MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia recurrentis A1 plasmid pl53

Total Repeats: 70

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011260	ATTT	3	12	844	855	25 %	75 %	0 %	0 %	203288437
2	NC_011260	TTTA	2	8	4164	4171	25 %	75 %	0 %	0 %	203288438
3	NC_011260	TTTA	2	8	4191	4198	25 %	75 %	0 %	0 %	203288438
4	NC_011260	CAAA	2	8	4957	4964	75 %	0 %	0 %	25 %	203288439
5	NC_011260	ATTA	2	8	5054	5061	50 %	50 %	0 %	0 %	203288439
6	NC_011260	CAAA	2	8	5066	5073	75 %	0 %	0 %	25 %	203288439
7	NC_011260	GTCA	2	8	5399	5406	25 %	25 %	25 %	25 %	203288439
8	NC_011260	ATAA	2	8	5738	5745	75 %	25 %	0 %	0 %	203288440
9	NC_011260	ATTT	2	8	5871	5878	25 %	75 %	0 %	0 %	203288440
10	NC_011260	ATTG	2	8	6309	6316	25 %	50 %	25 %	0 %	203288441
11	NC_011260	ATGA	2	8	6448	6455	50 %	25 %	25 %	0 %	203288441
12	NC_011260	TTTG	2	8	6881	6888	0 %	75 %	25 %	0 %	203288441
13	NC_011260	TTTG	2	8	7047	7054	0 %	75 %	25 %	0 %	203288442
14	NC_011260	AGGA	2	8	8289	8296	50 %	0 %	50 %	0 %	203288443
15	NC_011260	AAGG	2	8	8311	8318	50 %	0 %	50 %	0 %	203288443
16	NC_011260	GAAA	2	8	8445	8452	75 %	0 %	25 %	0 %	203288443
17	NC_011260	TATC	2	8	10624	10631	25 %	50 %	0 %	25 %	203288444
18	NC_011260	ATTT	2	8	12558	12565	25 %	75 %	0 %	0 %	203288445
19	NC_011260	TTAC	2	8	12799	12806	25 %	50 %	0 %	25 %	203288445
20	NC_011260	ATTA	2	8	15583	15590	50 %	50 %	0 %	0 %	203288446
21	NC_011260	ATCC	2	8	15938	15945	25 %	25 %	0 %	50 %	203288446
22	NC_011260	GCTA	2	8	16244	16251	25 %	25 %	25 %	25 %	203288447
23	NC_011260	TAAA	2	8	16582	16589	75 %	25 %	0 %	0 %	203288447
24	NC_011260	TTTC	2	8	16933	16940	0 %	75 %	0 %	25 %	203288448
25	NC_011260	AATC	2	8	17559	17566	50 %	25 %	0 %	25 %	203288449
26	NC_011260	TGTT	2	8	18181	18188	0 %	75 %	25 %	0 %	203288449
27	NC_011260	TATT	2	8	18524	18531	25 %	75 %	0 %	0 %	203288449
28	NC_011260	AATA	2	8	20251	20258	75 %	25 %	0 %	0 %	203288450
29	NC_011260	TATT	2	8	20343	20350	25 %	75 %	0 %	0 %	203288450
30	NC_011260	TGTT	2	8	20550	20557	0 %	75 %	25 %	0 %	203288450
31	NC_011260	ATCT	2	8	20650	20657	25 %	50 %	0 %	25 %	203288450
32	NC_011260	TAAA	2	8	20707	20714	75 %	25 %	0 %	0 %	203288450
33	NC_011260	TTCT	2	8	20764	20771	0 %	75 %	0 %	25 %	203288450
34	NC_011260	AGAT	2	8	24600	24607	50 %	25 %	25 %	0 %	203288452
35	NC_011260	ACTT	2	8	28786	28793	25 %	50 %	0 %	25 %	203288453
36	NC_011260	CCTT	2	8	28984	28991	0 %	50 %	0 %	50 %	203288453
37	NC_011260	TCTT	2	8	29032	29039	0 %	75 %	0 %	25 %	203288453
38	NC_011260	CACT	2	8	29186	29193	25 %	25 %	0 %	50 %	203288453
39	NC_011260	TACT	2	8	29207	29214	25 %	50 %	0 %	25 %	203288453
40	NC_011260	TCCT	2	8	29463	29470	0 %	50 %	0 %	50 %	203288453
41	NC_011260	CTTA	2	8	29475	29482	25 %	50 %	0 %	25 %	203288453
42	NC_011260	CTTC	2	8	29567	29574	0 %	50 %	0 %	50 %	203288453
43	NC_011260	TTAC	2	8	31318	31325	25 %	50 %	0 %	25 %	203288454
44	NC_011260	ACTT	2	8	31793	31800	25 %	50 %	0 %	25 %	203288455
45	NC_011260	TACA	2	8	33968	33975	50 %	25 %	0 %	25 %	203288456
46	NC_011260	GAAT	2	8	34628	34635	50 %	25 %	25 %	0 %	203288457
47	NC_011260	TAAA	2	8	34854	34861	75 %	25 %	0 %	0 %	203288457
48	NC_011260	ATTT	2	8	34881	34888	25 %	75 %	0 %	0 %	203288457
49	NC_011260	TTGT	2	8	35268	35275	0 %	75 %	25 %	0 %	203288458
50	NC_011260	GTTT	2	8	35468	35475	0 %	75 %	25 %	0 %	203288458
51	NC_011260	AAGC	2	8	35482	35489	50 %	0 %	25 %	25 %	203288458
52	NC_011260	TCAT	2	8	35805	35812	25 %	50 %	0 %	25 %	203288458
53	NC_011260	AGTA	2	8	37871	37878	50 %	25 %	25 %	0 %	203288459
54	NC_011260	AAGG	2	8	38654	38661	50 %	0 %	50 %	0 %	203288460
55	NC_011260	TGAG	2	8	39618	39625	25 %	25 %	50 %	0 %	203288461
56	NC_011260	CAAT	2	8	40374	40381	50 %	25 %	0 %	25 %	203288461
57	NC_011260	AGTA	2	8	40533	40540	50 %	25 %	25 %	0 %	203288461
58	NC_011260	GCAA	2	8	40911	40918	50 %	0 %	25 %	25 %	203288462
59	NC_011260	GAAA	2	8	41051	41058	75 %	0 %	25 %	0 %	203288462
60	NC_011260	TAAA	2	8	41234	41241	75 %	25 %	0 %	0 %	203288462
61	NC_011260	GAAG	2	8	43034	43041	50 %	0 %	50 %	0 %	203288463
62	NC_011260	TGAG	2	8	43162	43169	25 %	25 %	50 %	0 %	203288463
63	NC_011260	AAAG	2	8	43814	43821	75 %	0 %	25 %	0 %	203288463
64	NC_011260	AAAG	2	8	43841	43848	75 %	0 %	25 %	0 %	203288463
65	NC_011260	AAAT	2	8	44026	44033	75 %	25 %	0 %	0 %	203288463
66	NC_011260	AAGG	2	8	44052	44059	50 %	0 %	50 %	0 %	203288463
67	NC_011260	TAAT	2	8	44081	44088	50 %	50 %	0 %	0 %	203288463
68	NC_011260	AAAG	2	8	44793	44800	75 %	0 %	25 %	0 %	203288464
69	NC_011260	TAGA	2	8	44804	44811	50 %	25 %	25 %	0 %	203288464
70	NC_011260	CGAT	2	8	44867	44874	25 %	25 %	25 %	25 %	203288464

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.