MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Burkholderia cenocepacia J2315 chromosome 2

Total Repeats: 2728

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011001	TGACG	2	10	827	836	20 %	20 %	40 %	20 %	206561869
2	NC_011001	GTCGC	2	10	4083	4092	0 %	20 %	40 %	40 %	206561873
3	NC_011001	CGCTT	2	10	5114	5123	0 %	40 %	20 %	40 %	206561874
4	NC_011001	TCGAA	2	10	5511	5520	40 %	20 %	20 %	20 %	206561874
5	NC_011001	CGGCG	2	10	7789	7798	0 %	0 %	60 %	40 %	206561876
6	NC_011001	GCGTC	2	10	8257	8266	0 %	20 %	40 %	40 %	206561876
7	NC_011001	CGTGA	2	10	8447	8456	20 %	20 %	40 %	20 %	206561876
8	NC_011001	ATGCG	2	10	9153	9162	20 %	20 %	40 %	20 %	206561877
9	NC_011001	TTCGC	2	10	9511	9520	0 %	40 %	20 %	40 %	206561877
10	NC_011001	GCGAC	2	10	9800	9809	20 %	0 %	40 %	40 %	206561877
11	NC_011001	GATCG	2	10	10122	10131	20 %	20 %	40 %	20 %	206561878
12	NC_011001	GGCAT	2	10	11501	11510	20 %	20 %	40 %	20 %	206561880
13	NC_011001	CGTGC	2	10	14373	14382	0 %	20 %	40 %	40 %	206561883
14	NC_011001	GAGCC	2	10	14502	14511	20 %	0 %	40 %	40 %	206561883
15	NC_011001	CGCGC	2	10	14544	14553	0 %	0 %	40 %	60 %	206561883
16	NC_011001	TCGAA	2	10	15309	15318	40 %	20 %	20 %	20 %	206561884
17	NC_011001	ATCGC	2	10	16081	16090	20 %	20 %	20 %	40 %	206561885
18	NC_011001	TCGCC	2	10	16788	16797	0 %	20 %	20 %	60 %	206561886
19	NC_011001	CGACG	2	10	17122	17131	20 %	0 %	40 %	40 %	206561886
20	NC_011001	GTGCC	2	10	17348	17357	0 %	20 %	40 %	40 %	206561886
21	NC_011001	CGGCG	2	10	17475	17484	0 %	0 %	60 %	40 %	206561886
22	NC_011001	TGCCG	2	10	17682	17691	0 %	20 %	40 %	40 %	206561886
23	NC_011001	GGCCG	2	10	18706	18715	0 %	0 %	60 %	40 %	206561887
24	NC_011001	CGGCG	2	10	19758	19767	0 %	0 %	60 %	40 %	206561888
25	NC_011001	GATGC	2	10	20012	20021	20 %	20 %	40 %	20 %	206561889
26	NC_011001	GAACT	2	10	20681	20690	40 %	20 %	20 %	20 %	206561889
27	NC_011001	CGCGG	2	10	21924	21933	0 %	0 %	60 %	40 %	206561891
28	NC_011001	CGACA	2	10	21967	21976	40 %	0 %	20 %	40 %	206561891
29	NC_011001	GCACC	2	10	24753	24762	20 %	0 %	20 %	60 %	206561894
30	NC_011001	GCGAC	2	10	26888	26897	20 %	0 %	40 %	40 %	206561897
31	NC_011001	GGCTG	2	10	27005	27014	0 %	20 %	60 %	20 %	206561897
32	NC_011001	GTGTC	2	10	30644	30653	0 %	40 %	40 %	20 %	206561899
33	NC_011001	CGGCG	2	10	31026	31035	0 %	0 %	60 %	40 %	206561899
34	NC_011001	TGCGA	2	10	31123	31132	20 %	20 %	40 %	20 %	206561899
35	NC_011001	GGCGC	2	10	31355	31364	0 %	0 %	60 %	40 %	206561899
36	NC_011001	GGCCT	2	10	31609	31618	0 %	20 %	40 %	40 %	206561899
37	NC_011001	GCGAC	2	10	32451	32460	20 %	0 %	40 %	40 %	206561899
38	NC_011001	CGCGA	2	10	34646	34655	20 %	0 %	40 %	40 %	206561902
39	NC_011001	GCCGA	2	10	35258	35267	20 %	0 %	40 %	40 %	206561902
40	NC_011001	CGCGA	2	10	36867	36876	20 %	0 %	40 %	40 %	206561903
41	NC_011001	CGACG	2	10	38437	38446	20 %	0 %	40 %	40 %	206561905
42	NC_011001	GCCAT	2	10	39349	39358	20 %	20 %	20 %	40 %	206561905
43	NC_011001	GAACG	2	10	41099	41108	40 %	0 %	40 %	20 %	206561907
44	NC_011001	TCGCC	2	10	46408	46417	0 %	20 %	20 %	60 %	206561912
45	NC_011001	ACGCC	2	10	51373	51382	20 %	0 %	20 %	60 %	206561915
46	NC_011001	GTCGC	2	10	52641	52650	0 %	20 %	40 %	40 %	206561916
47	NC_011001	GGGCA	2	10	52941	52950	20 %	0 %	60 %	20 %	206561916
48	NC_011001	GGCGT	2	10	52965	52974	0 %	20 %	60 %	20 %	206561916
49	NC_011001	GCGCA	2	10	54008	54017	20 %	0 %	40 %	40 %	206561917
50	NC_011001	TGCGC	2	10	54948	54957	0 %	20 %	40 %	40 %	206561918
51	NC_011001	CCGGA	2	10	55114	55123	20 %	0 %	40 %	40 %	206561918
52	NC_011001	CCCGG	2	10	60031	60040	0 %	0 %	40 %	60 %	206561924
53	NC_011001	GCGAC	2	10	60865	60874	20 %	0 %	40 %	40 %	206561926
54	NC_011001	GCCGC	2	10	61226	61235	0 %	0 %	40 %	60 %	206561926
55	NC_011001	TGCAA	2	10	62543	62552	40 %	20 %	20 %	20 %	206561927
56	NC_011001	GCGAC	2	10	62834	62843	20 %	0 %	40 %	40 %	206561927
57	NC_011001	CGACG	2	10	64615	64624	20 %	0 %	40 %	40 %	206561929
58	NC_011001	GCGCT	2	10	65368	65377	0 %	20 %	40 %	40 %	206561930
59	NC_011001	ATCGC	2	10	65431	65440	20 %	20 %	20 %	40 %	206561930
60	NC_011001	CCGCA	2	10	68195	68204	20 %	0 %	20 %	60 %	206561933
61	NC_011001	TGGCG	2	10	68796	68805	0 %	20 %	60 %	20 %	206561933
62	NC_011001	CGGGC	2	10	69874	69883	0 %	0 %	60 %	40 %	206561935
63	NC_011001	AACGC	2	10	71249	71258	40 %	0 %	20 %	40 %	206561936
64	NC_011001	CCAGC	2	10	71337	71346	20 %	0 %	20 %	60 %	206561936
65	NC_011001	CAATG	2	10	72879	72888	40 %	20 %	20 %	20 %	206561936
66	NC_011001	TGGGG	2	10	74280	74289	0 %	20 %	80 %	0 %	206561938
67	NC_011001	GTGGC	2	10	74293	74302	0 %	20 %	60 %	20 %	206561938
68	NC_011001	GTATC	2	10	75028	75037	20 %	40 %	20 %	20 %	206561938
69	NC_011001	GATTG	2	10	75101	75110	20 %	40 %	40 %	0 %	206561938
70	NC_011001	TCTGT	2	10	75156	75165	0 %	60 %	20 %	20 %	206561938
71	NC_011001	TTCCA	2	10	75768	75777	20 %	40 %	0 %	40 %	206561939
72	NC_011001	CGGAA	2	10	76225	76234	40 %	0 %	40 %	20 %	206561939
73	NC_011001	CTTGG	2	10	77370	77379	0 %	40 %	40 %	20 %	206561940
74	NC_011001	GGGTT	2	10	77851	77860	0 %	40 %	60 %	0 %	206561941
75	NC_011001	GCGTC	2	10	82241	82250	0 %	20 %	40 %	40 %	206561944
76	NC_011001	GTCGC	2	10	82326	82335	0 %	20 %	40 %	40 %	206561944
77	NC_011001	GATCG	2	10	82448	82457	20 %	20 %	40 %	20 %	206561944
78	NC_011001	TCGAT	2	10	83147	83156	20 %	40 %	20 %	20 %	206561945
79	NC_011001	TTCGA	2	10	84545	84554	20 %	40 %	20 %	20 %	206561946
80	NC_011001	CGGCG	2	10	85039	85048	0 %	0 %	60 %	40 %	206561947
81	NC_011001	CGCAC	2	10	85344	85353	20 %	0 %	20 %	60 %	206561947
82	NC_011001	CGGGC	2	10	85429	85438	0 %	0 %	60 %	40 %	206561947
83	NC_011001	GCACG	2	10	85439	85448	20 %	0 %	40 %	40 %	206561947
84	NC_011001	CATCG	2	10	86396	86405	20 %	20 %	20 %	40 %	206561947
85	NC_011001	GCATC	2	10	87607	87616	20 %	20 %	20 %	40 %	206561948
86	NC_011001	GCAAC	2	10	88652	88661	40 %	0 %	20 %	40 %	206561949
87	NC_011001	ATCGC	2	10	89039	89048	20 %	20 %	20 %	40 %	206561950
88	NC_011001	CGGCA	2	10	89426	89435	20 %	0 %	40 %	40 %	206561950
89	NC_011001	GTTGC	2	10	91991	92000	0 %	40 %	40 %	20 %	206561952
90	NC_011001	TGCCG	2	10	93592	93601	0 %	20 %	40 %	40 %	206561954
91	NC_011001	AGCGC	2	10	93877	93886	20 %	0 %	40 %	40 %	206561954
92	NC_011001	CCCGA	2	10	95714	95723	20 %	0 %	20 %	60 %	206561956
93	NC_011001	CGCGC	2	10	96853	96862	0 %	0 %	40 %	60 %	206561956
94	NC_011001	GATTC	2	10	100242	100251	20 %	40 %	20 %	20 %	206561958
95	NC_011001	CGACG	2	10	100494	100503	20 %	0 %	40 %	40 %	206561959
96	NC_011001	AGCCG	2	10	100508	100517	20 %	0 %	40 %	40 %	206561959
97	NC_011001	GTCGC	2	10	103035	103044	0 %	20 %	40 %	40 %	206561961
98	NC_011001	GCACG	2	10	103620	103629	20 %	0 %	40 %	40 %	206561962
99	NC_011001	CGTGC	2	10	105960	105969	0 %	20 %	40 %	40 %	206561964
100	NC_011001	GCGCG	2	10	106703	106712	0 %	0 %	60 %	40 %	206561964
101	NC_011001	ATCGC	2	10	107535	107544	20 %	20 %	20 %	40 %	206561965
102	NC_011001	TCGAT	2	10	112339	112348	20 %	40 %	20 %	20 %	206561970
103	NC_011001	ACGCG	2	10	114411	114420	20 %	0 %	40 %	40 %	206561972
104	NC_011001	CGGGC	2	10	114715	114724	0 %	0 %	60 %	40 %	206561972
105	NC_011001	CGTCG	2	10	114745	114754	0 %	20 %	40 %	40 %	206561972
106	NC_011001	ACGGC	2	10	114855	114864	20 %	0 %	40 %	40 %	206561972
107	NC_011001	CCGGT	2	10	115641	115650	0 %	20 %	40 %	40 %	206561973
108	NC_011001	AGCGC	2	10	116212	116221	20 %	0 %	40 %	40 %	206561973
109	NC_011001	ATCGC	2	10	117025	117034	20 %	20 %	20 %	40 %	206561974
110	NC_011001	TGCGC	2	10	117314	117323	0 %	20 %	40 %	40 %	206561974
111	NC_011001	GCGAC	2	10	119663	119672	20 %	0 %	40 %	40 %	206561976
112	NC_011001	GCGCG	2	10	122870	122879	0 %	0 %	60 %	40 %	206561979
113	NC_011001	CGCGG	2	10	124591	124600	0 %	0 %	60 %	40 %	206561981
114	NC_011001	CGGCG	2	10	124712	124721	0 %	0 %	60 %	40 %	206561981
115	NC_011001	CTCGA	2	10	126307	126316	20 %	20 %	20 %	40 %	206561982
116	NC_011001	GACGT	2	10	128065	128074	20 %	20 %	40 %	20 %	206561984
117	NC_011001	CGGCC	2	10	131246	131255	0 %	0 %	40 %	60 %	206561988
118	NC_011001	ACTTC	2	10	134041	134050	20 %	40 %	0 %	40 %	206561989
119	NC_011001	GAAGA	2	10	134789	134798	60 %	0 %	40 %	0 %	206561990
120	NC_011001	CGCGA	2	10	135566	135575	20 %	0 %	40 %	40 %	206561990
121	NC_011001	CGGTG	2	10	139323	139332	0 %	20 %	60 %	20 %	206561993
122	NC_011001	CGGCG	2	10	139419	139428	0 %	0 %	60 %	40 %	206561994
123	NC_011001	CGGCG	2	10	139860	139869	0 %	0 %	60 %	40 %	206561994
124	NC_011001	GTGCG	2	10	140584	140593	0 %	20 %	60 %	20 %	206561995
125	NC_011001	CAGCG	2	10	141135	141144	20 %	0 %	40 %	40 %	206561995
126	NC_011001	GCTCG	2	10	142844	142853	0 %	20 %	40 %	40 %	206561996
127	NC_011001	CCGCG	2	10	143127	143136	0 %	0 %	40 %	60 %	206561997
128	NC_011001	CGGCG	2	10	143703	143712	0 %	0 %	60 %	40 %	206561997
129	NC_011001	TCGAA	2	10	144050	144059	40 %	20 %	20 %	20 %	206561997
130	NC_011001	CAGGC	2	10	144687	144696	20 %	0 %	40 %	40 %	206561998
131	NC_011001	AGCGC	2	10	147390	147399	20 %	0 %	40 %	40 %	206562000
132	NC_011001	CCTCG	2	10	147571	147580	0 %	20 %	20 %	60 %	206562000
133	NC_011001	GCGCG	2	10	147624	147633	0 %	0 %	60 %	40 %	206562000
134	NC_011001	TCGCG	2	10	147978	147987	0 %	20 %	40 %	40 %	206562000
135	NC_011001	CAGCG	2	10	148451	148460	20 %	0 %	40 %	40 %	206562001
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139	NC_011001	ACGCC	2	10	153817	153826	20 %	0 %	20 %	60 %	206562003
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247	NC_011001	TCGGG	2	10	257023	257032	0 %	20 %	60 %	20 %	206562088
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250	NC_011001	GCGAT	2	10	266718	266727	20 %	20 %	40 %	20 %	206562089
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252	NC_011001	GCCGT	2	10	271441	271450	0 %	20 %	40 %	40 %	206562093
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256	NC_011001	TGCCG	2	10	277353	277362	0 %	20 %	40 %	40 %	206562094
257	NC_011001	ACCGT	2	10	278614	278623	20 %	20 %	20 %	40 %	206562094
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262	NC_011001	CGGCC	2	10	286351	286360	0 %	0 %	40 %	60 %	206562097
263	NC_011001	GCGCG	2	10	287727	287736	0 %	0 %	60 %	40 %	206562098
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392	NC_011001	AAGGC	2	10	434241	434250	40 %	0 %	40 %	20 %	206562244
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