MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Borrelia recurrentis A1 plasmid pl53

Total Repeats: 57

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011260	TA	3	6	4157	4162	50 %	50 %	0 %	0 %	203288438
2	NC_011260	AT	3	6	4415	4420	50 %	50 %	0 %	0 %	203288438
3	NC_011260	AT	3	6	4625	4630	50 %	50 %	0 %	0 %	203288438
4	NC_011260	TA	3	6	5219	5224	50 %	50 %	0 %	0 %	203288439
5	NC_011260	AT	3	6	5312	5317	50 %	50 %	0 %	0 %	203288439
6	NC_011260	AG	3	6	5542	5547	50 %	0 %	50 %	0 %	203288439
7	NC_011260	GA	3	6	5833	5838	50 %	0 %	50 %	0 %	203288440
8	NC_011260	TA	3	6	6047	6052	50 %	50 %	0 %	0 %	203288440
9	NC_011260	AT	3	6	6423	6428	50 %	50 %	0 %	0 %	203288441
10	NC_011260	TA	3	6	6571	6576	50 %	50 %	0 %	0 %	203288441
11	NC_011260	AG	3	6	6759	6764	50 %	0 %	50 %	0 %	203288441
12	NC_011260	TA	4	8	7187	7194	50 %	50 %	0 %	0 %	203288442
13	NC_011260	AT	3	6	7263	7268	50 %	50 %	0 %	0 %	203288442
14	NC_011260	AG	3	6	7445	7450	50 %	0 %	50 %	0 %	203288442
15	NC_011260	TC	3	6	10893	10898	0 %	50 %	0 %	50 %	203288444
16	NC_011260	TC	5	10	12542	12551	0 %	50 %	0 %	50 %	203288445
17	NC_011260	TA	3	6	15881	15886	50 %	50 %	0 %	0 %	203288446
18	NC_011260	AT	3	6	16056	16061	50 %	50 %	0 %	0 %	203288446
19	NC_011260	TC	3	6	16172	16177	0 %	50 %	0 %	50 %	203288447
20	NC_011260	AT	3	6	16192	16197	50 %	50 %	0 %	0 %	203288447
21	NC_011260	TA	3	6	16211	16216	50 %	50 %	0 %	0 %	203288447
22	NC_011260	AT	3	6	16367	16372	50 %	50 %	0 %	0 %	203288447
23	NC_011260	AT	4	8	16700	16707	50 %	50 %	0 %	0 %	203288447
24	NC_011260	AC	3	6	17058	17063	50 %	0 %	0 %	50 %	203288448
25	NC_011260	TA	3	6	17086	17091	50 %	50 %	0 %	0 %	203288448
26	NC_011260	AT	3	6	17649	17654	50 %	50 %	0 %	0 %	203288449
27	NC_011260	AG	3	6	18007	18012	50 %	0 %	50 %	0 %	203288449
28	NC_011260	TC	3	6	18312	18317	0 %	50 %	0 %	50 %	203288449
29	NC_011260	TA	3	6	18481	18486	50 %	50 %	0 %	0 %	203288449
30	NC_011260	AT	3	6	20268	20273	50 %	50 %	0 %	0 %	203288450
31	NC_011260	TA	3	6	24209	24214	50 %	50 %	0 %	0 %	203288452
32	NC_011260	TA	3	6	24233	24238	50 %	50 %	0 %	0 %	203288452
33	NC_011260	TC	3	6	28829	28834	0 %	50 %	0 %	50 %	203288453
34	NC_011260	AT	3	6	29174	29179	50 %	50 %	0 %	0 %	203288453
35	NC_011260	TC	4	8	29507	29514	0 %	50 %	0 %	50 %	203288453
36	NC_011260	TC	3	6	29558	29563	0 %	50 %	0 %	50 %	203288453
37	NC_011260	AT	3	6	32247	32252	50 %	50 %	0 %	0 %	203288455
38	NC_011260	AT	3	6	33751	33756	50 %	50 %	0 %	0 %	203288456
39	NC_011260	AT	3	6	33864	33869	50 %	50 %	0 %	0 %	203288456
40	NC_011260	AT	3	6	33949	33954	50 %	50 %	0 %	0 %	203288456
41	NC_011260	TA	3	6	33989	33994	50 %	50 %	0 %	0 %	203288456
42	NC_011260	AT	3	6	34235	34240	50 %	50 %	0 %	0 %	203288456
43	NC_011260	TA	3	6	34642	34647	50 %	50 %	0 %	0 %	203288457
44	NC_011260	TA	3	6	34681	34686	50 %	50 %	0 %	0 %	203288457
45	NC_011260	AT	3	6	35437	35442	50 %	50 %	0 %	0 %	203288458
46	NC_011260	TA	3	6	35530	35535	50 %	50 %	0 %	0 %	203288458
47	NC_011260	TG	4	8	35771	35778	0 %	50 %	50 %	0 %	203288458
48	NC_011260	AG	4	8	37064	37071	50 %	0 %	50 %	0 %	203288459
49	NC_011260	GA	3	6	37183	37188	50 %	0 %	50 %	0 %	203288459
50	NC_011260	GA	3	6	38695	38700	50 %	0 %	50 %	0 %	203288460
51	NC_011260	AG	3	6	39491	39496	50 %	0 %	50 %	0 %	203288461
52	NC_011260	AG	3	6	39503	39508	50 %	0 %	50 %	0 %	203288461
53	NC_011260	AT	3	6	40158	40163	50 %	50 %	0 %	0 %	203288461
54	NC_011260	GA	3	6	40958	40963	50 %	0 %	50 %	0 %	203288462
55	NC_011260	GA	3	6	41337	41342	50 %	0 %	50 %	0 %	203288462
56	NC_011260	AG	3	6	43314	43319	50 %	0 %	50 %	0 %	203288463
57	NC_011260	GA	3	6	44044	44049	50 %	0 %	50 %	0 %	203288463

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.