MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl35

Total Repeats: 327

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011248	TAA	2	6	1292	1297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288642
2	NC_011248	TCC	2	6	1400	1405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288642
3	NC_011248	CAA	2	6	1460	1465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288642
4	NC_011248	TTA	2	6	1474	1479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288642
5	NC_011248	TCT	2	6	1495	1500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288642
6	NC_011248	CTA	3	9	1538	1546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288642
7	NC_011248	TAT	2	6	1586	1591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288642
8	NC_011248	TAA	2	6	1647	1652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288642
9	NC_011248	TTA	2	6	1681	1686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288642
10	NC_011248	TCA	2	6	1687	1692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288642
11	NC_011248	TTA	3	9	1705	1713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288642
12	NC_011248	TTC	2	6	1744	1749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288642
13	NC_011248	TAA	2	6	1794	1799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288642
14	NC_011248	TTA	2	6	1859	1864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288642
15	NC_011248	TAC	2	6	1878	1883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288642
16	NC_011248	AAC	2	6	1905	1910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288642
17	NC_011248	TCT	2	6	1912	1917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288642
18	NC_011248	TCA	2	6	1927	1932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288642
19	NC_011248	ACA	2	6	1948	1953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288642
20	NC_011248	ATT	2	6	1962	1967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288642
21	NC_011248	ACA	2	6	1969	1974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288642
22	NC_011248	TAT	2	6	2003	2008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288642
23	NC_011248	AAT	2	6	2011	2016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288642
24	NC_011248	TAA	2	6	2052	2057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288642
25	NC_011248	CTT	2	6	3109	3114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288643
26	NC_011248	AGT	2	6	3117	3122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288643
27	NC_011248	TTA	2	6	3163	3168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288643
28	NC_011248	TAA	2	6	3177	3182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288643
29	NC_011248	CTT	2	6	3260	3265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288643
30	NC_011248	ATC	2	6	3273	3278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288643
31	NC_011248	ATC	2	6	3354	3359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288643
32	NC_011248	TGC	2	6	3396	3401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288643
33	NC_011248	CTA	2	6	3611	3616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288643
34	NC_011248	TCC	2	6	3678	3683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288643
35	NC_011248	ATC	4	12	3706	3717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288643
36	NC_011248	ATT	2	6	3721	3726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288643
37	NC_011248	GCA	2	6	3862	3867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288643
38	NC_011248	CAG	2	6	3878	3883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288643
39	NC_011248	GCA	2	6	3907	3912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288643
40	NC_011248	TGC	2	6	3915	3920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288643
41	NC_011248	CTG	2	6	4220	4225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288644
42	NC_011248	GCT	3	9	4297	4305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288644
43	NC_011248	TTA	2	6	4348	4353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288644
44	NC_011248	ATA	2	6	4361	4366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288644
45	NC_011248	CAT	2	6	4373	4378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288644
46	NC_011248	AGC	2	6	4395	4400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288644
47	NC_011248	AGC	4	12	4545	4556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288644
48	NC_011248	TAA	2	6	4634	4639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288644
49	NC_011248	CAG	2	6	4700	4705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288644
50	NC_011248	CTC	2	6	5066	5071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288644
51	NC_011248	CTC	2	6	5075	5080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288644
52	NC_011248	ACC	2	6	5101	5106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288644
53	NC_011248	ATC	2	6	5107	5112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288644
54	NC_011248	ATT	3	9	5116	5124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288644
55	NC_011248	TTC	2	6	5135	5140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288644
56	NC_011248	CTT	2	6	5195	5200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288644
57	NC_011248	CCT	2	6	5620	5625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288645
58	NC_011248	CAT	2	6	5636	5641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288645
59	NC_011248	AGC	2	6	5682	5687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288645
60	NC_011248	GCA	2	6	5695	5700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288645
61	NC_011248	CCA	2	6	5725	5730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288645
62	NC_011248	TGC	3	9	5799	5807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288645
63	NC_011248	TCT	2	6	5818	5823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288645
64	NC_011248	CAT	2	6	5825	5830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288645
65	NC_011248	TAG	2	6	5888	5893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288645
66	NC_011248	ACC	2	6	5920	5925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288645
67	NC_011248	TTA	2	6	5956	5961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288645
68	NC_011248	TAG	2	6	6026	6031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288645
69	NC_011248	CAC	2	6	6032	6037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288645
70	NC_011248	CTT	2	6	6044	6049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288645
71	NC_011248	GCA	2	6	6058	6063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288645
72	NC_011248	TAA	2	6	6083	6088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288645
73	NC_011248	CAA	2	6	6095	6100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288645
74	NC_011248	AGT	2	6	6159	6164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288645
75	NC_011248	TCT	2	6	6173	6178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288645
76	NC_011248	ACC	2	6	6333	6338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288645
77	NC_011248	CAT	2	6	6351	6356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288645
78	NC_011248	CAT	3	9	6360	6368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288645
79	NC_011248	CAT	2	6	6372	6377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288645
80	NC_011248	TAT	2	6	6381	6386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288645
81	NC_011248	TGC	2	6	7821	7826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288646
82	NC_011248	CTT	2	6	7832	7837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288646
83	NC_011248	TAT	2	6	7851	7856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288646
84	NC_011248	AGT	2	6	7926	7931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288646
85	NC_011248	CAG	2	6	7937	7942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288646
86	NC_011248	CAT	2	6	7946	7951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288646
87	NC_011248	TCC	2	6	7968	7973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288646
88	NC_011248	TAT	2	6	8007	8012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288646
89	NC_011248	CTT	2	6	8019	8024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288646
90	NC_011248	CAC	3	9	8030	8038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288646
91	NC_011248	AGC	2	6	8043	8048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288646
92	NC_011248	CCA	2	6	8071	8076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288646
93	NC_011248	CTC	2	6	8114	8119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288646
94	NC_011248	TGC	2	6	8130	8135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288646
95	NC_011248	AAC	2	6	8191	8196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288646
96	NC_011248	CAG	2	6	8213	8218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288646
97	NC_011248	ATC	2	6	8262	8267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288646
98	NC_011248	CAT	2	6	8273	8278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288646
99	NC_011248	CTT	2	6	8285	8290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288646
100	NC_011248	ACC	2	6	8296	8301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288646
101	NC_011248	CTA	2	6	8303	8308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288646
102	NC_011248	GCA	2	6	8347	8352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288646
103	NC_011248	CCA	2	6	8353	8358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288646
104	NC_011248	GCA	2	6	8359	8364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288646
105	NC_011248	TAT	2	6	8439	8444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288646
106	NC_011248	CAA	2	6	8528	8533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288646
107	NC_011248	TTA	2	6	8536	8541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288646
108	NC_011248	AAT	2	6	8585	8590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288646
109	NC_011248	CTT	2	6	8604	8609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288646
110	NC_011248	CCA	2	6	8639	8644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288646
111	NC_011248	CCA	2	6	8732	8737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288646
112	NC_011248	CAC	2	6	8738	8743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288646
113	NC_011248	CAT	2	6	8754	8759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288646
114	NC_011248	CAT	3	9	8763	8771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288646
115	NC_011248	ATT	2	6	8776	8781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288646
116	NC_011248	CTT	2	6	8798	8803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288646
117	NC_011248	TTC	2	6	8819	8824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288646
118	NC_011248	ACC	2	6	9131	9136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288647
119	NC_011248	TCC	2	6	9253	9258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288647
120	NC_011248	TAG	2	6	9297	9302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288647
121	NC_011248	TTA	2	6	9311	9316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288647
122	NC_011248	GCA	2	6	9332	9337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288647
123	NC_011248	TGC	4	12	9433	9444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288647
124	NC_011248	CAT	2	6	9459	9464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288647
125	NC_011248	CAG	2	6	9465	9470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288647
126	NC_011248	TCT	2	6	9509	9514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288647
127	NC_011248	TAG	2	6	9522	9527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288647
128	NC_011248	CAA	2	6	9564	9569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288647
129	NC_011248	ACC	2	6	9580	9585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288647
130	NC_011248	TTA	2	6	9593	9598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288647
131	NC_011248	AAT	2	6	9649	9654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288647
132	NC_011248	CAC	2	6	9660	9665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288647
133	NC_011248	GCT	2	6	9677	9682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288647
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135	NC_011248	CCA	2	6	9830	9835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288647
136	NC_011248	CTT	2	6	9844	9849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288647
137	NC_011248	ATC	4	12	9992	10003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288647
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139	NC_011248	ATT	2	6	12686	12691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288648
140	NC_011248	ATT	2	6	12741	12746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288648
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.