MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl23

Total Repeats: 269

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011257	AAT	2	6	618	623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288798
2	NC_011257	TTA	2	6	664	669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288798
3	NC_011257	AAT	3	9	674	682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288798
4	NC_011257	CTC	2	6	735	740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288798
5	NC_011257	ACA	2	6	1328	1333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288799
6	NC_011257	TCA	2	6	1340	1345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288799
7	NC_011257	ATT	2	6	1477	1482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288799
8	NC_011257	GAA	2	6	1553	1558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288799
9	NC_011257	CAG	2	6	1602	1607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288799
10	NC_011257	AAC	2	6	1645	1650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288799
11	NC_011257	CAA	2	6	1653	1658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288799
12	NC_011257	GTT	2	6	1725	1730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288799
13	NC_011257	AAT	2	6	1770	1775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288799
14	NC_011257	CAA	2	6	1797	1802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288799
15	NC_011257	TAT	2	6	1803	1808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288799
16	NC_011257	AAG	2	6	1936	1941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288799
17	NC_011257	TAA	2	6	1974	1979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288799
18	NC_011257	ATC	2	6	1999	2004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288799
19	NC_011257	CAT	2	6	2022	2027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288799
20	NC_011257	ATT	2	6	2056	2061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288799
21	NC_011257	ACA	2	6	2102	2107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288799
22	NC_011257	AAT	2	6	2213	2218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288799
23	NC_011257	CAT	2	6	2226	2231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288799
24	NC_011257	TCC	2	6	2250	2255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288799
25	NC_011257	CAT	2	6	2558	2563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288800
26	NC_011257	ATG	2	6	2582	2587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288800
27	NC_011257	AGC	2	6	2808	2813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288800
28	NC_011257	ATC	2	6	2908	2913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288800
29	NC_011257	GCA	2	6	2929	2934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288800
30	NC_011257	ACC	2	6	2967	2972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288800
31	NC_011257	CAT	2	6	3017	3022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288800
32	NC_011257	TTG	2	6	3065	3070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288800
33	NC_011257	CTT	2	6	3140	3145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288800
34	NC_011257	TAG	2	6	3221	3226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288800
35	NC_011257	CAA	3	9	3245	3253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288800
36	NC_011257	TTC	2	6	3279	3284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288800
37	NC_011257	TTA	2	6	3407	3412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288800
38	NC_011257	TCA	2	6	3433	3438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288800
39	NC_011257	TCT	2	6	3502	3507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288800
40	NC_011257	ATC	2	6	3555	3560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288800
41	NC_011257	TAA	2	6	3695	3700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288800
42	NC_011257	GAT	2	6	3722	3727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288800
43	NC_011257	GAT	2	6	3928	3933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288800
44	NC_011257	CAT	2	6	3953	3958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288800
45	NC_011257	CTT	2	6	3971	3976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288800
46	NC_011257	ATT	2	6	3995	4000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288800
47	NC_011257	ATA	2	6	5257	5262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288801
48	NC_011257	AGC	2	6	5348	5353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288801
49	NC_011257	CAA	2	6	5377	5382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288801
50	NC_011257	AAC	2	6	5426	5431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288801
51	NC_011257	TAA	2	6	5543	5548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288801
52	NC_011257	TTA	2	6	5553	5558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288801
53	NC_011257	ATA	2	6	5647	5652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288801
54	NC_011257	TTA	2	6	5715	5720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288801
55	NC_011257	AGC	2	6	5783	5788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288801
56	NC_011257	TCA	2	6	5860	5865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288801
57	NC_011257	AAT	2	6	5891	5896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288801
58	NC_011257	ATA	2	6	5928	5933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288801
59	NC_011257	ATA	2	6	6102	6107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288801
60	NC_011257	ACA	2	6	6162	6167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288801
61	NC_011257	AAC	2	6	6326	6331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288801
62	NC_011257	TAT	2	6	6332	6337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288801
63	NC_011257	TAT	2	6	6397	6402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288801
64	NC_011257	ATT	2	6	6428	6433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288801
65	NC_011257	TTA	2	6	6574	6579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288802
66	NC_011257	ATT	2	6	6609	6614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288802
67	NC_011257	TAA	2	6	6656	6661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288802
68	NC_011257	TAA	2	6	6677	6682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288802
69	NC_011257	CTA	2	6	6782	6787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288802
70	NC_011257	AAT	2	6	6854	6859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288802
71	NC_011257	TAT	2	6	6875	6880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288802
72	NC_011257	TAA	2	6	6990	6995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288802
73	NC_011257	TAA	2	6	7007	7012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288802
74	NC_011257	TAT	2	6	7059	7064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288803
75	NC_011257	ATT	2	6	7070	7075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288803
76	NC_011257	CTA	2	6	7101	7106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288803
77	NC_011257	CAT	2	6	7135	7140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288803
78	NC_011257	AAT	2	6	7342	7347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288803
79	NC_011257	ATT	2	6	7406	7411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288803
80	NC_011257	AAT	2	6	7629	7634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288804
81	NC_011257	ATC	2	6	7716	7721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288804
82	NC_011257	GAA	2	6	7767	7772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288804
83	NC_011257	ATA	2	6	7948	7953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288804
84	NC_011257	CAA	2	6	7981	7986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288804
85	NC_011257	TTA	2	6	7989	7994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288804
86	NC_011257	TAC	2	6	8206	8211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288804
87	NC_011257	GAA	2	6	8298	8303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288804
88	NC_011257	ATT	2	6	8323	8328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288805
89	NC_011257	CAA	2	6	8371	8376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288805
90	NC_011257	TAA	2	6	8422	8427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288805
91	NC_011257	AAT	2	6	8570	8575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288805
92	NC_011257	CTT	2	6	8585	8590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288805
93	NC_011257	TAT	2	6	8629	8634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288805
94	NC_011257	TTA	2	6	8691	8696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288805
95	NC_011257	ATC	2	6	8795	8800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288805
96	NC_011257	AAC	2	6	8833	8838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288805
97	NC_011257	TAT	3	9	9031	9039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288806
98	NC_011257	CAT	2	6	9048	9053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288806
99	NC_011257	CTA	2	6	9153	9158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288806
100	NC_011257	ATT	2	6	9168	9173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288806
101	NC_011257	ATT	2	6	9187	9192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288806
102	NC_011257	AGA	2	6	9193	9198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288806
103	NC_011257	ATG	2	6	9399	9404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288806
104	NC_011257	CAA	2	6	9417	9422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288806
105	NC_011257	AAT	2	6	9503	9508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288806
106	NC_011257	TAT	2	6	9588	9593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288806
107	NC_011257	GAT	2	6	9668	9673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288806
108	NC_011257	ATT	2	6	9678	9683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288806
109	NC_011257	TAT	2	6	9704	9709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288806
110	NC_011257	ATT	2	6	9741	9746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288806
111	NC_011257	TTA	2	6	9772	9777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288806
112	NC_011257	ATA	2	6	10007	10012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288806
113	NC_011257	TCA	2	6	10075	10080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288806
114	NC_011257	AAT	2	6	10084	10089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288806
115	NC_011257	ATA	2	6	10229	10234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288806
116	NC_011257	ACA	2	6	11089	11094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288807
117	NC_011257	CAG	2	6	11351	11356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288807
118	NC_011257	AAC	2	6	11469	11474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288807
119	NC_011257	GGA	2	6	11551	11556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	203288807
120	NC_011257	GCA	2	6	11575	11580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288807
121	NC_011257	GGA	2	6	11635	11640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	203288807
122	NC_011257	CAT	2	6	11655	11660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288807
123	NC_011257	TAG	2	6	11681	11686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288807
124	NC_011257	AAT	2	6	11688	11693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288807
125	NC_011257	ATG	2	6	11725	11730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288807
126	NC_011257	TCA	2	6	11820	11825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288807
127	NC_011257	TCT	2	6	11828	11833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288807
128	NC_011257	TAC	2	6	11937	11942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288807
129	NC_011257	GCT	2	6	12016	12021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288807
130	NC_011257	TGC	2	6	12063	12068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288807
131	NC_011257	GCA	2	6	12145	12150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288807
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256	NC_011257	AAG	2	6	22808	22813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288818
257	NC_011257	ATA	2	6	22871	22876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288818
258	NC_011257	TGA	2	6	22878	22883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288818
259	NC_011257	GCT	3	9	22921	22929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288818
260	NC_011257	AAG	2	6	22937	22942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288818
261	NC_011257	GCA	2	6	22954	22959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288818
262	NC_011257	TAA	3	9	23031	23039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288818
263	NC_011257	TAA	2	6	23049	23054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288818
264	NC_011257	TGC	2	6	23058	23063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288818
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269	NC_011257	AAG	2	6	23232	23237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288818

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.