MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl36

Total Repeats: 58

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011249	TATT	2	8	186	193	25 %	75 %	0 %	0 %	203288662
2	NC_011249	GTAA	2	8	388	395	50 %	25 %	25 %	0 %	203288662
3	NC_011249	TATT	2	8	1055	1062	25 %	75 %	0 %	0 %	203288663
4	NC_011249	TTTA	2	8	1187	1194	25 %	75 %	0 %	0 %	203288663
5	NC_011249	GATT	2	8	1490	1497	25 %	50 %	25 %	0 %	203288663
6	NC_011249	TCTT	2	8	6430	6437	0 %	75 %	0 %	25 %	203288664
7	NC_011249	CTTC	2	8	6926	6933	0 %	50 %	0 %	50 %	203288664
8	NC_011249	ATTC	2	8	7182	7189	25 %	50 %	0 %	25 %	203288664
9	NC_011249	ATCT	2	8	8970	8977	25 %	50 %	0 %	25 %	203288665
10	NC_011249	CTTT	2	8	9021	9028	0 %	75 %	0 %	25 %	203288665
11	NC_011249	TTTA	2	8	9088	9095	25 %	75 %	0 %	0 %	203288665
12	NC_011249	TCCT	2	8	9310	9317	0 %	50 %	0 %	50 %	203288665
13	NC_011249	CACT	2	8	9351	9358	25 %	25 %	0 %	50 %	203288665
14	NC_011249	ATTC	2	8	10045	10052	25 %	50 %	0 %	25 %	203288665
15	NC_011249	ATTA	2	8	10262	10269	50 %	50 %	0 %	0 %	203288666
16	NC_011249	TTAT	2	8	10315	10322	25 %	75 %	0 %	0 %	203288666
17	NC_011249	TCTT	2	8	10510	10517	0 %	75 %	0 %	25 %	203288666
18	NC_011249	CACT	2	8	10655	10662	25 %	25 %	0 %	50 %	203288666
19	NC_011249	TTTA	2	8	11642	11649	25 %	75 %	0 %	0 %	203288667
20	NC_011249	TTCC	2	8	12508	12515	0 %	50 %	0 %	50 %	203288667
21	NC_011249	TTAT	2	8	12603	12610	25 %	75 %	0 %	0 %	203288667
22	NC_011249	ATCA	2	8	14610	14617	50 %	25 %	0 %	25 %	203288668
23	NC_011249	AATT	2	8	15743	15750	50 %	50 %	0 %	0 %	203288669
24	NC_011249	AATA	2	8	16009	16016	75 %	25 %	0 %	0 %	203288669
25	NC_011249	AAAG	2	8	16272	16279	75 %	0 %	25 %	0 %	203288669
26	NC_011249	AGGA	2	8	16382	16389	50 %	0 %	50 %	0 %	203288669
27	NC_011249	TAAA	2	8	16649	16656	75 %	25 %	0 %	0 %	203288669
28	NC_011249	AATG	2	8	16902	16909	50 %	25 %	25 %	0 %	203288670
29	NC_011249	GATA	2	8	17435	17442	50 %	25 %	25 %	0 %	203288671
30	NC_011249	GATA	2	8	17702	17709	50 %	25 %	25 %	0 %	203288671
31	NC_011249	ATTT	2	8	17809	17816	25 %	75 %	0 %	0 %	203288671
32	NC_011249	TAAA	2	8	17962	17969	75 %	25 %	0 %	0 %	203288671
33	NC_011249	AAGA	2	8	18607	18614	75 %	0 %	25 %	0 %	203288672
34	NC_011249	TATT	2	8	19490	19497	25 %	75 %	0 %	0 %	203288673
35	NC_011249	GTTT	2	8	21810	21817	0 %	75 %	25 %	0 %	203288674
36	NC_011249	AAAT	2	8	22008	22015	75 %	25 %	0 %	0 %	203288674
37	NC_011249	TAAT	2	8	22236	22243	50 %	50 %	0 %	0 %	203288674
38	NC_011249	AGAT	2	8	24482	24489	50 %	25 %	25 %	0 %	203288675
39	NC_011249	GTTC	2	8	24532	24539	0 %	50 %	25 %	25 %	203288675
40	NC_011249	GCAT	2	8	24705	24712	25 %	25 %	25 %	25 %	203288675
41	NC_011249	TAAG	2	8	26727	26734	50 %	25 %	25 %	0 %	203288676
42	NC_011249	AGAT	2	8	26756	26763	50 %	25 %	25 %	0 %	203288676
43	NC_011249	GTTG	2	8	27448	27455	0 %	50 %	50 %	0 %	203288677
44	NC_011249	AAAG	2	8	27724	27731	75 %	0 %	25 %	0 %	203288677
45	NC_011249	TAGA	2	8	27735	27742	50 %	25 %	25 %	0 %	203288677
46	NC_011249	CGAT	2	8	27798	27805	25 %	25 %	25 %	25 %	203288677
47	NC_011249	AGGA	2	8	28521	28528	50 %	0 %	50 %	0 %	203288678
48	NC_011249	AATA	2	8	28532	28539	75 %	25 %	0 %	0 %	203288678
49	NC_011249	GTAA	2	8	28559	28566	50 %	25 %	25 %	0 %	203288678
50	NC_011249	GAAG	2	8	28726	28733	50 %	0 %	50 %	0 %	203288678
51	NC_011249	GGAA	2	8	30012	30019	50 %	0 %	50 %	0 %	203288679
52	NC_011249	GAAA	2	8	30027	30034	75 %	0 %	25 %	0 %	203288679
53	NC_011249	TGAG	2	8	30165	30172	25 %	25 %	50 %	0 %	203288679
54	NC_011249	AGCA	2	8	30346	30353	50 %	0 %	25 %	25 %	203288679
55	NC_011249	AACA	2	8	33787	33794	75 %	0 %	0 %	25 %	203288680
56	NC_011249	AAAG	2	8	33920	33927	75 %	0 %	25 %	0 %	203288680
57	NC_011249	ATAG	2	8	33930	33937	50 %	25 %	25 %	0 %	203288680
58	NC_011249	TAAA	2	8	33985	33992	75 %	25 %	0 %	0 %	203288680

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.