MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum DJO10A chromosome

Total Repeats: 46524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010816	AGT	2	6	50158	50163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189438903
1002	NC_010816	TGAG	2	8	50275	50282	25 %	25 %	50 %	0 %	189438904
1003	NC_010816	TTTG	2	8	50288	50295	0 %	75 %	25 %	0 %	189438904
1004	NC_010816	GGC	2	6	50297	50302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438904
1005	NC_010816	CGC	2	6	50401	50406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438904
1006	NC_010816	GCC	2	6	50410	50415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438904
1007	NC_010816	CCA	2	6	50503	50508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189438904
1008	NC_010816	GGCC	2	8	50513	50520	0 %	0 %	50 %	50 %	189438904
1009	NC_010816	CCG	2	6	50548	50553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438904
1010	NC_010816	CGA	2	6	50642	50647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438904
1011	NC_010816	CAG	2	6	50670	50675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438904
1012	NC_010816	GCT	2	6	50681	50686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438904
1013	NC_010816	CCG	2	6	50689	50694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438904
1014	NC_010816	CCA	2	6	50725	50730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189438904
1015	NC_010816	CAT	2	6	50750	50755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438904
1016	NC_010816	GGT	2	6	50777	50782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438904
1017	NC_010816	GC	4	8	50831	50838	0 %	0 %	50 %	50 %	189438904
1018	NC_010816	TGA	2	6	50843	50848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189438904
1019	NC_010816	GGT	2	6	50913	50918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438904
1020	NC_010816	ACGC	2	8	50920	50927	25 %	0 %	25 %	50 %	189438904
1021	NC_010816	CGA	2	6	50972	50977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438904
1022	NC_010816	CAT	2	6	51005	51010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438904
1023	NC_010816	ACG	2	6	51082	51087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438904
1024	NC_010816	TCA	2	6	51100	51105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438904
1025	NC_010816	GCC	2	6	51132	51137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438904
1026	NC_010816	CAT	2	6	51197	51202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438904
1027	NC_010816	CGC	2	6	51206	51211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438904
1028	NC_010816	GCC	2	6	51231	51236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438904
1029	NC_010816	GCG	2	6	51264	51269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438904
1030	NC_010816	TAT	2	6	51305	51310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189438904
1031	NC_010816	CCA	2	6	51442	51447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189438904
1032	NC_010816	AT	3	6	51524	51529	50 %	50 %	0 %	0 %	189438904
1033	NC_010816	TAC	2	6	51555	51560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438904
1034	NC_010816	CAGC	2	8	51593	51600	25 %	0 %	25 %	50 %	189438904
1035	NC_010816	TGG	2	6	51629	51634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438904
1036	NC_010816	GAT	2	6	51736	51741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189438905
1037	NC_010816	CCTG	2	8	51800	51807	0 %	25 %	25 %	50 %	189438905
1038	NC_010816	CGC	2	6	51904	51909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438905
1039	NC_010816	AC	3	6	51959	51964	50 %	0 %	0 %	50 %	189438905
1040	NC_010816	CGT	2	6	51969	51974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438905
1041	NC_010816	CGA	2	6	51996	52001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438905
1042	NC_010816	CTG	2	6	52033	52038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438905
1043	NC_010816	GCCG	2	8	52071	52078	0 %	0 %	50 %	50 %	189438905
1044	NC_010816	AC	3	6	52167	52172	50 %	0 %	0 %	50 %	189438905
1045	NC_010816	CCA	2	6	52175	52180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189438905
1046	NC_010816	GCT	2	6	52221	52226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438905
1047	NC_010816	GCC	3	9	52240	52248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438905
1048	NC_010816	GGA	2	6	52356	52361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189438905
1049	NC_010816	TGC	2	6	52465	52470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438906
1050	NC_010816	TCG	2	6	52490	52495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438906
1051	NC_010816	TCT	2	6	52555	52560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189438906
1052	NC_010816	GC	3	6	52583	52588	0 %	0 %	50 %	50 %	189438906
1053	NC_010816	GCT	2	6	52592	52597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438906
1054	NC_010816	GCA	2	6	52643	52648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438906
1055	NC_010816	TCC	2	6	52743	52748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189438906
1056	NC_010816	GT	3	6	52759	52764	0 %	50 %	50 %	0 %	189438906
1057	NC_010816	CAT	2	6	52796	52801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438906
1058	NC_010816	GAC	2	6	52842	52847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438906
1059	NC_010816	TTC	2	6	52995	53000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189438906
1060	NC_010816	CAG	3	9	53022	53030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438906
1061	NC_010816	TGG	2	6	53056	53061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438906
1062	NC_010816	GTG	2	6	53085	53090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438906
1063	NC_010816	GTA	2	6	53094	53099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189438906
1064	NC_010816	CTGG	2	8	53102	53109	0 %	25 %	50 %	25 %	189438906
1065	NC_010816	TGC	2	6	53221	53226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438906
1066	NC_010816	AGA	2	6	53263	53268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189438906
1067	NC_010816	GGA	2	6	53279	53284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189438906
1068	NC_010816	GTCA	2	8	53319	53326	25 %	25 %	25 %	25 %	189438906
1069	NC_010816	ACC	2	6	53346	53351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189438906
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1071	NC_010816	CCA	2	6	53404	53409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189438906
1072	NC_010816	GGCC	2	8	53429	53436	0 %	0 %	50 %	50 %	189438906
1073	NC_010816	CGA	2	6	53777	53782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438906
1074	NC_010816	TCGA	2	8	53803	53810	25 %	25 %	25 %	25 %	189438906
1075	NC_010816	TTCACG	2	12	53828	53839	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	189438906
1076	NC_010816	CGG	2	6	53846	53851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438906
1077	NC_010816	TGC	2	6	53890	53895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438906
1078	NC_010816	GTA	2	6	53902	53907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189438906
1079	NC_010816	TGC	2	6	53953	53958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438906
1080	NC_010816	AGGTG	2	10	53975	53984	20 %	20 %	60 %	0 %	189438906
1081	NC_010816	CCA	2	6	54061	54066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189438906
1082	NC_010816	CA	3	6	54074	54079	50 %	0 %	0 %	50 %	189438906
1083	NC_010816	CGC	2	6	54096	54101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438906
1084	NC_010816	GAT	2	6	54107	54112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189438906
1085	NC_010816	GCC	2	6	54149	54154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438907
1086	NC_010816	CAG	2	6	54254	54259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438907
1087	NC_010816	CTG	2	6	54345	54350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438907
1088	NC_010816	CCG	2	6	54460	54465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438907
1089	NC_010816	GC	3	6	54483	54488	0 %	0 %	50 %	50 %	189438907
1090	NC_010816	GGT	2	6	54532	54537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438907
1091	NC_010816	TGA	2	6	54609	54614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189438907
1092	NC_010816	GCG	2	6	54651	54656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438907
1093	NC_010816	GCAA	2	8	54726	54733	50 %	0 %	25 %	25 %	189438907
1094	NC_010816	GTTG	2	8	54750	54757	0 %	50 %	50 %	0 %	189438907
1095	NC_010816	CCT	2	6	54810	54815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189438907
1096	NC_010816	TGC	2	6	54828	54833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438907
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1098	NC_010816	TGG	2	6	54894	54899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438907
1099	NC_010816	GAA	2	6	54938	54943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189438907
1100	NC_010816	CTG	2	6	54950	54955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438907
1101	NC_010816	TAC	2	6	55060	55065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438907
1102	NC_010816	AGC	2	6	55068	55073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438907
1103	NC_010816	GGT	2	6	55100	55105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438907
1104	NC_010816	T	6	6	55182	55187	0 %	100 %	0 %	0 %	189438907
1105	NC_010816	CGG	2	6	55195	55200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438907
1106	NC_010816	TGCG	2	8	55209	55216	0 %	25 %	50 %	25 %	189438907
1107	NC_010816	CGAT	2	8	55286	55293	25 %	25 %	25 %	25 %	189438907
1108	NC_010816	TTGGC	2	10	55390	55399	0 %	40 %	40 %	20 %	189438907
1109	NC_010816	TGA	3	9	55485	55493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189438907
1110	NC_010816	GC	3	6	55502	55507	0 %	0 %	50 %	50 %	189438907
1111	NC_010816	AGTG	2	8	55552	55559	25 %	25 %	50 %	0 %	189438907
1112	NC_010816	CCA	2	6	55614	55619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189438907
1113	NC_010816	CCT	2	6	55622	55627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189438907
1114	NC_010816	AAC	2	6	55641	55646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189438907
1115	NC_010816	GAA	2	6	56173	56178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189438908
1116	NC_010816	GAA	2	6	56182	56187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189438908
1117	NC_010816	CTG	3	9	56208	56216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438908
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1119	NC_010816	GGC	2	6	56312	56317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438908
1120	NC_010816	TGACC	2	10	56371	56380	20 %	20 %	20 %	40 %	189438908
1121	NC_010816	AAC	2	6	56396	56401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189438908
1122	NC_010816	CAG	2	6	56405	56410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438908
1123	NC_010816	CAA	2	6	56428	56433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189438908
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1125	NC_010816	CAT	2	6	56458	56463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438908
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1373	NC_010816	TTGC	2	8	67690	67697	0 %	50 %	25 %	25 %	189438918
1374	NC_010816	TGC	2	6	67770	67775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438918
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1376	NC_010816	CAGT	2	8	67788	67795	25 %	25 %	25 %	25 %	189438918
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1496	NC_010816	TAC	2	6	74144	74149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438923
1497	NC_010816	AGC	2	6	74160	74165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438923
1498	NC_010816	TCT	2	6	74571	74576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189438924
1499	NC_010816	GCG	2	6	74607	74612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438924
1500	NC_010816	GGC	2	6	74618	74623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438924

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