MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum DJO10A chromosome

Total Repeats: 46524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_010816	CGA	3	9	242616	242624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439054
4502	NC_010816	CCA	2	6	242630	242635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189439054
4503	NC_010816	GAATG	2	10	242686	242695	40 %	20 %	40 %	0 %	189439054
4504	NC_010816	GCT	2	6	242706	242711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439054
4505	NC_010816	TTCG	2	8	242842	242849	0 %	50 %	25 %	25 %	189439054
4506	NC_010816	GAT	2	6	242929	242934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189439054
4507	NC_010816	CCA	2	6	243009	243014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189439054
4508	NC_010816	CGC	3	9	243063	243071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439054
4509	NC_010816	CGA	2	6	243089	243094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439054
4510	NC_010816	CGC	2	6	243114	243119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439054
4511	NC_010816	GAT	2	6	243178	243183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189439054
4512	NC_010816	GCC	2	6	243217	243222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439054
4513	NC_010816	TGC	2	6	243242	243247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439054
4514	NC_010816	CGG	2	6	243252	243257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439054
4515	NC_010816	CGG	2	6	243339	243344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439054
4516	NC_010816	AGC	2	6	243347	243352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439054
4517	NC_010816	CCA	2	6	243566	243571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189439055
4518	NC_010816	GAA	2	6	243580	243585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189439055
4519	NC_010816	AT	3	6	243594	243599	50 %	50 %	0 %	0 %	189439055
4520	NC_010816	AAG	2	6	243631	243636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189439055
4521	NC_010816	CGC	2	6	243678	243683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439055
4522	NC_010816	CCG	2	6	243710	243715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439055
4523	NC_010816	GAA	2	6	243741	243746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189439055
4524	NC_010816	ACT	2	6	243761	243766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189439055
4525	NC_010816	CCAG	2	8	243828	243835	25 %	0 %	25 %	50 %	189439055
4526	NC_010816	CGC	2	6	243867	243872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439055
4527	NC_010816	TGCCG	2	10	243960	243969	0 %	20 %	40 %	40 %	189439055
4528	NC_010816	TCC	2	6	243986	243991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189439055
4529	NC_010816	GCC	2	6	243994	243999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439055
4530	NC_010816	CGC	2	6	244005	244010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439055
4531	NC_010816	GAG	2	6	244102	244107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189439055
4532	NC_010816	CCG	2	6	244135	244140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439055
4533	NC_010816	GAC	2	6	244150	244155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439055
4534	NC_010816	CATCC	2	10	244218	244227	20 %	20 %	0 %	60 %	189439055
4535	NC_010816	TGA	2	6	244259	244264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189439055
4536	NC_010816	CAA	2	6	244290	244295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189439055
4537	NC_010816	CAAG	2	8	244556	244563	50 %	0 %	25 %	25 %	189439055
4538	NC_010816	AGG	3	9	244568	244576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189439055
4539	NC_010816	AAG	2	6	244630	244635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189439055
4540	NC_010816	GAC	2	6	244669	244674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439055
4541	NC_010816	TTC	2	6	244678	244683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189439055
4542	NC_010816	CGA	2	6	244692	244697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439055
4543	NC_010816	CCG	2	6	244727	244732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439055
4544	NC_010816	GGCCC	2	10	244759	244768	0 %	0 %	40 %	60 %	189439055
4545	NC_010816	CCA	2	6	244787	244792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189439055
4546	NC_010816	TGC	2	6	244793	244798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439055
4547	NC_010816	GCAAG	2	10	244821	244830	40 %	0 %	40 %	20 %	189439055
4548	NC_010816	AACG	2	8	244873	244880	50 %	0 %	25 %	25 %	189439055
4549	NC_010816	AAGCG	2	10	244895	244904	40 %	0 %	40 %	20 %	189439056
4550	NC_010816	GC	3	6	244916	244921	0 %	0 %	50 %	50 %	189439056
4551	NC_010816	TGC	2	6	244990	244995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439056
4552	NC_010816	TTC	2	6	245034	245039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189439056
4553	NC_010816	TCG	2	6	245092	245097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439056
4554	NC_010816	ACCG	2	8	245124	245131	25 %	0 %	25 %	50 %	189439056
4555	NC_010816	TTC	2	6	245148	245153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189439056
4556	NC_010816	TCG	2	6	245157	245162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439056
4557	NC_010816	TGG	2	6	245221	245226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189439056
4558	NC_010816	CAT	2	6	245240	245245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189439056
4559	NC_010816	CTT	2	6	245249	245254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189439056
4560	NC_010816	AC	3	6	245269	245274	50 %	0 %	0 %	50 %	189439056
4561	NC_010816	TCA	2	6	245278	245283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189439056
4562	NC_010816	CGT	3	9	245291	245299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439056
4563	NC_010816	CAC	2	6	245372	245377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189439056
4564	NC_010816	GCTG	2	8	245401	245408	0 %	25 %	50 %	25 %	189439056
4565	NC_010816	GGC	2	6	245510	245515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439056
4566	NC_010816	GAT	2	6	245582	245587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189439056
4567	NC_010816	TGC	2	6	245596	245601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439056
4568	NC_010816	CGG	2	6	245660	245665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439056
4569	NC_010816	TCA	2	6	245698	245703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189439056
4570	NC_010816	GTG	2	6	245769	245774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189439056
4571	NC_010816	TTCA	2	8	245802	245809	25 %	50 %	0 %	25 %	189439056
4572	NC_010816	GGCA	2	8	245830	245837	25 %	0 %	50 %	25 %	189439057
4573	NC_010816	CA	3	6	245836	245841	50 %	0 %	0 %	50 %	189439057
4574	NC_010816	CAT	2	6	245893	245898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189439057
4575	NC_010816	CTG	2	6	245912	245917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439057
4576	NC_010816	GGC	2	6	245926	245931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439057
4577	NC_010816	CTG	2	6	245936	245941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439057
4578	NC_010816	GAC	2	6	245975	245980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439057
4579	NC_010816	CGC	2	6	245986	245991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439057
4580	NC_010816	TCG	2	6	246030	246035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439057
4581	NC_010816	GGC	2	6	246088	246093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439057
4582	NC_010816	CAT	2	6	246112	246117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189439057
4583	NC_010816	CTG	2	6	246185	246190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439057
4584	NC_010816	AAC	2	6	246266	246271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189439057
4585	NC_010816	TTGCC	2	10	246282	246291	0 %	40 %	20 %	40 %	189439057
4586	NC_010816	TTC	2	6	246315	246320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189439057
4587	NC_010816	GAT	2	6	246355	246360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189439057
4588	NC_010816	TCT	2	6	246453	246458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189439057
4589	NC_010816	CTGA	2	8	246503	246510	25 %	25 %	25 %	25 %	189439057
4590	NC_010816	TCT	2	6	246621	246626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189439057
4591	NC_010816	AAT	2	6	246681	246686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189439057
4592	NC_010816	GCT	2	6	246839	246844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439058
4593	NC_010816	CTGG	2	8	246983	246990	0 %	25 %	50 %	25 %	189439058
4594	NC_010816	GCA	2	6	247006	247011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439058
4595	NC_010816	CA	3	6	247139	247144	50 %	0 %	0 %	50 %	189439058
4596	NC_010816	ACG	2	6	247258	247263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439058
4597	NC_010816	ACC	2	6	247326	247331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189439058
4598	NC_010816	GCT	2	6	247434	247439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439058
4599	NC_010816	CCG	2	6	247498	247503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439058
4600	NC_010816	GTG	3	9	247571	247579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189439058
4601	NC_010816	TTC	2	6	247617	247622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189439058
4602	NC_010816	CCAC	2	8	247696	247703	25 %	0 %	0 %	75 %	189439058
4603	NC_010816	CACG	2	8	247723	247730	25 %	0 %	25 %	50 %	189439058
4604	NC_010816	GCT	2	6	247779	247784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439058
4605	NC_010816	GCTC	2	8	247798	247805	0 %	25 %	25 %	50 %	189439058
4606	NC_010816	ATG	2	6	247985	247990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189439058
4607	NC_010816	GCC	2	6	248295	248300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439059
4608	NC_010816	CGG	2	6	248312	248317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439059
4609	NC_010816	CAT	2	6	248331	248336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189439059
4610	NC_010816	G	6	6	248339	248344	0 %	0 %	100 %	0 %	189439059
4611	NC_010816	TCG	2	6	248411	248416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439059
4612	NC_010816	ACGA	2	8	248417	248424	50 %	0 %	25 %	25 %	189439059
4613	NC_010816	CGT	2	6	248433	248438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439059
4614	NC_010816	TGGC	2	8	248490	248497	0 %	25 %	50 %	25 %	189439059
4615	NC_010816	ATG	2	6	248531	248536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189439059
4616	NC_010816	CACAA	2	10	248588	248597	60 %	0 %	0 %	40 %	189439059
4617	NC_010816	GGC	2	6	248635	248640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439059
4618	NC_010816	CCGA	2	8	248671	248678	25 %	0 %	25 %	50 %	189439059
4619	NC_010816	CTG	2	6	248692	248697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439059
4620	NC_010816	GAT	2	6	248712	248717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189439059
4621	NC_010816	GAC	2	6	248731	248736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439059
4622	NC_010816	CCT	2	6	248810	248815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189439059
4623	NC_010816	T	6	6	248829	248834	0 %	100 %	0 %	0 %	189439059
4624	NC_010816	CG	3	6	248841	248846	0 %	0 %	50 %	50 %	189439059
4625	NC_010816	ACCGG	2	10	248884	248893	20 %	0 %	40 %	40 %	189439059
4626	NC_010816	TGG	2	6	248926	248931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189439059
4627	NC_010816	ATC	2	6	248939	248944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189439059
4628	NC_010816	CCGATC	2	12	249041	249052	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	189439059
4629	NC_010816	ATC	2	6	249304	249309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189439059
4630	NC_010816	TGG	2	6	249340	249345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189439059
4631	NC_010816	CAA	2	6	249355	249360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189439059
4632	NC_010816	ACC	2	6	249407	249412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189439059
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4634	NC_010816	ACG	2	6	249556	249561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439059
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4636	NC_010816	GAG	2	6	249631	249636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189439059
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4638	NC_010816	GAT	2	6	249753	249758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189439059
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4641	NC_010816	GGC	2	6	249868	249873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439059
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4643	NC_010816	CAT	2	6	250098	250103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189439059
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4645	NC_010816	GTCG	2	8	250221	250228	0 %	25 %	50 %	25 %	189439059
4646	NC_010816	GGA	2	6	250510	250515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189439059
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4648	NC_010816	CG	3	6	250630	250635	0 %	0 %	50 %	50 %	189439059
4649	NC_010816	GCC	2	6	250662	250667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439059
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4654	NC_010816	GGC	2	6	250901	250906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439060
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4656	NC_010816	CTG	2	6	251016	251021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439060
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4730	NC_010816	GTC	2	6	255650	255655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439062
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4862	NC_010816	GCA	2	6	263337	263342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439071
4863	NC_010816	TGA	2	6	263367	263372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189439071
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4866	NC_010816	GCA	2	6	263451	263456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439071
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4894	NC_010816	GC	3	6	264957	264962	0 %	0 %	50 %	50 %	189439073
4895	NC_010816	GTC	2	6	264984	264989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439073
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4982	NC_010816	TCG	2	6	268897	268902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439075
4983	NC_010816	TGC	2	6	268906	268911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439075
4984	NC_010816	TGC	2	6	268921	268926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439075
4985	NC_010816	CCT	2	6	268943	268948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189439075
4986	NC_010816	CCG	2	6	268951	268956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439075
4987	NC_010816	CG	3	6	269029	269034	0 %	0 %	50 %	50 %	189439075
4988	NC_010816	CAA	2	6	269057	269062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189439075
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4991	NC_010816	CAT	2	6	269246	269251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189439075
4992	NC_010816	CGT	2	6	269258	269263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439075
4993	NC_010816	TCG	2	6	269272	269277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439075
4994	NC_010816	CGC	2	6	269285	269290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439075
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4996	NC_010816	CAAGA	2	10	269335	269344	60 %	0 %	20 %	20 %	189439076
4997	NC_010816	GAC	2	6	269359	269364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439076
4998	NC_010816	ATC	2	6	269419	269424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189439076
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