MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia cenocepacia J2315 chromosome 1

Total Repeats: 98606

< Previous12...678910111213141516...197198Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_011000	TAC	2	6	196079	196084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206558579
5002	NC_011000	ACAA	2	8	196160	196167	75 %	0 %	0 %	25 %	206558579
5003	NC_011000	CCG	2	6	196172	196177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206558579
5004	NC_011000	CGTTGG	2	12	196192	196203	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	206558579
5005	NC_011000	CGG	2	6	196219	196224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206558579
5006	NC_011000	GCC	2	6	196253	196258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206558579
5007	NC_011000	CAA	2	6	196361	196366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206558579
5008	NC_011000	CGG	2	6	196375	196380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206558579
5009	NC_011000	GCA	2	6	196398	196403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558579
5010	NC_011000	TGG	2	6	196435	196440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206558579
5011	NC_011000	AGC	2	6	196445	196450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558579
5012	NC_011000	GGC	2	6	196457	196462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206558579
5013	NC_011000	GTG	2	6	196464	196469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206558579
5014	NC_011000	AGC	2	6	196517	196522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558579
5015	NC_011000	GCT	2	6	196562	196567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558579
5016	NC_011000	GAT	2	6	196570	196575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206558579
5017	NC_011000	GGC	2	6	196610	196615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206558579
5018	NC_011000	GAC	2	6	196688	196693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558579
5019	NC_011000	CGC	2	6	196747	196752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206558579
5020	NC_011000	CATG	2	8	196865	196872	25 %	25 %	25 %	25 %	206558580
5021	NC_011000	GCT	2	6	196944	196949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558580
5022	NC_011000	ATCT	2	8	196954	196961	25 %	50 %	0 %	25 %	206558580
5023	NC_011000	GTC	2	6	196995	197000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558580
5024	NC_011000	CGGGC	2	10	197017	197026	0 %	0 %	60 %	40 %	206558580
5025	NC_011000	AG	3	6	197043	197048	50 %	0 %	50 %	0 %	206558580
5026	NC_011000	GCA	2	6	197075	197080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558580
5027	NC_011000	CCG	2	6	197091	197096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206558580
5028	NC_011000	ACG	2	6	197104	197109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558580
5029	NC_011000	ATC	2	6	197151	197156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206558581
5030	NC_011000	TGC	2	6	197172	197177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558581
5031	NC_011000	GC	3	6	197311	197316	0 %	0 %	50 %	50 %	206558581
5032	NC_011000	GGC	2	6	197551	197556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206558582
5033	NC_011000	CGAT	2	8	197634	197641	25 %	25 %	25 %	25 %	206558582
5034	NC_011000	AGA	2	6	197667	197672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206558582
5035	NC_011000	TCA	2	6	197702	197707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206558582
5036	NC_011000	CGGC	2	8	197733	197740	0 %	0 %	50 %	50 %	206558582
5037	NC_011000	GGA	2	6	198147	198152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206558583
5038	NC_011000	CTGG	2	8	198158	198165	0 %	25 %	50 %	25 %	206558583
5039	NC_011000	TGGC	2	8	198183	198190	0 %	25 %	50 %	25 %	206558583
5040	NC_011000	GGA	2	6	198228	198233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206558583
5041	NC_011000	CG	3	6	198276	198281	0 %	0 %	50 %	50 %	206558583
5042	NC_011000	T	6	6	198328	198333	0 %	100 %	0 %	0 %	206558583
5043	NC_011000	GAA	2	6	198396	198401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206558583
5044	NC_011000	A	6	6	198411	198416	100 %	0 %	0 %	0 %	206558583
5045	NC_011000	GAG	2	6	198472	198477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206558583
5046	NC_011000	TAA	2	6	198521	198526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206558583
5047	NC_011000	GGCT	2	8	198529	198536	0 %	25 %	50 %	25 %	206558583
5048	NC_011000	TGAT	2	8	198559	198566	25 %	50 %	25 %	0 %	206558583
5049	NC_011000	CT	3	6	198637	198642	0 %	50 %	0 %	50 %	206558583
5050	NC_011000	TCG	2	6	198647	198652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558583
5051	NC_011000	CGA	2	6	198654	198659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558583
5052	NC_011000	TTG	2	6	198673	198678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206558583
5053	NC_011000	GAC	2	6	198760	198765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558583
5054	NC_011000	ATG	2	6	198781	198786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206558583
5055	NC_011000	TAA	2	6	198790	198795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206558583
5056	NC_011000	ACG	2	6	198799	198804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558583
5057	NC_011000	GAA	2	6	198821	198826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206558583
5058	NC_011000	GCA	2	6	198833	198838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558583
5059	NC_011000	A	6	6	198884	198889	100 %	0 %	0 %	0 %	206558583
5060	NC_011000	TCT	2	6	198928	198933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206558584
5061	NC_011000	GT	3	6	198962	198967	0 %	50 %	50 %	0 %	206558584
5062	NC_011000	TGA	2	6	198990	198995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206558584
5063	NC_011000	CT	3	6	198999	199004	0 %	50 %	0 %	50 %	206558584
5064	NC_011000	CGC	2	6	199037	199042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206558584
5065	NC_011000	TG	3	6	199087	199092	0 %	50 %	50 %	0 %	206558584
5066	NC_011000	CAC	2	6	199169	199174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	206558584
5067	NC_011000	GCG	2	6	199201	199206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206558584
5068	NC_011000	CGA	2	6	199280	199285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558584
5069	NC_011000	C	6	6	199305	199310	0 %	0 %	0 %	100 %	206558584
5070	NC_011000	CCT	2	6	199391	199396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	206558584
5071	NC_011000	CTT	2	6	199457	199462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206558584
5072	NC_011000	CAA	2	6	199463	199468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206558584
5073	NC_011000	TC	3	6	199472	199477	0 %	50 %	0 %	50 %	206558584
5074	NC_011000	ATC	2	6	199494	199499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206558584
5075	NC_011000	TGC	2	6	199521	199526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558584
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5077	NC_011000	GGA	2	6	199640	199645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206558584
5078	NC_011000	GCC	2	6	199671	199676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206558584
5079	NC_011000	GAC	2	6	199686	199691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558584
5080	NC_011000	GGCT	2	8	199761	199768	0 %	25 %	50 %	25 %	206558584
5081	NC_011000	CGG	2	6	199832	199837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206558584
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5083	NC_011000	CGT	2	6	199876	199881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558584
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5085	NC_011000	TGA	2	6	199947	199952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206558584
5086	NC_011000	ATG	2	6	199981	199986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206558584
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5088	NC_011000	CGT	2	6	200114	200119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558584
5089	NC_011000	TGGA	2	8	200161	200168	25 %	25 %	50 %	0 %	206558584
5090	NC_011000	T	7	7	200211	200217	0 %	100 %	0 %	0 %	206558584
5091	NC_011000	CAA	2	6	200222	200227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206558584
5092	NC_011000	TGT	2	6	200243	200248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206558584
5093	NC_011000	TGCT	2	8	200382	200389	0 %	50 %	25 %	25 %	206558584
5094	NC_011000	TTTC	2	8	200405	200412	0 %	75 %	0 %	25 %	206558584
5095	NC_011000	GGC	2	6	200424	200429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206558584
5096	NC_011000	CGTG	2	8	200451	200458	0 %	25 %	50 %	25 %	206558584
5097	NC_011000	TTGC	2	8	200474	200481	0 %	50 %	25 %	25 %	206558584
5098	NC_011000	ATC	2	6	200550	200555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206558584
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5100	NC_011000	CGT	2	6	200594	200599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558584
5101	NC_011000	GTT	2	6	200652	200657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206558584
5102	NC_011000	GTA	2	6	200719	200724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206558584
5103	NC_011000	TCG	2	6	200788	200793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558584
5104	NC_011000	TAAA	2	8	200802	200809	75 %	25 %	0 %	0 %	206558584
5105	NC_011000	CCA	2	6	200865	200870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	206558584
5106	NC_011000	GC	3	6	200887	200892	0 %	0 %	50 %	50 %	206558584
5107	NC_011000	AAGGG	2	10	200920	200929	40 %	0 %	60 %	0 %	206558584
5108	NC_011000	TGC	2	6	200934	200939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558584
5109	NC_011000	GGC	2	6	200948	200953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206558584
5110	NC_011000	TCG	2	6	201049	201054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558584
5111	NC_011000	ACA	2	6	201082	201087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206558584
5112	NC_011000	GAC	2	6	201133	201138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558584
5113	NC_011000	GC	3	6	201164	201169	0 %	0 %	50 %	50 %	206558584
5114	NC_011000	AAT	2	6	201474	201479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206558584
5115	NC_011000	CAAA	2	8	201800	201807	75 %	0 %	0 %	25 %	206558585
5116	NC_011000	GCC	2	6	201815	201820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206558585
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5118	NC_011000	ACC	2	6	201995	202000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	206558585
5119	NC_011000	GAC	2	6	202086	202091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558585
5120	NC_011000	GCC	2	6	202181	202186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206558585
5121	NC_011000	GTCT	2	8	202218	202225	0 %	50 %	25 %	25 %	206558585
5122	NC_011000	TCA	2	6	202236	202241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206558586
5123	NC_011000	CGA	2	6	202430	202435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558586
5124	NC_011000	GAA	2	6	202443	202448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206558586
5125	NC_011000	CGA	2	6	202469	202474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558586
5126	NC_011000	AGT	2	6	202790	202795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206558586
5127	NC_011000	TCC	2	6	203233	203238	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	206558587
5128	NC_011000	GTA	2	6	203250	203255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206558587
5129	NC_011000	GTCA	2	8	203367	203374	25 %	25 %	25 %	25 %	206558587
5130	NC_011000	TAC	2	6	203439	203444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206558587
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5132	NC_011000	TGC	2	6	203531	203536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558587
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5134	NC_011000	CGC	2	6	203692	203697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206558587
5135	NC_011000	GCCA	2	8	203713	203720	25 %	0 %	25 %	50 %	206558587
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5141	NC_011000	CGG	2	6	203962	203967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206558587
5142	NC_011000	GGAC	2	8	204083	204090	25 %	0 %	50 %	25 %	206558587
5143	NC_011000	T	6	6	204108	204113	0 %	100 %	0 %	0 %	206558587
5144	NC_011000	CTT	2	6	204125	204130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206558587
5145	NC_011000	CGC	2	6	204194	204199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206558587
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5150	NC_011000	ACC	2	6	204654	204659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	206558588
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5152	NC_011000	CG	3	6	204770	204775	0 %	0 %	50 %	50 %	206558588
5153	NC_011000	ATCG	2	8	204813	204820	25 %	25 %	25 %	25 %	206558588
5154	NC_011000	GCC	3	9	204841	204849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206558588
5155	NC_011000	GTT	2	6	204885	204890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206558588
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5162	NC_011000	GC	3	6	205233	205238	0 %	0 %	50 %	50 %	206558588
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5244	NC_011000	CGGC	2	8	207941	207948	0 %	0 %	50 %	50 %	206558590
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5345	NC_011000	CGCTG	2	10	210785	210794	0 %	20 %	40 %	40 %	206558593
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5361	NC_011000	GCG	2	6	211256	211261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206558593
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5365	NC_011000	CG	3	6	211300	211305	0 %	0 %	50 %	50 %	206558593
5366	NC_011000	CGT	2	6	211323	211328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558593
5367	NC_011000	GC	4	8	211339	211346	0 %	0 %	50 %	50 %	206558593
5368	NC_011000	CGCGT	2	10	211382	211391	0 %	20 %	40 %	40 %	206558593
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5370	NC_011000	CG	3	6	211421	211426	0 %	0 %	50 %	50 %	206558593
5371	NC_011000	GC	4	8	211459	211466	0 %	0 %	50 %	50 %	206558594
5372	NC_011000	CGA	2	6	211474	211479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558594
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5374	NC_011000	GC	3	6	211494	211499	0 %	0 %	50 %	50 %	206558594
5375	NC_011000	CGA	2	6	211519	211524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558594
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5377	NC_011000	ACG	2	6	211557	211562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558594
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5379	NC_011000	ACG	2	6	211627	211632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558594
5380	NC_011000	CGC	2	6	211669	211674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	206558594
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5385	NC_011000	CGAC	2	8	211777	211784	25 %	0 %	25 %	50 %	206558594
5386	NC_011000	ATC	2	6	211797	211802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206558594
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5391	NC_011000	TCG	2	6	211917	211922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558594
5392	NC_011000	GC	3	6	211958	211963	0 %	0 %	50 %	50 %	206558594
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5473	NC_011000	CTT	2	6	214512	214517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206558597
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5482	NC_011000	GCA	2	6	214787	214792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558597
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5484	NC_011000	CGA	2	6	214808	214813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558597
5485	NC_011000	GCT	2	6	214925	214930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558597
5486	NC_011000	CCTCGA	2	12	214970	214981	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	206558597
5487	NC_011000	TGT	2	6	215048	215053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206558597
5488	NC_011000	GC	3	6	215096	215101	0 %	0 %	50 %	50 %	206558597
5489	NC_011000	CG	4	8	215187	215194	0 %	0 %	50 %	50 %	206558597
5490	NC_011000	GTGTCG	2	12	215212	215223	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	206558597
5491	NC_011000	CGGC	2	8	215231	215238	0 %	0 %	50 %	50 %	206558597
5492	NC_011000	GCG	2	6	215268	215273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	206558597
5493	NC_011000	CG	3	6	215322	215327	0 %	0 %	50 %	50 %	206558597
5494	NC_011000	ACCTGC	2	12	215332	215343	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	206558597
5495	NC_011000	GC	5	10	215342	215351	0 %	0 %	50 %	50 %	206558597
5496	NC_011000	CGT	2	6	215372	215377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206558597
5497	NC_011000	CG	3	6	215389	215394	0 %	0 %	50 %	50 %	206558597
5498	NC_011000	CTT	2	6	215406	215411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206558597
5499	NC_011000	GGCCCT	2	12	215450	215461	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	206558597
5500	NC_011000	ACG	2	6	215491	215496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206558597

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