MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia cenocepacia J2315 chromosome 1

Total Repeats: 98606

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011000	TAC	2	6	19881	19886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206558423
502	NC_011000	TGG	3	9	19894	19902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206558423
503	NC_011000	TCG	2	6	19960	19965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558423
504	NC_011000	GC	4	8	19983	19990	0 %	0 %	50 %	50 %	206558423
505	NC_011000	ACCG	2	8	20010	20017	25 %	0 %	25 %	50 %	206558423
506	NC_011000	GCT	2	6	20024	20029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558423
507	NC_011000	GGTGCT	2	12	20078	20089	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	206558423
508	NC_011000	TCG	2	6	20134	20139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558423
509	NC_011000	TGA	2	6	20143	20148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206558423
510	NC_011000	CGG	2	6	20156	20161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206558423
511	NC_011000	CGA	2	6	20251	20256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558423
512	NC_011000	CGA	2	6	20293	20298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558423
513	NC_011000	CGTG	2	8	20323	20330	0 %	25 %	50 %	25 %	206558423
514	NC_011000	TCG	2	6	20350	20355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558423
515	NC_011000	CG	3	6	20366	20371	0 %	0 %	50 %	50 %	206558423
516	NC_011000	GATG	2	8	21494	21501	25 %	25 %	50 %	0 %	206558424
517	NC_011000	GT	3	6	21526	21531	0 %	50 %	50 %	0 %	206558424
518	NC_011000	GCG	2	6	21532	21537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206558424
519	NC_011000	CCGGC	2	10	21584	21593	0 %	0 %	40 %	60 %	206558424
520	NC_011000	GCT	2	6	21630	21635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558424
521	NC_011000	GAC	2	6	21679	21684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558424
522	NC_011000	CG	3	6	21700	21705	0 %	0 %	50 %	50 %	206558424
523	NC_011000	CGA	2	6	21729	21734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558424
524	NC_011000	ATC	2	6	21751	21756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206558424
525	NC_011000	TCG	2	6	21760	21765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558424
526	NC_011000	CTCG	2	8	21777	21784	0 %	25 %	25 %	50 %	206558424
527	NC_011000	CGA	2	6	21818	21823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558424
528	NC_011000	TCGC	2	8	21826	21833	0 %	25 %	25 %	50 %	206558424
529	NC_011000	GC	3	6	21839	21844	0 %	0 %	50 %	50 %	206558424
530	NC_011000	ATC	2	6	21847	21852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206558424
531	NC_011000	GC	3	6	21870	21875	0 %	0 %	50 %	50 %	206558424
532	NC_011000	CGG	2	6	22016	22021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206558424
533	NC_011000	GAA	2	6	22026	22031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206558424
534	NC_011000	GCT	2	6	22101	22106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558424
535	NC_011000	CGG	2	6	22151	22156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206558424
536	NC_011000	CAA	2	6	22224	22229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206558424
537	NC_011000	GCCG	2	8	22275	22282	0 %	0 %	50 %	50 %	206558424
538	NC_011000	GACC	2	8	22296	22303	25 %	0 %	25 %	50 %	206558424
539	NC_011000	GAA	2	6	22326	22331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206558424
540	NC_011000	CGG	2	6	22395	22400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206558424
541	NC_011000	CTG	3	9	22420	22428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558424
542	NC_011000	GAA	2	6	22452	22457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206558424
543	NC_011000	GC	3	6	22494	22499	0 %	0 %	50 %	50 %	206558424
544	NC_011000	GC	3	6	22585	22590	0 %	0 %	50 %	50 %	206558424
545	NC_011000	TCG	2	6	22604	22609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558424
546	NC_011000	TC	3	6	22850	22855	0 %	50 %	0 %	50 %	206558425
547	NC_011000	GCG	2	6	22860	22865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206558425
548	NC_011000	TTG	2	6	22908	22913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206558425
549	NC_011000	TCG	2	6	22975	22980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558425
550	NC_011000	CTG	2	6	23033	23038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558425
551	NC_011000	GCT	2	6	23039	23044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558425
552	NC_011000	CGC	2	6	23106	23111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206558425
553	NC_011000	CTG	2	6	23157	23162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558425
554	NC_011000	CCGATG	2	12	23205	23216	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	206558425
555	NC_011000	TCG	2	6	23245	23250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558425
556	NC_011000	ACG	2	6	23304	23309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558425
557	NC_011000	CTG	4	12	23310	23321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558425
558	NC_011000	GTCG	2	8	23327	23334	0 %	25 %	50 %	25 %	206558425
559	NC_011000	GGTC	2	8	23351	23358	0 %	25 %	50 %	25 %	206558425
560	NC_011000	TCGC	2	8	23415	23422	0 %	25 %	25 %	50 %	206558425
561	NC_011000	GCA	2	6	23428	23433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558425
562	NC_011000	TCG	3	9	23458	23466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558425
563	NC_011000	GC	3	6	23534	23539	0 %	0 %	50 %	50 %	206558425
564	NC_011000	TCG	2	6	23569	23574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558425
565	NC_011000	CAC	2	6	23582	23587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	206558425
566	NC_011000	GGC	2	6	23596	23601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206558425
567	NC_011000	CGG	2	6	23617	23622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206558425
568	NC_011000	TCG	2	6	23647	23652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558425
569	NC_011000	GAC	2	6	23660	23665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558425
570	NC_011000	CTA	2	6	23669	23674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206558425
571	NC_011000	TCG	2	6	23707	23712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558425
572	NC_011000	ATC	2	6	23718	23723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206558425
573	NC_011000	GCC	2	6	23751	23756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206558425
574	NC_011000	GCT	2	6	23762	23767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558425
575	NC_011000	TCG	2	6	23790	23795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558425
576	NC_011000	AGG	2	6	23815	23820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206558425
577	NC_011000	TGC	2	6	23848	23853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558425
578	NC_011000	CGC	2	6	23872	23877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206558425
579	NC_011000	GGAAGA	2	12	23882	23893	50 %	0 %	50 %	0 %	206558425
580	NC_011000	CAA	2	6	23922	23927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206558426
581	NC_011000	GTG	2	6	23947	23952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206558426
582	NC_011000	TGC	2	6	23969	23974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558426
583	NC_011000	GC	3	6	23978	23983	0 %	0 %	50 %	50 %	206558426
584	NC_011000	GCT	2	6	24009	24014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558426
585	NC_011000	TCG	2	6	24038	24043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558426
586	NC_011000	TGC	2	6	24056	24061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558426
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588	NC_011000	TCG	2	6	24104	24109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558426
589	NC_011000	GAC	2	6	24138	24143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558426
590	NC_011000	TCG	2	6	24176	24181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558426
591	NC_011000	CGT	2	6	24183	24188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558426
592	NC_011000	ACG	2	6	24323	24328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558426
593	NC_011000	GTG	2	6	24409	24414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206558426
594	NC_011000	CTG	2	6	24442	24447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558426
595	NC_011000	CG	3	6	24463	24468	0 %	0 %	50 %	50 %	206558426
596	NC_011000	CG	3	6	24472	24477	0 %	0 %	50 %	50 %	206558426
597	NC_011000	GCG	4	12	24482	24493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206558426
598	NC_011000	CGT	2	6	24534	24539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558426
599	NC_011000	GC	3	6	24600	24605	0 %	0 %	50 %	50 %	206558426
600	NC_011000	GTG	2	6	24661	24666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206558426
601	NC_011000	GGC	2	6	24667	24672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206558426
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605	NC_011000	ATC	2	6	24781	24786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206558426
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607	NC_011000	CG	3	6	24822	24827	0 %	0 %	50 %	50 %	206558426
608	NC_011000	TCG	2	6	24845	24850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558426
609	NC_011000	CG	3	6	24863	24868	0 %	0 %	50 %	50 %	206558426
610	NC_011000	CG	4	8	24872	24879	0 %	0 %	50 %	50 %	206558426
611	NC_011000	GC	3	6	24912	24917	0 %	0 %	50 %	50 %	206558426
612	NC_011000	GCT	2	6	24939	24944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558426
613	NC_011000	CGT	2	6	24945	24950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558426
614	NC_011000	ACGC	2	8	24956	24963	25 %	0 %	25 %	50 %	206558426
615	NC_011000	TGG	2	6	24980	24985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206558426
616	NC_011000	ACG	2	6	24992	24997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558426
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620	NC_011000	GCT	2	6	25197	25202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558426
621	NC_011000	GCA	2	6	25271	25276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558426
622	NC_011000	CG	3	6	25278	25283	0 %	0 %	50 %	50 %	206558426
623	NC_011000	CG	3	6	25323	25328	0 %	0 %	50 %	50 %	206558426
624	NC_011000	CCG	2	6	25335	25340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206558426
625	NC_011000	ACG	2	6	25364	25369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558426
626	NC_011000	CAG	2	6	25393	25398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558426
627	NC_011000	CG	3	6	25413	25418	0 %	0 %	50 %	50 %	206558426
628	NC_011000	TGC	2	6	25426	25431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558426
629	NC_011000	TGC	3	9	25442	25450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558426
630	NC_011000	CGA	2	6	25452	25457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558426
631	NC_011000	GCCG	2	8	25458	25465	0 %	0 %	50 %	50 %	206558426
632	NC_011000	AGC	2	6	25487	25492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558426
633	NC_011000	CTG	2	6	25504	25509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558426
634	NC_011000	CGG	2	6	25510	25515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206558426
635	NC_011000	GT	3	6	25535	25540	0 %	50 %	50 %	0 %	206558426
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638	NC_011000	TGG	2	6	25589	25594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206558426
639	NC_011000	GCA	2	6	25641	25646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558426
640	NC_011000	TGA	2	6	25687	25692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206558426
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642	NC_011000	GCT	2	6	25835	25840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558427
643	NC_011000	ACG	2	6	25906	25911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558427
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651	NC_011000	GCG	2	6	26310	26315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206558427
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657	NC_011000	CTG	3	9	27081	27089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558428
658	NC_011000	CGG	2	6	27137	27142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206558428
659	NC_011000	GCG	2	6	27184	27189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206558428
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732	NC_011000	CGA	2	6	29823	29828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558430
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748	NC_011000	AGA	2	6	30517	30522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206558431
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751	NC_011000	CGCTCG	2	12	30607	30618	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	206558431
752	NC_011000	CG	3	6	30696	30701	0 %	0 %	50 %	50 %	206558431
753	NC_011000	ATC	2	6	30756	30761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206558431
754	NC_011000	GCG	2	6	30770	30775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206558431
755	NC_011000	CG	3	6	30780	30785	0 %	0 %	50 %	50 %	206558431
756	NC_011000	GC	3	6	30786	30791	0 %	0 %	50 %	50 %	206558431
757	NC_011000	GGCC	2	8	30794	30801	0 %	0 %	50 %	50 %	206558431
758	NC_011000	GCC	3	9	30843	30851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206558431
759	NC_011000	CGA	2	6	30929	30934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558431
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761	NC_011000	GGC	2	6	30956	30961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206558431
762	NC_011000	TCGG	2	8	30966	30973	0 %	25 %	50 %	25 %	206558431
763	NC_011000	CTG	2	6	30999	31004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558431
764	NC_011000	CTG	2	6	31008	31013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558431
765	NC_011000	TGC	2	6	31039	31044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558431
766	NC_011000	GCAC	2	8	31067	31074	25 %	0 %	25 %	50 %	206558431
767	NC_011000	GC	3	6	31075	31080	0 %	0 %	50 %	50 %	206558431
768	NC_011000	GGT	2	6	31124	31129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206558431
769	NC_011000	CAA	2	6	31130	31135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206558431
770	NC_011000	TCG	2	6	31165	31170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558431
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773	NC_011000	GC	4	8	31203	31210	0 %	0 %	50 %	50 %	206558431
774	NC_011000	GAC	2	6	31215	31220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558431
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778	NC_011000	GCGGGC	2	12	31300	31311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206558431
779	NC_011000	CG	3	6	31358	31363	0 %	0 %	50 %	50 %	206558431
780	NC_011000	GCGCC	2	10	31426	31435	0 %	0 %	40 %	60 %	206558432
781	NC_011000	GGCT	2	8	31444	31451	0 %	25 %	50 %	25 %	206558432
782	NC_011000	TGC	2	6	31496	31501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558432
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784	NC_011000	CGCAT	2	10	31628	31637	20 %	20 %	20 %	40 %	206558432
785	NC_011000	CGAG	2	8	31656	31663	25 %	0 %	50 %	25 %	206558432
786	NC_011000	TGC	2	6	31673	31678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558432
787	NC_011000	CGC	2	6	31689	31694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206558432
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791	NC_011000	CGG	2	6	31786	31791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206558432
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874	NC_011000	CGGC	2	8	35745	35752	0 %	0 %	50 %	50 %	206558437
875	NC_011000	CGAAG	2	10	35755	35764	40 %	0 %	40 %	20 %	206558437
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