MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl28

Total Repeats: 63

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011245	ATTA	2	8	535	542	50 %	50 %	0 %	0 %	203288470
2	NC_011245	TTTA	2	8	649	656	25 %	75 %	0 %	0 %	203288471
3	NC_011245	TTGT	2	8	979	986	0 %	75 %	25 %	0 %	203288471
4	NC_011245	AATG	2	8	1271	1278	50 %	25 %	25 %	0 %	203288471
5	NC_011245	TTGT	2	8	1529	1536	0 %	75 %	25 %	0 %	203288471
6	NC_011245	ATTT	2	8	2070	2077	25 %	75 %	0 %	0 %	203288472
7	NC_011245	ACTT	2	8	2357	2364	25 %	50 %	0 %	25 %	203288472
8	NC_011245	ATTA	2	8	2457	2464	50 %	50 %	0 %	0 %	203288472
9	NC_011245	ATTT	2	8	2955	2962	25 %	75 %	0 %	0 %	203288473
10	NC_011245	AATA	2	8	3487	3494	75 %	25 %	0 %	0 %	203288474
11	NC_011245	ATTT	2	8	4315	4322	25 %	75 %	0 %	0 %	203288475
12	NC_011245	TTCT	2	8	4520	4527	0 %	75 %	0 %	25 %	203288475
13	NC_011245	TGTT	2	8	4622	4629	0 %	75 %	25 %	0 %	203288475
14	NC_011245	TCTT	2	8	4658	4665	0 %	75 %	0 %	25 %	203288475
15	NC_011245	TATT	2	8	4965	4972	25 %	75 %	0 %	0 %	203288475
16	NC_011245	GTAA	2	8	5335	5342	50 %	25 %	25 %	0 %	203288476
17	NC_011245	GAAT	2	8	5382	5389	50 %	25 %	25 %	0 %	203288476
18	NC_011245	AATT	2	8	5498	5505	50 %	50 %	0 %	0 %	203288476
19	NC_011245	TATT	2	8	5613	5620	25 %	75 %	0 %	0 %	203288476
20	NC_011245	TGGT	2	8	5730	5737	0 %	50 %	50 %	0 %	203288476
21	NC_011245	AATA	2	8	8167	8174	75 %	25 %	0 %	0 %	203288479
22	NC_011245	TATT	2	8	8259	8266	25 %	75 %	0 %	0 %	203288479
23	NC_011245	TCTG	2	8	8567	8574	0 %	50 %	25 %	25 %	203288479
24	NC_011245	TAAA	2	8	8623	8630	75 %	25 %	0 %	0 %	203288479
25	NC_011245	ATGT	2	8	9877	9884	25 %	50 %	25 %	0 %	203288481
26	NC_011245	GAAA	2	8	10220	10227	75 %	0 %	25 %	0 %	203288481
27	NC_011245	TAAA	2	8	10451	10458	75 %	25 %	0 %	0 %	203288482
28	NC_011245	TTAT	2	8	10554	10561	25 %	75 %	0 %	0 %	203288482
29	NC_011245	AATT	2	8	10734	10741	50 %	50 %	0 %	0 %	203288482
30	NC_011245	TTAT	2	8	10814	10821	25 %	75 %	0 %	0 %	203288482
31	NC_011245	AGAT	2	8	12073	12080	50 %	25 %	25 %	0 %	203288483
32	NC_011245	TTAT	2	8	12445	12452	25 %	75 %	0 %	0 %	203288484
33	NC_011245	AATT	2	8	12602	12609	50 %	50 %	0 %	0 %	203288484
34	NC_011245	CTAT	2	8	12847	12854	25 %	50 %	0 %	25 %	203288484
35	NC_011245	AGAT	2	8	12859	12866	50 %	25 %	25 %	0 %	203288484
36	NC_011245	ACTT	2	8	13202	13209	25 %	50 %	0 %	25 %	203288484
37	NC_011245	CAAA	2	8	13771	13778	75 %	0 %	0 %	25 %	203288485
38	NC_011245	GGTT	2	8	14675	14682	0 %	50 %	50 %	0 %	203288486
39	NC_011245	AGAA	2	8	15059	15066	75 %	0 %	25 %	0 %	203288487
40	NC_011245	TTGG	2	8	18120	18127	0 %	50 %	50 %	0 %	203288492
41	NC_011245	CCAT	2	8	18579	18586	25 %	25 %	0 %	50 %	203288493
42	NC_011245	ACAA	2	8	18984	18991	75 %	0 %	0 %	25 %	203288493
43	NC_011245	AAGT	2	8	19074	19081	50 %	25 %	25 %	0 %	203288494
44	NC_011245	ATTC	2	8	19559	19566	25 %	50 %	0 %	25 %	203288494
45	NC_011245	TGCA	2	8	19948	19955	25 %	25 %	25 %	25 %	203288494
46	NC_011245	TCAA	2	8	20185	20192	50 %	25 %	0 %	25 %	203288495
47	NC_011245	TAGT	2	8	20282	20289	25 %	50 %	25 %	0 %	203288495
48	NC_011245	AACA	2	8	20749	20756	75 %	0 %	0 %	25 %	203288496
49	NC_011245	TCTA	2	8	21253	21260	25 %	50 %	0 %	25 %	203288497
50	NC_011245	GAAA	2	8	21426	21433	75 %	0 %	25 %	0 %	203288498
51	NC_011245	CAAA	2	8	21450	21457	75 %	0 %	0 %	25 %	203288498
52	NC_011245	GAAA	2	8	22871	22878	75 %	0 %	25 %	0 %	203288499
53	NC_011245	TCAA	2	8	22882	22889	50 %	25 %	0 %	25 %	203288499
54	NC_011245	TTCA	2	8	22977	22984	25 %	50 %	0 %	25 %	203288499
55	NC_011245	TTAG	2	8	23127	23134	25 %	50 %	25 %	0 %	203288499
56	NC_011245	TAAC	2	8	23224	23231	50 %	25 %	0 %	25 %	203288499
57	NC_011245	AAAG	2	8	23238	23245	75 %	0 %	25 %	0 %	203288499
58	NC_011245	ACTA	2	8	23688	23695	50 %	25 %	0 %	25 %	203288500
59	NC_011245	AGTT	2	8	24453	24460	25 %	50 %	25 %	0 %	203288500
60	NC_011245	CTAT	2	8	25822	25829	25 %	50 %	0 %	25 %	203288503
61	NC_011245	CATT	2	8	26822	26829	25 %	50 %	0 %	25 %	203288504
62	NC_011245	GAAT	2	8	27018	27025	50 %	25 %	25 %	0 %	203288504
63	NC_011245	ATCA	2	8	27332	27339	50 %	25 %	0 %	25 %	203288505

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.