MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia recurrentis A1 plasmid pl124

Total Repeats: 2131

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011246	TAT	2	6	57149	57154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288317
1002	NC_011246	TAA	2	6	57181	57186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288317
1003	NC_011246	ATC	2	6	57243	57248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288317
1004	NC_011246	ACT	2	6	57324	57329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288317
1005	NC_011246	CTAA	2	8	57343	57350	50 %	25 %	0 %	25 %	203288317
1006	NC_011246	TGA	2	6	57354	57359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288317
1007	NC_011246	AAAAT	2	10	57386	57395	80 %	20 %	0 %	0 %	203288317
1008	NC_011246	GCA	2	6	57549	57554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288318
1009	NC_011246	TAA	2	6	57574	57579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288318
1010	NC_011246	AAT	2	6	57619	57624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288318
1011	NC_011246	T	7	7	57706	57712	0 %	100 %	0 %	0 %	203288318
1012	NC_011246	ATTA	2	8	57767	57774	50 %	50 %	0 %	0 %	203288318
1013	NC_011246	ACA	2	6	57789	57794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288318
1014	NC_011246	CCTT	2	8	57813	57820	0 %	50 %	0 %	50 %	203288318
1015	NC_011246	ATTAAC	2	12	57824	57835	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	203288318
1016	NC_011246	ACT	2	6	57848	57853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288318
1017	NC_011246	CTC	2	6	57869	57874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288318
1018	NC_011246	GGTT	2	8	57875	57882	0 %	50 %	50 %	0 %	203288318
1019	NC_011246	A	6	6	57899	57904	100 %	0 %	0 %	0 %	203288318
1020	NC_011246	GA	3	6	57975	57980	50 %	0 %	50 %	0 %	203288318
1021	NC_011246	T	8	8	58023	58030	0 %	100 %	0 %	0 %	203288318
1022	NC_011246	ATT	2	6	58181	58186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288319
1023	NC_011246	CAT	2	6	58294	58299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288319
1024	NC_011246	TCA	2	6	58407	58412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288319
1025	NC_011246	CCAA	2	8	58418	58425	50 %	0 %	0 %	50 %	203288319
1026	NC_011246	A	6	6	58495	58500	100 %	0 %	0 %	0 %	203288319
1027	NC_011246	TCTTT	2	10	58570	58579	0 %	80 %	0 %	20 %	203288319
1028	NC_011246	TAG	2	6	58582	58587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288319
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1030	NC_011246	ACA	2	6	58650	58655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288319
1031	NC_011246	CAT	3	9	58663	58671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288319
1032	NC_011246	A	6	6	58724	58729	100 %	0 %	0 %	0 %	203288319
1033	NC_011246	T	6	6	58864	58869	0 %	100 %	0 %	0 %	203288319
1034	NC_011246	CAT	2	6	58894	58899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288319
1035	NC_011246	ACC	2	6	58916	58921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288319
1036	NC_011246	AAAATC	2	12	58931	58942	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	203288319
1037	NC_011246	CATTTA	2	12	58978	58989	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	203288319
1038	NC_011246	ATT	2	6	59087	59092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288319
1039	NC_011246	A	6	6	59118	59123	100 %	0 %	0 %	0 %	203288319
1040	NC_011246	AATTA	2	10	59144	59153	60 %	40 %	0 %	0 %	203288319
1041	NC_011246	ATT	2	6	59156	59161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288319
1042	NC_011246	AAATTT	2	12	59217	59228	50 %	50 %	0 %	0 %	203288319
1043	NC_011246	ATC	2	6	59312	59317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288319
1044	NC_011246	A	6	6	59383	59388	100 %	0 %	0 %	0 %	203288319
1045	NC_011246	T	6	6	59402	59407	0 %	100 %	0 %	0 %	203288319
1046	NC_011246	A	7	7	59408	59414	100 %	0 %	0 %	0 %	203288319
1047	NC_011246	TAC	2	6	59419	59424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288319
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1050	NC_011246	T	6	6	59583	59588	0 %	100 %	0 %	0 %	203288320
1051	NC_011246	TCA	2	6	59629	59634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288320
1052	NC_011246	CTT	2	6	59643	59648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288320
1053	NC_011246	CAT	2	6	59651	59656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288320
1054	NC_011246	ATA	2	6	59688	59693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288320
1055	NC_011246	CTT	2	6	59707	59712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288320
1056	NC_011246	AAT	2	6	59723	59728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288320
1057	NC_011246	ATC	2	6	59811	59816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288321
1058	NC_011246	TCA	2	6	59830	59835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288321
1059	NC_011246	AT	3	6	59836	59841	50 %	50 %	0 %	0 %	203288321
1060	NC_011246	T	6	6	59918	59923	0 %	100 %	0 %	0 %	203288321
1061	NC_011246	CAAA	2	8	59945	59952	75 %	0 %	0 %	25 %	203288321
1062	NC_011246	TAG	2	6	59954	59959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288321
1063	NC_011246	TAT	2	6	59993	59998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288321
1064	NC_011246	TAA	2	6	60002	60007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288321
1065	NC_011246	TCA	2	6	60019	60024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288321
1066	NC_011246	A	7	7	60024	60030	100 %	0 %	0 %	0 %	203288321
1067	NC_011246	T	7	7	60056	60062	0 %	100 %	0 %	0 %	203288321
1068	NC_011246	ATT	2	6	60075	60080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288321
1069	NC_011246	CTTGA	2	10	60101	60110	20 %	40 %	20 %	20 %	203288321
1070	NC_011246	CATA	2	8	60137	60144	50 %	25 %	0 %	25 %	203288321
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1072	NC_011246	CTC	2	6	60217	60222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288322
1073	NC_011246	AATT	2	8	60233	60240	50 %	50 %	0 %	0 %	203288322
1074	NC_011246	A	7	7	60302	60308	100 %	0 %	0 %	0 %	203288322
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1082	NC_011246	TCA	2	6	60629	60634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288322
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1084	NC_011246	ATC	2	6	60665	60670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288323
1085	NC_011246	ACT	2	6	60671	60676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288323
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1088	NC_011246	CT	3	6	60798	60803	0 %	50 %	0 %	50 %	203288323
1089	NC_011246	TAAA	2	8	60814	60821	75 %	25 %	0 %	0 %	203288323
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1096	NC_011246	CAT	2	6	61090	61095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288323
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1099	NC_011246	TAC	2	6	61289	61294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288323
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1101	NC_011246	CAA	2	6	61354	61359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288323
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1105	NC_011246	CTC	2	6	61448	61453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288323
1106	NC_011246	A	7	7	61457	61463	100 %	0 %	0 %	0 %	203288323
1107	NC_011246	TTA	2	6	61477	61482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288323
1108	NC_011246	CAT	2	6	61534	61539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288323
1109	NC_011246	A	6	6	61560	61565	100 %	0 %	0 %	0 %	203288323
1110	NC_011246	TAA	2	6	61641	61646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288323
1111	NC_011246	ATT	2	6	61652	61657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288323
1112	NC_011246	T	6	6	61750	61755	0 %	100 %	0 %	0 %	203288324
1113	NC_011246	TATTT	2	10	61760	61769	20 %	80 %	0 %	0 %	203288324
1114	NC_011246	CAA	2	6	61771	61776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288324
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1117	NC_011246	TTAAAT	2	12	61938	61949	50 %	50 %	0 %	0 %	203288324
1118	NC_011246	A	6	6	61971	61976	100 %	0 %	0 %	0 %	203288324
1119	NC_011246	AT	3	6	62003	62008	50 %	50 %	0 %	0 %	203288324
1120	NC_011246	AAAAG	2	10	62041	62050	80 %	0 %	20 %	0 %	203288324
1121	NC_011246	TTA	2	6	62140	62145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288324
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1123	NC_011246	A	6	6	62268	62273	100 %	0 %	0 %	0 %	203288324
1124	NC_011246	AT	3	6	62360	62365	50 %	50 %	0 %	0 %	203288325
1125	NC_011246	ATA	2	6	62420	62425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288325
1126	NC_011246	TAA	2	6	62437	62442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288325
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1253	NC_011246	CAAA	2	8	69986	69993	75 %	0 %	0 %	25 %	203288330
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