MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum DJO10A chromosome

Total Repeats: 46524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_010816	CGA	2	6	100450	100455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438943
2002	NC_010816	CGGG	2	8	100465	100472	0 %	0 %	75 %	25 %	189438943
2003	NC_010816	CAT	2	6	100504	100509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438943
2004	NC_010816	CGC	2	6	100523	100528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438943
2005	NC_010816	TCC	2	6	100529	100534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189438943
2006	NC_010816	CAG	2	6	100588	100593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438943
2007	NC_010816	CAC	2	6	100609	100614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189438943
2008	NC_010816	CAG	2	6	100675	100680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438943
2009	NC_010816	TGA	2	6	100686	100691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189438943
2010	NC_010816	GCC	2	6	100763	100768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438943
2011	NC_010816	GAT	2	6	100831	100836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189438943
2012	NC_010816	ACG	2	6	100872	100877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438943
2013	NC_010816	TGA	2	6	100920	100925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189438943
2014	NC_010816	GCC	2	6	100928	100933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438943
2015	NC_010816	CCA	2	6	100938	100943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189438943
2016	NC_010816	TGT	2	6	100977	100982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189438943
2017	NC_010816	CGC	2	6	100998	101003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438943
2018	NC_010816	GGCA	2	8	101037	101044	25 %	0 %	50 %	25 %	189438944
2019	NC_010816	TCGCGT	2	12	101045	101056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438944
2020	NC_010816	GCC	2	6	101062	101067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438944
2021	NC_010816	GCC	2	6	101093	101098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438944
2022	NC_010816	CGTC	2	8	101128	101135	0 %	25 %	25 %	50 %	189438944
2023	NC_010816	CGG	2	6	101136	101141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438944
2024	NC_010816	GCGGAT	2	12	101148	101159	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	189438944
2025	NC_010816	GTC	3	9	101217	101225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438944
2026	NC_010816	TCG	2	6	101242	101247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438944
2027	NC_010816	CAG	2	6	101250	101255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438944
2028	NC_010816	GGGCCA	2	12	101282	101293	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	189438944
2029	NC_010816	GCC	2	6	101299	101304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438944
2030	NC_010816	GCC	2	6	101307	101312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438944
2031	NC_010816	GC	3	6	101329	101334	0 %	0 %	50 %	50 %	189438944
2032	NC_010816	CGT	2	6	101370	101375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438944
2033	NC_010816	TCG	2	6	101386	101391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438944
2034	NC_010816	GCA	2	6	101393	101398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438944
2035	NC_010816	GCC	2	6	101412	101417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438944
2036	NC_010816	CGC	2	6	101512	101517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438944
2037	NC_010816	CTG	2	6	101520	101525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438944
2038	NC_010816	CGC	2	6	101537	101542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438944
2039	NC_010816	GCCGGA	2	12	101619	101630	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	189438944
2040	NC_010816	CCA	2	6	101636	101641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189438944
2041	NC_010816	CGA	2	6	101645	101650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438944
2042	NC_010816	CGC	2	6	101654	101659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438944
2043	NC_010816	TCG	2	6	101698	101703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438944
2044	NC_010816	CCG	2	6	101705	101710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438944
2045	NC_010816	GAA	2	6	101751	101756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189438944
2046	NC_010816	ACT	2	6	101906	101911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438945
2047	NC_010816	CAC	2	6	102013	102018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189438945
2048	NC_010816	TCG	2	6	102045	102050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438945
2049	NC_010816	ACC	2	6	102155	102160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189438945
2050	NC_010816	GATCA	2	10	102164	102173	40 %	20 %	20 %	20 %	189438945
2051	NC_010816	ACG	2	6	102246	102251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438945
2052	NC_010816	TCA	2	6	102393	102398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438945
2053	NC_010816	AAC	2	6	102455	102460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189438945
2054	NC_010816	CG	3	6	102532	102537	0 %	0 %	50 %	50 %	189438946
2055	NC_010816	CGA	2	6	102568	102573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438946
2056	NC_010816	A	6	6	102573	102578	100 %	0 %	0 %	0 %	189438946
2057	NC_010816	TC	3	6	102589	102594	0 %	50 %	0 %	50 %	189438946
2058	NC_010816	CGT	2	6	102683	102688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438946
2059	NC_010816	CCG	2	6	102733	102738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438946
2060	NC_010816	CGC	2	6	102772	102777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438946
2061	NC_010816	GAT	2	6	102797	102802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189438946
2062	NC_010816	CGA	2	6	102823	102828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438946
2063	NC_010816	CTG	2	6	102887	102892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438946
2064	NC_010816	GCA	2	6	102917	102922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438946
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2066	NC_010816	GCC	2	6	102977	102982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438946
2067	NC_010816	CCGA	2	8	102992	102999	25 %	0 %	25 %	50 %	189438946
2068	NC_010816	CGA	2	6	103042	103047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438946
2069	NC_010816	CTG	2	6	103050	103055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438946
2070	NC_010816	GAC	2	6	103397	103402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438947
2071	NC_010816	TCC	2	6	103536	103541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189438947
2072	NC_010816	GAC	3	9	103617	103625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438947
2073	NC_010816	TCG	2	6	103642	103647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438947
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2082	NC_010816	GTG	2	6	103974	103979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438947
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2084	NC_010816	TCT	3	9	104029	104037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189438947
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2087	NC_010816	GCT	2	6	104141	104146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438947
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2089	NC_010816	ACG	3	9	104353	104361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438947
2090	NC_010816	ACC	2	6	104410	104415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189438947
2091	NC_010816	GCA	2	6	104424	104429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438947
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2093	NC_010816	AAGG	2	8	104490	104497	50 %	0 %	50 %	0 %	189438947
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2099	NC_010816	GAA	2	6	104829	104834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189438948
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2101	NC_010816	CCGC	2	8	104933	104940	0 %	0 %	25 %	75 %	189438948
2102	NC_010816	GAG	3	9	105058	105066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189438948
2103	NC_010816	CGCCGG	2	12	105078	105089	0 %	0 %	50 %	50 %	189438948
2104	NC_010816	CGA	2	6	105108	105113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438948
2105	NC_010816	GGAA	2	8	105143	105150	50 %	0 %	50 %	0 %	189438948
2106	NC_010816	TCGAGC	2	12	105152	105163	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	189438948
2107	NC_010816	CGT	2	6	105186	105191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438948
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2109	NC_010816	GACC	2	8	105273	105280	25 %	0 %	25 %	50 %	189438948
2110	NC_010816	CAT	2	6	105315	105320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438948
2111	NC_010816	CGTGG	2	10	105322	105331	0 %	20 %	60 %	20 %	189438948
2112	NC_010816	CGG	2	6	105342	105347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438948
2113	NC_010816	CAT	2	6	105387	105392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438948
2114	NC_010816	CG	3	6	105410	105415	0 %	0 %	50 %	50 %	189438948
2115	NC_010816	TCC	2	6	105424	105429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189438948
2116	NC_010816	CCA	2	6	105473	105478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189438948
2117	NC_010816	CGA	2	6	105501	105506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438948
2118	NC_010816	CCT	2	6	105539	105544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189438948
2119	NC_010816	CGCTT	2	10	105583	105592	0 %	40 %	20 %	40 %	189438948
2120	NC_010816	ACC	2	6	105625	105630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189438948
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2124	NC_010816	GC	3	6	105822	105827	0 %	0 %	50 %	50 %	189438948
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2241	NC_010816	ATG	2	6	111600	111605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189438952
2242	NC_010816	GAG	2	6	111632	111637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189438952
2243	NC_010816	CGG	2	6	111660	111665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438952
2244	NC_010816	GAT	2	6	111695	111700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189438952
2245	NC_010816	TCA	2	6	111717	111722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438952
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2248	NC_010816	TGTGG	2	10	111763	111772	0 %	40 %	60 %	0 %	189438952
2249	NC_010816	ATC	2	6	111827	111832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438952
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2253	NC_010816	TGG	2	6	112134	112139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438952
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2255	NC_010816	GGC	2	6	112169	112174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438952
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2257	NC_010816	CTG	2	6	112301	112306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438952
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2260	NC_010816	CGG	2	6	112519	112524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438952
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2262	NC_010816	ATC	2	6	112553	112558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438952
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2273	NC_010816	CCCT	2	8	113020	113027	0 %	25 %	0 %	75 %	189438953
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2282	NC_010816	GTCTG	2	10	113686	113695	0 %	40 %	40 %	20 %	189438954
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2359	NC_010816	G	6	6	118108	118113	0 %	0 %	100 %	0 %	189438958
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2361	NC_010816	GCC	2	6	118402	118407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438959
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2482	NC_010816	CCG	2	6	124947	124952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438969
2483	NC_010816	ATG	2	6	125057	125062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189438969
2484	NC_010816	GCCAA	2	10	125114	125123	40 %	0 %	20 %	40 %	189438969
2485	NC_010816	GCG	2	6	125124	125129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438969
2486	NC_010816	GTG	2	6	125138	125143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438969
2487	NC_010816	GAT	2	6	125147	125152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189438969
2488	NC_010816	TCA	2	6	125175	125180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438969
2489	NC_010816	CCGC	2	8	125352	125359	0 %	0 %	25 %	75 %	189438970
2490	NC_010816	ACC	2	6	125478	125483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189438970
2491	NC_010816	ACGC	2	8	125660	125667	25 %	0 %	25 %	50 %	189438970
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2493	NC_010816	AGG	2	6	125734	125739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189438970
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2495	NC_010816	GGCC	2	8	125757	125764	0 %	0 %	50 %	50 %	189438970
2496	NC_010816	GTG	2	6	125886	125891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438970
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2498	NC_010816	TGT	2	6	125962	125967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189438970
2499	NC_010816	GCT	2	6	126056	126061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438970
2500	NC_010816	GCC	2	6	126070	126075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438970

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