MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum DJO10A chromosome

Total Repeats: 46524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_010816	AGC	2	6	74793	74798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438924
1502	NC_010816	CGCC	2	8	74812	74819	0 %	0 %	25 %	75 %	189438924
1503	NC_010816	CTG	2	6	74904	74909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438924
1504	NC_010816	TCA	2	6	75139	75144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438924
1505	NC_010816	CGTA	2	8	75166	75173	25 %	25 %	25 %	25 %	189438924
1506	NC_010816	AACC	2	8	75175	75182	50 %	0 %	0 %	50 %	189438924
1507	NC_010816	TTC	2	6	75246	75251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189438924
1508	NC_010816	CT	3	6	75257	75262	0 %	50 %	0 %	50 %	189438924
1509	NC_010816	GCG	2	6	75301	75306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438924
1510	NC_010816	GCCGC	2	10	75345	75354	0 %	0 %	40 %	60 %	189438924
1511	NC_010816	CGA	2	6	75434	75439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438924
1512	NC_010816	CAT	2	6	75458	75463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438924
1513	NC_010816	ATT	2	6	75482	75487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189438924
1514	NC_010816	CGC	2	6	75491	75496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438924
1515	NC_010816	CAGAC	2	10	75504	75513	40 %	0 %	20 %	40 %	189438924
1516	NC_010816	GGC	2	6	75606	75611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438924
1517	NC_010816	GAAC	2	8	75650	75657	50 %	0 %	25 %	25 %	189438924
1518	NC_010816	CTT	2	6	75707	75712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189438924
1519	NC_010816	CTG	2	6	75747	75752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438924
1520	NC_010816	CGC	2	6	75803	75808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438924
1521	NC_010816	TGC	2	6	75811	75816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438924
1522	NC_010816	ATG	3	9	75948	75956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189438925
1523	NC_010816	AGCG	2	8	75992	75999	25 %	0 %	50 %	25 %	189438925
1524	NC_010816	CTG	2	6	76052	76057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438925
1525	NC_010816	GCGG	2	8	76097	76104	0 %	0 %	75 %	25 %	189438925
1526	NC_010816	GAA	2	6	76129	76134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189438925
1527	NC_010816	CGC	2	6	76172	76177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438925
1528	NC_010816	GAG	2	6	76178	76183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189438925
1529	NC_010816	GCG	2	6	76205	76210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438925
1530	NC_010816	GC	3	6	76274	76279	0 %	0 %	50 %	50 %	189438925
1531	NC_010816	CCAAGG	2	12	76320	76331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438925
1532	NC_010816	CTG	2	6	76361	76366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438925
1533	NC_010816	GTT	2	6	76465	76470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189438925
1534	NC_010816	ACA	2	6	76476	76481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189438925
1535	NC_010816	CCG	2	6	76519	76524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438925
1536	NC_010816	CGC	2	6	76625	76630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438925
1537	NC_010816	CGT	2	6	76803	76808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438926
1538	NC_010816	CCA	2	6	76845	76850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189438926
1539	NC_010816	GGA	2	6	76879	76884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189438926
1540	NC_010816	TCG	2	6	76943	76948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438926
1541	NC_010816	GAGTTC	2	12	76970	76981	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	189438926
1542	NC_010816	ATGTAG	2	12	77075	77086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189438926
1543	NC_010816	GTCC	2	8	77091	77098	0 %	25 %	25 %	50 %	189438926
1544	NC_010816	GCC	2	6	77137	77142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438926
1545	NC_010816	AGGA	2	8	77171	77178	50 %	0 %	50 %	0 %	189438926
1546	NC_010816	GCTCG	2	10	77206	77215	0 %	20 %	40 %	40 %	189438926
1547	NC_010816	ATC	2	6	77264	77269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438926
1548	NC_010816	CAT	2	6	77304	77309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438926
1549	NC_010816	TCGGA	2	10	77361	77370	20 %	20 %	40 %	20 %	189438926
1550	NC_010816	TCG	2	6	77372	77377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438926
1551	NC_010816	CCA	2	6	77430	77435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189438926
1552	NC_010816	CTCGC	2	10	77441	77450	0 %	20 %	20 %	60 %	189438926
1553	NC_010816	TGA	2	6	77469	77474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189438926
1554	NC_010816	AG	3	6	77519	77524	50 %	0 %	50 %	0 %	189438926
1555	NC_010816	TGA	2	6	77586	77591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189438926
1556	NC_010816	CGA	2	6	77622	77627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438926
1557	NC_010816	TGG	2	6	77634	77639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438926
1558	NC_010816	ATG	2	6	77654	77659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189438926
1559	NC_010816	CAG	2	6	77674	77679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438926
1560	NC_010816	GTA	2	6	77692	77697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189438926
1561	NC_010816	CGC	2	6	77712	77717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438926
1562	NC_010816	TAG	2	6	77738	77743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189438926
1563	NC_010816	TCG	2	6	77819	77824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438926
1564	NC_010816	TCC	2	6	77852	77857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189438926
1565	NC_010816	GTG	2	6	77897	77902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438926
1566	NC_010816	GTCGGT	2	12	77911	77922	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	189438926
1567	NC_010816	CCG	2	6	78041	78046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438926
1568	NC_010816	CGG	3	9	78072	78080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438926
1569	NC_010816	GCG	2	6	78092	78097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438926
1570	NC_010816	GCC	2	6	78098	78103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438926
1571	NC_010816	GGT	2	6	78184	78189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438926
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1573	NC_010816	TCG	2	6	78278	78283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438926
1574	NC_010816	CAT	2	6	78298	78303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438926
1575	NC_010816	CTG	2	6	78304	78309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438926
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1585	NC_010816	CGG	2	6	78902	78907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438927
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1589	NC_010816	GCA	2	6	79016	79021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438927
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1591	NC_010816	GCCA	2	8	79123	79130	25 %	0 %	25 %	50 %	189438927
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1593	NC_010816	CGAAC	2	10	79268	79277	40 %	0 %	20 %	40 %	189438927
1594	NC_010816	TCA	2	6	79289	79294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438927
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1598	NC_010816	CG	3	6	79338	79343	0 %	0 %	50 %	50 %	189438927
1599	NC_010816	GC	3	6	79391	79396	0 %	0 %	50 %	50 %	189438927
1600	NC_010816	GCAA	2	8	79423	79430	50 %	0 %	25 %	25 %	189438927
1601	NC_010816	GTCG	2	8	79447	79454	0 %	25 %	50 %	25 %	189438927
1602	NC_010816	CGC	2	6	79467	79472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438927
1603	NC_010816	GA	3	6	79507	79512	50 %	0 %	50 %	0 %	189438927
1604	NC_010816	CGCC	2	8	79523	79530	0 %	0 %	25 %	75 %	189438927
1605	NC_010816	CGG	2	6	79558	79563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438927
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1608	NC_010816	GCG	2	6	79618	79623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438927
1609	NC_010816	GC	3	6	79670	79675	0 %	0 %	50 %	50 %	189438927
1610	NC_010816	ACT	2	6	79693	79698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438927
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1993	NC_010816	GTC	2	6	100234	100239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438943
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1995	NC_010816	GCG	2	6	100301	100306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438943
1996	NC_010816	GGC	2	6	100336	100341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438943
1997	NC_010816	CGC	2	6	100353	100358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438943
1998	NC_010816	CAT	2	6	100378	100383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438943
1999	NC_010816	GGT	2	6	100423	100428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438943
2000	NC_010816	GCA	2	6	100431	100436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438943

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