MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl165

Total Repeats: 347

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011247	CATA	2	8	1522	1529	50 %	25 %	0 %	25 %	203288507
2	NC_011247	AGTT	2	8	2252	2259	25 %	50 %	25 %	0 %	203288507
3	NC_011247	TCAC	2	8	2355	2362	25 %	25 %	0 %	50 %	203288507
4	NC_011247	ATTT	2	8	2731	2738	25 %	75 %	0 %	0 %	203288508
5	NC_011247	TTCA	2	8	2779	2786	25 %	50 %	0 %	25 %	203288508
6	NC_011247	AATG	2	8	2987	2994	50 %	25 %	25 %	0 %	203288508
7	NC_011247	AGTA	2	8	3041	3048	50 %	25 %	25 %	0 %	203288508
8	NC_011247	TTCT	2	8	4763	4770	0 %	75 %	0 %	25 %	203288510
9	NC_011247	TTCT	2	8	6158	6165	0 %	75 %	0 %	25 %	203288511
10	NC_011247	CAAT	2	8	6358	6365	50 %	25 %	0 %	25 %	203288511
11	NC_011247	TTCA	2	8	7206	7213	25 %	50 %	0 %	25 %	203288512
12	NC_011247	CTTT	2	8	7726	7733	0 %	75 %	0 %	25 %	203288512
13	NC_011247	AAAT	2	8	7934	7941	75 %	25 %	0 %	0 %	203288512
14	NC_011247	AAAT	2	8	9358	9365	75 %	25 %	0 %	0 %	203288513
15	NC_011247	TTCT	2	8	9390	9397	0 %	75 %	0 %	25 %	203288513
16	NC_011247	AAAT	2	8	10101	10108	75 %	25 %	0 %	0 %	203288514
17	NC_011247	ACTT	2	8	10268	10275	25 %	50 %	0 %	25 %	203288514
18	NC_011247	ATAA	2	8	10435	10442	75 %	25 %	0 %	0 %	203288514
19	NC_011247	AAAT	2	8	11709	11716	75 %	25 %	0 %	0 %	203288515
20	NC_011247	TAAA	2	8	11727	11734	75 %	25 %	0 %	0 %	203288515
21	NC_011247	TAAT	2	8	12211	12218	50 %	50 %	0 %	0 %	203288516
22	NC_011247	ATCT	2	8	12571	12578	25 %	50 %	0 %	25 %	203288516
23	NC_011247	AATA	2	8	12581	12588	75 %	25 %	0 %	0 %	203288516
24	NC_011247	ATTG	2	8	12613	12620	25 %	50 %	25 %	0 %	203288516
25	NC_011247	AAAT	2	8	12910	12917	75 %	25 %	0 %	0 %	203288516
26	NC_011247	TAAA	2	8	12928	12935	75 %	25 %	0 %	0 %	203288516
27	NC_011247	TGTA	2	8	13243	13250	25 %	50 %	25 %	0 %	203288517
28	NC_011247	GGAA	2	8	13318	13325	50 %	0 %	50 %	0 %	203288517
29	NC_011247	TAAT	2	8	13398	13405	50 %	50 %	0 %	0 %	203288517
30	NC_011247	ACTA	2	8	13759	13766	50 %	25 %	0 %	25 %	203288517
31	NC_011247	ATTG	2	8	13791	13798	25 %	50 %	25 %	0 %	203288517
32	NC_011247	AAAT	2	8	14100	14107	75 %	25 %	0 %	0 %	203288517
33	NC_011247	TAAA	2	8	14118	14125	75 %	25 %	0 %	0 %	203288517
34	NC_011247	TAAT	2	8	14602	14609	50 %	50 %	0 %	0 %	203288518
35	NC_011247	ATCT	2	8	14962	14969	25 %	50 %	0 %	25 %	203288518
36	NC_011247	AATA	2	8	14972	14979	75 %	25 %	0 %	0 %	203288518
37	NC_011247	ATTG	2	8	15004	15011	25 %	50 %	25 %	0 %	203288518
38	NC_011247	AAAT	2	8	15298	15305	75 %	25 %	0 %	0 %	203288518
39	NC_011247	TAAA	2	8	15316	15323	75 %	25 %	0 %	0 %	203288518
40	NC_011247	GGAA	2	8	15719	15726	50 %	0 %	50 %	0 %	203288519
41	NC_011247	TAAT	2	8	15799	15806	50 %	50 %	0 %	0 %	203288519
42	NC_011247	ATTG	2	8	16192	16199	25 %	50 %	25 %	0 %	203288519
43	NC_011247	AAAT	2	8	16540	16547	75 %	25 %	0 %	0 %	203288519
44	NC_011247	TTTC	2	8	17701	17708	0 %	75 %	0 %	25 %	203288520
45	NC_011247	TTTA	2	8	18157	18164	25 %	75 %	0 %	0 %	203288521
46	NC_011247	GTAA	2	8	19195	19202	50 %	25 %	25 %	0 %	203288522
47	NC_011247	AATT	2	8	19215	19222	50 %	50 %	0 %	0 %	203288522
48	NC_011247	TTCT	2	8	19499	19506	0 %	75 %	0 %	25 %	203288522
49	NC_011247	TAAG	2	8	20005	20012	50 %	25 %	25 %	0 %	203288523
50	NC_011247	TTCT	2	8	20479	20486	0 %	75 %	0 %	25 %	203288523
51	NC_011247	AAAT	2	8	20567	20574	75 %	25 %	0 %	0 %	203288523
52	NC_011247	TAAG	2	8	20982	20989	50 %	25 %	25 %	0 %	203288524
53	NC_011247	TTCT	2	8	21456	21463	0 %	75 %	0 %	25 %	203288525
54	NC_011247	TTTA	2	8	22053	22060	25 %	75 %	0 %	0 %	203288526
55	NC_011247	TAAA	2	8	23217	23224	75 %	25 %	0 %	0 %	203288527
56	NC_011247	TGAG	2	8	23412	23419	25 %	25 %	50 %	0 %	203288527
57	NC_011247	AAAT	2	8	23525	23532	75 %	25 %	0 %	0 %	203288527
58	NC_011247	ATAA	2	8	24134	24141	75 %	25 %	0 %	0 %	203288528
59	NC_011247	AATA	2	8	24153	24160	75 %	25 %	0 %	0 %	203288528
60	NC_011247	TCTT	2	8	25316	25323	0 %	75 %	0 %	25 %	203288529
61	NC_011247	CAAT	2	8	25747	25754	50 %	25 %	0 %	25 %	203288530
62	NC_011247	TTTA	2	8	27464	27471	25 %	75 %	0 %	0 %	203288531
63	NC_011247	GCAA	2	8	27487	27494	50 %	0 %	25 %	25 %	203288531
64	NC_011247	CTTT	2	8	27503	27510	0 %	75 %	0 %	25 %	203288531
65	NC_011247	CTAG	2	8	27763	27770	25 %	25 %	25 %	25 %	203288531
66	NC_011247	AATA	2	8	28411	28418	75 %	25 %	0 %	0 %	203288531
67	NC_011247	ATAA	2	8	28507	28514	75 %	25 %	0 %	0 %	203288531
68	NC_011247	ACAA	2	8	30006	30013	75 %	0 %	0 %	25 %	203288532
69	NC_011247	TATT	2	8	30484	30491	25 %	75 %	0 %	0 %	203288532
70	NC_011247	AATG	2	8	30530	30537	50 %	25 %	25 %	0 %	203288532
71	NC_011247	ATTT	2	8	31200	31207	25 %	75 %	0 %	0 %	203288532
72	NC_011247	CAAT	2	8	31385	31392	50 %	25 %	0 %	25 %	203288532
73	NC_011247	TATC	2	8	31501	31508	25 %	50 %	0 %	25 %	203288532
74	NC_011247	ACAA	2	8	32000	32007	75 %	0 %	0 %	25 %	203288533
75	NC_011247	TTTA	2	8	32348	32355	25 %	75 %	0 %	0 %	203288533
76	NC_011247	AATG	2	8	32524	32531	50 %	25 %	25 %	0 %	203288533
77	NC_011247	ATTT	2	8	33191	33198	25 %	75 %	0 %	0 %	203288533
78	NC_011247	AAAT	2	8	34217	34224	75 %	25 %	0 %	0 %	203288534
79	NC_011247	AATG	2	8	34516	34523	50 %	25 %	25 %	0 %	203288534
80	NC_011247	ATTT	2	8	35183	35190	25 %	75 %	0 %	0 %	203288534
81	NC_011247	AAAC	2	8	35520	35527	75 %	0 %	0 %	25 %	203288534
82	NC_011247	TGAA	2	8	36549	36556	50 %	25 %	25 %	0 %	203288535
83	NC_011247	CAAT	2	8	37890	37897	50 %	25 %	0 %	25 %	203288536
84	NC_011247	AAAG	2	8	40522	40529	75 %	0 %	25 %	0 %	203288537
85	NC_011247	TAAT	2	8	40892	40899	50 %	50 %	0 %	0 %	203288537
86	NC_011247	TGAA	2	8	41129	41136	50 %	25 %	25 %	0 %	203288537
87	NC_011247	ATCA	2	8	41764	41771	50 %	25 %	0 %	25 %	203288538
88	NC_011247	CAAA	2	8	42006	42013	75 %	0 %	0 %	25 %	203288538
89	NC_011247	TCTA	2	8	42670	42677	25 %	50 %	0 %	25 %	203288539
90	NC_011247	AATT	2	8	44456	44463	50 %	50 %	0 %	0 %	203288540
91	NC_011247	GCTT	2	8	45066	45073	0 %	50 %	25 %	25 %	203288541
92	NC_011247	TCTT	2	8	45923	45930	0 %	75 %	0 %	25 %	203288541
93	NC_011247	AAAT	2	8	46301	46308	75 %	25 %	0 %	0 %	203288542
94	NC_011247	ACTC	2	8	47789	47796	25 %	25 %	0 %	50 %	203288543
95	NC_011247	TCAT	2	8	49293	49300	25 %	50 %	0 %	25 %	203288544
96	NC_011247	TTCA	2	8	50325	50332	25 %	50 %	0 %	25 %	203288545
97	NC_011247	ATCA	2	8	50451	50458	50 %	25 %	0 %	25 %	203288545
98	NC_011247	ATTT	2	8	51988	51995	25 %	75 %	0 %	0 %	203288546
99	NC_011247	AAGA	2	8	52783	52790	75 %	0 %	25 %	0 %	203288547
100	NC_011247	AGTA	2	8	53259	53266	50 %	25 %	25 %	0 %	203288547
101	NC_011247	ATCA	2	8	53281	53288	50 %	25 %	0 %	25 %	203288547
102	NC_011247	GATA	2	8	53617	53624	50 %	25 %	25 %	0 %	203288547
103	NC_011247	CAAG	2	8	53633	53640	50 %	0 %	25 %	25 %	203288547
104	NC_011247	TTCA	2	8	54049	54056	25 %	50 %	0 %	25 %	203288548
105	NC_011247	ATTC	2	8	54094	54101	25 %	50 %	0 %	25 %	203288548
106	NC_011247	AAGC	2	8	54260	54267	50 %	0 %	25 %	25 %	203288548
107	NC_011247	TCTT	3	12	56146	56157	0 %	75 %	0 %	25 %	203288549
108	NC_011247	CAAA	2	8	56803	56810	75 %	0 %	0 %	25 %	203288550
109	NC_011247	CAAA	2	8	57138	57145	75 %	0 %	0 %	25 %	203288550
110	NC_011247	GAAA	2	8	58232	58239	75 %	0 %	25 %	0 %	203288551
111	NC_011247	AAAT	2	8	58603	58610	75 %	25 %	0 %	0 %	203288551
112	NC_011247	AAGA	2	8	58740	58747	75 %	0 %	25 %	0 %	203288551
113	NC_011247	TTGA	2	8	58899	58906	25 %	50 %	25 %	0 %	203288551
114	NC_011247	ATTT	2	8	60550	60557	25 %	75 %	0 %	0 %	203288552
115	NC_011247	GTAA	2	8	60587	60594	50 %	25 %	25 %	0 %	203288552
116	NC_011247	TCAA	2	8	60638	60645	50 %	25 %	0 %	25 %	203288552
117	NC_011247	TAAA	2	8	60657	60664	75 %	25 %	0 %	0 %	203288552
118	NC_011247	TTAC	2	8	60810	60817	25 %	50 %	0 %	25 %	203288552
119	NC_011247	CTAT	2	8	60840	60847	25 %	50 %	0 %	25 %	203288552
120	NC_011247	AATT	2	8	60948	60955	50 %	50 %	0 %	0 %	203288552
121	NC_011247	TAAT	2	8	61143	61150	50 %	50 %	0 %	0 %	203288552
122	NC_011247	GAAT	2	8	61270	61277	50 %	25 %	25 %	0 %	203288552
123	NC_011247	AAAT	2	8	62462	62469	75 %	25 %	0 %	0 %	203288553
124	NC_011247	ATTT	2	8	62862	62869	25 %	75 %	0 %	0 %	203288554
125	NC_011247	AAGC	2	8	62970	62977	50 %	0 %	25 %	25 %	203288554
126	NC_011247	ATTA	2	8	63289	63296	50 %	50 %	0 %	0 %	203288554
127	NC_011247	CATT	2	8	63465	63472	25 %	50 %	0 %	25 %	203288554
128	NC_011247	TCTT	2	8	63835	63842	0 %	75 %	0 %	25 %	203288555
129	NC_011247	AATA	2	8	63878	63885	75 %	25 %	0 %	0 %	203288555
130	NC_011247	CAAA	2	8	63950	63957	75 %	0 %	0 %	25 %	203288555
131	NC_011247	TAAA	2	8	64073	64080	75 %	25 %	0 %	0 %	203288555
132	NC_011247	ATTT	2	8	64319	64326	25 %	75 %	0 %	0 %	203288555
133	NC_011247	TACT	2	8	65105	65112	25 %	50 %	0 %	25 %	203288556
134	NC_011247	TTAA	2	8	66200	66207	50 %	50 %	0 %	0 %	203288557
135	NC_011247	AAAT	2	8	66715	66722	75 %	25 %	0 %	0 %	203288557
136	NC_011247	ATAA	2	8	66997	67004	75 %	25 %	0 %	0 %	203288558
137	NC_011247	TATT	2	8	67728	67735	25 %	75 %	0 %	0 %	203288559
138	NC_011247	TAAA	2	8	68013	68020	75 %	25 %	0 %	0 %	203288559
139	NC_011247	CATT	2	8	68466	68473	25 %	50 %	0 %	25 %	203288559
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.