT	2	6	278901	278906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691153
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5569	NC_011593	GAT	2	6	279079	279084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213691153
5570	NC_011593	GGCCGG	2	12	279090	279101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691153
5571	NC_011593	CGG	2	6	279164	279169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691153
5572	NC_011593	CGCC	2	8	279216	279223	0 %	0 %	25 %	75 %	213691153
5573	NC_011593	CCA	2	6	279227	279232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213691153
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5578	NC_011593	GC	3	6	279576	279581	0 %	0 %	50 %	50 %	213691153
5579	NC_011593	ATCA	2	8	279662	279669	50 %	25 %	0 %	25 %	213691154
5580	NC_011593	CAG	2	6	279763	279768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691154
5581	NC_011593	GC	3	6	279849	279854	0 %	0 %	50 %	50 %	213691154
5582	NC_011593	GGCCG	2	10	279877	279886	0 %	0 %	60 %	40 %	213691154
5583	NC_011593	AAGC	2	8	279889	279896	50 %	0 %	25 %	25 %	213691154
5584	NC_011593	CGG	2	6	279969	279974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691154
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5587	NC_011593	GGC	2	6	280108	280113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691154
5588	NC_011593	CGGC	2	8	280136	280143	0 %	0 %	50 %	50 %	213691154
5589	NC_011593	TGG	2	6	280158	280163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213691154
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5591	NC_011593	GAT	2	6	280221	280226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213691154
5592	NC_011593	GAA	2	6	280240	280245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	213691154
5593	NC_011593	GCG	2	6	280259	280264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691154
5594	NC_011593	CGG	2	6	280296	280301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691154
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5596	NC_011593	CCA	2	6	280389	280394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213691154
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5598	NC_011593	ATG	2	6	280436	280441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213691154
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5602	NC_011593	AGCT	2	8	280606	280613	25 %	25 %	25 %	25 %	213691154
5603	NC_011593	GAA	2	6	281001	281006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	213691155
5604	NC_011593	AAGG	2	8	281038	281045	50 %	0 %	50 %	0 %	213691155
5605	NC_011593	CGT	2	6	281124	281129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691155
5606	NC_011593	CCG	2	6	281141	281146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691155
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5609	NC_011593	ACCA	2	8	281415	281422	50 %	0 %	0 %	50 %	213691156
5610	NC_011593	GAA	2	6	281498	281503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	213691156
5611	NC_011593	CAG	2	6	281535	281540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691156
5612	NC_011593	CGT	2	6	281576	281581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691156
5613	NC_011593	CCCT	2	8	281607	281614	0 %	25 %	0 %	75 %	213691156
5614	NC_011593	GTC	2	6	281645	281650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691156
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5620	NC_011593	CAG	2	6	281802	281807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691156
5621	NC_011593	TCC	2	6	281901	281906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	213691156
5622	NC_011593	CGG	3	9	281912	281920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691156
5623	NC_011593	CGA	2	6	281921	281926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691156
5624	NC_011593	CAT	2	6	282002	282007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213691157
5625	NC_011593	CCG	2	6	282027	282032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691157
5626	NC_011593	AAG	3	9	282045	282053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	213691157
5627	NC_011593	GCC	2	6	282069	282074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691157
5628	NC_011593	GCT	2	6	282107	282112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691157
5629	NC_011593	CGT	2	6	282150	282155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691157
5630	NC_011593	CTG	2	6	282225	282230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691157
5631	NC_011593	GC	3	6	282435	282440	0 %	0 %	50 %	50 %	213691158
5632	NC_011593	CGC	2	6	282480	282485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691158
5633	NC_011593	GCC	2	6	282490	282495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691158
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5640	NC_011593	GAGT	2	8	282715	282722	25 %	25 %	50 %	0 %	213691158
5641	NC_011593	ATG	2	6	283227	283232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213691159
5642	NC_011593	CG	3	6	283234	283239	0 %	0 %	50 %	50 %	213691159
5643	NC_011593	GCG	2	6	283255	283260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691159
5644	NC_011593	GTC	2	6	283263	283268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691159
5645	NC_011593	G	6	6	283280	283285	0 %	0 %	100 %	0 %	213691159
5646	NC_011593	CGG	2	6	283293	283298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691159
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5649	NC_011593	GCG	2	6	283423	283428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691159
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5652	NC_011593	GGC	2	6	283646	283651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691160
5653	NC_011593	GAT	2	6	283664	283669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213691160
5654	NC_011593	GCA	2	6	283702	283707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691160
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5658	NC_011593	ATC	2	6	283881	283886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213691160
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5677	NC_011593	AGC	2	6	284785	284790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691161
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5723	NC_011593	TA	3	6	288154	288159	50 %	50 %	0 %	0 %	213691165
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5730	NC_011593	AAT	2	6	288376	288381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	213691165
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5732	NC_011593	CAT	2	6	288495	288500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213691165
5733	NC_011593	ACG	2	6	288541	288546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691165
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5738	NC_011593	CAA	2	6	288696	288701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	213691165
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5740	NC_011593	GAT	2	6	288898	288903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213691165
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5981	NC_011593	GCG	2	6	301306	301311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691175
5982	NC_011593	CCA	2	6	301425	301430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213691176
5983	NC_011593	CGC	2	6	301438	301443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691176
5984	NC_011593	GCC	2	6	301461	301466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691176
5985	NC_011593	TCG	2	6	301471	301476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691176
5986	NC_011593	CGC	2	6	301487	301492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691176
5987	NC_011593	CAG	2	6	301499	301504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691176
5988	NC_011593	ACT	2	6	301543	301548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213691176
5989	NC_011593	TGG	2	6	301560	301565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213691176
5990	NC_011593	GCC	2	6	301596	301601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691176
5991	NC_011593	CGG	2	6	301610	301615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691176
5992	NC_011593	TCA	3	9	301618	301626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213691176
5993	NC_011593	ATGGCT	2	12	301713	301724	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	213691176
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5996	NC_011593	TTCT	2	8	301938	301945	0 %	75 %	0 %	25 %	213691177
5997	NC_011593	CAC	2	6	301958	301963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213691177
5998	NC_011593	TCAT	2	8	301978	301985	25 %	50 %	0 %	25 %	213691177
5999	NC_011593	GCC	2	6	302048	302053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691177
6000	NC_011593	TTG	2	6	302103	302108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	213691177

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