MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum DJO10A chromosome

Total Repeats: 46524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_010816	GCT	2	6	126083	126088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438970
2502	NC_010816	TGGCA	2	10	126108	126117	20 %	20 %	40 %	20 %	189438970
2503	NC_010816	CGA	2	6	126152	126157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438970
2504	NC_010816	GAT	2	6	126312	126317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189438971
2505	NC_010816	GAT	2	6	126345	126350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189438971
2506	NC_010816	GATC	2	8	126374	126381	25 %	25 %	25 %	25 %	189438971
2507	NC_010816	TCG	2	6	126436	126441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438971
2508	NC_010816	ATT	2	6	126642	126647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189438972
2509	NC_010816	GAT	2	6	126650	126655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189438972
2510	NC_010816	TTC	2	6	126730	126735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189438972
2511	NC_010816	TCG	2	6	126821	126826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438972
2512	NC_010816	GCG	2	6	126833	126838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438972
2513	NC_010816	CGT	2	6	126868	126873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438972
2514	NC_010816	GAG	2	6	126895	126900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189438972
2515	NC_010816	GAA	2	6	126923	126928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189438972
2516	NC_010816	CGGTC	2	10	127011	127020	0 %	20 %	40 %	40 %	189438972
2517	NC_010816	GATCGG	2	12	127089	127100	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	189438972
2518	NC_010816	GTC	2	6	127105	127110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438972
2519	NC_010816	GCC	2	6	127121	127126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438972
2520	NC_010816	CTG	2	6	127144	127149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438972
2521	NC_010816	TGA	2	6	127166	127171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189438972
2522	NC_010816	GTC	2	6	127174	127179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438972
2523	NC_010816	CAA	2	6	127183	127188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189438972
2524	NC_010816	GGC	3	9	127234	127242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438972
2525	NC_010816	ATG	2	6	127328	127333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189438972
2526	NC_010816	TGAA	2	8	127361	127368	50 %	25 %	25 %	0 %	189438972
2527	NC_010816	ATG	2	6	127412	127417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189438972
2528	NC_010816	CAT	2	6	127438	127443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438972
2529	NC_010816	TCG	2	6	127481	127486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438972
2530	NC_010816	GTG	2	6	127556	127561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438972
2531	NC_010816	TGG	2	6	127563	127568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438972
2532	NC_010816	CCG	2	6	127601	127606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438972
2533	NC_010816	ATG	2	6	127649	127654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189438972
2534	NC_010816	CGG	2	6	127692	127697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438972
2535	NC_010816	GCG	2	6	127705	127710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438972
2536	NC_010816	CGAA	2	8	127729	127736	50 %	0 %	25 %	25 %	189438972
2537	NC_010816	GGT	2	6	127744	127749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438972
2538	NC_010816	AGGC	2	8	127786	127793	25 %	0 %	50 %	25 %	189438972
2539	NC_010816	ATC	2	6	127886	127891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438972
2540	NC_010816	GTC	2	6	127895	127900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438972
2541	NC_010816	CTG	2	6	127954	127959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438972
2542	NC_010816	CCA	2	6	128048	128053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189438972
2543	NC_010816	CG	4	8	128058	128065	0 %	0 %	50 %	50 %	189438972
2544	NC_010816	CCTT	2	8	128114	128121	0 %	50 %	0 %	50 %	189438972
2545	NC_010816	CGT	2	6	128139	128144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438972
2546	NC_010816	TCG	2	6	128195	128200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438972
2547	NC_010816	GCC	2	6	128270	128275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438972
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2549	NC_010816	CGT	2	6	128833	128838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438973
2550	NC_010816	CG	3	6	128843	128848	0 %	0 %	50 %	50 %	189438973
2551	NC_010816	ATC	2	6	128849	128854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438973
2552	NC_010816	TGG	2	6	128934	128939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438973
2553	NC_010816	GCC	2	6	128983	128988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438973
2554	NC_010816	CTG	2	6	129080	129085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438973
2555	NC_010816	ATGG	2	8	129101	129108	25 %	25 %	50 %	0 %	189438973
2556	NC_010816	GCC	3	9	129119	129127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438973
2557	NC_010816	CCA	2	6	129138	129143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189438973
2558	NC_010816	GGCT	2	8	129146	129153	0 %	25 %	50 %	25 %	189438973
2559	NC_010816	CGA	2	6	129160	129165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438973
2560	NC_010816	GCT	2	6	129196	129201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438973
2561	NC_010816	GGA	2	6	129221	129226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189438973
2562	NC_010816	CGT	2	6	129262	129267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438973
2563	NC_010816	CTG	2	6	129320	129325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438973
2564	NC_010816	CGC	2	6	129352	129357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438973
2565	NC_010816	CG	3	6	129483	129488	0 %	0 %	50 %	50 %	189438973
2566	NC_010816	GGC	2	6	129535	129540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438973
2567	NC_010816	GGTT	2	8	129552	129559	0 %	50 %	50 %	0 %	189438973
2568	NC_010816	GCC	2	6	129629	129634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438973
2569	NC_010816	GC	3	6	129637	129642	0 %	0 %	50 %	50 %	189438973
2570	NC_010816	ATC	2	6	129685	129690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438973
2571	NC_010816	CGA	2	6	129700	129705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438973
2572	NC_010816	ACG	2	6	129768	129773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438973
2573	NC_010816	TATG	2	8	129913	129920	25 %	50 %	25 %	0 %	189438973
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2582	NC_010816	CAT	2	6	130469	130474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438974
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2584	NC_010816	CAC	2	6	130523	130528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189438974
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2587	NC_010816	GGCG	2	8	130774	130781	0 %	0 %	75 %	25 %	189438974
2588	NC_010816	AGGA	2	8	130803	130810	50 %	0 %	50 %	0 %	189438974
2589	NC_010816	GGT	2	6	130838	130843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438974
2590	NC_010816	CGG	2	6	130873	130878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438974
2591	NC_010816	CGG	2	6	130882	130887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438974
2592	NC_010816	CGG	2	6	130891	130896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438974
2593	NC_010816	GCCG	2	8	130952	130959	0 %	0 %	50 %	50 %	189438974
2594	NC_010816	GCCG	2	8	131030	131037	0 %	0 %	50 %	50 %	189438974
2595	NC_010816	TCGGCC	2	12	131040	131051	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	189438974
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2598	NC_010816	GCCG	2	8	131177	131184	0 %	0 %	50 %	50 %	189438974
2599	NC_010816	CAG	2	6	131219	131224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438974
2600	NC_010816	TCA	2	6	131227	131232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438974
2601	NC_010816	GAATCG	2	12	131260	131271	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	189438974
2602	NC_010816	CGC	2	6	131317	131322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438974
2603	NC_010816	CGT	2	6	131353	131358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438974
2604	NC_010816	CTCA	2	8	131495	131502	25 %	25 %	0 %	50 %	189438974
2605	NC_010816	CG	3	6	131504	131509	0 %	0 %	50 %	50 %	189438974
2606	NC_010816	GCC	2	6	131514	131519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438974
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2608	NC_010816	CTG	2	6	131567	131572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438974
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2610	NC_010816	CAT	2	6	131672	131677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438974
2611	NC_010816	CTG	2	6	131678	131683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438974
2612	NC_010816	GGAT	2	8	131690	131697	25 %	25 %	50 %	0 %	189438974
2613	NC_010816	TCA	2	6	131722	131727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438974
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2615	NC_010816	GTC	2	6	131828	131833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438974
2616	NC_010816	TCG	2	6	132148	132153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438975
2617	NC_010816	TGGTG	2	10	132173	132182	0 %	40 %	60 %	0 %	189438975
2618	NC_010816	CTG	3	9	132186	132194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438975
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2620	NC_010816	GAC	2	6	132290	132295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438975
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2981	NC_010816	TGG	2	6	152224	152229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438992
2982	NC_010816	CCA	2	6	152254	152259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189438992
2983	NC_010816	CAT	2	6	152285	152290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438992
2984	NC_010816	AG	3	6	152415	152420	50 %	0 %	50 %	0 %	189438992
2985	NC_010816	CAT	2	6	152450	152455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438992
2986	NC_010816	AGC	2	6	152469	152474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438992
2987	NC_010816	TCG	2	6	152509	152514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438992
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2989	NC_010816	GGC	2	6	152552	152557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438992
2990	NC_010816	GCAG	2	8	152578	152585	25 %	0 %	50 %	25 %	189438992
2991	NC_010816	GGC	2	6	152636	152641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438992
2992	NC_010816	GCT	2	6	152674	152679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438992
2993	NC_010816	CCA	2	6	152756	152761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189438992
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2998	NC_010816	GCA	2	6	152836	152841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438992
2999	NC_010816	CGAG	2	8	152869	152876	25 %	0 %	50 %	25 %	189438992
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