MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Bifidobacterium longum DJO10A chromosome

Total Repeats: 4699

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010816	TGCT	2	8	803	810	0 %	50 %	25 %	25 %	189438865
2	NC_010816	GCTG	2	8	1632	1639	0 %	25 %	50 %	25 %	189438865
3	NC_010816	CCTG	2	8	1941	1948	0 %	25 %	25 %	50 %	189438865
4	NC_010816	GACC	2	8	2007	2014	25 %	0 %	25 %	50 %	189438865
5	NC_010816	AGCG	2	8	2312	2319	25 %	0 %	50 %	25 %	189438866
6	NC_010816	TGGA	2	8	2321	2328	25 %	25 %	50 %	0 %	189438866
7	NC_010816	GCCT	2	8	2456	2463	0 %	25 %	25 %	50 %	189438866
8	NC_010816	CCTA	2	8	4645	4652	25 %	25 %	0 %	50 %	189438869
9	NC_010816	TTCC	2	8	5105	5112	0 %	50 %	0 %	50 %	189438869
10	NC_010816	GCCA	2	8	5236	5243	25 %	0 %	25 %	50 %	189438869
11	NC_010816	CCAG	2	8	5360	5367	25 %	0 %	25 %	50 %	189438869
12	NC_010816	GCCG	2	8	5712	5719	0 %	0 %	50 %	50 %	189438869
13	NC_010816	CCCG	2	8	6458	6465	0 %	0 %	25 %	75 %	189438870
14	NC_010816	CGGC	2	8	6518	6525	0 %	0 %	50 %	50 %	189438870
15	NC_010816	TGGC	2	8	8041	8048	0 %	25 %	50 %	25 %	189438872
16	NC_010816	GACC	2	8	8174	8181	25 %	0 %	25 %	50 %	189438872
17	NC_010816	ACCA	2	8	8331	8338	50 %	0 %	0 %	50 %	189438872
18	NC_010816	AGCG	2	8	8542	8549	25 %	0 %	50 %	25 %	189438872
19	NC_010816	ACCG	2	8	9062	9069	25 %	0 %	25 %	50 %	189438873
20	NC_010816	CCTG	2	8	10240	10247	0 %	25 %	25 %	50 %	189438873
21	NC_010816	GAAG	2	8	10447	10454	50 %	0 %	50 %	0 %	189438873
22	NC_010816	GTTC	2	8	10698	10705	0 %	50 %	25 %	25 %	189438873
23	NC_010816	GCCG	2	8	11608	11615	0 %	0 %	50 %	50 %	189438873
24	NC_010816	CGGC	2	8	11888	11895	0 %	0 %	50 %	50 %	189438874
25	NC_010816	TGGC	2	8	12359	12366	0 %	25 %	50 %	25 %	189438874
26	NC_010816	TCCT	2	8	12580	12587	0 %	50 %	0 %	50 %	189438874
27	NC_010816	GGTC	2	8	12729	12736	0 %	25 %	50 %	25 %	189438874
28	NC_010816	TTTC	2	8	12777	12784	0 %	75 %	0 %	25 %	189438874
29	NC_010816	CGAG	2	8	13411	13418	25 %	0 %	50 %	25 %	189438875
30	NC_010816	CCGG	2	8	13915	13922	0 %	0 %	50 %	50 %	189438875
31	NC_010816	CTTC	2	8	15081	15088	0 %	50 %	0 %	50 %	189438876
32	NC_010816	CTGC	2	8	15337	15344	0 %	25 %	25 %	50 %	189438876
33	NC_010816	CACC	2	8	15462	15469	25 %	0 %	0 %	75 %	189438876
34	NC_010816	ACCT	2	8	15851	15858	25 %	25 %	0 %	50 %	189438876
35	NC_010816	TCTG	2	8	15868	15875	0 %	50 %	25 %	25 %	189438876
36	NC_010816	CCGG	2	8	17118	17125	0 %	0 %	50 %	50 %	189438877
37	NC_010816	GCGT	2	8	17160	17167	0 %	25 %	50 %	25 %	189438877
38	NC_010816	ACGT	2	8	17878	17885	25 %	25 %	25 %	25 %	189438878
39	NC_010816	ACAA	2	8	18493	18500	75 %	0 %	0 %	25 %	189438878
40	NC_010816	CGGT	2	8	18523	18530	0 %	25 %	50 %	25 %	189438878
41	NC_010816	CCGA	2	8	18956	18963	25 %	0 %	25 %	50 %	189438878
42	NC_010816	CAGC	2	8	19076	19083	25 %	0 %	25 %	50 %	189438878
43	NC_010816	CGGC	2	8	19859	19866	0 %	0 %	50 %	50 %	189438879
44	NC_010816	GACG	2	8	21486	21493	25 %	0 %	50 %	25 %	189438880
45	NC_010816	GCCT	2	8	21598	21605	0 %	25 %	25 %	50 %	189438880
46	NC_010816	TGCG	2	8	22079	22086	0 %	25 %	50 %	25 %	189438880
47	NC_010816	CACC	2	8	22109	22116	25 %	0 %	0 %	75 %	189438880
48	NC_010816	GCCC	2	8	22536	22543	0 %	0 %	25 %	75 %	189438881
49	NC_010816	CGTG	2	8	23579	23586	0 %	25 %	50 %	25 %	189438881
50	NC_010816	CGTA	2	8	23846	23853	25 %	25 %	25 %	25 %	189438881
51	NC_010816	CAGC	2	8	25198	25205	25 %	0 %	25 %	50 %	189438882
52	NC_010816	ATGC	2	8	25262	25269	25 %	25 %	25 %	25 %	189438882
53	NC_010816	GACC	2	8	26940	26947	25 %	0 %	25 %	50 %	189438883
54	NC_010816	GGAA	2	8	27258	27265	50 %	0 %	50 %	0 %	189438884
55	NC_010816	GGCC	2	8	27610	27617	0 %	0 %	50 %	50 %	189438884
56	NC_010816	CTCG	2	8	29069	29076	0 %	25 %	25 %	50 %	189438886
57	NC_010816	GGGC	2	8	30504	30511	0 %	0 %	75 %	25 %	189438887
58	NC_010816	ACGG	2	8	31227	31234	25 %	0 %	50 %	25 %	189438887
59	NC_010816	GCTG	2	8	31602	31609	0 %	25 %	50 %	25 %	189438888
60	NC_010816	CGTC	2	8	32623	32630	0 %	25 %	25 %	50 %	189438889
61	NC_010816	CGCC	2	8	32642	32649	0 %	0 %	25 %	75 %	189438890
62	NC_010816	GTCT	2	8	32882	32889	0 %	50 %	25 %	25 %	189438890
63	NC_010816	GAAC	2	8	33441	33448	50 %	0 %	25 %	25 %	189438891
64	NC_010816	CCGC	2	8	33815	33822	0 %	0 %	25 %	75 %	189438891
65	NC_010816	CGTC	3	12	34297	34308	0 %	25 %	25 %	50 %	189438892
66	NC_010816	TGCT	2	8	34518	34525	0 %	50 %	25 %	25 %	189438892
67	NC_010816	GGGC	2	8	34709	34716	0 %	0 %	75 %	25 %	189438892
68	NC_010816	CGGC	2	8	34924	34931	0 %	0 %	50 %	50 %	189438892
69	NC_010816	GCCG	2	8	35801	35808	0 %	0 %	50 %	50 %	189438893
70	NC_010816	TGCC	2	8	37043	37050	0 %	25 %	25 %	50 %	189438894
71	NC_010816	ATGA	2	8	37361	37368	50 %	25 %	25 %	0 %	189438895
72	NC_010816	ACCG	2	8	37633	37640	25 %	0 %	25 %	50 %	189438895
73	NC_010816	CCCG	2	8	37748	37755	0 %	0 %	25 %	75 %	189438895
74	NC_010816	CTGC	2	8	38115	38122	0 %	25 %	25 %	50 %	189438895
75	NC_010816	GCGG	2	8	39053	39060	0 %	0 %	75 %	25 %	189438897
76	NC_010816	ACAG	2	8	39459	39466	50 %	0 %	25 %	25 %	189438897
77	NC_010816	ATGG	2	8	39506	39513	25 %	25 %	50 %	0 %	189438897
78	NC_010816	TGGC	2	8	39516	39523	0 %	25 %	50 %	25 %	189438897
79	NC_010816	TGGA	2	8	39910	39917	25 %	25 %	50 %	0 %	189438897
80	NC_010816	TAGA	2	8	40001	40008	50 %	25 %	25 %	0 %	189438898
81	NC_010816	CATC	2	8	40107	40114	25 %	25 %	0 %	50 %	189438898
82	NC_010816	GGAA	2	8	40614	40621	50 %	0 %	50 %	0 %	189438898
83	NC_010816	GTCC	2	8	40672	40679	0 %	25 %	25 %	50 %	189438898
84	NC_010816	CAGT	2	8	42064	42071	25 %	25 %	25 %	25 %	189438899
85	NC_010816	TCTG	2	8	42280	42287	0 %	50 %	25 %	25 %	189438899
86	NC_010816	GCAA	2	8	42315	42322	50 %	0 %	25 %	25 %	189438899
87	NC_010816	CATT	2	8	43283	43290	25 %	50 %	0 %	25 %	189438899
88	NC_010816	CCGA	2	8	44074	44081	25 %	0 %	25 %	50 %	189438899
89	NC_010816	GTTC	2	8	44838	44845	0 %	50 %	25 %	25 %	189438899
90	NC_010816	GACG	2	8	45280	45287	25 %	0 %	50 %	25 %	189438899
91	NC_010816	GTTG	2	8	45385	45392	0 %	50 %	50 %	0 %	189438899
92	NC_010816	CGGG	2	8	45619	45626	0 %	0 %	75 %	25 %	189438900
93	NC_010816	GATG	2	8	45768	45775	25 %	25 %	50 %	0 %	189438900
94	NC_010816	ACGA	2	8	47718	47725	50 %	0 %	25 %	25 %	189438903
95	NC_010816	CATC	2	8	48538	48545	25 %	25 %	0 %	50 %	189438903
96	NC_010816	TGAG	2	8	50275	50282	25 %	25 %	50 %	0 %	189438904
97	NC_010816	TTTG	2	8	50288	50295	0 %	75 %	25 %	0 %	189438904
98	NC_010816	GGCC	2	8	50513	50520	0 %	0 %	50 %	50 %	189438904
99	NC_010816	ACGC	2	8	50920	50927	25 %	0 %	25 %	50 %	189438904
100	NC_010816	CAGC	2	8	51593	51600	25 %	0 %	25 %	50 %	189438904
101	NC_010816	CCTG	2	8	51800	51807	0 %	25 %	25 %	50 %	189438905
102	NC_010816	GCCG	2	8	52071	52078	0 %	0 %	50 %	50 %	189438905
103	NC_010816	CTGG	2	8	53102	53109	0 %	25 %	50 %	25 %	189438906
104	NC_010816	GTCA	2	8	53319	53326	25 %	25 %	25 %	25 %	189438906
105	NC_010816	GGCC	2	8	53429	53436	0 %	0 %	50 %	50 %	189438906
106	NC_010816	TCGA	2	8	53803	53810	25 %	25 %	25 %	25 %	189438906
107	NC_010816	GCAA	2	8	54726	54733	50 %	0 %	25 %	25 %	189438907
108	NC_010816	GTTG	2	8	54750	54757	0 %	50 %	50 %	0 %	189438907
109	NC_010816	TGCG	2	8	55209	55216	0 %	25 %	50 %	25 %	189438907
110	NC_010816	CGAT	2	8	55286	55293	25 %	25 %	25 %	25 %	189438907
111	NC_010816	AGTG	2	8	55552	55559	25 %	25 %	50 %	0 %	189438907
112	NC_010816	TGGC	2	8	58549	58556	0 %	25 %	50 %	25 %	189438909
113	NC_010816	CATT	2	8	58917	58924	25 %	50 %	0 %	25 %	189438910
114	NC_010816	GGCC	2	8	58999	59006	0 %	0 %	50 %	50 %	189438910
115	NC_010816	TCGG	2	8	59096	59103	0 %	25 %	50 %	25 %	189438910
116	NC_010816	TCCT	2	8	59231	59238	0 %	50 %	0 %	50 %	189438910
117	NC_010816	GCCG	2	8	59279	59286	0 %	0 %	50 %	50 %	189438910
118	NC_010816	CAAA	2	8	59921	59928	75 %	0 %	0 %	25 %	189438911
119	NC_010816	TGTC	2	8	60143	60150	0 %	50 %	25 %	25 %	189438911
120	NC_010816	GCCG	2	8	60831	60838	0 %	0 %	50 %	50 %	189438911
121	NC_010816	CGAG	2	8	61677	61684	25 %	0 %	50 %	25 %	189438912
122	NC_010816	GACC	2	8	61956	61963	25 %	0 %	25 %	50 %	189438912
123	NC_010816	TCGG	2	8	62012	62019	0 %	25 %	50 %	25 %	189438912
124	NC_010816	ATGC	2	8	62048	62055	25 %	25 %	25 %	25 %	189438912
125	NC_010816	CTGC	2	8	62941	62948	0 %	25 %	25 %	50 %	189438913
126	NC_010816	CAGC	2	8	65092	65099	25 %	0 %	25 %	50 %	189438915
127	NC_010816	TCAA	2	8	65748	65755	50 %	25 %	0 %	25 %	189438916
128	NC_010816	GCTG	2	8	65848	65855	0 %	25 %	50 %	25 %	189438916
129	NC_010816	GAAT	2	8	66732	66739	50 %	25 %	25 %	0 %	189438918
130	NC_010816	CGGC	2	8	67218	67225	0 %	0 %	50 %	50 %	189438918
131	NC_010816	TTGC	2	8	67690	67697	0 %	50 %	25 %	25 %	189438918
132	NC_010816	CAGT	2	8	67788	67795	25 %	25 %	25 %	25 %	189438918
133	NC_010816	TCGT	2	8	68027	68034	0 %	50 %	25 %	25 %	189438918
134	NC_010816	GACC	2	8	68685	68692	25 %	0 %	25 %	50 %	189438918
135	NC_010816	GTGA	2	8	68720	68727	25 %	25 %	50 %	0 %	189438918
136	NC_010816	AGGC	2	8	68799	68806	25 %	0 %	50 %	25 %	189438918
137	NC_010816	CGGC	2	8	69265	69272	0 %	0 %	50 %	50 %	189438919
138	NC_010816	ACAG	2	8	69273	69280	50 %	0 %	25 %	25 %	189438919
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