MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl28

Total Repeats: 658

Go To Repeat Summary Page

< Previous 12Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011245	AGC	2	6	21534	21539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288498
502	NC_011245	A	8	8	21540	21547	100 %	0 %	0 %	0 %	203288498
503	NC_011245	A	8	8	21575	21582	100 %	0 %	0 %	0 %	203288498
504	NC_011245	AGA	2	6	21600	21605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288498
505	NC_011245	A	6	6	21608	21613	100 %	0 %	0 %	0 %	203288498
506	NC_011245	GAA	2	6	21643	21648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288498
507	NC_011245	AAG	2	6	21692	21697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288498
508	NC_011245	AAG	2	6	21725	21730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288498
509	NC_011245	A	6	6	21759	21764	100 %	0 %	0 %	0 %	203288498
510	NC_011245	GC	3	6	21804	21809	0 %	0 %	50 %	50 %	203288498
511	NC_011245	ACT	2	6	21865	21870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288498
512	NC_011245	GGT	2	6	21877	21882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	203288498
513	NC_011245	TAT	2	6	21915	21920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288498
514	NC_011245	CAA	2	6	21921	21926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288498
515	NC_011245	A	8	8	21936	21943	100 %	0 %	0 %	0 %	203288498
516	NC_011245	TTC	2	6	22001	22006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288498
517	NC_011245	AGA	2	6	22041	22046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288498
518	NC_011245	TGC	2	6	22134	22139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288498
519	NC_011245	GTA	2	6	22189	22194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288498
520	NC_011245	A	8	8	22341	22348	100 %	0 %	0 %	0 %	203288498
521	NC_011245	TGA	2	6	22353	22358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288498
522	NC_011245	GAA	2	6	22396	22401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288498
523	NC_011245	GAT	2	6	22411	22416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288498
524	NC_011245	ACTTT	2	10	22511	22520	20 %	60 %	0 %	20 %	203288498
525	NC_011245	T	6	6	22563	22568	0 %	100 %	0 %	0 %	203288498
526	NC_011245	TAC	2	6	22622	22627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288498
527	NC_011245	GAA	2	6	22657	22662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288498
528	NC_011245	CAC	2	6	22685	22690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288498
529	NC_011245	ACT	2	6	22696	22701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288498
530	NC_011245	AGG	2	6	22748	22753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	203288498
531	NC_011245	TTAAC	2	10	22837	22846	40 %	40 %	0 %	20 %	203288499
532	NC_011245	AAC	2	6	22859	22864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288499
533	NC_011245	GAAA	2	8	22871	22878	75 %	0 %	25 %	0 %	203288499
534	NC_011245	TCAA	2	8	22882	22889	50 %	25 %	0 %	25 %	203288499
535	NC_011245	GT	3	6	22897	22902	0 %	50 %	50 %	0 %	203288499
536	NC_011245	TTCA	2	8	22977	22984	25 %	50 %	0 %	25 %	203288499
537	NC_011245	TAC	2	6	23018	23023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288499
538	NC_011245	ATT	2	6	23047	23052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288499
539	NC_011245	ATC	2	6	23103	23108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288499
540	NC_011245	AAT	2	6	23115	23120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288499
541	NC_011245	TTAG	2	8	23127	23134	25 %	50 %	25 %	0 %	203288499
542	NC_011245	ACT	2	6	23147	23152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288499
543	NC_011245	ACA	2	6	23216	23221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288499
544	NC_011245	TAAC	2	8	23224	23231	50 %	25 %	0 %	25 %	203288499
545	NC_011245	AAAG	2	8	23238	23245	75 %	0 %	25 %	0 %	203288499
546	NC_011245	TGA	2	6	23333	23338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288499
547	NC_011245	A	6	6	23473	23478	100 %	0 %	0 %	0 %	203288500
548	NC_011245	AAAGA	2	10	23506	23515	80 %	0 %	20 %	0 %	203288500
549	NC_011245	GAA	2	6	23539	23544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288500
550	NC_011245	GAA	2	6	23554	23559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288500
551	NC_011245	AAAGA	2	10	23563	23572	80 %	0 %	20 %	0 %	203288500
552	NC_011245	TA	3	6	23648	23653	50 %	50 %	0 %	0 %	203288500
553	NC_011245	TA	3	6	23665	23670	50 %	50 %	0 %	0 %	203288500
554	NC_011245	ACTA	2	8	23688	23695	50 %	25 %	0 %	25 %	203288500
555	NC_011245	TAA	2	6	23721	23726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288500
556	NC_011245	A	6	6	23761	23766	100 %	0 %	0 %	0 %	203288500
557	NC_011245	GTG	2	6	23840	23845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	203288500
558	NC_011245	ATT	2	6	23888	23893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288500
559	NC_011245	TAG	2	6	23964	23969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288500
560	NC_011245	ATA	2	6	24007	24012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288500
561	NC_011245	TCA	2	6	24119	24124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288500
562	NC_011245	TA	3	6	24163	24168	50 %	50 %	0 %	0 %	203288500
563	NC_011245	AAACAG	2	12	24191	24202	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	203288500
564	NC_011245	A	6	6	24205	24210	100 %	0 %	0 %	0 %	203288500
565	NC_011245	GAA	2	6	24211	24216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288500
566	NC_011245	A	7	7	24221	24227	100 %	0 %	0 %	0 %	203288500
567	NC_011245	ACA	2	6	24271	24276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288500
568	NC_011245	AGA	2	6	24285	24290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288500
569	NC_011245	A	7	7	24297	24303	100 %	0 %	0 %	0 %	203288500
570	NC_011245	TCT	2	6	24339	24344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288500
571	NC_011245	CAA	2	6	24358	24363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288500
572	NC_011245	AT	3	6	24400	24405	50 %	50 %	0 %	0 %	203288500
573	NC_011245	AGTT	2	8	24453	24460	25 %	50 %	25 %	0 %	203288500
574	NC_011245	GAT	2	6	24559	24564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288500
575	NC_011245	T	6	6	24570	24575	0 %	100 %	0 %	0 %	203288500
576	NC_011245	AAG	2	6	24662	24667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288501
577	NC_011245	AAG	2	6	24743	24748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288501
578	NC_011245	ATG	2	6	24830	24835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288501
579	NC_011245	AGT	2	6	24853	24858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288501
580	NC_011245	ATG	2	6	24878	24883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288501
581	NC_011245	ATT	2	6	24887	24892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288501
582	NC_011245	TA	3	6	24910	24915	50 %	50 %	0 %	0 %	203288501
583	NC_011245	CA	3	6	24970	24975	50 %	0 %	0 %	50 %	203288501
584	NC_011245	A	6	6	24975	24980	100 %	0 %	0 %	0 %	203288501
585	NC_011245	ATA	3	9	24998	25006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288501
586	NC_011245	AGA	2	6	25026	25031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288501
587	NC_011245	AAC	2	6	25105	25110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288501
588	NC_011245	ACAAA	2	10	25113	25122	80 %	0 %	0 %	20 %	203288501
589	NC_011245	GAA	2	6	25274	25279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288502
590	NC_011245	AAC	2	6	25284	25289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288502
591	NC_011245	TCT	2	6	25299	25304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288502
592	NC_011245	ATT	2	6	25353	25358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288502
593	NC_011245	GAC	2	6	25642	25647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288503
594	NC_011245	ACA	2	6	25661	25666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288503
595	NC_011245	TGA	2	6	25707	25712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288503
596	NC_011245	TAC	2	6	25791	25796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288503
597	NC_011245	CTAT	2	8	25822	25829	25 %	50 %	0 %	25 %	203288503
598	NC_011245	AC	3	6	25840	25845	50 %	0 %	0 %	50 %	203288503
599	NC_011245	CTG	2	6	25862	25867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288503
600	NC_011245	GAA	2	6	25897	25902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288503
601	NC_011245	AGA	2	6	25929	25934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288503
602	NC_011245	TAC	2	6	25989	25994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288503
603	NC_011245	ATT	2	6	26008	26013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288503
604	NC_011245	AAT	3	9	26029	26037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288503
605	NC_011245	A	6	6	26071	26076	100 %	0 %	0 %	0 %	203288503
606	NC_011245	ATC	2	6	26117	26122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288503
607	NC_011245	ATA	2	6	26174	26179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288503
608	NC_011245	T	7	7	26217	26223	0 %	100 %	0 %	0 %	203288503
609	NC_011245	AAT	2	6	26329	26334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288503
610	NC_011245	GAA	2	6	26350	26355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288503
611	NC_011245	TTGATT	2	12	26366	26377	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	203288503
612	NC_011245	AT	3	6	26402	26407	50 %	50 %	0 %	0 %	203288503
613	NC_011245	CTA	2	6	26441	26446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288504
614	NC_011245	A	6	6	26477	26482	100 %	0 %	0 %	0 %	203288504
615	NC_011245	AAT	2	6	26514	26519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288504
616	NC_011245	CTA	2	6	26564	26569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288504
617	NC_011245	CAA	2	6	26630	26635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288504
618	NC_011245	A	6	6	26658	26663	100 %	0 %	0 %	0 %	203288504
619	NC_011245	CTA	2	6	26756	26761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288504
620	NC_011245	CATT	2	8	26822	26829	25 %	50 %	0 %	25 %	203288504
621	NC_011245	GTA	2	6	26834	26839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288504
622	NC_011245	A	7	7	26844	26850	100 %	0 %	0 %	0 %	203288504
623	NC_011245	A	7	7	26866	26872	100 %	0 %	0 %	0 %	203288504
624	NC_011245	A	6	6	26908	26913	100 %	0 %	0 %	0 %	203288504
625	NC_011245	TCA	2	6	26966	26971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288504
626	NC_011245	A	6	6	26971	26976	100 %	0 %	0 %	0 %	203288504
627	NC_011245	GAA	2	6	26990	26995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288504
628	NC_011245	GAAT	2	8	27018	27025	50 %	25 %	25 %	0 %	203288504
629	NC_011245	ATA	2	6	27045	27050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288504
630	NC_011245	CGT	2	6	27097	27102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288505
631	NC_011245	ATG	2	6	27108	27113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288505
632	NC_011245	AGA	2	6	27140	27145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288505
633	NC_011245	GAT	2	6	27179	27184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288505
634	NC_011245	TGA	2	6	27214	27219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288505
635	NC_011245	A	7	7	27239	27245	100 %	0 %	0 %	0 %	203288505
636	NC_011245	AAGGCG	2	12	27255	27266	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	203288505
637	NC_011245	ATT	2	6	27310	27315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288505
638	NC_011245	ATCA	2	8	27332	27339	50 %	25 %	0 %	25 %	203288505
639	NC_011245	A	6	6	27367	27372	100 %	0 %	0 %	0 %	203288505
640	NC_011245	ATTCT	2	10	27393	27402	20 %	60 %	0 %	20 %	203288505
641	NC_011245	AAATAC	2	12	27454	27465	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	203288505
642	NC_011245	T	6	6	27469	27474	0 %	100 %	0 %	0 %	203288505
643	NC_011245	TTC	2	6	27487	27492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288505
644	NC_011245	A	7	7	27497	27503	100 %	0 %	0 %	0 %	203288505
645	NC_011245	TAG	2	6	27532	27537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288505
646	NC_011245	AGT	2	6	27551	27556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288505
647	NC_011245	TAG	3	9	27586	27594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288505
648	NC_011245	GAA	2	6	27686	27691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288505
649	NC_011245	ATA	2	6	27720	27725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288505
650	NC_011245	CTA	2	6	27780	27785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288505
651	NC_011245	A	6	6	27785	27790	100 %	0 %	0 %	0 %	203288505
652	NC_011245	TTC	2	6	27814	27819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288505
653	NC_011245	GGT	2	6	27857	27862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	203288505
654	NC_011245	ATT	2	6	27865	27870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288505
655	NC_011245	ATA	2	6	27876	27881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288505
656	NC_011245	A	7	7	27903	27909	100 %	0 %	0 %	0 %	203288505
657	NC_011245	G	6	6	27913	27918	0 %	0 %	100 %	0 %	203288505
658	NC_011245	ATTTTT	2	12	27943	27954	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	203288505

< Previous 12Next >