MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum DJO10A chromosome

Total Repeats: 46524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_010816	TC	3	6	318648	318653	0 %	50 %	0 %	50 %	189439116
6002	NC_010816	TGC	2	6	318654	318659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439116
6003	NC_010816	CGG	2	6	318738	318743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439116
6004	NC_010816	TCGGT	2	10	318789	318798	0 %	40 %	40 %	20 %	189439116
6005	NC_010816	ATC	2	6	318812	318817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189439116
6006	NC_010816	TCC	2	6	318839	318844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189439116
6007	NC_010816	GGTCA	2	10	318896	318905	20 %	20 %	40 %	20 %	189439116
6008	NC_010816	TGC	2	6	318906	318911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439116
6009	NC_010816	TGC	2	6	318918	318923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439116
6010	NC_010816	GTC	2	6	318941	318946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439116
6011	NC_010816	GTG	2	6	318981	318986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189439116
6012	NC_010816	TGG	2	6	319068	319073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189439116
6013	NC_010816	C	6	6	319287	319292	0 %	0 %	0 %	100 %	189439117
6014	NC_010816	GAG	2	6	319295	319300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189439117
6015	NC_010816	CGA	2	6	319434	319439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439118
6016	NC_010816	GCGAG	2	10	319452	319461	20 %	0 %	60 %	20 %	189439118
6017	NC_010816	CTG	2	6	319481	319486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439118
6018	NC_010816	CG	3	6	319572	319577	0 %	0 %	50 %	50 %	189439118
6019	NC_010816	GGAA	2	8	319583	319590	50 %	0 %	50 %	0 %	189439118
6020	NC_010816	TGG	2	6	319602	319607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189439118
6021	NC_010816	CCA	2	6	319620	319625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189439118
6022	NC_010816	AGG	2	6	319665	319670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189439118
6023	NC_010816	CGTCTG	2	12	319691	319702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439118
6024	NC_010816	CGCC	2	8	319723	319730	0 %	0 %	25 %	75 %	189439118
6025	NC_010816	CGG	2	6	319792	319797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439118
6026	NC_010816	CAG	2	6	319817	319822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439118
6027	NC_010816	GGC	2	6	319861	319866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439118
6028	NC_010816	CGC	2	6	319894	319899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439118
6029	NC_010816	CCGC	2	8	320070	320077	0 %	0 %	25 %	75 %	189439118
6030	NC_010816	GGC	2	6	320087	320092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439118
6031	NC_010816	TCA	2	6	320193	320198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189439118
6032	NC_010816	CAA	2	6	320209	320214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189439118
6033	NC_010816	TCG	2	6	320232	320237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439118
6034	NC_010816	CAC	2	6	320242	320247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189439118
6035	NC_010816	CTG	2	6	320261	320266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439118
6036	NC_010816	ACG	2	6	320283	320288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439118
6037	NC_010816	CAG	2	6	320300	320305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439118
6038	NC_010816	CAT	2	6	320308	320313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189439118
6039	NC_010816	GCA	2	6	320323	320328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439118
6040	NC_010816	GGA	2	6	320527	320532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189439118
6041	NC_010816	ATC	2	6	320609	320614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189439118
6042	NC_010816	CGC	2	6	320626	320631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439118
6043	NC_010816	ACC	2	6	320693	320698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189439119
6044	NC_010816	CCA	2	6	320746	320751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189439119
6045	NC_010816	TCA	2	6	320797	320802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189439119
6046	NC_010816	CTG	2	6	320811	320816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439119
6047	NC_010816	ATC	2	6	320817	320822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189439119
6048	NC_010816	TCA	2	6	320824	320829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189439119
6049	NC_010816	TCG	2	6	320830	320835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439119
6050	NC_010816	CAAG	2	8	320861	320868	50 %	0 %	25 %	25 %	189439119
6051	NC_010816	CCG	2	6	320911	320916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439119
6052	NC_010816	CTGT	2	8	320988	320995	0 %	50 %	25 %	25 %	189439119
6053	NC_010816	GCT	2	6	321011	321016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439119
6054	NC_010816	TCG	2	6	321025	321030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439119
6055	NC_010816	CTT	2	6	321056	321061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189439119
6056	NC_010816	CGG	2	6	321062	321067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439119
6057	NC_010816	TCT	2	6	321103	321108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189439119
6058	NC_010816	TGC	2	6	321121	321126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439119
6059	NC_010816	GTG	2	6	321138	321143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189439119
6060	NC_010816	GAA	2	6	321251	321256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189439119
6061	NC_010816	ATC	2	6	321345	321350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189439119
6062	NC_010816	CCA	2	6	321358	321363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189439119
6063	NC_010816	CCT	2	6	321373	321378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189439119
6064	NC_010816	ACC	2	6	321426	321431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189439119
6065	NC_010816	CCG	2	6	321508	321513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439119
6066	NC_010816	TCA	2	6	321538	321543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189439119
6067	NC_010816	TGAC	2	8	321620	321627	25 %	25 %	25 %	25 %	189439120
6068	NC_010816	GCT	2	6	321672	321677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439120
6069	NC_010816	CAC	2	6	321705	321710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189439120
6070	NC_010816	GTGG	2	8	321771	321778	0 %	25 %	75 %	0 %	189439120
6071	NC_010816	CTG	2	6	321835	321840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439120
6072	NC_010816	CAA	2	6	322023	322028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189439120
6073	NC_010816	CGA	2	6	322080	322085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439120
6074	NC_010816	ACG	3	9	322103	322111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439120
6075	NC_010816	AAG	2	6	322159	322164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189439120
6076	NC_010816	CGA	2	6	322266	322271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439120
6077	NC_010816	TCA	2	6	322274	322279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189439120
6078	NC_010816	CGA	2	6	322293	322298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439120
6079	NC_010816	AAG	2	6	322318	322323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189439120
6080	NC_010816	CTG	2	6	322363	322368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439120
6081	NC_010816	CGC	2	6	322389	322394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439120
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6085	NC_010816	CTG	2	6	322483	322488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439120
6086	NC_010816	CGA	2	6	322494	322499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439120
6087	NC_010816	ACC	2	6	322544	322549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189439120
6088	NC_010816	CCG	2	6	322577	322582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439120
6089	NC_010816	TCA	2	6	322589	322594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189439120
6090	NC_010816	GC	3	6	322620	322625	0 %	0 %	50 %	50 %	189439120
6091	NC_010816	GTC	2	6	322657	322662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439120
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6103	NC_010816	GAG	2	6	323167	323172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189439120
6104	NC_010816	CTG	2	6	323230	323235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439120
6105	NC_010816	GCCAGC	2	12	323294	323305	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	189439120
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6112	NC_010816	CGG	2	6	323598	323603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439120
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6114	NC_010816	GC	3	6	324088	324093	0 %	0 %	50 %	50 %	189439121
6115	NC_010816	CCA	2	6	324105	324110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189439121
6116	NC_010816	AACG	2	8	324139	324146	50 %	0 %	25 %	25 %	189439121
6117	NC_010816	TTC	2	6	324198	324203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189439121
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6119	NC_010816	CGC	2	6	324278	324283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439121
6120	NC_010816	GCC	2	6	324300	324305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439121
6121	NC_010816	CG	3	6	324555	324560	0 %	0 %	50 %	50 %	189439121
6122	NC_010816	CATGG	2	10	324585	324594	20 %	20 %	40 %	20 %	189439121
6123	NC_010816	CGG	2	6	324620	324625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439121
6124	NC_010816	GC	3	6	324677	324682	0 %	0 %	50 %	50 %	189439121
6125	NC_010816	CCT	2	6	324686	324691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189439121
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6127	NC_010816	AAG	2	6	324955	324960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189439122
6128	NC_010816	AGCCG	2	10	324963	324972	20 %	0 %	40 %	40 %	189439122
6129	NC_010816	GCC	2	6	325003	325008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439122
6130	NC_010816	CGC	2	6	325020	325025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439122
6131	NC_010816	ATG	2	6	325115	325120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189439122
6132	NC_010816	ATCTGG	2	12	325145	325156	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	189439122
6133	NC_010816	CTA	2	6	325161	325166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189439122
6134	NC_010816	TCC	2	6	325175	325180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189439122
6135	NC_010816	CCA	2	6	325235	325240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189439122
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6139	NC_010816	GGC	2	6	325402	325407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439122
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6141	NC_010816	TCT	2	6	325466	325471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189439122
6142	NC_010816	GCT	2	6	325480	325485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439122
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6144	NC_010816	TCG	3	9	325538	325546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439122
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6147	NC_010816	CCG	2	6	325594	325599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439122
6148	NC_010816	GCC	2	6	325621	325626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439122
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6150	NC_010816	ACA	2	6	325685	325690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189439122
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6152	NC_010816	ACC	2	6	325735	325740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189439122
6153	NC_010816	ACA	2	6	325799	325804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189439123
6154	NC_010816	CGG	2	6	325875	325880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439123
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6156	NC_010816	GTG	2	6	325915	325920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189439123
6157	NC_010816	TCG	2	6	325922	325927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439123
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6161	NC_010816	CG	4	8	326166	326173	0 %	0 %	50 %	50 %	189439123
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6164	NC_010816	GGTC	2	8	326301	326308	0 %	25 %	50 %	25 %	189439123
6165	NC_010816	CTG	2	6	326314	326319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439123
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6168	NC_010816	ATT	2	6	326434	326439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189439123
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6187	NC_010816	GCT	2	6	327211	327216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439124
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6201	NC_010816	CCG	2	6	327992	327997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439125
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6205	NC_010816	TCT	2	6	328114	328119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189439125
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6220	NC_010816	CGC	2	6	329193	329198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439126
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6222	NC_010816	CGG	2	6	329337	329342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439126
6223	NC_010816	GGCAC	2	10	329347	329356	20 %	0 %	40 %	40 %	189439126
6224	NC_010816	GGC	2	6	329372	329377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439126
6225	NC_010816	GTA	2	6	329404	329409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189439126
6226	NC_010816	TGC	2	6	329432	329437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439126
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6228	NC_010816	CTG	2	6	329655	329660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439126
6229	NC_010816	AGC	2	6	329669	329674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439126
6230	NC_010816	GC	3	6	329764	329769	0 %	0 %	50 %	50 %	189439126
6231	NC_010816	GTGCG	2	10	329777	329786	0 %	20 %	60 %	20 %	189439126
6232	NC_010816	ATT	2	6	329827	329832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189439126
6233	NC_010816	TCG	2	6	329854	329859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439126
6234	NC_010816	GCA	2	6	329865	329870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439126
6235	NC_010816	GT	3	6	329900	329905	0 %	50 %	50 %	0 %	189439126
6236	NC_010816	CGCT	2	8	330077	330084	0 %	25 %	25 %	50 %	189439126
6237	NC_010816	CG	4	8	330201	330208	0 %	0 %	50 %	50 %	189439126
6238	NC_010816	GAAC	2	8	330225	330232	50 %	0 %	25 %	25 %	189439126
6239	NC_010816	TGC	2	6	330272	330277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439126
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6241	NC_010816	ACG	2	6	330353	330358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439126
6242	NC_010816	AGG	2	6	330371	330376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189439126
6243	NC_010816	GCG	2	6	330403	330408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439126
6244	NC_010816	CCA	2	6	330413	330418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189439126
6245	NC_010816	GGT	2	6	330432	330437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189439126
6246	NC_010816	TGG	2	6	330440	330445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189439126
6247	NC_010816	CGT	2	6	330471	330476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439126
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6250	NC_010816	GGC	2	6	330727	330732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439126
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6252	NC_010816	TGC	2	6	330770	330775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439126
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6261	NC_010816	CGA	2	6	331251	331256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439127
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6481	NC_010816	CTG	2	6	341810	341815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439135
6482	NC_010816	AAG	2	6	341849	341854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189439135
6483	NC_010816	GCT	2	6	341920	341925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439135
6484	NC_010816	TGT	2	6	342091	342096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189439136
6485	NC_010816	TTC	2	6	342165	342170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189439136
6486	NC_010816	CGC	2	6	342173	342178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439136
6487	NC_010816	CTG	2	6	342214	342219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439136
6488	NC_010816	CGT	2	6	342333	342338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439137
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6490	NC_010816	CGC	2	6	342444	342449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439137
6491	NC_010816	GCA	2	6	342459	342464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439137
6492	NC_010816	CGGC	2	8	342488	342495	0 %	0 %	50 %	50 %	189439137
6493	NC_010816	CG	3	6	342496	342501	0 %	0 %	50 %	50 %	189439137
6494	NC_010816	CGTGGC	2	12	342585	342596	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	189439137
6495	NC_010816	CTG	2	6	342619	342624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439137
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6500	NC_010816	AGCC	2	8	342930	342937	25 %	0 %	25 %	50 %	189439137

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