MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl26

Total Repeats: 379

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011261	AAT	2	6	548	553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288833
2	NC_011261	TAA	2	6	593	598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288833
3	NC_011261	TAT	2	6	602	607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288833
4	NC_011261	TTA	2	6	618	623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288833
5	NC_011261	ATG	2	6	727	732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288833
6	NC_011261	ACA	2	6	764	769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288833
7	NC_011261	TAA	3	9	848	856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288833
8	NC_011261	ATA	2	6	865	870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288833
9	NC_011261	GAA	2	6	1040	1045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288833
10	NC_011261	TAA	2	6	1275	1280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288834
11	NC_011261	ATT	2	6	1429	1434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288834
12	NC_011261	TAT	2	6	1516	1521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288834
13	NC_011261	ATT	2	6	1563	1568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288834
14	NC_011261	ATA	2	6	1573	1578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288834
15	NC_011261	GGA	2	6	1630	1635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	203288834
16	NC_011261	AAT	2	6	1667	1672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288834
17	NC_011261	ATT	2	6	1733	1738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288835
18	NC_011261	ACT	2	6	1788	1793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288835
19	NC_011261	AAG	2	6	1835	1840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288835
20	NC_011261	AAT	2	6	1905	1910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288835
21	NC_011261	ATT	2	6	2092	2097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288835
22	NC_011261	CAG	2	6	2113	2118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288835
23	NC_011261	TTA	2	6	2197	2202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288835
24	NC_011261	ATA	2	6	2218	2223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288835
25	NC_011261	ATT	2	6	2234	2239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288835
26	NC_011261	ATA	2	6	2317	2322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288835
27	NC_011261	TAA	3	9	2526	2534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288836
28	NC_011261	GAA	2	6	2536	2541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288836
29	NC_011261	TAA	2	6	2610	2615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288836
30	NC_011261	TAT	2	6	2659	2664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288836
31	NC_011261	ATG	2	6	2708	2713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288836
32	NC_011261	ATT	2	6	2735	2740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288836
33	NC_011261	GCA	2	6	2749	2754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288836
34	NC_011261	AGA	2	6	2760	2765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288836
35	NC_011261	AGA	2	6	2775	2780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288836
36	NC_011261	ATT	2	6	2961	2966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288836
37	NC_011261	TAA	2	6	3462	3467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288837
38	NC_011261	TAA	2	6	3474	3479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288837
39	NC_011261	CAA	2	6	3499	3504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288837
40	NC_011261	CAA	2	6	3517	3522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288837
41	NC_011261	TTA	2	6	3524	3529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288837
42	NC_011261	ATA	3	9	3566	3574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288837
43	NC_011261	GCT	2	6	3739	3744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288837
44	NC_011261	AAG	2	6	3785	3790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288837
45	NC_011261	TGA	2	6	3849	3854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288837
46	NC_011261	ATA	2	6	3875	3880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288837
47	NC_011261	TTG	2	6	3962	3967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288837
48	NC_011261	CAA	2	6	3971	3976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288837
49	NC_011261	ATT	2	6	4043	4048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288837
50	NC_011261	TGA	2	6	4185	4190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288837
51	NC_011261	AAT	2	6	4216	4221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288837
52	NC_011261	TGA	2	6	4238	4243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288837
53	NC_011261	AGA	2	6	4332	4337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288837
54	NC_011261	ATT	2	6	4379	4384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288837
55	NC_011261	ATA	2	6	4628	4633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288837
56	NC_011261	ATT	2	6	4724	4729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288837
57	NC_011261	TCG	2	6	4752	4757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288837
58	NC_011261	ATG	3	9	5006	5014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288838
59	NC_011261	TAA	2	6	5035	5040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288838
60	NC_011261	TAG	2	6	5086	5091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288838
61	NC_011261	TAA	2	6	5125	5130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288838
62	NC_011261	TAT	2	6	5187	5192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288838
63	NC_011261	GTT	2	6	5246	5251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288838
64	NC_011261	ATT	2	6	5315	5320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288838
65	NC_011261	CAT	2	6	5360	5365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288838
66	NC_011261	TCC	2	6	5395	5400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288838
67	NC_011261	ACA	2	6	5503	5508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288839
68	NC_011261	ATA	2	6	5514	5519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288839
69	NC_011261	TTA	2	6	5525	5530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288839
70	NC_011261	GTT	2	6	5547	5552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288839
71	NC_011261	ATT	2	6	5568	5573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288839
72	NC_011261	TAA	3	9	5617	5625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288839
73	NC_011261	TTA	2	6	5626	5631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288839
74	NC_011261	AAT	2	6	5789	5794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288839
75	NC_011261	CAA	2	6	5814	5819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288839
76	NC_011261	ATA	2	6	5820	5825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288839
77	NC_011261	ATC	2	6	5874	5879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288839
78	NC_011261	ATT	2	6	6327	6332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288840
79	NC_011261	TAT	2	6	6576	6581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288840
80	NC_011261	TTA	2	6	6693	6698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288840
81	NC_011261	ATT	2	6	6769	6774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288840
82	NC_011261	TCT	2	6	6779	6784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288840
83	NC_011261	TCA	2	6	6794	6799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288840
84	NC_011261	CTC	2	6	6822	6827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288840
85	NC_011261	TAA	2	6	6982	6987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288840
86	NC_011261	CTT	2	6	6991	6996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288840
87	NC_011261	TTG	2	6	7561	7566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288841
88	NC_011261	ATT	2	6	7595	7600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288841
89	NC_011261	TTA	2	6	7621	7626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288841
90	NC_011261	CTT	2	6	7768	7773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288841
91	NC_011261	CTT	2	6	7825	7830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288841
92	NC_011261	TTG	2	6	7853	7858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288841
93	NC_011261	TAT	2	6	7900	7905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288841
94	NC_011261	ACT	2	6	7919	7924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288841
95	NC_011261	TAG	2	6	7928	7933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288841
96	NC_011261	TAA	2	6	7934	7939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288841
97	NC_011261	ACT	2	6	8305	8310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288842
98	NC_011261	ATT	2	6	8426	8431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288842
99	NC_011261	AGA	2	6	8457	8462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288842
100	NC_011261	TAG	2	6	8511	8516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288842
101	NC_011261	AAG	2	6	8530	8535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288842
102	NC_011261	GAA	2	6	8601	8606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288842
103	NC_011261	GGA	2	6	8647	8652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	203288842
104	NC_011261	AGT	3	9	8672	8680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288843
105	NC_011261	CTT	2	6	8733	8738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288843
106	NC_011261	AAT	2	6	8834	8839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288843
107	NC_011261	AAT	2	6	8951	8956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288843
108	NC_011261	TGG	2	6	9103	9108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	203288843
109	NC_011261	CTG	2	6	9150	9155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288843
110	NC_011261	CAA	2	6	9174	9179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288843
111	NC_011261	AAG	2	6	9201	9206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288843
112	NC_011261	ATC	2	6	9261	9266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288843
113	NC_011261	ATT	2	6	9273	9278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288843
114	NC_011261	AAG	2	6	9375	9380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288843
115	NC_011261	TAC	2	6	9417	9422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288843
116	NC_011261	ATG	2	6	9444	9449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288843
117	NC_011261	TAG	2	6	9523	9528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288843
118	NC_011261	TGG	2	6	9529	9534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	203288843
119	NC_011261	ATA	2	6	9537	9542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288843
120	NC_011261	TAT	2	6	9578	9583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288843
121	NC_011261	TAA	2	6	9645	9650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288843
122	NC_011261	GAT	2	6	9692	9697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288843
123	NC_011261	ATA	2	6	9744	9749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288843
124	NC_011261	CAA	2	6	9774	9779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288843
125	NC_011261	TTA	2	6	9815	9820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288843
126	NC_011261	TTA	2	6	9848	9853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288843
127	NC_011261	TAG	2	6	9859	9864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288843
128	NC_011261	ATG	3	9	9915	9923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288843
129	NC_011261	CAG	2	6	9939	9944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288843
130	NC_011261	ATT	2	6	10020	10025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288844
131	NC_011261	TAA	2	6	10029	10034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288844
132	NC_011261	TAC	2	6	10176	10181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288844
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257	NC_011261	GAT	2	6	17797	17802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288855
258	NC_011261	CTT	2	6	17829	17834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288855
259	NC_011261	CAA	2	6	17929	17934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288855
260	NC_011261	GAA	2	6	18040	18045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288855
261	NC_011261	GCA	2	6	18292	18297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288855
262	NC_011261	TTG	2	6	18320	18325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288855
263	NC_011261	TGC	2	6	18378	18383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288855
264	NC_011261	AGG	2	6	18488	18493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	203288855
265	NC_011261	AAT	2	6	18497	18502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288855
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274	NC_011261	AGA	3	9	19236	19244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288857
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278	NC_011261	ATG	2	6	19495	19500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288858
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289	NC_011261	TAT	2	6	20267	20272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288859
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379	NC_011261	AAT	2	6	26198	26203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288866

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.