MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Burkholderia multivorans ATCC 17616 plasmid pTGL1

Total Repeats: 362

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010802	GGGC	2	8	1190	1197	0 %	0 %	75 %	25 %	189348762
2	NC_010802	GGCA	2	8	1348	1355	25 %	0 %	50 %	25 %	189348763
3	NC_010802	CCGG	2	8	2152	2159	0 %	0 %	50 %	50 %	189348763
4	NC_010802	GAGG	2	8	2442	2449	25 %	0 %	75 %	0 %	189348763
5	NC_010802	ATCG	2	8	5757	5764	25 %	25 %	25 %	25 %	189348766
6	NC_010802	GAAG	2	8	5994	6001	50 %	0 %	50 %	0 %	189348766
7	NC_010802	GTCC	2	8	6195	6202	0 %	25 %	25 %	50 %	189348766
8	NC_010802	GCAA	2	8	6220	6227	50 %	0 %	25 %	25 %	189348766
9	NC_010802	GCAA	2	8	7106	7113	50 %	0 %	25 %	25 %	189348767
10	NC_010802	GTTC	2	8	7629	7636	0 %	50 %	25 %	25 %	189348768
11	NC_010802	TCGG	2	8	8183	8190	0 %	25 %	50 %	25 %	189348768
12	NC_010802	CGGC	2	8	8204	8211	0 %	0 %	50 %	50 %	189348768
13	NC_010802	GCTC	2	8	8943	8950	0 %	25 %	25 %	50 %	189348769
14	NC_010802	CGAC	2	8	9249	9256	25 %	0 %	25 %	50 %	189348769
15	NC_010802	GCTT	2	8	10347	10354	0 %	50 %	25 %	25 %	189348770
16	NC_010802	GATC	2	8	10408	10415	25 %	25 %	25 %	25 %	189348770
17	NC_010802	CGGA	2	8	10645	10652	25 %	0 %	50 %	25 %	189348770
18	NC_010802	TGGC	2	8	13259	13266	0 %	25 %	50 %	25 %	189348771
19	NC_010802	AAAC	2	8	14686	14693	75 %	0 %	0 %	25 %	189348772
20	NC_010802	CAAC	2	8	15530	15537	50 %	0 %	0 %	50 %	189348773
21	NC_010802	GTCC	2	8	15554	15561	0 %	25 %	25 %	50 %	189348773
22	NC_010802	CAGC	2	8	15894	15901	25 %	0 %	25 %	50 %	189348773
23	NC_010802	CGAG	2	8	16571	16578	25 %	0 %	50 %	25 %	189348774
24	NC_010802	CGCC	2	8	16771	16778	0 %	0 %	25 %	75 %	189348774
25	NC_010802	CAGT	2	8	17278	17285	25 %	25 %	25 %	25 %	189348775
26	NC_010802	TGAA	2	8	17933	17940	50 %	25 %	25 %	0 %	189348776
27	NC_010802	CGTT	2	8	18001	18008	0 %	50 %	25 %	25 %	189348776
28	NC_010802	CGCT	2	8	18437	18444	0 %	25 %	25 %	50 %	189348776
29	NC_010802	GAGC	2	8	18898	18905	25 %	0 %	50 %	25 %	189348777
30	NC_010802	GAAT	2	8	19932	19939	50 %	25 %	25 %	0 %	189348778
31	NC_010802	ATCG	2	8	19957	19964	25 %	25 %	25 %	25 %	189348778
32	NC_010802	GATG	2	8	20119	20126	25 %	25 %	50 %	0 %	189348778
33	NC_010802	CGGC	2	8	21682	21689	0 %	0 %	50 %	50 %	189348780
34	NC_010802	GCTC	2	8	21805	21812	0 %	25 %	25 %	50 %	189348780
35	NC_010802	CGTC	2	8	22011	22018	0 %	25 %	25 %	50 %	189348780
36	NC_010802	TACC	2	8	22655	22662	25 %	25 %	0 %	50 %	189348780
37	NC_010802	CAAG	2	8	22808	22815	50 %	0 %	25 %	25 %	189348780
38	NC_010802	TCGC	2	8	22910	22917	0 %	25 %	25 %	50 %	189348781
39	NC_010802	TACG	2	8	22954	22961	25 %	25 %	25 %	25 %	189348781
40	NC_010802	ACTG	2	8	23140	23147	25 %	25 %	25 %	25 %	189348781
41	NC_010802	GCCG	2	8	23200	23207	0 %	0 %	50 %	50 %	189348781
42	NC_010802	CCGT	2	8	23235	23242	0 %	25 %	25 %	50 %	189348781
43	NC_010802	GCGA	2	8	24085	24092	25 %	0 %	50 %	25 %	189348782
44	NC_010802	CGCT	2	8	24194	24201	0 %	25 %	25 %	50 %	189348782
45	NC_010802	TCGC	2	8	24451	24458	0 %	25 %	25 %	50 %	189348782
46	NC_010802	CGGG	2	8	25149	25156	0 %	0 %	75 %	25 %	189348782
47	NC_010802	CGAT	2	8	26081	26088	25 %	25 %	25 %	25 %	189348782
48	NC_010802	GGAG	2	8	26436	26443	25 %	0 %	75 %	0 %	189348782
49	NC_010802	GACT	2	8	27671	27678	25 %	25 %	25 %	25 %	189348784
50	NC_010802	TCTT	2	8	27841	27848	0 %	75 %	0 %	25 %	189348784
51	NC_010802	CTCG	2	8	28956	28963	0 %	25 %	25 %	50 %	189348785
52	NC_010802	GCCG	2	8	29457	29464	0 %	0 %	50 %	50 %	189348785
53	NC_010802	AAGC	2	8	29761	29768	50 %	0 %	25 %	25 %	189348785
54	NC_010802	GGCT	2	8	29837	29844	0 %	25 %	50 %	25 %	189348785
55	NC_010802	AGGG	2	8	30276	30283	25 %	0 %	75 %	0 %	189348786
56	NC_010802	TCGA	2	8	31400	31407	25 %	25 %	25 %	25 %	189348786
57	NC_010802	GGTG	2	8	31439	31446	0 %	25 %	75 %	0 %	189348786
58	NC_010802	CCCG	2	8	31650	31657	0 %	0 %	25 %	75 %	189348786
59	NC_010802	GCGG	2	8	32021	32028	0 %	0 %	75 %	25 %	189348786
60	NC_010802	AGTC	2	8	32219	32226	25 %	25 %	25 %	25 %	189348786
61	NC_010802	AGCG	2	8	32388	32395	25 %	0 %	50 %	25 %	189348786
62	NC_010802	GCAA	2	8	32932	32939	50 %	0 %	25 %	25 %	189348786
63	NC_010802	GCCC	2	8	34938	34945	0 %	0 %	25 %	75 %	189348787
64	NC_010802	TTTA	2	8	35070	35077	25 %	75 %	0 %	0 %	189348787
65	NC_010802	CGAT	2	8	35333	35340	25 %	25 %	25 %	25 %	189348787
66	NC_010802	ATCG	2	8	35435	35442	25 %	25 %	25 %	25 %	189348788
67	NC_010802	CGAC	2	8	35818	35825	25 %	0 %	25 %	50 %	189348788
68	NC_010802	TCGC	2	8	36280	36287	0 %	25 %	25 %	50 %	189348788
69	NC_010802	TCCT	2	8	37630	37637	0 %	50 %	0 %	50 %	189348789
70	NC_010802	CGAG	2	8	37746	37753	25 %	0 %	50 %	25 %	189348789
71	NC_010802	CCGA	2	8	38014	38021	25 %	0 %	25 %	50 %	189348789
72	NC_010802	CAAA	2	8	38051	38058	75 %	0 %	0 %	25 %	189348789
73	NC_010802	CGCT	2	8	38752	38759	0 %	25 %	25 %	50 %	189348790
74	NC_010802	CCGG	2	8	38838	38845	0 %	0 %	50 %	50 %	189348790
75	NC_010802	ATTG	2	8	38994	39001	25 %	50 %	25 %	0 %	189348790
76	NC_010802	TGCA	2	8	39075	39082	25 %	25 %	25 %	25 %	189348790
77	NC_010802	GACA	2	8	39121	39128	50 %	0 %	25 %	25 %	189348790
78	NC_010802	GTGC	2	8	39530	39537	0 %	25 %	50 %	25 %	189348790
79	NC_010802	TGAT	2	8	39673	39680	25 %	50 %	25 %	0 %	189348790
80	NC_010802	TACC	2	8	40389	40396	25 %	25 %	0 %	50 %	189348791
81	NC_010802	TGAT	2	8	40715	40722	25 %	50 %	25 %	0 %	189348791
82	NC_010802	CTTC	2	8	40943	40950	0 %	50 %	0 %	50 %	189348791
83	NC_010802	TCGA	2	8	43100	43107	25 %	25 %	25 %	25 %	189348792
84	NC_010802	TCGA	2	8	43331	43338	25 %	25 %	25 %	25 %	189348792
85	NC_010802	CTCG	2	8	45254	45261	0 %	25 %	25 %	50 %	189348793
86	NC_010802	CGGC	2	8	45646	45653	0 %	0 %	50 %	50 %	189348793
87	NC_010802	CGAC	2	8	45655	45662	25 %	0 %	25 %	50 %	189348793
88	NC_010802	AACG	2	8	45663	45670	50 %	0 %	25 %	25 %	189348793
89	NC_010802	CGAC	2	8	45775	45782	25 %	0 %	25 %	50 %	189348793
90	NC_010802	CAGC	2	8	46060	46067	25 %	0 %	25 %	50 %	189348793
91	NC_010802	GCGG	2	8	46329	46336	0 %	0 %	75 %	25 %	189348793
92	NC_010802	GGGC	2	8	46699	46706	0 %	0 %	75 %	25 %	189348793
93	NC_010802	CAGA	2	8	47585	47592	50 %	0 %	25 %	25 %	189348794
94	NC_010802	CACG	2	8	47596	47603	25 %	0 %	25 %	50 %	189348794
95	NC_010802	CTCG	2	8	47776	47783	0 %	25 %	25 %	50 %	189348794
96	NC_010802	CTGA	2	8	47914	47921	25 %	25 %	25 %	25 %	189348795
97	NC_010802	TGCT	2	8	47930	47937	0 %	50 %	25 %	25 %	189348795
98	NC_010802	CGGC	2	8	47963	47970	0 %	0 %	50 %	50 %	189348795
99	NC_010802	GTGG	2	8	48325	48332	0 %	25 %	75 %	0 %	189348795
100	NC_010802	CGGC	2	8	48977	48984	0 %	0 %	50 %	50 %	189348795
101	NC_010802	ACCG	2	8	49162	49169	25 %	0 %	25 %	50 %	189348795
102	NC_010802	CCGG	2	8	49181	49188	0 %	0 %	50 %	50 %	189348795
103	NC_010802	AATT	2	8	49472	49479	50 %	50 %	0 %	0 %	189348795
104	NC_010802	CGAC	2	8	49484	49491	25 %	0 %	25 %	50 %	189348795
105	NC_010802	ACTG	2	8	49804	49811	25 %	25 %	25 %	25 %	189348795
106	NC_010802	CCGG	2	8	49973	49980	0 %	0 %	50 %	50 %	189348795
107	NC_010802	CAAG	2	8	50301	50308	50 %	0 %	25 %	25 %	189348795
108	NC_010802	TGGC	2	8	50467	50474	0 %	25 %	50 %	25 %	189348795
109	NC_010802	CCAG	2	8	50654	50661	25 %	0 %	25 %	50 %	189348795
110	NC_010802	GATC	2	8	51273	51280	25 %	25 %	25 %	25 %	189348795
111	NC_010802	GATC	2	8	51684	51691	25 %	25 %	25 %	25 %	189348795
112	NC_010802	AAGG	2	8	51934	51941	50 %	0 %	50 %	0 %	189348795
113	NC_010802	GATA	2	8	52541	52548	50 %	25 %	25 %	0 %	189348796
114	NC_010802	TTTC	2	8	53420	53427	0 %	75 %	0 %	25 %	189348797
115	NC_010802	CTGG	2	8	53540	53547	0 %	25 %	50 %	25 %	189348797
116	NC_010802	GCGA	2	8	54548	54555	25 %	0 %	50 %	25 %	189348798
117	NC_010802	TCGC	2	8	55228	55235	0 %	25 %	25 %	50 %	189348798
118	NC_010802	CTGG	2	8	55572	55579	0 %	25 %	50 %	25 %	189348798
119	NC_010802	CTTC	2	8	55676	55683	0 %	50 %	0 %	50 %	189348798
120	NC_010802	TCGC	2	8	56754	56761	0 %	25 %	25 %	50 %	189348799
121	NC_010802	CATC	2	8	57786	57793	25 %	25 %	0 %	50 %	189348799
122	NC_010802	CGGC	2	8	58658	58665	0 %	0 %	50 %	50 %	189348799
123	NC_010802	ATCG	2	8	58696	58703	25 %	25 %	25 %	25 %	189348799
124	NC_010802	GATC	2	8	58779	58786	25 %	25 %	25 %	25 %	189348799
125	NC_010802	AGCT	2	8	59181	59188	25 %	25 %	25 %	25 %	189348799
126	NC_010802	CCGG	2	8	59538	59545	0 %	0 %	50 %	50 %	189348799
127	NC_010802	CCAA	2	8	59654	59661	50 %	0 %	0 %	50 %	189348799
128	NC_010802	CCCG	2	8	59708	59715	0 %	0 %	25 %	75 %	189348799
129	NC_010802	CCGC	2	8	59779	59786	0 %	0 %	25 %	75 %	189348799
130	NC_010802	TGAA	2	8	59795	59802	50 %	25 %	25 %	0 %	189348799
131	NC_010802	CCGA	2	8	62051	62058	25 %	0 %	25 %	50 %	189348800
132	NC_010802	GCCG	2	8	62090	62097	0 %	0 %	50 %	50 %	189348800
133	NC_010802	CGAC	2	8	63861	63868	25 %	0 %	25 %	50 %	189348801
134	NC_010802	CCTG	2	8	64893	64900	0 %	25 %	25 %	50 %	189348802
135	NC_010802	AGAA	2	8	65265	65272	75 %	0 %	25 %	0 %	189348803
136	NC_010802	TTCG	2	8	67198	67205	0 %	50 %	25 %	25 %	189348806
137	NC_010802	ATTG	2	8	67239	67246	25 %	50 %	25 %	0 %	189348806
138	NC_010802	AGAA	2	8	68071	68078	75 %	0 %	25 %	0 %	189348807
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.