MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. infantis ATCC 15697 chromosome

Total Repeats: 54322

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_011593	TCG	2	6	229048	229053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691113
4502	NC_011593	GCG	2	6	229147	229152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691113
4503	NC_011593	GCA	2	6	229159	229164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691113
4504	NC_011593	GTT	2	6	229179	229184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	213691113
4505	NC_011593	TGG	2	6	229193	229198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213691113
4506	NC_011593	TACG	2	8	229202	229209	25 %	25 %	25 %	25 %	213691113
4507	NC_011593	GGC	3	9	229218	229226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691113
4508	NC_011593	GGC	2	6	229230	229235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691113
4509	NC_011593	ACCGCG	2	12	229282	229293	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	213691113
4510	NC_011593	CGCCAC	2	12	229302	229313	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	213691113
4511	NC_011593	TTG	2	6	229351	229356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	213691113
4512	NC_011593	CTG	2	6	229413	229418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691113
4513	NC_011593	GTCA	2	8	229422	229429	25 %	25 %	25 %	25 %	213691113
4514	NC_011593	ATC	3	9	229642	229650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213691114
4515	NC_011593	CAG	2	6	229662	229667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691114
4516	NC_011593	GAT	2	6	229689	229694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213691114
4517	NC_011593	GC	3	6	229721	229726	0 %	0 %	50 %	50 %	213691114
4518	NC_011593	GC	3	6	229733	229738	0 %	0 %	50 %	50 %	213691114
4519	NC_011593	CGCCAG	2	12	229743	229754	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	213691114
4520	NC_011593	CG	3	6	229764	229769	0 %	0 %	50 %	50 %	213691114
4521	NC_011593	CTG	2	6	229785	229790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691114
4522	NC_011593	CGA	2	6	229814	229819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691114
4523	NC_011593	GGT	2	6	229845	229850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213691114
4524	NC_011593	GCGG	2	8	229875	229882	0 %	0 %	75 %	25 %	213691114
4525	NC_011593	AGC	2	6	229912	229917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691114
4526	NC_011593	CAG	2	6	229923	229928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691114
4527	NC_011593	GAT	2	6	229929	229934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213691114
4528	NC_011593	GGT	2	6	229998	230003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213691114
4529	NC_011593	GAG	2	6	230023	230028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	213691114
4530	NC_011593	TGA	2	6	230057	230062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213691114
4531	NC_011593	GCG	2	6	230092	230097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691114
4532	NC_011593	ACGA	2	8	230101	230108	50 %	0 %	25 %	25 %	213691114
4533	NC_011593	GAT	2	6	230166	230171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213691114
4534	NC_011593	CCG	2	6	230176	230181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691114
4535	NC_011593	GC	3	6	230186	230191	0 %	0 %	50 %	50 %	213691114
4536	NC_011593	CCA	2	6	230226	230231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213691114
4537	NC_011593	CCA	2	6	230333	230338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213691114
4538	NC_011593	CGA	2	6	230345	230350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691114
4539	NC_011593	CAC	2	6	230358	230363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213691114
4540	NC_011593	GATGT	2	10	230432	230441	20 %	40 %	40 %	0 %	213691114
4541	NC_011593	CGT	2	6	231095	231100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691115
4542	NC_011593	CGGT	2	8	231190	231197	0 %	25 %	50 %	25 %	213691115
4543	NC_011593	GAT	2	6	231206	231211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213691115
4544	NC_011593	TCC	2	6	231227	231232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	213691115
4545	NC_011593	TCG	2	6	231253	231258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691115
4546	NC_011593	TGA	2	6	231464	231469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213691115
4547	NC_011593	TTG	2	6	231537	231542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	213691115
4548	NC_011593	GAG	2	6	231555	231560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	213691115
4549	NC_011593	CTG	2	6	231594	231599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691115
4550	NC_011593	TAC	2	6	231621	231626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213691115
4551	NC_011593	GC	3	6	231684	231689	0 %	0 %	50 %	50 %	213691115
4552	NC_011593	GCA	2	6	232653	232658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691116
4553	NC_011593	GGC	2	6	232662	232667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691116
4554	NC_011593	GAA	2	6	232682	232687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	213691116
4555	NC_011593	GCA	2	6	232705	232710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691116
4556	NC_011593	CGC	2	6	232740	232745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691116
4557	NC_011593	GC	4	8	232769	232776	0 %	0 %	50 %	50 %	213691116
4558	NC_011593	TCC	2	6	232780	232785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	213691116
4559	NC_011593	CGCT	2	8	232798	232805	0 %	25 %	25 %	50 %	213691116
4560	NC_011593	CGA	2	6	232853	232858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691116
4561	NC_011593	CAC	2	6	232893	232898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213691116
4562	NC_011593	TAC	2	6	232899	232904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213691116
4563	NC_011593	CGC	2	6	233021	233026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691116
4564	NC_011593	GC	3	6	233032	233037	0 %	0 %	50 %	50 %	213691116
4565	NC_011593	CTG	2	6	233040	233045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691116
4566	NC_011593	CGC	2	6	233068	233073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691116
4567	NC_011593	CCA	2	6	233107	233112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213691116
4568	NC_011593	TGG	2	6	233119	233124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213691116
4569	NC_011593	CAC	2	6	233135	233140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213691116
4570	NC_011593	CG	3	6	233212	233217	0 %	0 %	50 %	50 %	213691116
4571	NC_011593	CGC	2	6	233232	233237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691116
4572	NC_011593	TGT	2	6	233263	233268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	213691116
4573	NC_011593	CCA	2	6	233272	233277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213691116
4574	NC_011593	GCT	2	6	233320	233325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691116
4575	NC_011593	GC	3	6	233353	233358	0 %	0 %	50 %	50 %	213691116
4576	NC_011593	CGT	2	6	233361	233366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691116
4577	NC_011593	GT	3	6	233407	233412	0 %	50 %	50 %	0 %	213691116
4578	NC_011593	GCC	2	6	233430	233435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691116
4579	NC_011593	ATCG	2	8	233446	233453	25 %	25 %	25 %	25 %	213691116
4580	NC_011593	GAT	2	6	233508	233513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213691116
4581	NC_011593	GCG	3	9	233537	233545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691116
4582	NC_011593	GCC	3	9	233574	233582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691116
4583	NC_011593	CGCAC	2	10	233593	233602	20 %	0 %	20 %	60 %	213691116
4584	NC_011593	CAA	2	6	233652	233657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	213691116
4585	NC_011593	TGG	2	6	233742	233747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213691116
4586	NC_011593	CG	3	6	233752	233757	0 %	0 %	50 %	50 %	213691116
4587	NC_011593	CTGA	2	8	233829	233836	25 %	25 %	25 %	25 %	213691116
4588	NC_011593	GCC	2	6	233895	233900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691116
4589	NC_011593	AT	3	6	233959	233964	50 %	50 %	0 %	0 %	213691116
4590	NC_011593	CTG	2	6	234024	234029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691116
4591	NC_011593	GCTG	2	8	234062	234069	0 %	25 %	50 %	25 %	213691116
4592	NC_011593	TGG	2	6	234082	234087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213691116
4593	NC_011593	CGA	2	6	234099	234104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691116
4594	NC_011593	TTG	2	6	234135	234140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	213691116
4595	NC_011593	CT	3	6	234259	234264	0 %	50 %	0 %	50 %	213691116
4596	NC_011593	TCG	2	6	234440	234445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691117
4597	NC_011593	GC	3	6	234451	234456	0 %	0 %	50 %	50 %	213691117
4598	NC_011593	CG	3	6	234493	234498	0 %	0 %	50 %	50 %	213691117
4599	NC_011593	GC	3	6	234515	234520	0 %	0 %	50 %	50 %	213691117
4600	NC_011593	GCA	2	6	234529	234534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691117
4601	NC_011593	GTC	2	6	234538	234543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691117
4602	NC_011593	GAT	2	6	234599	234604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213691117
4603	NC_011593	CGC	2	6	234605	234610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691117
4604	NC_011593	TCC	2	6	234616	234621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	213691117
4605	NC_011593	CAT	2	6	234629	234634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213691117
4606	NC_011593	CCACTG	2	12	234667	234678	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	213691117
4607	NC_011593	CGA	2	6	234695	234700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691117
4608	NC_011593	CAC	2	6	234701	234706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213691117
4609	NC_011593	ACC	2	6	234831	234836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	213691117
4610	NC_011593	CAA	2	6	234857	234862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	213691117
4611	NC_011593	GTG	2	6	234864	234869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	213691117
4612	NC_011593	GCA	3	9	234902	234910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691117
4613	NC_011593	CCG	2	6	234988	234993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691117
4614	NC_011593	CAG	2	6	235011	235016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691117
4615	NC_011593	AAG	3	9	235107	235115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	213691117
4616	NC_011593	GGAA	2	8	235141	235148	50 %	0 %	50 %	0 %	213691117
4617	NC_011593	GATGC	2	10	235155	235164	20 %	20 %	40 %	20 %	213691117
4618	NC_011593	CGC	2	6	235208	235213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691117
4619	NC_011593	ACG	2	6	235234	235239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691117
4620	NC_011593	CTA	2	6	235241	235246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213691117
4621	NC_011593	CTC	2	6	235343	235348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	213691117
4622	NC_011593	AAG	2	6	235380	235385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	213691117
4623	NC_011593	CGA	2	6	235391	235396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691117
4624	NC_011593	GAA	2	6	235400	235405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	213691117
4625	NC_011593	GCC	2	6	235422	235427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691117
4626	NC_011593	CGG	2	6	235436	235441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691117
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4630	NC_011593	CGC	2	6	235544	235549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691117
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4634	NC_011593	GC	3	6	235708	235713	0 %	0 %	50 %	50 %	213691117
4635	NC_011593	TCG	2	6	235714	235719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691117
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4639	NC_011593	TCT	2	6	235930	235935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	213691117
4640	NC_011593	GCATG	2	10	235967	235976	20 %	20 %	40 %	20 %	213691117
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4643	NC_011593	ATC	2	6	236013	236018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213691117
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4652	NC_011593	GAG	2	6	236343	236348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	213691117
4653	NC_011593	GC	3	6	236350	236355	0 %	0 %	50 %	50 %	213691117
4654	NC_011593	ATG	2	6	236496	236501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213691118
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4657	NC_011593	TGC	2	6	236533	236538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691118
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4701	NC_011593	CGT	2	6	238744	238749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691120
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4739	NC_011593	GAT	2	6	240091	240096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	213691121
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4741	NC_011593	GAG	2	6	240125	240130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	213691121
4742	NC_011593	TGCG	2	8	240132	240139	0 %	25 %	50 %	25 %	213691121
4743	NC_011593	CACC	2	8	240162	240169	25 %	0 %	0 %	75 %	213691121
4744	NC_011593	GCA	2	6	240217	240222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	213691121
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4862	NC_011593	CCG	2	6	244932	244937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691125
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4981	NC_011593	CAT	2	6	250537	250542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213691128
4982	NC_011593	CTT	2	6	250561	250566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	213691128
4983	NC_011593	GAAG	2	8	250588	250595	50 %	0 %	50 %	0 %	213691128
4984	NC_011593	GCG	2	6	250626	250631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691128
4985	NC_011593	CGG	2	6	250636	250641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691128
4986	NC_011593	GAG	2	6	250643	250648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	213691128
4987	NC_011593	GC	3	6	250650	250655	0 %	0 %	50 %	50 %	213691128
4988	NC_011593	CGG	2	6	250678	250683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	213691128
4989	NC_011593	CGC	2	6	250729	250734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691128
4990	NC_011593	CGTG	2	8	250752	250759	0 %	25 %	50 %	25 %	213691128
4991	NC_011593	GAG	2	6	250886	250891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	213691128
4992	NC_011593	GAG	2	6	250907	250912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	213691128
4993	NC_011593	GAAG	2	8	251152	251159	50 %	0 %	50 %	0 %	213691128
4994	NC_011593	CTGG	2	8	251162	251169	0 %	25 %	50 %	25 %	213691128
4995	NC_011593	TCG	2	6	251214	251219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691128
4996	NC_011593	TGGCG	2	10	251342	251351	0 %	20 %	60 %	20 %	213691128
4997	NC_011593	ATT	2	6	251357	251362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	213691128
4998	NC_011593	CCG	2	6	251414	251419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	213691128
4999	NC_011593	CTG	2	6	251426	251431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	213691128
5000	NC_011593	ATC	2	6	251453	251458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	213691128

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