MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum DJO10A chromosome

Total Repeats: 46524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010816	GC	3	6	24110	24115	0 %	0 %	50 %	50 %	189438881
502	NC_010816	CGA	2	6	24146	24151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438881
503	NC_010816	TGT	2	6	24639	24644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189438882
504	NC_010816	TGT	2	6	24652	24657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189438882
505	NC_010816	CCT	2	6	24674	24679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189438882
506	NC_010816	GC	3	6	24692	24697	0 %	0 %	50 %	50 %	189438882
507	NC_010816	GTT	2	6	24799	24804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189438882
508	NC_010816	TGA	2	6	24915	24920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189438882
509	NC_010816	CAT	2	6	24925	24930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438882
510	NC_010816	GCC	2	6	25101	25106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438882
511	NC_010816	TGA	2	6	25186	25191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189438882
512	NC_010816	CAGC	2	8	25198	25205	25 %	0 %	25 %	50 %	189438882
513	NC_010816	ATGC	2	8	25262	25269	25 %	25 %	25 %	25 %	189438882
514	NC_010816	CTG	2	6	25296	25301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438882
515	NC_010816	CTC	2	6	25359	25364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189438882
516	NC_010816	CGC	2	6	25417	25422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438882
517	NC_010816	CAG	2	6	25481	25486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438882
518	NC_010816	GTT	2	6	25544	25549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189438882
519	NC_010816	TGG	2	6	26345	26350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438883
520	NC_010816	CAA	2	6	26526	26531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189438883
521	NC_010816	TCA	2	6	26561	26566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438883
522	NC_010816	AAG	2	6	26584	26589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189438883
523	NC_010816	CGG	2	6	26670	26675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438883
524	NC_010816	CAG	3	9	26677	26685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438883
525	NC_010816	CG	3	6	26701	26706	0 %	0 %	50 %	50 %	189438883
526	NC_010816	CGA	2	6	26736	26741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438883
527	NC_010816	GAT	2	6	26820	26825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189438883
528	NC_010816	CG	3	6	26850	26855	0 %	0 %	50 %	50 %	189438883
529	NC_010816	GCC	2	6	26860	26865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438883
530	NC_010816	CGA	2	6	26916	26921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438883
531	NC_010816	TTC	2	6	26923	26928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189438883
532	NC_010816	GACC	2	8	26940	26947	25 %	0 %	25 %	50 %	189438883
533	NC_010816	CGC	2	6	27061	27066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438884
534	NC_010816	CGC	2	6	27070	27075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438884
535	NC_010816	GCG	2	6	27105	27110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438884
536	NC_010816	AAG	2	6	27170	27175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189438884
537	NC_010816	GACGTG	2	12	27197	27208	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	189438884
538	NC_010816	ATC	2	6	27251	27256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438884
539	NC_010816	GGAA	2	8	27258	27265	50 %	0 %	50 %	0 %	189438884
540	NC_010816	AGC	2	6	27276	27281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438884
541	NC_010816	CGA	2	6	27340	27345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438884
542	NC_010816	AAG	2	6	27350	27355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189438884
543	NC_010816	GAC	2	6	27413	27418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438884
544	NC_010816	CCG	2	6	27483	27488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438884
545	NC_010816	ACC	2	6	27590	27595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189438884
546	NC_010816	GAC	2	6	27596	27601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438884
547	NC_010816	ATC	2	6	27602	27607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438884
548	NC_010816	GGCC	2	8	27610	27617	0 %	0 %	50 %	50 %	189438884
549	NC_010816	CG	3	6	27630	27635	0 %	0 %	50 %	50 %	189438884
550	NC_010816	GGT	2	6	27646	27651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438884
551	NC_010816	TAC	2	6	27674	27679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438884
552	NC_010816	AAG	2	6	27692	27697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189438884
553	NC_010816	CCA	2	6	27714	27719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189438884
554	NC_010816	CAA	2	6	27724	27729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189438884
555	NC_010816	AGGAG	2	10	27841	27850	40 %	0 %	60 %	0 %	189438884
556	NC_010816	TGA	2	6	27854	27859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189438884
557	NC_010816	CAT	3	9	28053	28061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438885
558	NC_010816	CAC	2	6	28119	28124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189438885
559	NC_010816	CTT	2	6	28128	28133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189438885
560	NC_010816	CGG	2	6	28166	28171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438885
561	NC_010816	AGGCCG	2	12	28223	28234	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	189438885
562	NC_010816	TGGGCT	2	12	28244	28255	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	189438885
563	NC_010816	GCC	3	9	28357	28365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438885
564	NC_010816	TGA	2	6	28394	28399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189438885
565	NC_010816	GAT	2	6	28404	28409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189438885
566	NC_010816	ATC	2	6	28429	28434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438885
567	NC_010816	ATC	2	6	28474	28479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438885
568	NC_010816	CAC	2	6	28494	28499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189438885
569	NC_010816	CAA	2	6	28509	28514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189438885
570	NC_010816	AGG	2	6	28525	28530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189438885
571	NC_010816	GGT	2	6	28637	28642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438886
572	NC_010816	CCG	2	6	28674	28679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438886
573	NC_010816	CAGCT	2	10	28692	28701	20 %	20 %	20 %	40 %	189438886
574	NC_010816	CCG	2	6	28717	28722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438886
575	NC_010816	CCA	2	6	28780	28785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189438886
576	NC_010816	GTG	2	6	28794	28799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438886
577	NC_010816	GTG	2	6	28806	28811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438886
578	NC_010816	CTG	2	6	28839	28844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438886
579	NC_010816	CCG	2	6	28870	28875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438886
580	NC_010816	TCG	2	6	28879	28884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438886
581	NC_010816	TGC	3	9	28906	28914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438886
582	NC_010816	TCT	3	9	28921	28929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189438886
583	NC_010816	GTTCGC	2	12	28937	28948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438886
584	NC_010816	GTG	2	6	28977	28982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438886
585	NC_010816	GGT	2	6	29009	29014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438886
586	NC_010816	GGC	2	6	29052	29057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438886
587	NC_010816	CTCG	2	8	29069	29076	0 %	25 %	25 %	50 %	189438886
588	NC_010816	TGC	2	6	29140	29145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438886
589	NC_010816	GCC	2	6	29148	29153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438886
590	NC_010816	GTG	2	6	29169	29174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438886
591	NC_010816	ATC	2	6	29199	29204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438886
592	NC_010816	CTG	2	6	29217	29222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438886
593	NC_010816	CTG	2	6	29303	29308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438886
594	NC_010816	TGT	2	6	29311	29316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189438886
595	NC_010816	GCA	2	6	29348	29353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438886
596	NC_010816	GCCGAG	2	12	29370	29381	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	189438886
597	NC_010816	CGC	2	6	29396	29401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438886
598	NC_010816	TGG	2	6	29462	29467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438886
599	NC_010816	GGC	2	6	29524	29529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438886
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601	NC_010816	GGC	2	6	29799	29804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438887
602	NC_010816	CGA	2	6	29958	29963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438887
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605	NC_010816	AT	3	6	30108	30113	50 %	50 %	0 %	0 %	189438887
606	NC_010816	TCT	2	6	30158	30163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189438887
607	NC_010816	AGC	2	6	30238	30243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438887
608	NC_010816	CGG	2	6	30246	30251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438887
609	NC_010816	CGC	2	6	30425	30430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438887
610	NC_010816	CAA	2	6	30459	30464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189438887
611	NC_010816	CAT	2	6	30498	30503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438887
612	NC_010816	GGGC	2	8	30504	30511	0 %	0 %	75 %	25 %	189438887
613	NC_010816	CGC	2	6	30642	30647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438887
614	NC_010816	GGC	2	6	30679	30684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438887
615	NC_010816	CG	3	6	30821	30826	0 %	0 %	50 %	50 %	189438887
616	NC_010816	GCG	2	6	30829	30834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438887
617	NC_010816	TGC	2	6	30839	30844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438887
618	NC_010816	CCG	2	6	31022	31027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438887
619	NC_010816	CGG	2	6	31106	31111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438887
620	NC_010816	CCGGA	2	10	31133	31142	20 %	0 %	40 %	40 %	189438887
621	NC_010816	CGG	2	6	31218	31223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438887
622	NC_010816	ACGG	2	8	31227	31234	25 %	0 %	50 %	25 %	189438887
623	NC_010816	CAG	2	6	31261	31266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438887
624	NC_010816	GAG	2	6	31502	31507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189438888
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626	NC_010816	GGT	2	6	31558	31563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438888
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