MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum DJO10A chromosome

Total Repeats: 46524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_010816	CCG	2	6	269594	269599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439076
5002	NC_010816	CAC	2	6	269613	269618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189439076
5003	NC_010816	CGC	2	6	269619	269624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439076
5004	NC_010816	GTGTG	2	10	269645	269654	0 %	40 %	60 %	0 %	189439076
5005	NC_010816	CCG	2	6	269666	269671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439076
5006	NC_010816	TCG	2	6	269681	269686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439076
5007	NC_010816	TGC	2	6	269717	269722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439076
5008	NC_010816	CTA	2	6	269739	269744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189439076
5009	NC_010816	GCT	3	9	269805	269813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439076
5010	NC_010816	CAT	2	6	269829	269834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189439076
5011	NC_010816	GTG	2	6	269896	269901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189439076
5012	NC_010816	CG	4	8	269973	269980	0 %	0 %	50 %	50 %	189439076
5013	NC_010816	CAT	2	6	270003	270008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189439076
5014	NC_010816	CCG	4	12	270128	270139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439076
5015	NC_010816	CCG	2	6	270179	270184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439076
5016	NC_010816	TGG	2	6	270190	270195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189439076
5017	NC_010816	GC	3	6	270288	270293	0 %	0 %	50 %	50 %	189439076
5018	NC_010816	CCG	2	6	270302	270307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439076
5019	NC_010816	GATC	2	8	270320	270327	25 %	25 %	25 %	25 %	189439076
5020	NC_010816	CGTC	2	8	270335	270342	0 %	25 %	25 %	50 %	189439076
5021	NC_010816	CGCA	2	8	270363	270370	25 %	0 %	25 %	50 %	189439076
5022	NC_010816	CCG	2	6	270406	270411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439076
5023	NC_010816	TCG	2	6	270440	270445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439076
5024	NC_010816	GA	3	6	270488	270493	50 %	0 %	50 %	0 %	189439076
5025	NC_010816	ACA	2	6	270503	270508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189439077
5026	NC_010816	CG	3	6	270654	270659	0 %	0 %	50 %	50 %	189439077
5027	NC_010816	CAT	2	6	270663	270668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189439077
5028	NC_010816	GCT	2	6	270672	270677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439077
5029	NC_010816	CCA	2	6	270689	270694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189439077
5030	NC_010816	GCG	2	6	270758	270763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439077
5031	NC_010816	GC	3	6	270870	270875	0 %	0 %	50 %	50 %	189439077
5032	NC_010816	AAG	2	6	270892	270897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189439077
5033	NC_010816	GC	3	6	270903	270908	0 %	0 %	50 %	50 %	189439077
5034	NC_010816	GAA	2	6	270927	270932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189439077
5035	NC_010816	ACT	2	6	270965	270970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189439077
5036	NC_010816	CGG	2	6	270987	270992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439077
5037	NC_010816	AGC	2	6	270998	271003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439077
5038	NC_010816	CGA	2	6	271053	271058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439077
5039	NC_010816	CTG	2	6	271105	271110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439077
5040	NC_010816	TCA	3	9	271145	271153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189439077
5041	NC_010816	GGT	2	6	271191	271196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189439077
5042	NC_010816	TCT	2	6	271244	271249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189439077
5043	NC_010816	GAC	2	6	271261	271266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439077
5044	NC_010816	CTG	2	6	271279	271284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439077
5045	NC_010816	GTGCC	2	10	271286	271295	0 %	20 %	40 %	40 %	189439077
5046	NC_010816	TGG	2	6	271490	271495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189439077
5047	NC_010816	CCA	2	6	271517	271522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189439077
5048	NC_010816	CGG	2	6	271557	271562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439077
5049	NC_010816	GC	3	6	271623	271628	0 %	0 %	50 %	50 %	189439077
5050	NC_010816	CTC	2	6	271659	271664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189439077
5051	NC_010816	TGA	2	6	271676	271681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189439077
5052	NC_010816	GCT	2	6	271707	271712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439077
5053	NC_010816	CAC	2	6	271717	271722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189439077
5054	NC_010816	CTG	2	6	271765	271770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439077
5055	NC_010816	CG	3	6	271787	271792	0 %	0 %	50 %	50 %	189439077
5056	NC_010816	CGG	2	6	271824	271829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439077
5057	NC_010816	GCT	2	6	271878	271883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439077
5058	NC_010816	TCA	2	6	271985	271990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189439077
5059	NC_010816	GGT	2	6	272004	272009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189439077
5060	NC_010816	CAT	2	6	272028	272033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189439077
5061	NC_010816	GCA	2	6	272085	272090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439077
5062	NC_010816	AAG	2	6	272110	272115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189439077
5063	NC_010816	CTG	2	6	272116	272121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439077
5064	NC_010816	TGCCCG	2	12	272129	272140	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	189439077
5065	NC_010816	CG	3	6	272144	272149	0 %	0 %	50 %	50 %	189439077
5066	NC_010816	CAG	2	6	272152	272157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439077
5067	NC_010816	CTG	2	6	272258	272263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439078
5068	NC_010816	GGGCGT	2	12	272281	272292	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	189439078
5069	NC_010816	CGCT	2	8	272337	272344	0 %	25 %	25 %	50 %	189439078
5070	NC_010816	TCG	2	6	272409	272414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439078
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5072	NC_010816	CCA	2	6	272530	272535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189439078
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5074	NC_010816	CAC	2	6	272582	272587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189439078
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5079	NC_010816	TCT	2	6	272734	272739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189439078
5080	NC_010816	CGT	2	6	272863	272868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439079
5081	NC_010816	CGG	2	6	272887	272892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439079
5082	NC_010816	CGT	2	6	272926	272931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439079
5083	NC_010816	GATGCC	2	12	272942	272953	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	189439079
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5087	NC_010816	GC	3	6	273067	273072	0 %	0 %	50 %	50 %	189439079
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5101	NC_010816	TGG	2	6	273604	273609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189439079
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5103	NC_010816	GTC	2	6	273689	273694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439079
5104	NC_010816	GGAT	2	8	273739	273746	25 %	25 %	50 %	0 %	189439079
5105	NC_010816	CACGCG	2	12	273785	273796	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	189439079
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5120	NC_010816	TCG	2	6	274845	274850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439080
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5125	NC_010816	CGT	2	6	274927	274932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439080
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5234	NC_010816	GA	3	6	281460	281465	50 %	0 %	50 %	0 %	189439082
5235	NC_010816	AGA	2	6	281523	281528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189439082
5236	NC_010816	CGC	2	6	281546	281551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439082
5237	NC_010816	GAG	2	6	281609	281614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189439082
5238	NC_010816	TCA	2	6	281679	281684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189439082
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5240	NC_010816	CCG	2	6	281736	281741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439082
5241	NC_010816	GGC	2	6	281777	281782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439082
5242	NC_010816	CAC	2	6	281821	281826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189439082
5243	NC_010816	CGGC	2	8	281850	281857	0 %	0 %	50 %	50 %	189439082
5244	NC_010816	CCT	2	6	281878	281883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189439082
5245	NC_010816	CGG	2	6	281887	281892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439082
5246	NC_010816	CCGC	2	8	281937	281944	0 %	0 %	25 %	75 %	189439082
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5253	NC_010816	CTT	2	6	282333	282338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189439083
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5255	NC_010816	GCA	2	6	282483	282488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439083
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5348	NC_010816	TGG	3	9	287761	287769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189439089
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5355	NC_010816	TCG	2	6	288030	288035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439089
5356	NC_010816	CAT	2	6	288037	288042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189439089
5357	NC_010816	ACGGTC	2	12	288093	288104	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	189439089
5358	NC_010816	TTG	2	6	288216	288221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189439089
5359	NC_010816	GAT	2	6	288232	288237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189439089
5360	NC_010816	GC	3	6	288250	288255	0 %	0 %	50 %	50 %	189439089
5361	NC_010816	CCTTG	2	10	288373	288382	0 %	40 %	20 %	40 %	189439089
5362	NC_010816	AATCG	2	10	288385	288394	40 %	20 %	20 %	20 %	189439089
5363	NC_010816	CGG	2	6	288424	288429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439089
5364	NC_010816	AAT	2	6	288430	288435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189439089
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5366	NC_010816	CG	3	6	288890	288895	0 %	0 %	50 %	50 %	189439090
5367	NC_010816	CAA	2	6	288939	288944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189439090
5368	NC_010816	TGC	3	9	289011	289019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439090
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5370	NC_010816	CGT	2	6	289087	289092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439090
5371	NC_010816	GCAT	2	8	289094	289101	25 %	25 %	25 %	25 %	189439090
5372	NC_010816	GTG	2	6	289102	289107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189439090
5373	NC_010816	TGG	2	6	289124	289129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189439090
5374	NC_010816	TGC	2	6	289148	289153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439090
5375	NC_010816	CGGT	2	8	289211	289218	0 %	25 %	50 %	25 %	189439090
5376	NC_010816	TGC	2	6	289307	289312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439090
5377	NC_010816	CCG	2	6	289343	289348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439090
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5380	NC_010816	CAG	2	6	289456	289461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439090
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5398	NC_010816	TGCT	2	8	290300	290307	0 %	50 %	25 %	25 %	189439091
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5473	NC_010816	TGG	2	6	294361	294366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189439095
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5478	NC_010816	AAG	2	6	294476	294481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189439095
5479	NC_010816	AGC	2	6	294498	294503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439095
5480	NC_010816	GTC	2	6	294504	294509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439095
5481	NC_010816	GGC	2	6	294547	294552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439095
5482	NC_010816	TCAGGC	2	12	294577	294588	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	189439095
5483	NC_010816	AGA	2	6	294618	294623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189439095
5484	NC_010816	AAG	2	6	294632	294637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189439095
5485	NC_010816	AGG	2	6	294648	294653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189439095
5486	NC_010816	GCA	2	6	294654	294659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439095
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5490	NC_010816	CCG	2	6	294793	294798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439096
5491	NC_010816	TGC	2	6	294805	294810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439096
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5497	NC_010816	GCT	2	6	295020	295025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439097
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