MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl27

Total Repeats: 372

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011265	AAC	2	6	21	26	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288912
2	NC_011265	CAA	2	6	64	69	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288912
3	NC_011265	CAA	2	6	82	87	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288912
4	NC_011265	TTA	2	6	89	94	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288912
5	NC_011265	ATA	3	9	131	139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288912
6	NC_011265	GCT	3	9	304	312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288912
7	NC_011265	AAG	2	6	350	355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288912
8	NC_011265	TGA	2	6	414	419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288912
9	NC_011265	ATA	2	6	440	445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288912
10	NC_011265	ATA	2	6	521	526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288912
11	NC_011265	TTG	2	6	527	532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288912
12	NC_011265	CAA	2	6	536	541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288912
13	NC_011265	ATT	2	6	608	613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288912
14	NC_011265	TGA	2	6	750	755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288912
15	NC_011265	AAT	2	6	781	786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288912
16	NC_011265	AGA	2	6	897	902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288912
17	NC_011265	ATT	2	6	921	926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288912
18	NC_011265	ATA	2	6	1193	1198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288912
19	NC_011265	ATT	3	9	1289	1297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288912
20	NC_011265	TCG	2	6	1317	1322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288912
21	NC_011265	TAA	2	6	1602	1607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288913
22	NC_011265	TAG	2	6	1653	1658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288913
23	NC_011265	TAA	2	6	1692	1697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288913
24	NC_011265	TAT	2	6	1754	1759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288913
25	NC_011265	GTT	2	6	1813	1818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288913
26	NC_011265	TAT	2	6	1840	1845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288913
27	NC_011265	ATT	2	6	1882	1887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288913
28	NC_011265	CAT	2	6	1927	1932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288913
29	NC_011265	TCC	2	6	1962	1967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288913
30	NC_011265	ACA	2	6	2057	2062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288914
31	NC_011265	ATA	2	6	2068	2073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288914
32	NC_011265	TTA	2	6	2079	2084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288914
33	NC_011265	GTT	2	6	2101	2106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288914
34	NC_011265	ATT	2	6	2122	2127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288914
35	NC_011265	ATT	2	6	2179	2184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288914
36	NC_011265	AAT	2	6	2343	2348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288914
37	NC_011265	CAA	2	6	2368	2373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288914
38	NC_011265	ATA	2	6	2374	2379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288914
39	NC_011265	ATT	2	6	2698	2703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288915
40	NC_011265	TAT	2	6	2947	2952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288915
41	NC_011265	TTA	2	6	3064	3069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288915
42	NC_011265	ATT	2	6	3140	3145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288915
43	NC_011265	TTA	2	6	3157	3162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288915
44	NC_011265	TCA	2	6	3165	3170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288915
45	NC_011265	TAA	2	6	3353	3358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288915
46	NC_011265	CTT	2	6	3362	3367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288915
47	NC_011265	GCT	2	6	3924	3929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288916
48	NC_011265	CTA	2	6	3970	3975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288916
49	NC_011265	CTT	2	6	4117	4122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288916
50	NC_011265	TTC	2	6	4175	4180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288916
51	NC_011265	TTG	2	6	4202	4207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288916
52	NC_011265	TTA	2	6	4251	4256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288916
53	NC_011265	ACT	2	6	4268	4273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288916
54	NC_011265	TAA	2	6	4283	4288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288916
55	NC_011265	GAA	2	6	4513	4518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288917
56	NC_011265	ACT	2	6	4657	4662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288917
57	NC_011265	AGA	2	6	4809	4814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288917
58	NC_011265	TAG	2	6	4863	4868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288917
59	NC_011265	AAG	2	6	4882	4887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288917
60	NC_011265	AGA	2	6	4917	4922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288917
61	NC_011265	GAA	2	6	4953	4958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288917
62	NC_011265	GGA	2	6	4999	5004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	203288917
63	NC_011265	GAA	2	6	5181	5186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288918
64	NC_011265	AGG	2	6	5211	5216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	203288918
65	NC_011265	AAT	2	6	5302	5307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288918
66	NC_011265	TGG	2	6	5454	5459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	203288918
67	NC_011265	CTG	2	6	5501	5506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288918
68	NC_011265	CAA	2	6	5525	5530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288918
69	NC_011265	AAG	2	6	5552	5557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288918
70	NC_011265	ATC	2	6	5612	5617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288918
71	NC_011265	ATT	2	6	5624	5629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288918
72	NC_011265	AAG	2	6	5726	5731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288918
73	NC_011265	TAC	2	6	5768	5773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288918
74	NC_011265	ATG	2	6	5795	5800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288918
75	NC_011265	TAG	2	6	5874	5879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288918
76	NC_011265	TGG	2	6	5880	5885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	203288918
77	NC_011265	ATA	2	6	5888	5893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288918
78	NC_011265	TAT	2	6	5929	5934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288918
79	NC_011265	TAA	2	6	5996	6001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288918
80	NC_011265	GAT	2	6	6043	6048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288918
81	NC_011265	ATA	2	6	6095	6100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288918
82	NC_011265	CAA	2	6	6125	6130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288918
83	NC_011265	TTA	2	6	6166	6171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288918
84	NC_011265	TTA	2	6	6199	6204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288918
85	NC_011265	TAG	2	6	6210	6215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288918
86	NC_011265	ATG	3	9	6266	6274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288918
87	NC_011265	TTG	2	6	6372	6377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288919
88	NC_011265	TAA	2	6	6380	6385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288919
89	NC_011265	TGA	2	6	6491	6496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288919
90	NC_011265	TAC	2	6	6527	6532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288919
91	NC_011265	ATA	2	6	6631	6636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288919
92	NC_011265	TCA	2	6	6804	6809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288919
93	NC_011265	TAT	2	6	6854	6859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288919
94	NC_011265	AAT	2	6	7084	7089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288920
95	NC_011265	AAT	2	6	7157	7162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288920
96	NC_011265	AGA	2	6	7168	7173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288920
97	NC_011265	AAG	2	6	7266	7271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288920
98	NC_011265	CAG	2	6	7332	7337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288920
99	NC_011265	GAT	2	6	7340	7345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288920
100	NC_011265	AGA	2	6	7456	7461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288920
101	NC_011265	GAT	2	6	7463	7468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288920
102	NC_011265	AAG	2	6	7488	7493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288920
103	NC_011265	ATG	2	6	7683	7688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288920
104	NC_011265	ATA	2	6	7740	7745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288920
105	NC_011265	AAG	2	6	7760	7765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288920
106	NC_011265	TGA	2	6	7783	7788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288920
107	NC_011265	GTG	2	6	7806	7811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	203288920
108	NC_011265	AAG	2	6	7823	7828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288920
109	NC_011265	AAT	2	6	7853	7858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288920
110	NC_011265	ATG	2	6	7902	7907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288920
111	NC_011265	ATG	2	6	8067	8072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288920
112	NC_011265	ATT	2	6	8091	8096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288920
113	NC_011265	GAA	2	6	8276	8281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288920
114	NC_011265	AGG	2	6	8341	8346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	203288920
115	NC_011265	TAA	2	6	8348	8353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288920
116	NC_011265	ACA	2	6	8379	8384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288921
117	NC_011265	AGT	2	6	8386	8391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288921
118	NC_011265	TAA	2	6	8422	8427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288921
119	NC_011265	ATA	2	6	8472	8477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288921
120	NC_011265	AGT	2	6	8675	8680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288921
121	NC_011265	AGG	2	6	8691	8696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	203288921
122	NC_011265	CTA	2	6	8699	8704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288921
123	NC_011265	ATT	2	6	8830	8835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288921
124	NC_011265	GAA	2	6	9145	9150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288922
125	NC_011265	TAA	2	6	9178	9183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288922
126	NC_011265	GCA	2	6	9215	9220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288922
127	NC_011265	GGT	2	6	9224	9229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	203288922
128	NC_011265	AGT	2	6	9239	9244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288922
129	NC_011265	GTG	2	6	9291	9296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	203288922
130	NC_011265	GTA	2	6	9335	9340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288922
131	NC_011265	GGT	3	9	9344	9352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	203288922
132	NC_011265	TGA	2	6	9382	9387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288922
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.