MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Borrelia recurrentis A1 plasmid pl35

Total Repeats: 26

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011255	CT	3	6	1689	1694	0 %	50 %	0 %	50 %	203288401
2	NC_011255	AT	3	6	3741	3746	50 %	50 %	0 %	0 %	203288402
3	NC_011255	TA	3	6	4506	4511	50 %	50 %	0 %	0 %	203288402
4	NC_011255	TC	3	6	6912	6917	0 %	50 %	0 %	50 %	203288403
5	NC_011255	TA	3	6	9112	9117	50 %	50 %	0 %	0 %	203288404
6	NC_011255	AT	3	6	9126	9131	50 %	50 %	0 %	0 %	203288404
7	NC_011255	TA	3	6	9303	9308	50 %	50 %	0 %	0 %	203288404
8	NC_011255	TA	4	8	9481	9488	50 %	50 %	0 %	0 %	203288404
9	NC_011255	AT	3	6	15990	15995	50 %	50 %	0 %	0 %	203288406
10	NC_011255	AG	4	8	16537	16544	50 %	0 %	50 %	0 %	203288407
11	NC_011255	AT	3	6	16559	16564	50 %	50 %	0 %	0 %	203288407
12	NC_011255	TA	3	6	16844	16849	50 %	50 %	0 %	0 %	203288407
13	NC_011255	AT	3	6	16940	16945	50 %	50 %	0 %	0 %	203288407
14	NC_011255	AT	3	6	17191	17196	50 %	50 %	0 %	0 %	203288408
15	NC_011255	TA	3	6	17371	17376	50 %	50 %	0 %	0 %	203288408
16	NC_011255	TA	3	6	17686	17691	50 %	50 %	0 %	0 %	203288408
17	NC_011255	TC	3	6	22699	22704	0 %	50 %	0 %	50 %	203288410
18	NC_011255	AG	3	6	24413	24418	50 %	0 %	50 %	0 %	203288411
19	NC_011255	GA	3	6	24434	24439	50 %	0 %	50 %	0 %	203288411
20	NC_011255	AG	3	6	26077	26082	50 %	0 %	50 %	0 %	203288412
21	NC_011255	AG	3	6	28039	28044	50 %	0 %	50 %	0 %	203288413
22	NC_011255	AG	3	6	28072	28077	50 %	0 %	50 %	0 %	203288413
23	NC_011255	TA	3	6	30882	30887	50 %	50 %	0 %	0 %	203288414
24	NC_011255	AT	3	6	31647	31652	50 %	50 %	0 %	0 %	203288414
25	NC_011255	AG	3	6	33699	33704	50 %	0 %	50 %	0 %	203288415
26	NC_011255	GA	3	6	34144	34149	50 %	0 %	50 %	0 %	203288415

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.