MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl26

Total Repeats: 23

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011261	AGAGA	2	10	1814	1823	60 %	0 %	40 %	0 %	203288835
2	NC_011261	CAAAA	2	10	2858	2867	80 %	0 %	0 %	20 %	203288836
3	NC_011261	AATTA	2	10	4397	4406	60 %	40 %	0 %	0 %	203288837
4	NC_011261	TTAAA	2	10	4439	4448	60 %	40 %	0 %	0 %	203288837
5	NC_011261	ATTAG	2	10	5639	5648	40 %	40 %	20 %	0 %	203288839
6	NC_011261	AATAA	2	10	8284	8293	80 %	20 %	0 %	0 %	203288842
7	NC_011261	GTTAT	2	10	8583	8592	20 %	60 %	20 %	0 %	203288842
8	NC_011261	ATTGA	2	10	10384	10393	40 %	40 %	20 %	0 %	203288844
9	NC_011261	TTCTA	2	10	11240	11249	20 %	60 %	0 %	20 %	203288845
10	NC_011261	AATTT	2	10	11303	11312	40 %	60 %	0 %	0 %	203288845
11	NC_011261	ATTCT	2	10	11505	11514	20 %	60 %	0 %	20 %	203288845
12	NC_011261	CAAAG	2	10	12183	12192	60 %	0 %	20 %	20 %	203288846
13	NC_011261	AAAAG	2	10	14065	14074	80 %	0 %	20 %	0 %	203288849
14	NC_011261	CAAAT	2	10	14255	14264	60 %	20 %	0 %	20 %	203288849
15	NC_011261	AAATT	2	10	14441	14450	60 %	40 %	0 %	0 %	203288849
16	NC_011261	ATCAA	2	10	15095	15104	60 %	20 %	0 %	20 %	203288850
17	NC_011261	CACAA	2	10	18450	18459	60 %	0 %	0 %	40 %	203288855
18	NC_011261	ATTCA	2	10	19208	19217	40 %	40 %	0 %	20 %	203288857
19	NC_011261	ACTTT	2	10	20863	20872	20 %	60 %	0 %	20 %	203288859
20	NC_011261	AAAGA	2	10	21858	21867	80 %	0 %	20 %	0 %	203288861
21	NC_011261	ACAAA	2	10	23465	23474	80 %	0 %	0 %	20 %	203288862
22	NC_011261	ATTCT	2	10	25741	25750	20 %	60 %	0 %	20 %	203288866
23	NC_011261	TACAA	2	10	26033	26042	60 %	20 %	0 %	20 %	203288866

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.