MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia recurrentis A1 plasmid pl23

Total Repeats: 207

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011252	ATA	2	6	5252	5257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288365
2	NC_011252	AGC	2	6	5343	5348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288365
3	NC_011252	CAA	2	6	5372	5377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288365
4	NC_011252	AAC	2	6	5421	5426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288365
5	NC_011252	TAA	2	6	5538	5543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288365
6	NC_011252	TTA	2	6	5548	5553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288365
7	NC_011252	ATA	2	6	5642	5647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288365
8	NC_011252	TTA	2	6	5710	5715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288365
9	NC_011252	AGC	2	6	5778	5783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288365
10	NC_011252	TCA	2	6	5855	5860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288365
11	NC_011252	AAT	2	6	5886	5891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288365
12	NC_011252	ATA	2	6	5923	5928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288365
13	NC_011252	ATA	2	6	6097	6102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288365
14	NC_011252	ACA	2	6	6157	6162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288365
15	NC_011252	GCA	2	6	6241	6246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288365
16	NC_011252	AAC	2	6	6321	6326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288365
17	NC_011252	TAT	2	6	6327	6332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288365
18	NC_011252	TAT	2	6	6392	6397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288365
19	NC_011252	ATT	2	6	6423	6428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288365
20	NC_011252	TTA	2	6	6569	6574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288366
21	NC_011252	ATT	2	6	6604	6609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288366
22	NC_011252	TAA	2	6	6651	6656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288366
23	NC_011252	CTA	2	6	6777	6782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288366
24	NC_011252	AAT	2	6	6849	6854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288366
25	NC_011252	TAT	2	6	6870	6875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288366
26	NC_011252	TAA	2	6	6985	6990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288366
27	NC_011252	TAA	2	6	7002	7007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288366
28	NC_011252	TAT	2	6	7054	7059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288367
29	NC_011252	ATT	2	6	7065	7070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288367
30	NC_011252	CTA	2	6	7096	7101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288367
31	NC_011252	CAT	2	6	7130	7135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288367
32	NC_011252	AAT	2	6	7337	7342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288367
33	NC_011252	ATT	2	6	7401	7406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288367
34	NC_011252	ATT	2	6	8317	8322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288368
35	NC_011252	CAA	2	6	8365	8370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288368
36	NC_011252	TAA	2	6	8416	8421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288368
37	NC_011252	AAT	2	6	8564	8569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288368
38	NC_011252	CTT	2	6	8579	8584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288368
39	NC_011252	TAT	2	6	8623	8628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288368
40	NC_011252	TTA	2	6	8685	8690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288368
41	NC_011252	ATC	2	6	8789	8794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288368
42	NC_011252	AAC	2	6	8827	8832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288368
43	NC_011252	TAT	3	9	9025	9033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288369
44	NC_011252	CAT	2	6	9042	9047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288369
45	NC_011252	CTA	2	6	9147	9152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288369
46	NC_011252	ATT	2	6	9162	9167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288369
47	NC_011252	ATT	2	6	9181	9186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288369
48	NC_011252	AGA	2	6	9187	9192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288369
49	NC_011252	ATG	2	6	9393	9398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288369
50	NC_011252	CAA	2	6	9411	9416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288369
51	NC_011252	AAT	2	6	9497	9502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288369
52	NC_011252	TAT	2	6	9582	9587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288369
53	NC_011252	AAT	2	6	9668	9673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288369
54	NC_011252	TAT	2	6	9698	9703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288369
55	NC_011252	ATT	2	6	9735	9740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288369
56	NC_011252	TTA	2	6	9766	9771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288369
57	NC_011252	ATA	2	6	10001	10006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288369
58	NC_011252	TCA	2	6	10069	10074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288369
59	NC_011252	AAT	2	6	10078	10083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288369
60	NC_011252	TCA	2	6	10104	10109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288369
61	NC_011252	AAT	2	6	10220	10225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288369
62	NC_011252	ACA	2	6	11081	11086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288370
63	NC_011252	TAA	2	6	11250	11255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288370
64	NC_011252	CAG	2	6	11343	11348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288370
65	NC_011252	AAC	2	6	11461	11466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288370
66	NC_011252	GGA	2	6	11543	11548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	203288370
67	NC_011252	GCA	2	6	11567	11572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288370
68	NC_011252	GGA	2	6	11627	11632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	203288370
69	NC_011252	CAT	2	6	11647	11652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288370
70	NC_011252	TAG	2	6	11673	11678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288370
71	NC_011252	AAT	2	6	11680	11685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288370
72	NC_011252	ATG	2	6	11717	11722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288370
73	NC_011252	TCA	2	6	11812	11817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288370
74	NC_011252	TCT	2	6	11820	11825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288370
75	NC_011252	TAC	2	6	11929	11934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288370
76	NC_011252	GCT	2	6	12008	12013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288370
77	NC_011252	TGC	2	6	12055	12060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288370
78	NC_011252	GCA	2	6	12137	12142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288370
79	NC_011252	TTA	2	6	12191	12196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288370
80	NC_011252	TGG	2	6	12235	12240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	203288370
81	NC_011252	AAC	2	6	12286	12291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288370
82	NC_011252	CTA	2	6	12306	12311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288370
83	NC_011252	TTA	2	6	12337	12342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288370
84	NC_011252	AGA	3	9	12400	12408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288370
85	NC_011252	ATA	2	6	12410	12415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288370
86	NC_011252	GGA	2	6	12476	12481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	203288370
87	NC_011252	GGA	2	6	12629	12634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	203288370
88	NC_011252	ATA	2	6	12642	12647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288370
89	NC_011252	ATT	2	6	12674	12679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288370
90	NC_011252	ATG	2	6	12768	12773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288371
91	NC_011252	GAT	2	6	12882	12887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288371
92	NC_011252	ATA	2	6	12900	12905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288371
93	NC_011252	TCA	2	6	12913	12918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288371
94	NC_011252	TTA	2	6	13043	13048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288371
95	NC_011252	TTA	3	9	13109	13117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288372
96	NC_011252	TAT	2	6	13431	13436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288372
97	NC_011252	AAT	2	6	13504	13509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288372
98	NC_011252	ATC	2	6	13757	13762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288373
99	NC_011252	AAC	2	6	13808	13813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288373
100	NC_011252	TCC	2	6	13828	13833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288373
101	NC_011252	ATC	2	6	13889	13894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288373
102	NC_011252	TTA	2	6	13933	13938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288373
103	NC_011252	ATC	2	6	13940	13945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288373
104	NC_011252	CTA	2	6	14022	14027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288373
105	NC_011252	TCT	2	6	14033	14038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288373
106	NC_011252	TAT	2	6	14098	14103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288373
107	NC_011252	TCA	2	6	14280	14285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288373
108	NC_011252	ATT	2	6	14313	14318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288373
109	NC_011252	TCT	2	6	14447	14452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288373
110	NC_011252	ATG	2	6	14480	14485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288373
111	NC_011252	ATT	2	6	14561	14566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288373
112	NC_011252	ATC	2	6	14571	14576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288373
113	NC_011252	TTC	2	6	14675	14680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288373
114	NC_011252	TAT	2	6	14708	14713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288373
115	NC_011252	TTC	2	6	14864	14869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288373
116	NC_011252	AAC	2	6	14883	14888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288373
117	NC_011252	TAT	2	6	15018	15023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288374
118	NC_011252	ATA	3	9	15053	15061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288374
119	NC_011252	ATC	2	6	15143	15148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288374
120	NC_011252	TCT	2	6	15183	15188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288374
121	NC_011252	TGT	2	6	15192	15197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288374
122	NC_011252	TAA	2	6	15377	15382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288374
123	NC_011252	ATA	2	6	15400	15405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288374
124	NC_011252	ATA	2	6	15449	15454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288374
125	NC_011252	AAT	2	6	15487	15492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288374
126	NC_011252	TTA	3	9	15519	15527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288374
127	NC_011252	TCT	2	6	15567	15572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288374
128	NC_011252	GAA	2	6	15591	15596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288374
129	NC_011252	AGT	2	6	15963	15968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288375
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.