MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl28

Total Repeats: 419

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011245	TAC	2	6	233	238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288470
2	NC_011245	AGA	2	6	254	259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288470
3	NC_011245	CAG	2	6	409	414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288470
4	NC_011245	TAT	2	6	566	571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288471
5	NC_011245	CTA	2	6	704	709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288471
6	NC_011245	ATC	2	6	799	804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288471
7	NC_011245	ACT	2	6	847	852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288471
8	NC_011245	ATA	2	6	910	915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288471
9	NC_011245	AAC	2	6	973	978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288471
10	NC_011245	ACT	2	6	1045	1050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288471
11	NC_011245	TAT	2	6	1068	1073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288471
12	NC_011245	TAT	2	6	1089	1094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288471
13	NC_011245	TGT	3	9	1306	1314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288471
14	NC_011245	AAC	2	6	1315	1320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288471
15	NC_011245	CTA	2	6	1323	1328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288471
16	NC_011245	TAA	2	6	1392	1397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288471
17	NC_011245	TTA	2	6	1547	1552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288471
18	NC_011245	TGT	2	6	1558	1563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288471
19	NC_011245	ATT	2	6	1588	1593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288471
20	NC_011245	TAA	2	6	2017	2022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288472
21	NC_011245	CTC	2	6	2154	2159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288472
22	NC_011245	TAT	2	6	2324	2329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288472
23	NC_011245	ATC	2	6	2334	2339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288472
24	NC_011245	TAT	2	6	2345	2350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288472
25	NC_011245	ATC	2	6	2391	2396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288472
26	NC_011245	CAT	2	6	2408	2413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288472
27	NC_011245	ATT	2	6	2439	2444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288472
28	NC_011245	TCG	2	6	2470	2475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288472
29	NC_011245	ATT	2	6	2478	2483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288472
30	NC_011245	TAT	2	6	2562	2567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288473
31	NC_011245	ATA	2	6	2594	2599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288473
32	NC_011245	ATT	2	6	2601	2606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288473
33	NC_011245	ACA	2	6	2698	2703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288473
34	NC_011245	ATT	2	6	2728	2733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288473
35	NC_011245	AAT	2	6	2737	2742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288473
36	NC_011245	TAT	2	6	2753	2758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288473
37	NC_011245	ATA	2	6	2776	2781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288473
38	NC_011245	TAT	2	6	2874	2879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288473
39	NC_011245	TTA	2	6	3146	3151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288473
40	NC_011245	TAA	2	6	3184	3189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288473
41	NC_011245	ATA	2	6	3257	3262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288473
42	NC_011245	TAG	2	6	3269	3274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288473
43	NC_011245	TTA	2	6	3311	3316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288473
44	NC_011245	TAA	2	6	3359	3364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288474
45	NC_011245	TTC	2	6	3563	3568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288474
46	NC_011245	AAT	2	6	3681	3686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288474
47	NC_011245	TAT	2	6	3778	3783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288474
48	NC_011245	TAA	2	6	3799	3804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288474
49	NC_011245	ATA	2	6	3873	3878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288474
50	NC_011245	TCT	2	6	3895	3900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288475
51	NC_011245	TAA	2	6	3957	3962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288475
52	NC_011245	ATT	2	6	3965	3970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288475
53	NC_011245	AAT	2	6	4009	4014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288475
54	NC_011245	TTC	2	6	4053	4058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288475
55	NC_011245	TCT	2	6	4107	4112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288475
56	NC_011245	TAC	2	6	4183	4188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288475
57	NC_011245	CTT	2	6	4270	4275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288475
58	NC_011245	CTT	2	6	4285	4290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288475
59	NC_011245	TCT	2	6	4296	4301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288475
60	NC_011245	TCT	2	6	4306	4311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288475
61	NC_011245	CTA	2	6	4330	4335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288475
62	NC_011245	TCT	2	6	4374	4379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288475
63	NC_011245	TGT	2	6	4418	4423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288475
64	NC_011245	ATC	2	6	4451	4456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288475
65	NC_011245	CTT	2	6	4469	4474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288475
66	NC_011245	TCT	3	9	4525	4533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288475
67	NC_011245	TAT	2	6	4537	4542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288475
68	NC_011245	TTA	3	9	4545	4553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288475
69	NC_011245	TAT	3	9	4555	4563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288475
70	NC_011245	ATT	2	6	4610	4615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288475
71	NC_011245	GTT	2	6	4648	4653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288475
72	NC_011245	ATT	2	6	4853	4858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288475
73	NC_011245	TTA	3	9	4866	4874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288475
74	NC_011245	ATT	2	6	5209	5214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288476
75	NC_011245	CAA	2	6	5248	5253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288476
76	NC_011245	CAA	2	6	5266	5271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288476
77	NC_011245	TTA	2	6	5273	5278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288476
78	NC_011245	ATA	3	9	5315	5323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288476
79	NC_011245	TGC	3	9	5487	5495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288476
80	NC_011245	AAG	2	6	5534	5539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288476
81	NC_011245	TGA	2	6	5598	5603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288476
82	NC_011245	ATA	2	6	5624	5629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288476
83	NC_011245	TTG	2	6	5711	5716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288476
84	NC_011245	CAA	2	6	5720	5725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288476
85	NC_011245	ATT	2	6	5792	5797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288476
86	NC_011245	TGA	2	6	5934	5939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288476
87	NC_011245	AAT	2	6	5965	5970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288476
88	NC_011245	TGA	2	6	5987	5992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288476
89	NC_011245	AGA	2	6	6081	6086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288476
90	NC_011245	ATT	2	6	6128	6133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288476
91	NC_011245	ATA	2	6	6377	6382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288476
92	NC_011245	ATT	2	6	6473	6478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288476
93	NC_011245	TCG	2	6	6501	6506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288476
94	NC_011245	ATG	3	9	6755	6763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288477
95	NC_011245	TAA	2	6	6784	6789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288477
96	NC_011245	TAG	2	6	6835	6840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288477
97	NC_011245	TAA	2	6	6874	6879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288477
98	NC_011245	TAT	2	6	6936	6941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288477
99	NC_011245	GTT	2	6	6995	7000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288477
100	NC_011245	ATT	2	6	7064	7069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288477
101	NC_011245	CAT	2	6	7109	7114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288477
102	NC_011245	TCC	2	6	7144	7149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288477
103	NC_011245	ACA	2	6	7252	7257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288478
104	NC_011245	ATA	2	6	7263	7268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288478
105	NC_011245	TTA	2	6	7274	7279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288478
106	NC_011245	GTT	2	6	7296	7301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288478
107	NC_011245	ATT	2	6	7317	7322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288478
108	NC_011245	TAA	3	9	7366	7374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288478
109	NC_011245	TTA	2	6	7375	7380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288478
110	NC_011245	AAT	2	6	7538	7543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288478
111	NC_011245	CAA	2	6	7563	7568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288478
112	NC_011245	ATA	2	6	7569	7574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288478
113	NC_011245	ATC	2	6	7623	7628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288478
114	NC_011245	ATT	2	6	8019	8024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288479
115	NC_011245	TAT	2	6	8268	8273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288479
116	NC_011245	TTA	2	6	8385	8390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288479
117	NC_011245	CTT	2	6	8419	8424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288479
118	NC_011245	ATT	2	6	8461	8466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288479
119	NC_011245	TCT	2	6	8471	8476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288479
120	NC_011245	TCA	2	6	8486	8491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288479
121	NC_011245	CTC	2	6	8514	8519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288479
122	NC_011245	TAA	2	6	8674	8679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288479
123	NC_011245	CTT	2	6	8683	8688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288479
124	NC_011245	CTA	2	6	9277	9282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288480
125	NC_011245	ACT	2	6	9413	9418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288480
126	NC_011245	TTC	2	6	9482	9487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288480
127	NC_011245	TGT	2	6	9510	9515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288480
128	NC_011245	ACT	2	6	9575	9580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288480
129	NC_011245	TAA	2	6	9590	9595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288480
130	NC_011245	ACT	2	6	9963	9968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288481
131	NC_011245	AGA	2	6	10115	10120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288481
132	NC_011245	TAG	2	6	10169	10174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288481
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382	NC_011245	TGA	2	6	25707	25712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288503
383	NC_011245	TAC	2	6	25791	25796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288503
384	NC_011245	CTG	2	6	25862	25867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288503
385	NC_011245	GAA	2	6	25897	25902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288503
386	NC_011245	AGA	2	6	25929	25934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288503
387	NC_011245	TAC	2	6	25989	25994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288503
388	NC_011245	ATT	2	6	26008	26013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288503
389	NC_011245	AAT	3	9	26029	26037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288503
390	NC_011245	ATC	2	6	26117	26122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288503
391	NC_011245	ATA	2	6	26174	26179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288503
392	NC_011245	AAT	2	6	26329	26334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288503
393	NC_011245	GAA	2	6	26350	26355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288503
394	NC_011245	CTA	2	6	26441	26446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288504
395	NC_011245	AAT	2	6	26514	26519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288504
396	NC_011245	CTA	2	6	26564	26569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288504
397	NC_011245	CAA	2	6	26630	26635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288504
398	NC_011245	CTA	2	6	26756	26761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288504
399	NC_011245	GTA	2	6	26834	26839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288504
400	NC_011245	TCA	2	6	26966	26971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288504
401	NC_011245	GAA	2	6	26990	26995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288504
402	NC_011245	ATA	2	6	27045	27050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288504
403	NC_011245	CGT	2	6	27097	27102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288505
404	NC_011245	ATG	2	6	27108	27113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288505
405	NC_011245	AGA	2	6	27140	27145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288505
406	NC_011245	GAT	2	6	27179	27184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288505
407	NC_011245	TGA	2	6	27214	27219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288505
408	NC_011245	ATT	2	6	27310	27315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288505
409	NC_011245	TTC	2	6	27487	27492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288505
410	NC_011245	TAG	2	6	27532	27537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288505
411	NC_011245	AGT	2	6	27551	27556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288505
412	NC_011245	TAG	3	9	27586	27594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288505
413	NC_011245	GAA	2	6	27686	27691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288505
414	NC_011245	ATA	2	6	27720	27725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288505
415	NC_011245	CTA	2	6	27780	27785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288505
416	NC_011245	TTC	2	6	27814	27819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288505
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418	NC_011245	ATT	2	6	27865	27870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288505
419	NC_011245	ATA	2	6	27876	27881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288505

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.