MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl28

Total Repeats: 48

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011245	TA	3	6	508	513	50 %	50 %	0 %	0 %	203288470
2	NC_011245	AT	3	6	672	677	50 %	50 %	0 %	0 %	203288471
3	NC_011245	CT	3	6	2098	2103	0 %	50 %	0 %	50 %	203288472
4	NC_011245	TC	3	6	2294	2299	0 %	50 %	0 %	50 %	203288472
5	NC_011245	TA	3	6	2943	2948	50 %	50 %	0 %	0 %	203288473
6	NC_011245	AT	3	6	3134	3139	50 %	50 %	0 %	0 %	203288473
7	NC_011245	TA	3	6	3439	3444	50 %	50 %	0 %	0 %	203288474
8	NC_011245	AT	3	6	3467	3472	50 %	50 %	0 %	0 %	203288474
9	NC_011245	TG	3	6	3709	3714	0 %	50 %	50 %	0 %	203288474
10	NC_011245	AT	3	6	4081	4086	50 %	50 %	0 %	0 %	203288475
11	NC_011245	CT	3	6	4355	4360	0 %	50 %	0 %	50 %	203288475
12	NC_011245	AG	3	6	4439	4444	50 %	0 %	50 %	0 %	203288475
13	NC_011245	TC	3	6	4753	4758	0 %	50 %	0 %	50 %	203288475
14	NC_011245	TA	3	6	4807	4812	50 %	50 %	0 %	0 %	203288475
15	NC_011245	TA	3	6	4922	4927	50 %	50 %	0 %	0 %	203288475
16	NC_011245	AG	3	6	5958	5963	50 %	0 %	50 %	0 %	203288476
17	NC_011245	AT	3	6	6338	6343	50 %	50 %	0 %	0 %	203288476
18	NC_011245	AT	3	6	6404	6409	50 %	50 %	0 %	0 %	203288476
19	NC_011245	GA	3	6	6907	6912	50 %	0 %	50 %	0 %	203288477
20	NC_011245	AT	3	6	7240	7245	50 %	50 %	0 %	0 %	203288478
21	NC_011245	AT	3	6	8184	8189	50 %	50 %	0 %	0 %	203288479
22	NC_011245	TC	3	6	9471	9476	0 %	50 %	0 %	50 %	203288480
23	NC_011245	AG	5	10	10133	10142	50 %	0 %	50 %	0 %	203288481
24	NC_011245	AT	3	6	10322	10327	50 %	50 %	0 %	0 %	203288482
25	NC_011245	AG	3	6	11785	11790	50 %	0 %	50 %	0 %	203288483
26	NC_011245	TA	3	6	12393	12398	50 %	50 %	0 %	0 %	203288484
27	NC_011245	TG	3	6	12648	12653	0 %	50 %	50 %	0 %	203288484
28	NC_011245	AT	3	6	12684	12689	50 %	50 %	0 %	0 %	203288484
29	NC_011245	AT	3	6	12762	12767	50 %	50 %	0 %	0 %	203288484
30	NC_011245	GA	3	6	13119	13124	50 %	0 %	50 %	0 %	203288484
31	NC_011245	TC	3	6	13428	13433	0 %	50 %	0 %	50 %	203288484
32	NC_011245	AT	3	6	18585	18590	50 %	50 %	0 %	0 %	203288493
33	NC_011245	GT	3	6	18677	18682	0 %	50 %	50 %	0 %	203288493
34	NC_011245	AC	4	8	20636	20643	50 %	0 %	0 %	50 %	203288496
35	NC_011245	AT	3	6	20815	20820	50 %	50 %	0 %	0 %	203288496
36	NC_011245	AC	3	6	21083	21088	50 %	0 %	0 %	50 %	203288497
37	NC_011245	AT	3	6	21239	21244	50 %	50 %	0 %	0 %	203288497
38	NC_011245	AT	3	6	21347	21352	50 %	50 %	0 %	0 %	203288498
39	NC_011245	GC	3	6	21804	21809	0 %	0 %	50 %	50 %	203288498
40	NC_011245	GT	3	6	22897	22902	0 %	50 %	50 %	0 %	203288499
41	NC_011245	TA	3	6	23648	23653	50 %	50 %	0 %	0 %	203288500
42	NC_011245	TA	3	6	23665	23670	50 %	50 %	0 %	0 %	203288500
43	NC_011245	TA	3	6	24163	24168	50 %	50 %	0 %	0 %	203288500
44	NC_011245	AT	3	6	24400	24405	50 %	50 %	0 %	0 %	203288500
45	NC_011245	TA	3	6	24910	24915	50 %	50 %	0 %	0 %	203288501
46	NC_011245	CA	3	6	24970	24975	50 %	0 %	0 %	50 %	203288501
47	NC_011245	AC	3	6	25840	25845	50 %	0 %	0 %	50 %	203288503
48	NC_011245	AT	3	6	26402	26407	50 %	50 %	0 %	0 %	203288503

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.